Doublet Group distance statistics: 53635

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 3, 15, 14, 14, 5, 9, 2, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.017, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N2	A	0, 0.012, 0.027, 0.042, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.027 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.008, 0.026, 0.043, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.026 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.010, 0.030, 0.050, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.030 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.004, 0.031, 0.058, 0.174 max_d=0.174 avg_d=0.031 std_dev=0.027
O4'	A	0, -0.008, 0.064, 0.136, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.064 std_dev=0.072
C2'	A	0, 0.009, 0.098, 0.187, 0.451 max_d=0.451 avg_d=0.098 std_dev=0.089
C4'	A	0, 0.001, 0.116, 0.232, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.116 std_dev=0.116
O2'	A	0, 0.056, 0.186, 0.315, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.186 std_dev=0.129
C3'	A	0, 0.003, 0.137, 0.270, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.137 std_dev=0.133
OP1	B	0, 0.231, 0.396, 0.562, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.396 std_dev=0.165
O3'	A	0, 0.028, 0.220, 0.412, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.220 std_dev=0.192
P	B	0, 0.187, 0.386, 0.586, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.386 std_dev=0.200
C5'	A	0, -0.024, 0.195, 0.415, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.195 std_dev=0.220
OP2	B	0, 0.248, 0.469, 0.690, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.469 std_dev=0.221
O5'	A	0, -0.120, 0.266, 0.653, 2.151 max_d=2.151 avg_d=0.266 std_dev=0.386
P	A	0, -0.077, 0.335, 0.748, 2.361 max_d=2.361 avg_d=0.335 std_dev=0.413
O5'	B	0, 0.010, 0.453, 0.895, 2.501 max_d=2.501 avg_d=0.453 std_dev=0.442
C5	B	0, 0.120, 0.674, 1.227, 3.331 max_d=3.331 avg_d=0.674 std_dev=0.553
OP2	A	0, -0.131, 0.457, 1.046, 2.855 max_d=2.855 avg_d=0.457 std_dev=0.589
O4	B	0, 0.195, 0.795, 1.395, 3.457 max_d=3.457 avg_d=0.795 std_dev=0.600
C4	B	0, 0.109, 0.769, 1.429, 3.946 max_d=3.946 avg_d=0.769 std_dev=0.660
C6	B	0, -0.001, 0.663, 1.326, 3.930 max_d=3.930 avg_d=0.663 std_dev=0.664
OP1	A	0, -0.245, 0.441, 1.126, 3.435 max_d=3.435 avg_d=0.441 std_dev=0.686
C5'	B	0, -0.203, 0.511, 1.225, 3.968 max_d=3.968 avg_d=0.511 std_dev=0.714
N3	B	0, -0.014, 0.862, 1.739, 5.158 max_d=5.158 avg_d=0.862 std_dev=0.876
N1	B	0, -0.151, 0.745, 1.642, 5.166 max_d=5.166 avg_d=0.745 std_dev=0.897
C4'	B	0, -0.303, 0.619, 1.541, 5.050 max_d=5.050 avg_d=0.619 std_dev=0.922
O4'	B	0, -0.289, 0.655, 1.599, 5.142 max_d=5.142 avg_d=0.655 std_dev=0.944
C3'	B	0, -0.288, 0.678, 1.645, 5.414 max_d=5.414 avg_d=0.678 std_dev=0.967
C2	B	0, -0.149, 0.864, 1.877, 5.836 max_d=5.836 avg_d=0.864 std_dev=1.013
C1'	B	0, -0.296, 0.747, 1.791, 5.792 max_d=5.792 avg_d=0.747 std_dev=1.044
O3'	B	0, -0.383, 0.721, 1.826, 6.027 max_d=6.027 avg_d=0.721 std_dev=1.104
C2'	B	0, -0.330, 0.797, 1.924, 6.267 max_d=6.267 avg_d=0.797 std_dev=1.127
O2	B	0, -0.244, 0.986, 2.217, 6.958 max_d=6.958 avg_d=0.986 std_dev=1.230
O2'	B	0, -0.475, 0.872, 2.218, 7.254 max_d=7.254 avg_d=0.872 std_dev=1.347

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.02	0.15	0.13	0.06
C2	0.02	0.00	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.10	0.02	0.20	0.02	0.25	0.27	0.16
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.05	0.04	0.06	0.10	0.08	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.11	0.05	0.19	0.09	0.10
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.07	0.06	0.10	0.07	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.15	0.06	0.27	0.09	0.13
C4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.21	0.01	0.26	0.28	0.16
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.03	0.05	0.03	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.06	0.11	0.11	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.26	0.01	0.33	0.37	0.22
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.11	0.08	0.07	0.06	0.12	0.07	0.04	0.03	0.02	0.01	0.12	0.14	0.20	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02	0.27	0.01	0.35	0.40	0.24
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.02	0.27	0.02	0.32	0.34	0.20
N1	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.02	0.24	0.02	0.30	0.34	0.21
N2	0.02	0.01	0.10	0.10	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.14	0.02	0.18	0.03	0.23	0.24	0.15
N3	0.02	0.00	0.08	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.09	0.02	0.17	0.02	0.21	0.23	0.13
N7	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.29	0.02	0.37	0.42	0.25
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.20	0.02	0.24	0.24	0.14
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.04	0.05	0.04	0.07	0.03	0.09	0.13	0.09	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.04	0.06	0.14	0.07	0.05
O3'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.06	0.08	0.08	0.14	0.09	0.07	0.02	0.04	0.00	0.02	0.13	0.07	0.35	0.16	0.15
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.09	0.03	0.15	0.13	0.07
O5'	0.11	0.20	0.11	0.15	0.21	0.02	0.26	0.01	0.27	0.27	0.24	0.18	0.17	0.29	0.20	0.04	0.13	0.09	0.00	0.31	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.02	0.05	0.06	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.06	0.07	0.03	0.31	0.00	0.40	0.46	0.29
OP1	0.15	0.25	0.19	0.27	0.26	0.11	0.33	0.14	0.35	0.32	0.30	0.23	0.21	0.37	0.24	0.14	0.35	0.15	0.01	0.40	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.27	0.09	0.09	0.28	0.11	0.37	0.20	0.40	0.34	0.34	0.24	0.23	0.42	0.24	0.07	0.16	0.13	0.01	0.46	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.16	0.10	0.13	0.16	0.02	0.22	0.01	0.24	0.20	0.21	0.15	0.13	0.25	0.14	0.05	0.15	0.07	0.00	0.29	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.72	0.59	0.74	0.67	0.34	0.73	0.33	0.63	0.44	0.58	0.47	0.70	0.87	0.72	0.26	0.71	0.38	0.10	0.18	0.12
C2	0.44	0.35	0.50	0.50	0.21	0.51	0.21	0.47	0.27	0.35	0.28	0.42	0.56	0.56	0.18	0.44	0.28	0.10	0.16	0.12
C2'	0.80	0.66	0.84	0.76	0.36	0.82	0.34	0.68	0.48	0.64	0.52	0.79	0.99	0.83	0.27	0.79	0.41	0.16	0.21	0.14
C3'	0.81	0.68	0.86	0.77	0.37	0.81	0.33	0.66	0.47	0.65	0.54	0.83	1.02	0.85	0.27	0.78	0.40	0.16	0.23	0.13
C4	0.55	0.45	0.60	0.57	0.25	0.60	0.25	0.52	0.33	0.44	0.35	0.54	0.70	0.64	0.20	0.55	0.31	0.10	0.17	0.11
C4'	0.80	0.68	0.82	0.73	0.38	0.79	0.36	0.65	0.49	0.65	0.54	0.81	0.98	0.79	0.29	0.78	0.40	0.12	0.19	0.12
C5	0.48	0.39	0.54	0.52	0.22	0.53	0.22	0.45	0.28	0.38	0.31	0.47	0.63	0.60	0.18	0.46	0.27	0.12	0.16	0.12
C5'	0.76	0.65	0.79	0.70	0.36	0.74	0.33	0.60	0.45	0.62	0.52	0.79	0.95	0.76	0.27	0.73	0.35	0.13	0.21	0.10
C6	0.37	0.31	0.45	0.45	0.19	0.43	0.18	0.36	0.23	0.30	0.25	0.38	0.52	0.54	0.17	0.35	0.22	0.13	0.15	0.12
C8	0.59	0.49	0.64	0.60	0.28	0.62	0.27	0.52	0.36	0.48	0.39	0.59	0.76	0.67	0.22	0.58	0.31	0.11	0.17	0.11
N1	0.35	0.29	0.42	0.43	0.18	0.41	0.18	0.36	0.22	0.28	0.23	0.35	0.48	0.52	0.17	0.34	0.22	0.12	0.15	0.12
N2	0.41	0.32	0.46	0.47	0.20	0.48	0.21	0.47	0.26	0.33	0.26	0.38	0.50	0.53	0.18	0.41	0.29	0.10	0.15	0.12
N3	0.55	0.44	0.59	0.56	0.25	0.61	0.25	0.54	0.34	0.44	0.34	0.52	0.68	0.62	0.20	0.55	0.33	0.10	0.17	0.11
N7	0.51	0.42	0.57	0.54	0.24	0.55	0.23	0.45	0.30	0.41	0.33	0.51	0.68	0.63	0.19	0.49	0.27	0.12	0.16	0.11
N9	0.63	0.52	0.67	0.62	0.29	0.66	0.28	0.56	0.38	0.50	0.41	0.62	0.79	0.68	0.23	0.62	0.34	0.10	0.17	0.12
O2'	0.89	0.75	0.91	0.82	0.43	0.89	0.41	0.76	0.56	0.73	0.61	0.89	1.06	0.86	0.33	0.89	0.48	0.18	0.21	0.18
O3'	0.89	0.77	0.95	0.84	0.42	0.88	0.38	0.71	0.53	0.72	0.61	0.92	1.12	0.92	0.32	0.85	0.44	0.20	0.26	0.17
O4'	0.72	0.61	0.74	0.67	0.35	0.73	0.34	0.62	0.45	0.59	0.49	0.72	0.88	0.71	0.27	0.72	0.37	0.10	0.19	0.12
O5'	0.74	0.63	0.79	0.72	0.34	0.75	0.31	0.62	0.44	0.59	0.49	0.76	0.94	0.80	0.25	0.71	0.39	0.20	0.22	0.17
O6	0.31	0.27	0.39	0.39	0.17	0.35	0.17	0.28	0.19	0.25	0.22	0.32	0.44	0.49	0.16	0.28	0.19	0.14	0.16	0.14
OP1	0.78	0.70	0.81	0.69	0.40	0.72	0.36	0.55	0.47	0.64	0.57	0.85	0.98	0.75	0.32	0.73	0.32	0.24	0.30	0.17
OP2	0.81	0.68	0.91	0.86	0.38	0.85	0.37	0.73	0.50	0.66	0.54	0.82	1.06	0.98	0.29	0.77	0.49	0.27	0.19	0.26
P	0.69	0.59	0.74	0.66	0.31	0.68	0.29	0.55	0.40	0.55	0.46	0.72	0.89	0.75	0.23	0.65	0.32	0.18	0.24	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.06	0.08	0.06
C2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.02	0.03	0.08	0.10	0.13	0.10
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.12	0.00	0.02	0.04	0.01	0.04	0.11	0.10	0.05
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.09	0.11	0.02	0.01	0.09	0.01	0.05	0.15	0.12	0.08
C4	0.02	0.01	0.03	0.08	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.10	0.01	0.03	0.11	0.15	0.19	0.15
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.05	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.09	0.02	0.04	0.12	0.15	0.18	0.15
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.06	0.03	0.05	0.05	0.05	0.02	0.08	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.02	0.04	0.10	0.12	0.14	0.12
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.07	0.09	0.11	0.09
N3	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.01	0.02	0.10	0.13	0.17	0.13
O2	0.04	0.01	0.12	0.11	0.02	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.14	0.02	0.05	0.08	0.10	0.13	0.09
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.03	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.05	0.11	0.00	0.04	0.04	0.04	0.04	0.10	0.08	0.04
O3'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.10	0.01	0.09	0.02	0.08	0.05	0.11	0.14	0.04	0.00	0.12	0.01	0.07	0.21	0.16	0.13
O4	0.02	0.02	0.04	0.09	0.01	0.06	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.12	0.00	0.03	0.13	0.18	0.22	0.18
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.04	0.01	0.03	0.00	0.06	0.08	0.09	0.10
O5'	0.04	0.08	0.04	0.05	0.11	0.01	0.12	0.01	0.10	0.07	0.10	0.08	0.04	0.07	0.13	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.06	0.10	0.11	0.15	0.15	0.06	0.15	0.05	0.12	0.09	0.13	0.10	0.10	0.21	0.18	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.13	0.10	0.12	0.19	0.03	0.18	0.02	0.14	0.11	0.17	0.13	0.08	0.16	0.22	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.10	0.05	0.08	0.15	0.02	0.15	0.01	0.12	0.09	0.13	0.09	0.04	0.13	0.18	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00