Doublet Group distance statistics: 53617

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.006, 0.009, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C8	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.023 std_dev=0.011
O6	A	0, 0.009, 0.022, 0.034, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.014
O4'	A	0, 0.010, 0.162, 0.315, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.162 std_dev=0.153
O2'	A	0, 0.037, 0.190, 0.343, 0.488 max_d=0.488 avg_d=0.190 std_dev=0.153
C2'	A	0, -0.043, 0.111, 0.265, 0.478 max_d=0.478 avg_d=0.111 std_dev=0.154
C4'	A	0, 0.095, 0.342, 0.588, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.342 std_dev=0.246
C3'	A	0, 0.066, 0.313, 0.560, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.313 std_dev=0.247
P	B	0, 0.181, 0.438, 0.695, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.438 std_dev=0.257
O3'	A	0, 0.149, 0.518, 0.887, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.518 std_dev=0.369
C5'	A	0, 0.121, 0.516, 0.911, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.516 std_dev=0.395
OP2	B	0, 0.121, 0.528, 0.936, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.528 std_dev=0.408
OP2	A	0, 0.046, 0.506, 0.966, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.506 std_dev=0.460
OP1	B	0, 0.231, 0.730, 1.228, 1.598 max_d=1.598 avg_d=0.730 std_dev=0.499
O5'	A	0, 0.096, 0.681, 1.265, 1.865 max_d=1.865 avg_d=0.681 std_dev=0.585
P	A	0, -0.011, 0.649, 1.309, 2.145 max_d=2.145 avg_d=0.649 std_dev=0.660
OP1	A	0, -0.008, 1.057, 2.122, 3.454 max_d=3.454 avg_d=1.057 std_dev=1.065
O5'	B	0, -0.210, 0.856, 1.922, 3.415 max_d=3.415 avg_d=0.856 std_dev=1.066
C5'	B	0, -0.647, 1.196, 3.039, 5.676 max_d=5.676 avg_d=1.196 std_dev=1.843
C4'	B	0, -1.092, 1.549, 4.190, 7.991 max_d=7.991 avg_d=1.549 std_dev=2.641
C3'	B	0, -1.137, 1.641, 4.419, 8.413 max_d=8.413 avg_d=1.641 std_dev=2.778
O4'	B	0, -1.501, 1.706, 4.912, 9.542 max_d=9.542 avg_d=1.706 std_dev=3.206
O3'	B	0, -1.249, 1.991, 5.231, 9.878 max_d=9.878 avg_d=1.991 std_dev=3.240
C2'	B	0, -1.565, 1.971, 5.506, 10.600 max_d=10.600 avg_d=1.971 std_dev=3.535
C1'	B	0, -1.789, 1.991, 5.771, 11.229 max_d=11.229 avg_d=1.991 std_dev=3.780
N9	B	0, -1.978, 2.059, 6.097, 11.931 max_d=11.931 avg_d=2.059 std_dev=4.037
C8	B	0, -2.026, 2.031, 6.088, 11.956 max_d=11.956 avg_d=2.031 std_dev=4.057
O2'	B	0, -1.821, 2.439, 6.700, 12.829 max_d=12.829 avg_d=2.439 std_dev=4.260
N7	B	0, -2.241, 2.194, 6.629, 13.046 max_d=13.046 avg_d=2.194 std_dev=4.435
C4	B	0, -2.192, 2.256, 6.705, 13.130 max_d=13.130 avg_d=2.256 std_dev=4.448
N3	B	0, -2.219, 2.376, 6.971, 13.602 max_d=13.602 avg_d=2.376 std_dev=4.595
C5	B	0, -2.386, 2.354, 7.093, 13.946 max_d=13.946 avg_d=2.354 std_dev=4.740
C2	B	0, -2.512, 2.634, 7.780, 15.208 max_d=15.208 avg_d=2.634 std_dev=5.146
C6	B	0, -2.717, 2.628, 7.973, 15.701 max_d=15.701 avg_d=2.628 std_dev=5.345
N2	B	0, -2.567, 2.838, 8.242, 16.036 max_d=16.036 avg_d=2.838 std_dev=5.405
N1	B	0, -2.779, 2.760, 8.299, 16.300 max_d=16.300 avg_d=2.760 std_dev=5.539
O6	B	0, -2.940, 2.790, 8.521, 16.809 max_d=16.809 avg_d=2.790 std_dev=5.730

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.20	0.01	0.19	0.21	0.07
C2	0.02	0.00	0.09	0.14	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.18	0.01	0.33	0.00	0.31	0.17	0.13
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.06	0.11	0.09	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.03	0.23	0.25	0.04
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.09	0.11	0.12	0.17	0.13	0.10	0.05	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.26	0.28	0.03
C4	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.09	0.01	0.33	0.01	0.27	0.18	0.12
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.09	0.07	0.09	0.07	0.09	0.04	0.03	0.03	0.00	0.00	0.08	0.21	0.26	0.04
C5	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.10	0.02	0.37	0.01	0.27	0.18	0.14
C5'	0.02	0.12	0.01	0.02	0.10	0.00	0.14	0.00	0.15	0.15	0.13	0.12	0.10	0.16	0.08	0.03	0.06	0.01	0.01	0.17	0.28	0.28	0.02
C6	0.01	0.00	0.03	0.09	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.12	0.02	0.38	0.00	0.29	0.18	0.16
C8	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.12	0.02	0.35	0.01	0.21	0.19	0.12
N1	0.02	0.00	0.06	0.12	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.15	0.01	0.37	0.00	0.32	0.17	0.15
N2	0.02	0.00	0.11	0.17	0.00	0.09	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.22	0.02	0.31	0.00	0.33	0.17	0.13
N3	0.02	0.00	0.09	0.13	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.16	0.01	0.30	0.00	0.29	0.18	0.12
N7	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.12	0.02	0.38	0.01	0.23	0.18	0.15
N9	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.31	0.01	0.23	0.19	0.11
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.03	0.03	0.03	0.05	0.02	0.08	0.11	0.09	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.04	0.05	0.18	0.24	0.06
O3'	0.01	0.18	0.01	0.01	0.09	0.03	0.10	0.06	0.12	0.12	0.15	0.22	0.16	0.12	0.05	0.03	0.00	0.02	0.13	0.13	0.25	0.32	0.07
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.20	0.02	0.17	0.21	0.07
O5'	0.20	0.33	0.10	0.04	0.33	0.00	0.37	0.01	0.38	0.35	0.37	0.31	0.30	0.38	0.31	0.04	0.13	0.20	0.00	0.40	0.01	0.00	0.00
O6	0.01	0.00	0.03	0.10	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.13	0.02	0.40	0.00	0.29	0.18	0.17
OP1	0.19	0.31	0.23	0.26	0.27	0.21	0.27	0.28	0.29	0.21	0.32	0.33	0.29	0.23	0.23	0.18	0.25	0.17	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.17	0.25	0.28	0.18	0.26	0.18	0.28	0.18	0.19	0.17	0.17	0.18	0.18	0.19	0.24	0.32	0.21	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.13	0.04	0.03	0.12	0.04	0.14	0.02	0.16	0.12	0.15	0.13	0.12	0.15	0.11	0.06	0.07	0.07	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	1.43	0.32	1.32	1.11	1.01	1.19	1.17	1.11	0.90	1.74	0.49	0.13	0.56	1.60	1.39	1.79	1.06	1.38	0.70	0.98	0.08	0.13	0.23
C2	0.82	0.53	0.78	0.76	0.34	0.78	0.58	0.85	0.27	1.30	0.28	1.04	0.27	1.14	0.82	1.13	0.82	0.82	0.55	0.40	0.09	0.10	0.24
C2'	1.74	0.77	1.56	1.24	1.39	1.36	1.55	1.21	1.32	2.05	0.94	0.36	0.97	1.93	1.73	2.04	1.14	1.66	0.70	1.40	0.17	0.30	0.14
C3'	1.92	0.90	1.75	1.40	1.52	1.51	1.64	1.26	1.39	2.14	1.04	0.51	1.13	2.00	1.87	2.31	1.37	1.81	0.68	1.45	0.20	0.42	0.11
C4	1.09	0.32	1.07	1.00	0.53	1.03	0.70	1.00	0.36	1.41	0.16	0.81	0.09	1.21	1.01	1.53	1.08	1.07	0.63	0.45	0.11	0.11	0.24
C4'	1.77	0.72	1.64	1.32	1.36	1.41	1.48	1.21	1.22	1.99	0.86	0.33	0.96	1.85	1.71	2.19	1.29	1.67	0.69	1.28	0.15	0.31	0.13
C5	0.93	0.71	0.99	1.00	0.24	0.98	0.37	0.92	0.12	1.16	0.56	1.23	0.35	0.91	0.77	1.48	1.21	0.90	0.58	0.12	0.18	0.13	0.24
C5'	1.80	0.63	1.71	1.41	1.30	1.48	1.39	1.22	1.09	1.95	0.73	0.25	0.91	1.77	1.69	2.32	1.46	1.68	0.68	1.12	0.19	0.37	0.16
C6	0.67	1.08	0.78	0.88	0.15	0.81	0.13	0.78	0.39	0.93	0.91	1.63	0.69	0.66	0.51	1.24	1.16	0.65	0.50	0.32	0.23	0.15	0.24
C8	1.20	0.33	1.22	1.15	0.53	1.15	0.64	1.05	0.27	1.37	0.23	0.80	0.12	1.13	1.04	1.77	1.30	1.14	0.65	0.31	0.14	0.12	0.25
N1	0.61	0.98	0.67	0.76	0.11	0.71	0.20	0.74	0.24	1.00	0.76	1.53	0.66	0.78	0.53	1.07	0.96	0.60	0.48	0.15	0.20	0.14	0.24
N2	0.70	0.45	0.61	0.57	0.36	0.60	0.67	0.74	0.40	1.35	0.16	0.96	0.26	1.24	0.80	0.88	0.55	0.71	0.51	0.58	0.07	0.09	0.24
N3	1.07	0.19	0.99	0.89	0.62	0.95	0.84	0.97	0.54	1.51	0.11	0.66	0.11	1.35	1.07	1.37	0.89	1.07	0.62	0.66	0.07	0.11	0.24
N7	1.01	0.68	1.09	1.10	0.27	1.06	0.36	0.96	0.14	1.16	0.57	1.18	0.30	0.89	0.81	1.64	1.33	0.96	0.60	0.13	0.19	0.13	0.24
N9	1.26	0.12	1.22	1.10	0.71	1.14	0.85	1.07	0.53	1.53	0.13	0.55	0.24	1.33	1.17	1.71	1.15	1.22	0.67	0.60	0.10	0.12	0.24
O2'	1.77	1.05	1.54	1.17	1.58	1.30	1.77	1.19	1.60	2.16	1.25	0.68	1.20	2.11	1.84	1.96	0.95	1.69	0.73	1.71	0.21	0.25	0.18
O3'	2.17	1.33	1.95	1.50	1.86	1.62	1.98	1.30	1.77	2.38	1.47	0.98	1.52	2.28	2.14	2.52	1.41	2.01	0.68	1.83	0.28	0.56	0.13
O4'	1.49	0.37	1.40	1.17	1.04	1.24	1.18	1.13	0.90	1.75	0.51	0.11	0.62	1.60	1.43	1.91	1.14	1.42	0.69	0.97	0.09	0.16	0.22
O5'	1.46	0.27	1.38	1.12	0.92	1.16	1.00	0.93	0.69	1.59	0.34	0.26	0.54	1.40	1.33	2.00	1.18	1.33	0.44	0.72	0.32	0.46	0.12
O6	0.49	1.45	0.66	0.83	0.42	0.71	0.30	0.65	0.76	0.68	1.31	2.04	1.01	0.37	0.28	1.14	1.23	0.45	0.42	0.71	0.29	0.18	0.23
OP1	1.45	0.21	1.38	1.11	0.88	1.15	0.94	0.89	0.61	1.56	0.26	0.33	0.49	1.35	1.30	2.03	1.22	1.32	0.35	0.63	0.33	0.59	0.21
OP2	1.60	0.15	1.62	1.45	0.89	1.45	0.93	1.21	0.53	1.65	0.18	0.42	0.47	1.38	1.38	2.27	1.65	1.49	0.74	0.53	0.13	0.14	0.25
P	1.53	0.22	1.49	1.27	0.92	1.30	0.99	1.07	0.64	1.64	0.27	0.31	0.52	1.41	1.36	2.12	1.39	1.41	0.58	0.65	0.09	0.29	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.22	0.00	0.23	0.01	0.17	0.26	0.19
C2	0.01	0.00	0.06	0.20	0.01	0.54	0.01	1.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.13	0.47	0.59	0.02	1.02	0.16	0.58
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.14	0.04	0.03	0.05	0.06	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.19	0.06	0.05
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.03	0.00	0.19	0.00	0.12	0.41	0.06	0.33	0.21	0.37	0.17	0.02	0.01	0.02	0.02	0.18	0.13	0.19	0.08
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.20	0.00	0.41	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.06	0.24	0.13	0.01	0.29	0.57	0.20
C4'	0.01	0.54	0.01	0.00	0.20	0.00	0.03	0.00	0.14	0.38	0.37	0.72	0.53	0.28	0.06	0.23	0.01	0.00	0.01	0.07	0.30	0.20	0.11
C5	0.01	0.01	0.02	0.19	0.00	0.03	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.25	0.06	0.09	0.53	0.01	0.18	1.16	0.67
C5'	0.05	1.05	0.14	0.00	0.41	0.00	0.13	0.00	0.34	0.55	0.75	1.39	0.97	0.39	0.04	0.09	0.16	0.01	0.01	0.21	0.09	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.14	0.00	0.34	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.06	0.19	0.31	0.00	0.12	1.03	0.47
C8	0.01	0.01	0.03	0.41	0.00	0.38	0.00	0.55	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.38	0.11	0.25	1.18	0.02	0.80	1.64	1.32
N1	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.37	0.01	0.75	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.04	0.35	0.21	0.01	0.62	0.43	0.16
N2	0.02	0.00	0.06	0.33	0.01	0.72	0.01	1.39	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.18	0.56	1.02	0.02	1.50	0.64	1.10
N3	0.01	0.00	0.06	0.21	0.00	0.53	0.00	0.97	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.17	0.47	0.52	0.01	0.94	0.17	0.52
N7	0.01	0.01	0.02	0.37	0.00	0.28	0.00	0.39	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.39	0.14	0.14	1.10	0.02	0.78	1.79	1.31
N9	0.01	0.01	0.01	0.17	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.19	0.05	0.01	0.52	0.01	0.12	0.82	0.56
O2'	0.00	0.12	0.00	0.02	0.11	0.23	0.25	0.09	0.22	0.38	0.10	0.24	0.14	0.39	0.19	0.00	0.02	0.16	0.04	0.29	0.07	0.14	0.03
O3'	0.22	0.13	0.01	0.01	0.06	0.01	0.06	0.16	0.06	0.11	0.04	0.18	0.17	0.14	0.05	0.02	0.00	0.14	0.06	0.11	0.06	0.36	0.10
O4'	0.00	0.47	0.01	0.02	0.24	0.00	0.09	0.01	0.19	0.25	0.35	0.56	0.47	0.14	0.01	0.16	0.14	0.00	0.26	0.12	0.22	0.22	0.19
O5'	0.23	0.59	0.03	0.02	0.13	0.01	0.53	0.01	0.31	1.18	0.21	1.02	0.52	1.10	0.52	0.04	0.06	0.26	0.00	0.51	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.02	0.04	0.18	0.01	0.07	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.29	0.11	0.12	0.51	0.00	0.24	1.37	0.73
OP1	0.17	1.02	0.19	0.13	0.29	0.30	0.18	0.09	0.12	0.80	0.62	1.50	0.94	0.78	0.12	0.07	0.06	0.22	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.16	0.06	0.19	0.57	0.20	1.16	0.04	1.03	1.64	0.43	0.64	0.17	1.79	0.82	0.14	0.36	0.22	0.01	1.37	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.58	0.05	0.08	0.20	0.11	0.67	0.01	0.47	1.32	0.16	1.10	0.52	1.31	0.56	0.03	0.10	0.19	0.00	0.73	0.00	0.00	0.00