Doublet Group distance statistics: 53618

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.006
O6	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.001, 0.016, 0.030, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.010, 0.026, 0.042, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.026 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.018 std_dev=0.017
N1	A	0, -0.003, 0.019, 0.042, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.019 std_dev=0.022
N3	A	0, -0.002, 0.023, 0.048, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.023 std_dev=0.025
C2	A	0, -0.005, 0.026, 0.056, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.026 std_dev=0.030
C1'	A	0, -0.007, 0.028, 0.063, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.028 std_dev=0.035
N2	A	0, -0.010, 0.064, 0.138, 0.220 max_d=0.220 avg_d=0.064 std_dev=0.074
P	A	0, 0.254, 0.500, 0.746, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.500 std_dev=0.246
C3'	B	0, 0.288, 0.585, 0.882, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.585 std_dev=0.297
O3'	B	0, 0.287, 0.584, 0.881, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.584 std_dev=0.297
O5'	A	0, 0.173, 0.476, 0.780, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.476 std_dev=0.304
C2'	B	0, 0.297, 0.631, 0.965, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.631 std_dev=0.334
C4'	B	0, 0.309, 0.659, 1.010, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.659 std_dev=0.350
OP1	B	0, 0.071, 0.426, 0.780, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.426 std_dev=0.354
OP2	A	0, 0.251, 0.609, 0.967, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.609 std_dev=0.358
C1'	B	0, 0.340, 0.709, 1.078, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.709 std_dev=0.369
C5'	B	0, 0.273, 0.645, 1.017, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.645 std_dev=0.372
N9	B	0, 0.324, 0.699, 1.074, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.699 std_dev=0.375
C8	B	0, 0.296, 0.674, 1.052, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.674 std_dev=0.378
O4'	B	0, 0.332, 0.713, 1.094, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.713 std_dev=0.381
O5'	B	0, 0.231, 0.614, 0.997, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.614 std_dev=0.383
P	B	0, 0.121, 0.523, 0.924, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.523 std_dev=0.401
O2'	B	0, 0.329, 0.736, 1.142, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.736 std_dev=0.407
OP2	B	0, 0.251, 0.661, 1.071, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.661 std_dev=0.410
N7	B	0, 0.320, 0.731, 1.141, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.731 std_dev=0.411
C4	B	0, 0.353, 0.769, 1.184, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.769 std_dev=0.415
C5	B	0, 0.356, 0.794, 1.232, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.794 std_dev=0.438
O4'	A	0, 0.070, 0.519, 0.967, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.519 std_dev=0.448
N3	B	0, 0.378, 0.827, 1.275, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.827 std_dev=0.449
OP1	A	0, 0.347, 0.815, 1.283, 1.311 max_d=1.311 avg_d=0.815 std_dev=0.468
C2'	A	0, 0.009, 0.509, 1.010, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.509 std_dev=0.501
C6	B	0, 0.403, 0.905, 1.406, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.905 std_dev=0.501
C2	B	0, 0.407, 0.910, 1.412, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.910 std_dev=0.503
C4'	A	0, 0.085, 0.596, 1.106, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.596 std_dev=0.511
C3'	A	0, 0.071, 0.587, 1.104, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.587 std_dev=0.517
N1	B	0, 0.425, 0.951, 1.477, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.951 std_dev=0.526
O6	B	0, 0.438, 0.977, 1.515, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.977 std_dev=0.539
O3'	A	0, 0.072, 0.618, 1.165, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.618 std_dev=0.546
N2	B	0, 0.426, 0.980, 1.533, 1.699 max_d=1.699 avg_d=0.980 std_dev=0.554
O2'	A	0, 0.019, 0.821, 1.622, 2.043 max_d=2.043 avg_d=0.821 std_dev=0.802
C5'	A	0, 0.256, 1.073, 1.890, 2.148 max_d=2.148 avg_d=1.073 std_dev=0.817

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.10	0.04	0.01	0.07	0.11	0.07	0.02	0.01	0.01	0.20	0.00	0.22	0.04	0.26	0.26	0.14
C2	0.08	0.00	0.32	0.13	0.03	0.08	0.02	0.31	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.45	0.16	0.20	0.36	0.01	0.18	0.29	0.17
C2'	0.01	0.32	0.00	0.01	0.15	0.02	0.07	0.17	0.14	0.14	0.25	0.40	0.32	0.08	0.02	0.01	0.03	0.02	0.51	0.10	0.55	0.49	0.50
C3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.05	0.06	0.09	0.18	0.12	0.06	0.02	0.02	0.01	0.02	0.41	0.04	0.46	0.31	0.38
C4	0.03	0.03	0.15	0.05	0.00	0.06	0.01	0.29	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.02	0.24	0.14	0.09	0.32	0.02	0.18	0.29	0.14
C4'	0.02	0.08	0.02	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.08	0.05	0.08	0.12	0.07	0.06	0.03	0.11	0.05	0.00	0.02	0.09	0.23	0.25	0.03
C5	0.03	0.02	0.07	0.04	0.01	0.06	0.00	0.31	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.17	0.13	0.04	0.32	0.01	0.17	0.29	0.14
C5'	0.10	0.31	0.17	0.02	0.29	0.01	0.31	0.00	0.34	0.23	0.34	0.28	0.29	0.28	0.22	0.10	0.12	0.03	0.01	0.36	0.29	0.30	0.02
C6	0.04	0.01	0.14	0.05	0.02	0.08	0.01	0.34	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.26	0.13	0.07	0.34	0.01	0.16	0.29	0.15
C8	0.01	0.04	0.14	0.06	0.02	0.05	0.01	0.23	0.01	0.00	0.03	0.05	0.03	0.00	0.01	0.17	0.13	0.11	0.28	0.01	0.22	0.28	0.13
N1	0.07	0.00	0.25	0.09	0.03	0.08	0.02	0.34	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.38	0.14	0.14	0.35	0.01	0.18	0.28	0.16
N2	0.11	0.00	0.40	0.18	0.04	0.12	0.02	0.28	0.02	0.05	0.02	0.00	0.03	0.02	0.07	0.54	0.18	0.27	0.37	0.03	0.22	0.27	0.20
N3	0.07	0.01	0.32	0.12	0.01	0.07	0.01	0.29	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.04	0.41	0.16	0.21	0.35	0.01	0.18	0.29	0.15
N7	0.02	0.02	0.08	0.06	0.02	0.06	0.00	0.28	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.12	0.12	0.08	0.30	0.01	0.19	0.29	0.13
N9	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.22	0.03	0.01	0.04	0.07	0.04	0.01	0.00	0.08	0.15	0.02	0.27	0.03	0.21	0.28	0.13
O2'	0.01	0.45	0.01	0.02	0.24	0.11	0.17	0.10	0.26	0.17	0.38	0.54	0.41	0.12	0.08	0.00	0.06	0.04	0.45	0.23	0.56	0.58	0.51
O3'	0.20	0.16	0.03	0.01	0.14	0.05	0.13	0.12	0.13	0.13	0.14	0.18	0.16	0.12	0.15	0.06	0.00	0.18	0.26	0.12	0.34	0.22	0.23
O4'	0.00	0.20	0.02	0.02	0.09	0.00	0.04	0.03	0.07	0.11	0.14	0.27	0.21	0.08	0.02	0.04	0.18	0.00	0.34	0.05	0.37	0.43	0.29
O5'	0.22	0.36	0.51	0.41	0.32	0.02	0.32	0.01	0.34	0.28	0.35	0.37	0.35	0.30	0.27	0.45	0.26	0.34	0.00	0.34	0.02	0.01	0.01
O6	0.04	0.01	0.10	0.04	0.02	0.09	0.01	0.36	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.23	0.12	0.05	0.34	0.00	0.17	0.28	0.15
OP1	0.26	0.18	0.55	0.46	0.18	0.23	0.17	0.29	0.16	0.22	0.18	0.22	0.18	0.19	0.21	0.56	0.34	0.37	0.02	0.17	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.29	0.49	0.31	0.29	0.25	0.29	0.30	0.29	0.28	0.28	0.27	0.29	0.29	0.28	0.58	0.22	0.43	0.01	0.28	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.17	0.50	0.38	0.14	0.03	0.14	0.02	0.15	0.13	0.16	0.20	0.15	0.13	0.13	0.51	0.23	0.29	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.36	0.21	0.15	0.33	0.15	0.41	0.17	0.46	0.33	0.43	0.35	0.31	0.40	0.28	0.24	0.14	0.20	0.20	0.52	0.17	0.22	0.17
C2	0.19	0.13	0.18	0.15	0.18	0.17	0.20	0.21	0.19	0.27	0.15	0.12	0.14	0.27	0.21	0.17	0.15	0.19	0.21	0.24	0.26	0.26	0.24
C2'	0.51	0.49	0.49	0.51	0.53	0.52	0.56	0.53	0.56	0.56	0.52	0.46	0.50	0.58	0.53	0.44	0.52	0.53	0.53	0.58	0.51	0.44	0.49
C3'	0.49	0.58	0.50	0.45	0.53	0.42	0.52	0.36	0.54	0.45	0.57	0.60	0.56	0.46	0.49	0.51	0.47	0.45	0.33	0.54	0.20	0.18	0.19
C4	0.23	0.26	0.22	0.15	0.28	0.17	0.35	0.19	0.38	0.33	0.32	0.23	0.24	0.39	0.27	0.23	0.14	0.21	0.21	0.43	0.23	0.26	0.23
C4'	0.43	0.65	0.43	0.29	0.54	0.25	0.53	0.15	0.59	0.39	0.64	0.69	0.60	0.43	0.45	0.45	0.24	0.33	0.17	0.58	0.24	0.27	0.17
C5	0.23	0.23	0.21	0.15	0.28	0.17	0.36	0.21	0.38	0.35	0.30	0.20	0.23	0.41	0.28	0.23	0.13	0.22	0.23	0.45	0.27	0.30	0.27
C5'	0.69	0.90	0.73	0.52	0.79	0.43	0.72	0.25	0.76	0.58	0.85	0.95	0.88	0.59	0.70	0.72	0.43	0.56	0.27	0.71	0.35	0.38	0.27
C6	0.22	0.17	0.20	0.15	0.23	0.19	0.29	0.23	0.26	0.32	0.19	0.14	0.19	0.36	0.25	0.21	0.13	0.22	0.24	0.32	0.31	0.32	0.30
C8	0.24	0.34	0.21	0.14	0.34	0.16	0.43	0.19	0.49	0.36	0.43	0.30	0.30	0.44	0.30	0.26	0.13	0.22	0.22	0.57	0.23	0.27	0.24
N1	0.20	0.12	0.19	0.15	0.18	0.19	0.20	0.23	0.17	0.28	0.13	0.11	0.15	0.29	0.22	0.18	0.15	0.21	0.24	0.21	0.31	0.31	0.29
N2	0.15	0.08	0.14	0.15	0.11	0.18	0.11	0.22	0.12	0.18	0.10	0.08	0.09	0.16	0.15	0.13	0.17	0.17	0.21	0.17	0.26	0.25	0.22
N3	0.21	0.20	0.20	0.15	0.23	0.16	0.28	0.18	0.29	0.29	0.25	0.19	0.20	0.32	0.24	0.20	0.15	0.20	0.21	0.34	0.21	0.24	0.20
N7	0.24	0.29	0.21	0.14	0.32	0.17	0.41	0.20	0.46	0.36	0.38	0.25	0.27	0.44	0.29	0.24	0.12	0.22	0.23	0.55	0.26	0.30	0.26
N9	0.23	0.32	0.22	0.14	0.32	0.16	0.40	0.18	0.44	0.34	0.39	0.29	0.28	0.41	0.28	0.25	0.13	0.21	0.21	0.51	0.20	0.25	0.21
O2'	0.39	0.33	0.35	0.44	0.41	0.47	0.50	0.56	0.50	0.54	0.42	0.27	0.33	0.57	0.44	0.28	0.45	0.45	0.60	0.57	0.68	0.60	0.62
O3'	0.47	0.67	0.48	0.37	0.57	0.33	0.57	0.26	0.64	0.45	0.68	0.71	0.62	0.50	0.49	0.50	0.36	0.39	0.26	0.65	0.12	0.15	0.12
O4'	0.23	0.52	0.21	0.15	0.41	0.16	0.45	0.22	0.53	0.31	0.56	0.55	0.45	0.39	0.30	0.25	0.16	0.18	0.24	0.56	0.31	0.33	0.27
O5'	0.21	0.38	0.16	0.17	0.37	0.15	0.46	0.21	0.50	0.41	0.46	0.35	0.33	0.48	0.32	0.14	0.03	0.20	0.32	0.56	0.23	0.31	0.27
O6	0.23	0.17	0.20	0.15	0.23	0.20	0.27	0.24	0.24	0.32	0.17	0.16	0.19	0.36	0.25	0.21	0.14	0.23	0.26	0.29	0.35	0.35	0.33
OP1	0.04	0.20	0.05	0.04	0.13	0.12	0.18	0.19	0.23	0.12	0.23	0.22	0.15	0.17	0.07	0.11	0.02	0.09	0.22	0.28	0.33	0.25	0.23
OP2	0.07	0.17	0.09	0.05	0.16	0.10	0.21	0.19	0.24	0.17	0.22	0.16	0.14	0.21	0.13	0.05	0.02	0.08	0.22	0.28	0.21	0.11	0.12
P	0.03	0.16	0.03	0.02	0.14	0.02	0.19	0.06	0.23	0.14	0.21	0.16	0.12	0.19	0.09	0.07	0.01	0.03	0.15	0.28	0.16	0.12	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.06	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.04	0.10	0.16	0.09
C2	0.05	0.00	0.07	0.10	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.11	0.06	0.09	0.01	0.09	0.15	0.08
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.06	0.02	0.07	0.08	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.16	0.19	0.12
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.03	0.13	0.06	0.12	0.11	0.08	0.09	0.05	0.01	0.01	0.01	0.09	0.15	0.18	0.15	0.11
C4	0.02	0.02	0.04	0.08	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.03	0.08	0.03	0.08	0.17	0.09
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.07	0.07	0.05	0.07	0.05	0.07	0.02	0.06	0.02	0.00	0.02	0.11	0.12	0.07	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.06	0.00	0.07	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.13	0.03	0.11	0.04	0.07	0.13	0.06
C5'	0.03	0.06	0.03	0.03	0.04	0.01	0.07	0.00	0.09	0.07	0.07	0.07	0.06	0.08	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.14	0.12	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.06	0.13	0.02	0.07	0.02	0.09	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.06	0.16	0.04	0.14	0.00	0.09	0.09	0.07
C8	0.02	0.02	0.02	0.06	0.01	0.07	0.02	0.07	0.04	0.00	0.04	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.06	0.09	0.07	0.06	0.16	0.06
N1	0.03	0.01	0.07	0.12	0.02	0.05	0.02	0.07	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.07	0.14	0.04	0.12	0.02	0.09	0.11	0.07
N2	0.06	0.01	0.08	0.11	0.02	0.07	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.10	0.11	0.07	0.09	0.02	0.10	0.15	0.09
N3	0.05	0.01	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.06	0.08	0.01	0.09	0.17	0.10
N7	0.02	0.02	0.03	0.09	0.00	0.07	0.01	0.08	0.04	0.00	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.12	0.05	0.12	0.07	0.06	0.12	0.05
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.07	0.05	0.08	0.18	0.10
O2'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.04	0.06	0.04	0.05	0.06	0.02	0.07	0.10	0.07	0.03	0.02	0.00	0.03	0.06	0.05	0.06	0.14	0.14	0.07
O3'	0.02	0.11	0.01	0.01	0.09	0.02	0.13	0.04	0.16	0.08	0.14	0.11	0.08	0.12	0.06	0.03	0.00	0.02	0.10	0.19	0.18	0.13	0.09
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.06	0.04	0.07	0.06	0.05	0.01	0.06	0.02	0.00	0.06	0.07	0.07	0.14	0.07
O5'	0.07	0.09	0.09	0.09	0.08	0.02	0.11	0.01	0.14	0.09	0.12	0.09	0.08	0.12	0.07	0.05	0.10	0.06	0.00	0.19	0.02	0.02	0.01
O6	0.04	0.01	0.07	0.15	0.03	0.11	0.04	0.14	0.00	0.07	0.02	0.02	0.01	0.07	0.05	0.06	0.19	0.07	0.19	0.00	0.13	0.09	0.12
OP1	0.10	0.09	0.16	0.18	0.08	0.12	0.07	0.12	0.09	0.06	0.09	0.10	0.09	0.06	0.08	0.14	0.18	0.07	0.02	0.13	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.15	0.19	0.15	0.17	0.07	0.13	0.02	0.09	0.16	0.11	0.15	0.17	0.12	0.18	0.14	0.13	0.14	0.02	0.09	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.08	0.12	0.11	0.09	0.04	0.06	0.02	0.07	0.06	0.07	0.09	0.10	0.05	0.10	0.07	0.09	0.07	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00