Doublet Group distance statistics: 53615

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 2, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N9	A	0, 0.012, 0.026, 0.040, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.008, 0.037, 0.066, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.037 std_dev=0.029
C4	A	0, 0.005, 0.034, 0.063, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.034 std_dev=0.029
C1'	A	0, 0.000, 0.032, 0.063, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.032 std_dev=0.032
N1	A	0, 0.001, 0.036, 0.070, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.036 std_dev=0.034
C6	A	0, -0.006, 0.029, 0.064, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.029 std_dev=0.035
C5	A	0, -0.006, 0.044, 0.093, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.044 std_dev=0.049
C2	A	0, -0.014, 0.048, 0.110, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.048 std_dev=0.062
N3	A	0, -0.009, 0.054, 0.117, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.054 std_dev=0.063
N2	A	0, 0.008, 0.072, 0.137, 0.186 max_d=0.186 avg_d=0.072 std_dev=0.065
N7	A	0, -0.004, 0.061, 0.126, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.061 std_dev=0.065
C2'	A	0, 0.022, 0.106, 0.189, 0.312 max_d=0.312 avg_d=0.106 std_dev=0.083
O6	A	0, -0.014, 0.074, 0.162, 0.237 max_d=0.237 avg_d=0.074 std_dev=0.088
O2'	A	0, 0.063, 0.179, 0.294, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.179 std_dev=0.116
O5'	A	0, 0.097, 0.223, 0.349, 0.428 max_d=0.428 avg_d=0.223 std_dev=0.126
C3'	A	0, 0.074, 0.207, 0.339, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.207 std_dev=0.133
C4'	A	0, 0.102, 0.234, 0.367, 0.384 max_d=0.384 avg_d=0.234 std_dev=0.133
O3'	A	0, 0.087, 0.243, 0.399, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.243 std_dev=0.156
C2	B	0, 0.117, 0.275, 0.432, 0.490 max_d=0.490 avg_d=0.275 std_dev=0.157
O4'	A	0, 0.054, 0.215, 0.377, 0.437 max_d=0.437 avg_d=0.215 std_dev=0.161
P	A	0, 0.095, 0.259, 0.423, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.259 std_dev=0.164
OP2	A	0, 0.117, 0.299, 0.482, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.299 std_dev=0.182
OP1	B	0, 0.211, 0.402, 0.593, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.402 std_dev=0.191
N3	B	0, 0.155, 0.350, 0.544, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.350 std_dev=0.195
N1	B	0, 0.160, 0.368, 0.575, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.368 std_dev=0.208
C4	B	0, 0.200, 0.416, 0.632, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.416 std_dev=0.216
C5'	A	0, 0.153, 0.370, 0.587, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.370 std_dev=0.217
C5'	B	0, 0.326, 0.551, 0.776, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.551 std_dev=0.225
P	B	0, 0.190, 0.415, 0.640, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.415 std_dev=0.225
OP1	A	0, 0.082, 0.308, 0.535, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.308 std_dev=0.227
O5'	B	0, 0.347, 0.574, 0.802, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.574 std_dev=0.228
N2	B	0, 0.115, 0.345, 0.574, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.345 std_dev=0.230
O4'	B	0, 0.307, 0.563, 0.819, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.563 std_dev=0.256
C4'	B	0, 0.366, 0.646, 0.926, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.646 std_dev=0.280
C5	B	0, 0.176, 0.476, 0.776, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.476 std_dev=0.300
OP2	B	0, 0.323, 0.624, 0.924, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.624 std_dev=0.301
N9	B	0, 0.231, 0.537, 0.843, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.537 std_dev=0.306
C6	B	0, 0.170, 0.502, 0.834, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.502 std_dev=0.332
C8	B	0, 0.203, 0.605, 1.007, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.605 std_dev=0.402
C3'	B	0, 0.448, 0.870, 1.293, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.870 std_dev=0.422
C1'	B	0, 0.258, 0.685, 1.113, 1.572 max_d=1.572 avg_d=0.685 std_dev=0.428
N7	B	0, 0.145, 0.597, 1.049, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.597 std_dev=0.452
O6	B	0, 0.111, 0.641, 1.171, 1.948 max_d=1.948 avg_d=0.641 std_dev=0.530
O3'	B	0, 0.656, 1.225, 1.794, 1.762 max_d=1.762 avg_d=1.225 std_dev=0.569
C2'	B	0, 0.333, 1.018, 1.702, 2.673 max_d=2.673 avg_d=1.018 std_dev=0.685
O2'	B	0, 0.186, 1.521, 2.856, 4.798 max_d=4.798 avg_d=1.521 std_dev=1.335

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.06	0.08	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.05	0.05	0.06	0.06	0.06
C2	0.07	0.00	0.08	0.07	0.03	0.05	0.05	0.05	0.08	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.03	0.10	0.07	0.06	0.09	0.06	0.09	0.18	0.12
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.02	0.03	0.05	0.06	0.09	0.08	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.09	0.05	0.06	0.09	0.08
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.07	0.06	0.09	0.07	0.07	0.03	0.04	0.01	0.02	0.14	0.08	0.10	0.11	0.12
C4	0.01	0.03	0.05	0.05	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.05	0.04	0.04	0.03	0.05	0.15	0.09
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.07	0.04	0.05	0.06	0.06	0.03	0.07	0.03	0.02	0.02	0.10	0.08	0.07	0.03
C5	0.01	0.05	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.02	0.03	0.02	0.06	0.07	0.01	0.01	0.05	0.04	0.06	0.08	0.06	0.12	0.22	0.15
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.01	0.06	0.00	0.06	0.08	0.06	0.05	0.06	0.10	0.03	0.07	0.05	0.02	0.01	0.11	0.09	0.10	0.03
C6	0.01	0.08	0.03	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.00	0.01	0.04	0.07	0.09	0.05	0.01	0.06	0.05	0.06	0.07	0.00	0.12	0.23	0.14
C8	0.02	0.02	0.05	0.07	0.00	0.07	0.03	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.07	0.09	0.06	0.07	0.08	0.15	0.10
N1	0.05	0.03	0.06	0.06	0.05	0.04	0.02	0.06	0.04	0.02	0.00	0.03	0.04	0.05	0.03	0.08	0.06	0.05	0.08	0.02	0.11	0.22	0.14
N2	0.06	0.01	0.09	0.09	0.01	0.05	0.06	0.05	0.07	0.01	0.03	0.00	0.02	0.07	0.01	0.12	0.10	0.06	0.08	0.04	0.07	0.17	0.11
N3	0.08	0.01	0.08	0.07	0.01	0.06	0.07	0.06	0.09	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.03	0.10	0.07	0.07	0.09	0.09	0.08	0.16	0.12
N7	0.01	0.05	0.04	0.07	0.02	0.06	0.01	0.10	0.05	0.04	0.05	0.07	0.06	0.00	0.01	0.04	0.07	0.08	0.10	0.12	0.16	0.24	0.18
N9	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.03	0.05	0.05	0.06	0.04	0.12	0.09
O2'	0.04	0.10	0.01	0.04	0.07	0.07	0.05	0.07	0.06	0.04	0.08	0.12	0.10	0.04	0.04	0.00	0.08	0.08	0.09	0.07	0.10	0.09	0.08
O3'	0.02	0.07	0.03	0.01	0.05	0.03	0.04	0.05	0.05	0.07	0.06	0.10	0.07	0.07	0.03	0.08	0.00	0.02	0.15	0.07	0.13	0.12	0.13
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.04	0.02	0.06	0.02	0.06	0.09	0.05	0.06	0.07	0.08	0.05	0.08	0.02	0.00	0.13	0.11	0.14	0.14	0.13
O5'	0.05	0.09	0.09	0.14	0.04	0.02	0.08	0.01	0.07	0.06	0.08	0.08	0.09	0.10	0.05	0.09	0.15	0.13	0.00	0.08	0.03	0.07	0.01
O6	0.05	0.06	0.05	0.08	0.03	0.10	0.06	0.11	0.00	0.07	0.02	0.04	0.09	0.12	0.06	0.07	0.07	0.11	0.08	0.00	0.11	0.20	0.12
OP1	0.06	0.09	0.06	0.10	0.05	0.08	0.12	0.09	0.12	0.08	0.11	0.07	0.08	0.16	0.04	0.10	0.13	0.14	0.03	0.11	0.00	0.05	0.01
OP2	0.06	0.18	0.09	0.11	0.15	0.07	0.22	0.10	0.23	0.15	0.22	0.17	0.16	0.24	0.12	0.09	0.12	0.14	0.07	0.20	0.05	0.00	0.02
P	0.06	0.12	0.08	0.12	0.09	0.03	0.15	0.03	0.14	0.10	0.14	0.11	0.12	0.18	0.09	0.08	0.13	0.13	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.39	0.11	0.51	0.36	0.15	0.27	0.16	0.28	0.27	0.15	0.26	0.13	0.20	0.15	0.22	0.87	0.57	0.22	0.34	0.37	0.20	0.24	0.17
C2	0.19	0.16	0.16	0.09	0.12	0.06	0.21	0.25	0.26	0.15	0.19	0.21	0.16	0.24	0.10	0.27	0.19	0.09	0.33	0.37	0.13	0.26	0.14
C2'	0.45	0.15	0.56	0.44	0.17	0.33	0.19	0.30	0.30	0.17	0.28	0.15	0.19	0.18	0.25	1.00	0.69	0.28	0.40	0.40	0.21	0.28	0.21
C3'	0.45	0.13	0.57	0.47	0.16	0.36	0.18	0.31	0.30	0.15	0.27	0.14	0.19	0.17	0.24	1.04	0.76	0.29	0.43	0.42	0.20	0.30	0.23
C4	0.26	0.13	0.24	0.16	0.10	0.14	0.23	0.24	0.35	0.14	0.28	0.21	0.15	0.24	0.11	0.49	0.37	0.14	0.34	0.47	0.15	0.23	0.14
C4'	0.44	0.14	0.60	0.46	0.18	0.34	0.16	0.31	0.26	0.17	0.24	0.17	0.22	0.15	0.25	1.04	0.73	0.27	0.39	0.37	0.20	0.27	0.20
C5	0.20	0.17	0.17	0.10	0.15	0.11	0.32	0.23	0.44	0.23	0.33	0.26	0.15	0.36	0.12	0.36	0.31	0.12	0.37	0.61	0.12	0.27	0.17
C5'	0.42	0.14	0.58	0.45	0.17	0.33	0.15	0.30	0.24	0.15	0.22	0.21	0.23	0.15	0.23	1.01	0.72	0.26	0.38	0.37	0.19	0.25	0.19
C6	0.16	0.18	0.21	0.11	0.20	0.08	0.37	0.24	0.46	0.31	0.30	0.25	0.16	0.44	0.17	0.25	0.24	0.10	0.36	0.62	0.11	0.27	0.17
C8	0.27	0.14	0.30	0.20	0.13	0.17	0.26	0.24	0.40	0.16	0.33	0.23	0.16	0.28	0.12	0.57	0.42	0.15	0.34	0.56	0.15	0.23	0.15
N1	0.16	0.19	0.25	0.15	0.20	0.08	0.33	0.26	0.37	0.29	0.24	0.24	0.18	0.40	0.18	0.25	0.18	0.08	0.33	0.49	0.11	0.26	0.15
N2	0.16	0.12	0.16	0.11	0.06	0.08	0.12	0.26	0.17	0.12	0.11	0.16	0.12	0.17	0.08	0.18	0.14	0.10	0.32	0.27	0.12	0.26	0.14
N3	0.28	0.11	0.25	0.16	0.07	0.13	0.16	0.24	0.26	0.10	0.20	0.19	0.15	0.18	0.13	0.48	0.32	0.14	0.35	0.37	0.14	0.27	0.16
N7	0.21	0.17	0.20	0.12	0.16	0.13	0.33	0.22	0.47	0.23	0.35	0.27	0.15	0.37	0.12	0.42	0.35	0.13	0.37	0.65	0.13	0.28	0.18
N9	0.31	0.11	0.35	0.25	0.10	0.19	0.20	0.24	0.33	0.11	0.29	0.18	0.16	0.21	0.14	0.66	0.46	0.17	0.34	0.46	0.16	0.24	0.15
O2'	0.54	0.24	0.72	0.59	0.27	0.44	0.25	0.36	0.31	0.28	0.31	0.25	0.27	0.24	0.35	1.19	0.84	0.35	0.45	0.37	0.23	0.35	0.28
O3'	0.53	0.14	0.68	0.59	0.20	0.45	0.18	0.33	0.29	0.21	0.26	0.13	0.22	0.18	0.30	1.20	0.90	0.36	0.47	0.40	0.22	0.33	0.27
O4'	0.41	0.15	0.57	0.40	0.19	0.29	0.15	0.29	0.24	0.18	0.23	0.21	0.24	0.15	0.24	0.93	0.60	0.24	0.33	0.35	0.19	0.23	0.16
O5'	0.35	0.11	0.47	0.36	0.12	0.30	0.20	0.31	0.34	0.13	0.29	0.14	0.15	0.21	0.16	0.86	0.61	0.23	0.36	0.49	0.22	0.21	0.18
O6	0.17	0.19	0.31	0.18	0.25	0.08	0.43	0.26	0.49	0.40	0.30	0.25	0.17	0.53	0.24	0.30	0.21	0.08	0.33	0.69	0.12	0.26	0.17
OP1	0.35	0.10	0.49	0.40	0.10	0.32	0.19	0.32	0.33	0.12	0.27	0.11	0.14	0.21	0.15	0.91	0.70	0.24	0.38	0.49	0.23	0.23	0.19
OP2	0.34	0.16	0.41	0.27	0.19	0.22	0.26	0.27	0.38	0.21	0.30	0.22	0.19	0.29	0.18	0.75	0.49	0.19	0.24	0.56	0.24	0.12	0.11
P	0.35	0.13	0.46	0.36	0.15	0.30	0.22	0.31	0.34	0.17	0.28	0.17	0.18	0.23	0.18	0.83	0.62	0.24	0.35	0.50	0.23	0.18	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.07	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.03	0.01	0.06	0.23	0.01	0.13	0.04	0.07	0.26	0.10
C2	0.04	0.00	0.13	0.06	0.06	0.16	0.02	0.25	0.06	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.19	0.33	0.20	0.17	0.05	0.15	0.22	0.03
C2'	0.02	0.13	0.00	0.01	0.07	0.01	0.12	0.16	0.10	0.20	0.11	0.17	0.13	0.20	0.09	0.01	0.05	0.02	0.35	0.11	0.33	0.51	0.36
C3'	0.03	0.06	0.01	0.00	0.08	0.01	0.16	0.04	0.13	0.24	0.09	0.09	0.06	0.25	0.11	0.07	0.01	0.02	0.25	0.15	0.25	0.19	0.18
C4	0.03	0.06	0.07	0.08	0.00	0.06	0.01	0.13	0.02	0.01	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.13	0.23	0.10	0.18	0.01	0.09	0.28	0.10
C4'	0.02	0.16	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.04	0.14	0.10	0.20	0.16	0.12	0.04	0.18	0.06	0.02	0.02	0.08	0.17	0.07	0.05
C5	0.02	0.02	0.12	0.16	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.06	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.18	0.10	0.05	0.15	0.04	0.12	0.29	0.13
C5'	0.07	0.25	0.16	0.04	0.13	0.01	0.10	0.00	0.13	0.13	0.20	0.30	0.23	0.09	0.07	0.06	0.16	0.02	0.01	0.14	0.15	0.13	0.06
C6	0.02	0.06	0.10	0.13	0.02	0.04	0.01	0.13	0.00	0.05	0.03	0.05	0.08	0.01	0.02	0.14	0.16	0.08	0.20	0.00	0.13	0.31	0.15
C8	0.01	0.06	0.20	0.24	0.01	0.14	0.06	0.13	0.05	0.00	0.06	0.04	0.03	0.06	0.01	0.35	0.13	0.11	0.17	0.02	0.17	0.35	0.19
N1	0.03	0.02	0.11	0.09	0.06	0.10	0.01	0.20	0.03	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.10	0.25	0.14	0.17	0.02	0.13	0.26	0.09
N2	0.04	0.01	0.17	0.09	0.03	0.20	0.03	0.30	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.32	0.43	0.23	0.19	0.03	0.19	0.20	0.03
N3	0.04	0.01	0.13	0.06	0.01	0.16	0.05	0.23	0.08	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.20	0.33	0.21	0.17	0.08	0.13	0.23	0.04
N7	0.03	0.01	0.20	0.25	0.00	0.12	0.01	0.09	0.01	0.06	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.34	0.11	0.07	0.16	0.06	0.16	0.33	0.18
N9	0.01	0.05	0.09	0.11	0.01	0.04	0.03	0.07	0.02	0.01	0.05	0.03	0.03	0.03	0.00	0.14	0.12	0.03	0.15	0.02	0.09	0.29	0.13
O2'	0.06	0.19	0.01	0.07	0.13	0.18	0.18	0.06	0.14	0.35	0.10	0.32	0.20	0.34	0.14	0.00	0.16	0.13	0.33	0.20	0.28	0.62	0.37
O3'	0.23	0.33	0.05	0.01	0.23	0.06	0.10	0.16	0.16	0.13	0.25	0.43	0.33	0.11	0.12	0.16	0.00	0.17	0.24	0.14	0.31	0.18	0.20
O4'	0.01	0.20	0.02	0.02	0.10	0.02	0.05	0.02	0.08	0.11	0.14	0.23	0.21	0.07	0.03	0.13	0.17	0.00	0.19	0.11	0.18	0.25	0.20
O5'	0.13	0.17	0.35	0.25	0.18	0.02	0.15	0.01	0.20	0.17	0.17	0.19	0.17	0.16	0.15	0.33	0.24	0.19	0.00	0.28	0.11	0.04	0.01
O6	0.04	0.05	0.11	0.15	0.01	0.08	0.04	0.14	0.00	0.02	0.02	0.03	0.08	0.06	0.02	0.20	0.14	0.11	0.28	0.00	0.20	0.41	0.25
OP1	0.07	0.15	0.33	0.25	0.09	0.17	0.12	0.15	0.13	0.17	0.13	0.19	0.13	0.16	0.09	0.28	0.31	0.18	0.11	0.20	0.00	0.05	0.01
OP2	0.26	0.22	0.51	0.19	0.28	0.07	0.29	0.13	0.31	0.35	0.26	0.20	0.23	0.33	0.29	0.62	0.18	0.25	0.04	0.41	0.05	0.00	0.02
P	0.10	0.03	0.36	0.18	0.10	0.05	0.13	0.06	0.15	0.19	0.09	0.03	0.04	0.18	0.13	0.37	0.20	0.20	0.01	0.25	0.01	0.02	0.00