Doublet Group distance statistics: 53622

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.007, 0.026, 0.045, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.026 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.008, 0.028, 0.049, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.028 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.009, 0.032, 0.055, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.032 std_dev=0.023
C2	A	0, 0.009, 0.033, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.033 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.010, 0.037, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.037 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.011, 0.040, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.040 std_dev=0.029
O6	A	0, 0.011, 0.041, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.041 std_dev=0.030
C1'	A	0, 0.011, 0.041, 0.072, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.041 std_dev=0.031
N3	A	0, 0.011, 0.042, 0.073, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.042 std_dev=0.031
N2	A	0, 0.022, 0.083, 0.143, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.083 std_dev=0.061
P	B	0, 0.069, 0.425, 0.781, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.425 std_dev=0.356
OP1	B	0, 0.161, 0.713, 1.266, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.713 std_dev=0.553
O2'	A	0, 0.195, 0.756, 1.316, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.756 std_dev=0.561
OP2	B	0, 0.023, 0.601, 1.179, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.601 std_dev=0.578
C2'	A	0, 0.230, 0.830, 1.430, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.830 std_dev=0.600
O5'	B	0, 0.286, 1.017, 1.748, 1.684 max_d=1.684 avg_d=1.017 std_dev=0.731
O4'	A	0, 0.302, 1.047, 1.793, 1.680 max_d=1.680 avg_d=1.047 std_dev=0.746
C3'	A	0, 0.429, 1.492, 2.555, 2.401 max_d=2.401 avg_d=1.492 std_dev=1.063
C4'	A	0, 0.445, 1.539, 2.632, 2.444 max_d=2.444 avg_d=1.539 std_dev=1.094
O3'	A	0, 0.582, 2.042, 3.501, 3.324 max_d=3.324 avg_d=2.042 std_dev=1.459
C5'	B	0, 0.674, 2.318, 3.963, 3.639 max_d=3.639 avg_d=2.318 std_dev=1.644
C5'	A	0, 0.716, 2.490, 4.265, 4.006 max_d=4.006 avg_d=2.490 std_dev=1.775
C3'	B	0, 0.716, 2.576, 4.437, 4.328 max_d=4.328 avg_d=2.576 std_dev=1.861
C4'	B	0, 0.809, 2.765, 4.721, 4.205 max_d=4.205 avg_d=2.765 std_dev=1.956
O5'	A	0, 0.752, 2.743, 4.735, 4.668 max_d=4.668 avg_d=2.743 std_dev=1.992
O4'	B	0, 0.909, 3.123, 5.336, 4.877 max_d=4.877 avg_d=3.123 std_dev=2.214
C2'	B	0, 0.906, 3.210, 5.514, 5.297 max_d=5.297 avg_d=3.210 std_dev=2.304
C8	B	0, 0.961, 3.311, 5.662, 5.219 max_d=5.219 avg_d=3.311 std_dev=2.351
OP2	A	0, 0.966, 3.324, 5.681, 5.217 max_d=5.217 avg_d=3.324 std_dev=2.358
C1'	B	0, 1.005, 3.431, 5.856, 5.166 max_d=5.166 avg_d=3.431 std_dev=2.426
N9	B	0, 1.002, 3.433, 5.863, 5.303 max_d=5.303 avg_d=3.433 std_dev=2.431
O3'	B	0, 1.026, 3.524, 6.023, 5.511 max_d=5.511 avg_d=3.524 std_dev=2.499
P	A	0, 1.023, 3.578, 6.132, 5.799 max_d=5.799 avg_d=3.578 std_dev=2.554
N7	B	0, 1.067, 3.678, 6.289, 5.804 max_d=5.804 avg_d=3.678 std_dev=2.611
C4	B	0, 1.148, 3.931, 6.713, 6.056 max_d=6.056 avg_d=3.931 std_dev=2.782
C5	B	0, 1.170, 4.012, 6.855, 6.238 max_d=6.238 avg_d=4.012 std_dev=2.843
O2'	B	0, 1.248, 4.265, 7.282, 6.501 max_d=6.501 avg_d=4.265 std_dev=3.017
N3	B	0, 1.317, 4.503, 7.688, 6.873 max_d=6.873 avg_d=4.503 std_dev=3.185
OP1	A	0, 1.280, 4.492, 7.703, 7.322 max_d=7.322 avg_d=4.492 std_dev=3.212
C6	B	0, 1.361, 4.657, 7.953, 7.169 max_d=7.169 avg_d=4.657 std_dev=3.296
O6	B	0, 1.458, 4.989, 8.519, 7.658 max_d=7.658 avg_d=4.989 std_dev=3.530
C2	B	0, 1.487, 5.081, 8.676, 7.749 max_d=7.749 avg_d=5.081 std_dev=3.594
N1	B	0, 1.501, 5.131, 8.761, 7.837 max_d=7.837 avg_d=5.131 std_dev=3.630
N2	B	0, 1.707, 5.831, 9.954, 8.854 max_d=8.854 avg_d=5.831 std_dev=4.124

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.13	0.01	0.08	0.40	0.16
C2	0.03	0.00	0.27	0.24	0.01	0.10	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.30	0.21	0.08	0.01	0.21	0.55	0.31
C2'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.16	0.02	0.11	0.02	0.16	0.07	0.23	0.30	0.26	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.14	0.08	0.37	0.14
C3'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.17	0.00	0.17	0.02	0.21	0.09	0.24	0.26	0.22	0.12	0.09	0.01	0.01	0.01	0.05	0.21	0.13	0.30	0.12
C4	0.01	0.01	0.16	0.17	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.20	0.11	0.10	0.00	0.15	0.50	0.24
C4'	0.01	0.10	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.10	0.06	0.14	0.09	0.08	0.03	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.16	0.23	0.06
C5	0.01	0.01	0.11	0.17	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.20	0.07	0.14	0.00	0.18	0.47	0.21
C5'	0.03	0.13	0.02	0.02	0.05	0.00	0.01	0.00	0.03	0.11	0.09	0.18	0.12	0.08	0.01	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.20	0.09	0.01
C6	0.01	0.00	0.16	0.21	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.26	0.11	0.11	0.00	0.22	0.48	0.24
C8	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.10	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.09	0.09	0.24	0.00	0.08	0.38	0.13
N1	0.02	0.00	0.23	0.24	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.30	0.17	0.08	0.00	0.23	0.53	0.29
N2	0.04	0.01	0.30	0.26	0.01	0.14	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.33	0.25	0.10	0.01	0.22	0.57	0.34
N3	0.03	0.01	0.26	0.22	0.00	0.09	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.26	0.19	0.08	0.00	0.17	0.54	0.29
N7	0.01	0.01	0.01	0.12	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.14	0.04	0.22	0.00	0.15	0.38	0.15
N9	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.01	0.14	0.00	0.08	0.45	0.19
O2'	0.02	0.16	0.01	0.01	0.06	0.06	0.03	0.05	0.06	0.09	0.12	0.20	0.15	0.06	0.03	0.00	0.05	0.04	0.01	0.05	0.14	0.34	0.11
O3'	0.01	0.30	0.03	0.01	0.20	0.03	0.20	0.02	0.26	0.09	0.30	0.33	0.26	0.14	0.09	0.05	0.00	0.02	0.17	0.27	0.21	0.30	0.15
O4'	0.01	0.21	0.01	0.01	0.11	0.00	0.07	0.02	0.11	0.09	0.17	0.25	0.19	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.13	0.09	0.09	0.31	0.13
O5'	0.13	0.08	0.05	0.05	0.10	0.01	0.14	0.00	0.11	0.24	0.08	0.10	0.08	0.22	0.14	0.01	0.17	0.13	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.14	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.27	0.09	0.14	0.00	0.25	0.44	0.22
OP1	0.08	0.21	0.08	0.13	0.15	0.16	0.18	0.20	0.22	0.08	0.23	0.22	0.17	0.15	0.08	0.14	0.21	0.09	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00
OP2	0.40	0.55	0.37	0.30	0.50	0.23	0.47	0.09	0.48	0.38	0.53	0.57	0.54	0.38	0.45	0.34	0.30	0.31	0.01	0.44	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.31	0.14	0.12	0.24	0.06	0.21	0.01	0.24	0.13	0.29	0.34	0.29	0.15	0.19	0.11	0.15	0.13	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.76	1.05	0.78	0.60	0.52	0.94	0.07	1.04	0.13	0.13	0.50	1.52	1.05	0.44	0.40	1.22	1.01	0.95	0.39	0.61	0.16	0.59	0.23
C2	0.81	1.10	0.65	0.42	0.78	0.71	0.42	0.81	0.47	0.14	0.82	1.27	1.12	0.19	0.61	0.89	0.59	0.83	0.30	0.32	0.10	0.57	0.18
C2'	0.88	0.87	0.95	0.82	0.51	1.11	0.06	1.20	0.20	0.08	0.31	1.28	0.98	0.39	0.47	1.42	1.22	1.03	0.44	0.70	0.34	0.50	0.36
C3'	0.75	0.66	0.82	0.71	0.34	1.03	0.21	1.17	0.39	0.17	0.11	1.06	0.78	0.50	0.34	1.33	1.13	0.95	0.38	0.89	0.29	0.47	0.30
C4	0.85	1.38	0.76	0.51	0.84	0.82	0.41	0.92	0.49	0.11	1.01	1.70	1.30	0.15	0.62	1.07	0.78	0.90	0.34	0.24	0.10	0.57	0.20
C4'	0.54	0.54	0.61	0.47	0.15	0.87	0.41	1.03	0.58	0.36	0.10	1.00	0.62	0.70	0.13	1.13	0.95	0.82	0.37	1.10	0.14	0.62	0.20
C5	0.87	1.55	0.76	0.46	0.98	0.73	0.66	0.81	0.82	0.26	1.31	1.84	1.40	0.18	0.72	1.02	0.66	0.86	0.30	0.55	0.04	0.51	0.16
C5'	0.51	0.54	0.55	0.41	0.15	0.83	0.39	1.02	0.54	0.36	0.12	0.99	0.60	0.69	0.11	1.08	0.89	0.80	0.37	1.05	0.20	0.67	0.24
C6	0.85	1.51	0.70	0.37	1.04	0.61	0.81	0.67	1.00	0.36	1.37	1.72	1.37	0.34	0.77	0.90	0.49	0.78	0.25	0.81	0.01	0.45	0.12
C8	0.86	1.51	0.81	0.54	0.87	0.84	0.47	0.93	0.58	0.14	1.16	1.94	1.36	0.07	0.64	1.15	0.84	0.91	0.35	0.24	0.09	0.55	0.20
N1	0.82	1.30	0.64	0.34	0.95	0.58	0.71	0.66	0.83	0.32	1.14	1.46	1.23	0.29	0.72	0.82	0.44	0.76	0.24	0.65	0.02	0.48	0.13
N2	0.74	0.74	0.56	0.37	0.56	0.67	0.25	0.80	0.27	0.10	0.47	0.86	0.83	0.33	0.49	0.77	0.51	0.79	0.28	0.36	0.13	0.61	0.20
N3	0.82	1.13	0.72	0.52	0.71	0.84	0.26	0.95	0.29	0.07	0.72	1.39	1.15	0.30	0.54	1.03	0.78	0.91	0.36	0.35	0.14	0.60	0.22
N7	0.88	1.62	0.80	0.49	1.00	0.76	0.66	0.84	0.84	0.26	1.37	1.99	1.44	0.17	0.72	1.08	0.72	0.87	0.31	0.55	0.04	0.50	0.16
N9	0.83	1.35	0.79	0.56	0.75	0.88	0.29	0.98	0.34	0.05	0.91	1.77	1.26	0.21	0.56	1.15	0.90	0.93	0.38	0.22	0.12	0.58	0.22
O2'	0.73	0.58	0.89	0.79	0.27	1.05	0.34	1.15	0.51	0.27	0.04	0.98	0.74	0.63	0.28	1.42	1.25	0.92	0.41	0.99	0.25	0.48	0.29
O3'	0.67	0.34	0.77	0.73	0.16	1.05	0.41	1.21	0.65	0.27	0.24	0.69	0.53	0.63	0.23	1.33	1.18	0.89	0.43	1.14	0.40	0.43	0.38
O4'	0.57	0.82	0.59	0.42	0.30	0.82	0.26	0.97	0.36	0.31	0.29	1.33	0.82	0.62	0.21	1.06	0.88	0.84	0.46	0.87	0.31	0.72	0.34
O5'	0.60	0.76	0.59	0.47	0.33	0.87	0.29	1.06	0.42	0.27	0.38	1.20	0.77	0.57	0.25	1.08	0.91	0.86	0.34	0.85	0.07	0.65	0.18
O6	0.84	1.57	0.67	0.32	1.10	0.52	0.94	0.56	1.18	0.46	1.50	1.77	1.39	0.50	0.81	0.84	0.38	0.74	0.23	1.07	0.07	0.37	0.10
OP1	0.58	0.70	0.54	0.40	0.29	0.83	0.18	1.00	0.27	0.24	0.24	1.13	0.73	0.51	0.23	1.02	0.87	0.81	0.27	0.71	0.23	0.56	0.13
OP2	0.84	1.06	0.87	0.42	0.66	0.56	0.35	0.53	0.26	0.45	0.65	1.48	1.05	0.48	0.59	1.30	0.50	0.69	0.25	0.36	0.59	0.40	0.41
P	0.61	0.80	0.63	0.28	0.36	0.66	0.15	0.80	0.18	0.28	0.34	1.24	0.80	0.50	0.29	1.10	0.67	0.70	0.21	0.63	0.34	0.54	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.04	0.05	0.03	0.02	0.01	0.02	0.29	0.01	0.13	0.05	0.30	0.37	0.09
C2	0.04	0.00	0.30	0.15	0.01	0.31	0.01	0.43	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.26	0.31	0.44	0.31	0.01	0.34	0.43	0.16
C2'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.16	0.02	0.09	0.05	0.14	0.13	0.23	0.34	0.29	0.05	0.03	0.01	0.06	0.02	0.40	0.10	0.86	0.50	0.43
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.16	0.00	0.20	0.06	0.21	0.20	0.18	0.13	0.13	0.22	0.15	0.03	0.00	0.01	0.37	0.22	0.79	0.17	0.35
C4	0.03	0.01	0.16	0.16	0.00	0.15	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.19	0.24	0.32	0.02	0.35	0.38	0.13
C4'	0.02	0.31	0.02	0.00	0.15	0.00	0.10	0.01	0.17	0.14	0.26	0.39	0.28	0.08	0.03	0.23	0.07	0.01	0.02	0.16	0.30	0.26	0.05
C5	0.03	0.01	0.09	0.20	0.01	0.10	0.00	0.16	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.08	0.11	0.15	0.41	0.02	0.39	0.36	0.19
C5'	0.03	0.43	0.05	0.06	0.22	0.01	0.16	0.00	0.26	0.19	0.38	0.53	0.37	0.11	0.06	0.18	0.15	0.01	0.01	0.25	0.26	0.25	0.02
C6	0.04	0.01	0.14	0.21	0.01	0.17	0.01	0.26	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.14	0.24	0.42	0.01	0.40	0.40	0.23
C8	0.02	0.02	0.13	0.20	0.01	0.14	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.29	0.04	0.16	0.43	0.03	0.42	0.28	0.14
N1	0.04	0.00	0.23	0.18	0.01	0.26	0.02	0.38	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.23	0.36	0.38	0.01	0.37	0.43	0.20
N2	0.05	0.01	0.34	0.13	0.02	0.39	0.03	0.53	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.37	0.38	0.51	0.30	0.02	0.33	0.46	0.17
N3	0.03	0.01	0.29	0.13	0.00	0.28	0.01	0.37	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.25	0.32	0.41	0.26	0.01	0.33	0.41	0.12
N7	0.02	0.02	0.05	0.22	0.00	0.08	0.00	0.11	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.24	0.07	0.05	0.47	0.03	0.43	0.29	0.21
N9	0.01	0.02	0.03	0.15	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.09	0.12	0.04	0.29	0.03	0.37	0.36	0.10
O2'	0.02	0.26	0.01	0.03	0.05	0.23	0.08	0.18	0.04	0.29	0.14	0.37	0.25	0.24	0.09	0.00	0.06	0.16	0.17	0.08	0.74	0.42	0.25
O3'	0.29	0.31	0.06	0.00	0.19	0.07	0.11	0.15	0.14	0.04	0.23	0.38	0.32	0.07	0.12	0.06	0.00	0.27	0.20	0.12	0.88	0.15	0.37
O4'	0.01	0.44	0.02	0.01	0.24	0.01	0.15	0.01	0.24	0.16	0.36	0.51	0.41	0.05	0.04	0.16	0.27	0.00	0.25	0.21	0.22	0.42	0.36
O5'	0.13	0.31	0.40	0.37	0.32	0.02	0.41	0.01	0.42	0.43	0.38	0.30	0.26	0.47	0.29	0.17	0.20	0.25	0.00	0.47	0.02	0.02	0.00
O6	0.05	0.01	0.10	0.22	0.02	0.16	0.02	0.25	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.08	0.12	0.21	0.47	0.00	0.42	0.40	0.28
OP1	0.30	0.34	0.86	0.79	0.35	0.30	0.39	0.26	0.40	0.42	0.37	0.33	0.33	0.43	0.37	0.74	0.88	0.22	0.02	0.42	0.00	0.01	0.00
OP2	0.37	0.43	0.50	0.17	0.38	0.26	0.36	0.25	0.40	0.28	0.43	0.46	0.41	0.29	0.36	0.42	0.15	0.42	0.02	0.40	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.16	0.43	0.35	0.13	0.05	0.19	0.02	0.23	0.14	0.20	0.17	0.12	0.21	0.10	0.25	0.37	0.36	0.00	0.28	0.00	0.01	0.00