Doublet Group distance statistics: 53624

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.001, 0.004, 0.008, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.001, 0.007, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N7	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.008
O6	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.002, 0.013, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C8	A	0, 0.003, 0.017, 0.030, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N2	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.021 std_dev=0.016
O2'	A	0, 0.044, 0.154, 0.264, 0.253 max_d=0.253 avg_d=0.154 std_dev=0.110
C2'	A	0, 0.074, 0.260, 0.445, 0.419 max_d=0.419 avg_d=0.260 std_dev=0.185
P	B	0, 0.007, 0.222, 0.436, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.222 std_dev=0.214
O4'	A	0, 0.110, 0.378, 0.647, 0.594 max_d=0.594 avg_d=0.378 std_dev=0.268
OP1	B	0, -0.082, 0.258, 0.598, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.258 std_dev=0.340
C3'	A	0, 0.208, 0.710, 1.212, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.710 std_dev=0.502
C4'	A	0, 0.216, 0.739, 1.263, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.739 std_dev=0.523
O5'	A	0, 0.260, 0.928, 1.596, 1.546 max_d=1.546 avg_d=0.928 std_dev=0.668
C5'	A	0, 0.301, 1.045, 1.789, 1.670 max_d=1.670 avg_d=1.045 std_dev=0.744
O3'	A	0, 0.318, 1.090, 1.862, 1.693 max_d=1.693 avg_d=1.090 std_dev=0.772
P	A	0, 0.298, 1.078, 1.858, 1.818 max_d=1.818 avg_d=1.078 std_dev=0.780
OP2	A	0, 0.317, 1.131, 1.945, 1.885 max_d=1.885 avg_d=1.131 std_dev=0.814
OP1	A	0, 0.390, 1.440, 2.490, 2.475 max_d=2.475 avg_d=1.440 std_dev=1.050
OP2	B	0, 0.469, 1.601, 2.734, 2.412 max_d=2.412 avg_d=1.601 std_dev=1.132
O5'	B	0, 0.466, 1.607, 2.748, 2.535 max_d=2.535 avg_d=1.607 std_dev=1.141
C5'	B	0, 0.628, 2.149, 3.669, 3.296 max_d=3.296 avg_d=2.149 std_dev=1.520
O6	B	0, 0.742, 2.532, 4.323, 3.820 max_d=3.820 avg_d=2.532 std_dev=1.791
C6	B	0, 0.791, 2.700, 4.610, 4.071 max_d=4.071 avg_d=2.700 std_dev=1.909
N1	B	0, 0.797, 2.722, 4.648, 4.122 max_d=4.122 avg_d=2.722 std_dev=1.925
C5	B	0, 0.915, 3.123, 5.331, 4.699 max_d=4.699 avg_d=3.123 std_dev=2.208
C2	B	0, 0.920, 3.143, 5.365, 4.758 max_d=4.758 avg_d=3.143 std_dev=2.223
N2	B	0, 0.969, 3.311, 5.652, 5.031 max_d=5.031 avg_d=3.311 std_dev=2.342
N7	B	0, 1.005, 3.433, 5.860, 5.159 max_d=5.159 avg_d=3.433 std_dev=2.427
C4	B	0, 1.019, 3.478, 5.938, 5.238 max_d=5.238 avg_d=3.478 std_dev=2.460
N3	B	0, 1.034, 3.532, 6.029, 5.332 max_d=5.332 avg_d=3.532 std_dev=2.498
C4'	B	0, 1.063, 3.631, 6.198, 5.502 max_d=5.502 avg_d=3.631 std_dev=2.568
O4'	B	0, 1.068, 3.645, 6.222, 5.473 max_d=5.473 avg_d=3.645 std_dev=2.577
C8	B	0, 1.141, 3.896, 6.652, 5.855 max_d=5.855 avg_d=3.896 std_dev=2.755
N9	B	0, 1.162, 3.967, 6.772, 5.966 max_d=5.966 avg_d=3.967 std_dev=2.805
C3'	B	0, 1.347, 4.600, 7.854, 6.990 max_d=6.990 avg_d=4.600 std_dev=3.254
C1'	B	0, 1.352, 4.616, 7.880, 6.942 max_d=6.942 avg_d=4.616 std_dev=3.264
O3'	B	0, 1.605, 5.481, 9.358, 8.326 max_d=8.326 avg_d=5.481 std_dev=3.877
C2'	B	0, 1.630, 5.565, 9.500, 8.400 max_d=8.400 avg_d=5.565 std_dev=3.935
O2'	B	0, 2.044, 6.978, 11.912, 10.518 max_d=10.518 avg_d=6.978 std_dev=4.934

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.04
C2	0.01	0.00	0.09	0.11	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.11	0.05	0.10	0.00	0.11	0.24	0.14
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.00	0.07	0.02	0.08	0.10	0.08	0.04	0.03	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.06	0.05	0.03
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.11	0.00	0.14	0.02	0.15	0.11	0.14	0.11	0.09	0.14	0.09	0.01	0.00	0.01	0.03	0.16	0.08	0.02	0.04
C4	0.00	0.00	0.06	0.11	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.10	0.03	0.11	0.01	0.12	0.22	0.15
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.05	0.09	0.02	0.03	0.02	0.09	0.05	0.06	0.02	0.00	0.00	0.07	0.04	0.02	0.01
C5	0.00	0.00	0.06	0.14	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.14	0.01	0.16	0.01	0.20	0.29	0.21
C5'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.00	0.09	0.00	0.09	0.13	0.05	0.03	0.02	0.14	0.06	0.06	0.03	0.01	0.00	0.11	0.04	0.01	0.00
C6	0.01	0.00	0.07	0.15	0.00	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.16	0.02	0.17	0.00	0.22	0.32	0.22
C8	0.00	0.00	0.02	0.11	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.12	0.04	0.17	0.01	0.19	0.24	0.21
N1	0.01	0.00	0.08	0.14	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.14	0.04	0.13	0.00	0.17	0.29	0.19
N2	0.01	0.00	0.10	0.11	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.10	0.06	0.08	0.01	0.08	0.22	0.12
N3	0.01	0.00	0.08	0.09	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.05	0.07	0.00	0.07	0.20	0.11
N7	0.00	0.00	0.04	0.14	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.16	0.02	0.19	0.01	0.24	0.32	0.25
N9	0.00	0.00	0.03	0.09	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.10	0.17	0.13
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.06	0.03	0.02	0.05	0.07	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.02	0.03	0.06	0.02	0.02
O3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.10	0.02	0.14	0.03	0.16	0.12	0.14	0.10	0.08	0.16	0.08	0.02	0.00	0.02	0.03	0.18	0.11	0.04	0.06
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.06	0.05	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.06	0.04
O5'	0.01	0.10	0.03	0.03	0.11	0.00	0.16	0.00	0.17	0.17	0.13	0.08	0.07	0.19	0.10	0.02	0.03	0.02	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.07	0.16	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.18	0.02	0.19	0.00	0.26	0.36	0.26
OP1	0.01	0.11	0.06	0.08	0.12	0.04	0.20	0.04	0.22	0.19	0.17	0.08	0.07	0.24	0.10	0.06	0.11	0.04	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.24	0.05	0.02	0.22	0.02	0.29	0.01	0.32	0.24	0.29	0.22	0.20	0.32	0.17	0.02	0.04	0.06	0.01	0.36	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.14	0.03	0.04	0.15	0.01	0.21	0.00	0.22	0.21	0.19	0.12	0.11	0.25	0.13	0.02	0.06	0.04	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.93	0.61	0.78	0.59	0.76	0.77	0.62	0.61	0.42	0.82	0.45	0.59	0.74	0.67	0.86	0.94	0.53	0.93	0.39	0.18	0.04	0.45	0.03
C2	0.85	0.72	0.68	0.54	0.65	0.77	0.27	0.61	0.17	0.25	0.44	0.83	0.85	0.03	0.65	0.79	0.49	0.95	0.44	0.14	0.04	0.49	0.03
C2'	0.86	0.60	0.79	0.61	0.76	0.69	0.70	0.53	0.53	0.85	0.50	0.55	0.71	0.78	0.83	0.93	0.57	0.80	0.30	0.37	0.09	0.48	0.13
C3'	0.88	0.59	0.81	0.61	0.75	0.68	0.71	0.51	0.56	0.88	0.51	0.53	0.69	0.81	0.84	0.98	0.58	0.80	0.29	0.44	0.13	0.52	0.16
C4	1.11	0.76	0.93	0.71	0.86	0.90	0.60	0.66	0.39	0.79	0.53	0.79	0.91	0.52	0.96	1.12	0.65	1.10	0.47	0.08	0.03	0.52	0.04
C4'	0.88	0.55	0.76	0.58	0.71	0.74	0.64	0.60	0.46	0.83	0.44	0.50	0.67	0.72	0.82	0.92	0.53	0.88	0.40	0.30	0.03	0.41	0.01
C5	1.29	0.82	1.12	0.84	0.93	1.04	0.64	0.70	0.42	0.89	0.57	0.86	1.00	0.57	1.08	1.37	0.80	1.24	0.54	0.12	0.02	0.58	0.04
C5'	0.94	0.56	0.81	0.61	0.74	0.77	0.66	0.59	0.48	0.89	0.45	0.50	0.69	0.76	0.87	1.01	0.55	0.92	0.40	0.33	0.03	0.45	0.03
C6	1.29	0.84	1.13	0.86	0.88	1.07	0.53	0.70	0.35	0.70	0.56	0.92	1.02	0.37	1.01	1.37	0.83	1.27	0.57	0.04	0.01	0.60	0.04
C8	1.29	0.78	1.14	0.85	0.97	1.01	0.76	0.70	0.52	1.07	0.58	0.77	0.97	0.82	1.14	1.40	0.80	1.20	0.51	0.25	0.03	0.56	0.04
N1	1.08	0.79	0.91	0.71	0.75	0.95	0.36	0.67	0.24	0.40	0.49	0.90	0.94	0.09	0.80	1.08	0.68	1.15	0.54	0.08	0.02	0.57	0.04
N2	0.47	0.62	0.34	0.29	0.37	0.54	0.04	0.51	0.05	0.25	0.33	0.79	0.69	0.47	0.26	0.40	0.27	0.65	0.34	0.30	0.05	0.40	0.04
N3	0.87	0.70	0.69	0.54	0.71	0.75	0.41	0.60	0.25	0.48	0.46	0.76	0.82	0.22	0.74	0.82	0.49	0.93	0.40	0.06	0.04	0.47	0.04
N7	1.38	0.84	1.23	0.92	1.00	1.09	0.74	0.72	0.50	1.05	0.60	0.85	1.03	0.75	1.18	1.53	0.88	1.28	0.55	0.21	0.01	0.59	0.04
N9	1.12	0.72	0.96	0.72	0.87	0.90	0.68	0.65	0.45	0.93	0.53	0.72	0.88	0.71	1.00	1.16	0.66	1.08	0.46	0.18	0.04	0.51	0.04
O2'	0.75	0.58	0.68	0.58	0.70	0.67	0.67	0.60	0.54	0.73	0.51	0.53	0.66	0.70	0.73	0.76	0.54	0.75	0.36	0.40	0.04	0.29	0.05
O3'	0.76	0.55	0.74	0.59	0.69	0.61	0.70	0.48	0.60	0.81	0.52	0.49	0.63	0.79	0.76	0.88	0.56	0.69	0.26	0.55	0.13	0.46	0.17
O4'	0.94	0.56	0.76	0.58	0.73	0.79	0.59	0.64	0.39	0.82	0.41	0.53	0.71	0.66	0.84	0.94	0.51	0.96	0.45	0.17	0.08	0.41	0.05
O5'	1.04	0.61	0.93	0.66	0.81	0.80	0.71	0.55	0.51	0.97	0.49	0.56	0.76	0.82	0.95	1.17	0.61	0.97	0.36	0.35	0.12	0.59	0.14
O6	1.36	0.87	1.23	0.94	0.90	1.14	0.53	0.71	0.36	0.71	0.58	0.96	1.05	0.37	1.03	1.53	0.94	1.31	0.61	0.06	0.01	0.61	0.05
OP1	1.07	0.63	0.96	0.68	0.83	0.81	0.75	0.55	0.57	1.01	0.52	0.57	0.77	0.87	0.98	1.23	0.63	0.98	0.36	0.43	0.15	0.61	0.16
OP2	1.14	0.64	1.03	0.70	0.84	0.82	0.72	0.48	0.51	1.01	0.50	0.59	0.80	0.83	1.01	1.35	0.66	1.00	0.31	0.33	0.30	0.80	0.32
P	1.07	0.60	0.95	0.65	0.80	0.80	0.70	0.52	0.49	0.97	0.47	0.55	0.76	0.81	0.96	1.22	0.60	0.98	0.34	0.33	0.17	0.67	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.09	0.01	0.06	0.16	0.15
C2	0.03	0.00	0.04	0.30	0.00	0.37	0.00	0.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.23	0.26	0.28	0.41	0.00	0.46	0.50	0.42
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.03	0.00	0.04	0.01	0.19	0.03	0.06	0.16	0.17
C3'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.08	0.00	0.05	0.01	0.03	0.27	0.17	0.41	0.30	0.22	0.08	0.03	0.01	0.00	0.25	0.03	0.09	0.10	0.18
C4	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.14	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.04	0.14	0.05	0.01	0.03	0.13	0.08
C4'	0.00	0.37	0.01	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.09	0.27	0.25	0.49	0.37	0.20	0.04	0.08	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.10	0.00
C5	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.04	0.24	0.01	0.31	0.51	0.40
C5'	0.02	0.67	0.01	0.01	0.25	0.00	0.05	0.00	0.19	0.41	0.47	0.90	0.63	0.31	0.05	0.08	0.01	0.01	0.00	0.09	0.08	0.23	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.09	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.10	0.12	0.00	0.19	0.35	0.25
C8	0.01	0.00	0.03	0.27	0.00	0.27	0.00	0.41	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.27	0.18	0.65	0.01	0.71	1.00	0.86
N1	0.02	0.00	0.04	0.17	0.01	0.25	0.00	0.47	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.14	0.20	0.19	0.00	0.18	0.15	0.14
N2	0.03	0.00	0.04	0.41	0.01	0.49	0.00	0.90	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.32	0.39	0.34	0.64	0.00	0.77	0.89	0.74
N3	0.02	0.00	0.04	0.30	0.00	0.37	0.00	0.63	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.23	0.24	0.28	0.39	0.00	0.43	0.43	0.37
N7	0.01	0.00	0.03	0.22	0.00	0.20	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.23	0.11	0.60	0.01	0.72	1.03	0.84
N9	0.00	0.01	0.03	0.08	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.09	0.01	0.24	0.01	0.24	0.41	0.35
O2'	0.02	0.23	0.00	0.03	0.09	0.08	0.01	0.08	0.04	0.13	0.15	0.32	0.23	0.11	0.02	0.00	0.07	0.07	0.15	0.00	0.06	0.11	0.13
O3'	0.03	0.26	0.04	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.27	0.14	0.39	0.24	0.23	0.09	0.07	0.00	0.02	0.22	0.06	0.03	0.03	0.09
O4'	0.00	0.28	0.01	0.00	0.14	0.00	0.04	0.01	0.10	0.18	0.20	0.34	0.28	0.11	0.01	0.07	0.02	0.00	0.06	0.06	0.08	0.06	0.05
O5'	0.09	0.41	0.19	0.25	0.05	0.01	0.24	0.00	0.12	0.65	0.19	0.64	0.39	0.60	0.24	0.15	0.22	0.06	0.00	0.24	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.06	0.24	0.00	0.37	0.57	0.42
OP1	0.06	0.46	0.06	0.09	0.03	0.09	0.31	0.08	0.19	0.71	0.18	0.77	0.43	0.72	0.24	0.06	0.03	0.08	0.01	0.37	0.00	0.00	0.00
OP2	0.16	0.50	0.16	0.10	0.13	0.10	0.51	0.23	0.35	1.00	0.15	0.89	0.43	1.03	0.41	0.11	0.03	0.06	0.01	0.57	0.00	0.00	0.00
P	0.15	0.42	0.17	0.18	0.08	0.00	0.40	0.01	0.25	0.86	0.14	0.74	0.37	0.84	0.35	0.13	0.09	0.05	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00