Doublet Group distance statistics: 53621

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.005
O6	A	0, 0.005, 0.023, 0.041, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.023 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.002, 0.019, 0.037, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.002, 0.022, 0.043, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.022 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.005, 0.027, 0.050, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.022
N1	A	0, -0.005, 0.018, 0.040, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.018 std_dev=0.023
C2	A	0, -0.003, 0.020, 0.043, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.020 std_dev=0.023
N3	A	0, -0.001, 0.023, 0.046, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.023 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.004, 0.028, 0.052, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.028 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C1'	A	0, -0.004, 0.025, 0.054, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.025 std_dev=0.029
C2'	A	0, 0.000, 0.037, 0.074, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.037 std_dev=0.037
O4'	A	0, 0.002, 0.045, 0.089, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.045 std_dev=0.043
N2	A	0, 0.001, 0.045, 0.090, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.045 std_dev=0.044
O2'	A	0, -0.012, 0.105, 0.223, 0.269 max_d=0.269 avg_d=0.105 std_dev=0.118
P	B	0, -0.033, 0.119, 0.271, 0.334 max_d=0.334 avg_d=0.119 std_dev=0.152
C4'	A	0, -0.055, 0.149, 0.352, 0.437 max_d=0.437 avg_d=0.149 std_dev=0.204
C3'	A	0, -0.059, 0.164, 0.386, 0.478 max_d=0.478 avg_d=0.164 std_dev=0.222
OP2	B	0, -0.035, 0.194, 0.424, 0.517 max_d=0.517 avg_d=0.194 std_dev=0.230
C5'	A	0, -0.074, 0.217, 0.509, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.217 std_dev=0.292
O5'	A	0, -0.080, 0.266, 0.611, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.266 std_dev=0.346
O3'	A	0, -0.112, 0.300, 0.712, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.300 std_dev=0.412
O5'	B	0, -0.119, 0.350, 0.819, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.350 std_dev=0.469
P	A	0, -0.129, 0.342, 0.814, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.342 std_dev=0.472
OP1	B	0, -0.138, 0.435, 1.008, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.435 std_dev=0.573
OP1	A	0, -0.213, 0.598, 1.409, 1.744 max_d=1.744 avg_d=0.598 std_dev=0.811
OP2	A	0, -0.216, 0.612, 1.441, 1.783 max_d=1.783 avg_d=0.612 std_dev=0.828
C2'	B	0, -0.432, 1.119, 2.671, 3.314 max_d=3.314 avg_d=1.119 std_dev=1.552
C5'	B	0, -0.457, 1.164, 2.785, 3.456 max_d=3.456 avg_d=1.164 std_dev=1.621
C3'	B	0, -0.474, 1.228, 2.930, 3.635 max_d=3.635 avg_d=1.228 std_dev=1.702
O2'	B	0, -0.501, 1.336, 3.173, 3.933 max_d=3.933 avg_d=1.336 std_dev=1.837
C8	B	0, -0.533, 1.373, 3.280, 4.070 max_d=4.070 avg_d=1.373 std_dev=1.907
C1'	B	0, -0.579, 1.445, 3.469, 4.307 max_d=4.307 avg_d=1.445 std_dev=2.024
C4'	B	0, -0.576, 1.453, 3.482, 4.323 max_d=4.323 avg_d=1.453 std_dev=2.029
N9	B	0, -0.590, 1.490, 3.570, 4.432 max_d=4.432 avg_d=1.490 std_dev=2.080
O4'	B	0, -0.627, 1.557, 3.741, 4.646 max_d=4.646 avg_d=1.557 std_dev=2.184
N7	B	0, -0.699, 1.812, 4.324, 5.363 max_d=5.363 avg_d=1.812 std_dev=2.511
O3'	B	0, -0.756, 1.933, 4.623, 5.736 max_d=5.736 avg_d=1.933 std_dev=2.689
C4	B	0, -0.772, 1.920, 4.611, 5.726 max_d=5.726 avg_d=1.920 std_dev=2.692
C5	B	0, -0.808, 2.051, 4.911, 6.095 max_d=6.095 avg_d=2.051 std_dev=2.860
N3	B	0, -0.943, 2.294, 5.531, 6.872 max_d=6.872 avg_d=2.294 std_dev=3.237
C6	B	0, -1.007, 2.527, 6.061, 7.525 max_d=7.525 avg_d=2.527 std_dev=3.534
C2	B	0, -1.091, 2.651, 6.393, 7.944 max_d=7.944 avg_d=2.651 std_dev=3.742
N1	B	0, -1.106, 2.738, 6.582, 8.174 max_d=8.174 avg_d=2.738 std_dev=3.844
O6	B	0, -1.119, 2.857, 6.832, 8.478 max_d=8.478 avg_d=2.857 std_dev=3.975
N2	B	0, -1.239, 3.114, 7.467, 9.270 max_d=9.270 avg_d=3.114 std_dev=4.353

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.05	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.10	0.18	0.04
C2	0.05	0.00	0.03	0.07	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.09	0.05	0.08	0.01	0.09	0.43	0.18
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.12	0.03
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.11	0.01	0.15	0.02	0.14	0.14	0.11	0.04	0.05	0.16	0.10	0.05	0.02	0.01	0.04	0.16	0.02	0.08	0.05
C4	0.02	0.01	0.02	0.11	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.12	0.02	0.08	0.01	0.09	0.41	0.18
C4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.10	0.04	0.02	0.00	0.11	0.05	0.01	0.04	0.01	0.03	0.10	0.12	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.15	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.02	0.15	0.00	0.21	0.53	0.26
C5'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.08	0.01	0.13	0.00	0.14	0.14	0.09	0.02	0.02	0.17	0.07	0.03	0.05	0.01	0.01	0.17	0.09	0.05	0.01
C6	0.02	0.00	0.01	0.14	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.19	0.02	0.17	0.00	0.26	0.58	0.29
C8	0.01	0.01	0.04	0.14	0.00	0.10	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.15	0.00	0.11	0.01	0.14	0.43	0.21
N1	0.04	0.00	0.02	0.11	0.02	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.15	0.04	0.13	0.01	0.19	0.52	0.24
N2	0.05	0.00	0.05	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.11	0.05	0.05	0.06	0.01	0.06	0.40	0.16
N3	0.04	0.01	0.02	0.05	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.06	0.05	0.04	0.01	0.03	0.35	0.13
N7	0.00	0.01	0.04	0.16	0.00	0.11	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.00	0.17	0.01	0.25	0.57	0.29
N9	0.01	0.02	0.03	0.10	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.01	0.04	0.01	0.03	0.33	0.13
O2'	0.00	0.08	0.00	0.05	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.07	0.11	0.07	0.01	0.01	0.00	0.10	0.02	0.03	0.03	0.14	0.08	0.00
O3'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.12	0.04	0.18	0.05	0.19	0.15	0.15	0.05	0.06	0.20	0.09	0.10	0.00	0.04	0.07	0.23	0.01	0.02	0.04
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.05	0.05	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.11	0.01	0.17	0.08	0.03
O5'	0.04	0.08	0.01	0.04	0.08	0.03	0.15	0.01	0.17	0.11	0.13	0.06	0.04	0.17	0.04	0.03	0.07	0.11	0.00	0.21	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.02	0.16	0.01	0.10	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.23	0.01	0.21	0.00	0.34	0.66	0.34
OP1	0.10	0.09	0.07	0.02	0.09	0.12	0.21	0.09	0.26	0.14	0.19	0.06	0.03	0.25	0.03	0.14	0.01	0.17	0.02	0.34	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.43	0.12	0.08	0.41	0.02	0.53	0.05	0.58	0.43	0.52	0.40	0.35	0.57	0.33	0.08	0.02	0.08	0.01	0.66	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.18	0.03	0.05	0.18	0.01	0.26	0.01	0.29	0.21	0.24	0.16	0.13	0.29	0.13	0.00	0.04	0.03	0.00	0.34	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	1.83	2.81	1.40	1.00	1.85	1.44	1.13	0.80	1.21	0.65	2.13	3.46	2.66	0.35	1.49	1.67	1.33	2.00	0.37	0.50	0.23	0.01	0.12
C2	1.65	2.40	1.36	0.72	2.00	1.03	1.66	0.52	1.74	1.05	2.15	2.55	2.35	1.00	1.63	1.47	0.71	1.64	0.28	1.33	0.15	0.00	0.09
C2'	1.75	2.34	1.43	1.19	1.55	1.63	0.72	1.00	0.67	0.39	1.57	2.97	2.35	0.03	1.28	1.64	1.59	2.03	0.41	0.09	0.17	0.03	0.09
C3'	1.72	2.39	1.43	1.21	1.53	1.64	0.73	1.02	0.73	0.36	1.64	3.08	2.35	0.03	1.25	1.63	1.64	2.00	0.37	0.00	0.05	0.10	0.01
C4	1.76	2.90	1.38	0.79	2.11	1.18	1.67	0.61	1.89	0.97	2.57	3.26	2.70	0.88	1.66	1.56	0.90	1.82	0.30	1.41	0.16	0.01	0.09
C4'	1.81	2.59	1.44	1.17	1.66	1.62	0.87	0.96	0.89	0.48	1.84	3.37	2.50	0.11	1.36	1.71	1.62	2.05	0.40	0.14	0.14	0.05	0.07
C5	1.72	2.99	1.35	0.67	2.21	1.03	1.94	0.50	2.28	1.15	2.84	3.32	2.71	1.21	1.72	1.51	0.67	1.70	0.27	1.99	0.12	0.06	0.10
C5'	1.81	2.69	1.44	1.14	1.72	1.59	0.98	0.94	1.05	0.53	1.99	3.47	2.55	0.21	1.39	1.70	1.56	2.04	0.38	0.36	0.09	0.06	0.04
C6	1.62	2.83	1.31	0.56	2.20	0.86	2.08	0.39	2.43	1.29	2.80	3.05	2.57	1.45	1.73	1.43	0.44	1.53	0.24	2.28	0.10	0.10	0.11
C8	1.80	3.12	1.37	0.78	2.15	1.20	1.71	0.62	2.03	0.99	2.80	3.65	2.81	0.92	1.67	1.60	0.91	1.85	0.30	1.60	0.14	0.03	0.09
N1	1.57	2.55	1.31	0.58	2.09	0.83	1.96	0.38	2.18	1.26	2.47	2.69	2.38	1.39	1.68	1.40	0.45	1.47	0.24	1.96	0.11	0.08	0.11
N2	1.55	1.89	1.36	0.74	1.71	0.99	1.32	0.51	1.27	0.94	1.61	1.99	1.96	0.79	1.50	1.41	0.71	1.55	0.28	0.88	0.17	0.05	0.09
N3	1.74	2.60	1.38	0.83	1.99	1.21	1.45	0.63	1.54	0.86	2.17	2.86	2.53	0.68	1.59	1.55	0.96	1.82	0.30	0.99	0.17	0.03	0.08
N7	1.75	3.14	1.35	0.68	2.24	1.07	1.94	0.52	2.32	1.14	2.97	3.57	2.80	1.18	1.73	1.54	0.71	1.75	0.27	2.04	0.11	0.06	0.09
N9	1.80	2.99	1.38	0.86	2.05	1.28	1.51	0.68	1.72	0.86	2.54	3.51	2.75	0.70	1.61	1.61	1.05	1.90	0.32	1.17	0.17	0.01	0.10
O2'	1.76	2.01	1.45	1.32	1.30	1.75	0.35	1.08	0.16	0.21	1.07	2.68	2.15	0.34	1.15	1.70	1.85	2.07	0.47	0.72	0.27	0.02	0.14
O3'	1.65	2.08	1.44	1.37	1.30	1.77	0.44	1.15	0.37	0.16	1.27	2.78	2.12	0.29	1.08	1.62	1.88	1.98	0.38	0.40	0.02	0.15	0.04
O4'	1.83	2.83	1.39	1.01	1.83	1.47	1.12	0.81	1.21	0.65	2.16	3.58	2.65	0.35	1.48	1.69	1.37	2.01	0.38	0.51	0.22	0.00	0.12
O5'	1.79	2.90	1.41	1.02	1.88	1.46	1.24	0.82	1.43	0.67	2.34	3.65	2.68	0.45	1.48	1.66	1.34	1.96	0.30	0.85	0.01	0.10	0.02
O6	1.55	2.84	1.26	0.46	2.21	0.72	2.19	0.29	2.60	1.38	2.89	3.04	2.53	1.63	1.72	1.37	0.26	1.40	0.21	2.58	0.07	0.14	0.12
OP1	1.91	3.07	1.50	1.09	1.99	1.52	1.35	0.84	1.55	0.75	2.49	3.89	2.83	0.54	1.58	1.79	1.46	2.05	0.32	0.97	0.02	0.12	0.03
OP2	1.49	2.79	1.07	0.58	1.73	1.03	1.22	0.42	1.51	0.53	2.36	3.51	2.49	0.42	1.27	1.29	0.79	1.61	0.04	1.07	0.39	0.37	0.33
P	1.74	2.96	1.32	0.87	1.90	1.31	1.32	0.67	1.56	0.69	2.46	3.72	2.69	0.52	1.47	1.58	1.15	1.87	0.20	1.04	0.10	0.17	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.30	0.00	0.11	0.02	0.49	0.59	0.34
C2	0.03	0.00	0.58	0.54	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.40	0.18	0.36	0.04	0.02	0.77	0.77	0.45
C2'	0.01	0.58	0.00	0.00	0.32	0.01	0.17	0.22	0.28	0.22	0.47	0.70	0.55	0.09	0.04	0.00	0.04	0.00	0.68	0.21	0.98	0.86	0.83
C3'	0.01	0.54	0.00	0.00	0.45	0.00	0.51	0.02	0.57	0.30	0.60	0.54	0.45	0.43	0.30	0.02	0.01	0.00	0.43	0.59	0.33	0.38	0.40
C4	0.01	0.02	0.32	0.45	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.19	0.01	0.01	0.76	0.66	0.40
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.00	0.20	0.01	0.17	0.34	0.09	0.07	0.04	0.33	0.17	0.20	0.02	0.00	0.01	0.23	0.21	0.30	0.05
C5	0.01	0.02	0.17	0.51	0.00	0.20	0.00	0.25	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.14	0.24	0.08	0.12	0.01	0.87	0.53	0.35
C5'	0.04	0.01	0.22	0.02	0.10	0.01	0.25	0.00	0.23	0.39	0.11	0.08	0.05	0.41	0.15	0.04	0.15	0.01	0.01	0.31	0.31	0.20	0.03
C6	0.02	0.01	0.28	0.57	0.00	0.17	0.01	0.23	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.30	0.16	0.12	0.00	0.89	0.54	0.36
C8	0.02	0.04	0.22	0.30	0.02	0.34	0.02	0.39	0.03	0.00	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.46	0.11	0.23	0.20	0.03	0.81	0.33	0.25
N1	0.03	0.00	0.47	0.60	0.02	0.09	0.02	0.11	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.21	0.28	0.27	0.05	0.01	0.84	0.67	0.41
N2	0.04	0.01	0.70	0.54	0.03	0.07	0.02	0.08	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.61	0.17	0.41	0.08	0.02	0.73	0.83	0.47
N3	0.01	0.01	0.55	0.45	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.40	0.07	0.36	0.08	0.02	0.72	0.78	0.45
N7	0.02	0.03	0.09	0.43	0.01	0.33	0.01	0.41	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.40	0.24	0.12	0.24	0.02	0.89	0.30	0.25
N9	0.01	0.03	0.04	0.30	0.01	0.17	0.01	0.15	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.00	0.00	0.16	0.00	0.01	0.02	0.02	0.69	0.56	0.35
O2'	0.02	0.40	0.00	0.02	0.07	0.20	0.14	0.04	0.04	0.46	0.21	0.61	0.40	0.40	0.16	0.00	0.06	0.22	0.52	0.13	0.88	0.77	0.69
O3'	0.30	0.18	0.04	0.01	0.11	0.02	0.24	0.15	0.30	0.11	0.28	0.17	0.07	0.24	0.00	0.06	0.00	0.22	0.23	0.36	0.08	0.17	0.13
O4'	0.00	0.36	0.00	0.00	0.19	0.00	0.08	0.01	0.16	0.23	0.27	0.41	0.36	0.12	0.01	0.22	0.22	0.00	0.21	0.11	0.08	0.42	0.01
O5'	0.11	0.04	0.68	0.43	0.01	0.01	0.12	0.01	0.12	0.20	0.05	0.08	0.08	0.24	0.02	0.52	0.23	0.21	0.00	0.18	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.21	0.59	0.01	0.23	0.01	0.31	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.13	0.36	0.11	0.18	0.00	0.93	0.42	0.31
OP1	0.49	0.77	0.98	0.33	0.76	0.21	0.87	0.31	0.89	0.81	0.84	0.73	0.72	0.89	0.69	0.88	0.08	0.08	0.01	0.93	0.00	0.00	0.00
OP2	0.59	0.77	0.86	0.38	0.66	0.30	0.53	0.20	0.54	0.33	0.67	0.83	0.78	0.30	0.56	0.77	0.17	0.42	0.02	0.42	0.00	0.00	0.01
P	0.34	0.45	0.83	0.40	0.40	0.05	0.35	0.03	0.36	0.25	0.41	0.47	0.45	0.25	0.35	0.69	0.13	0.01	0.01	0.31	0.00	0.01	0.00