Doublet Group distance statistics: 53636

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 10, 12, 8, 6, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.002, 0.014, 0.027, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.014 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.002, 0.017, 0.032, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.017 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.002, 0.017, 0.032, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.017 std_dev=0.015
C2	A	0, -0.003, 0.013, 0.029, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.013 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.003, 0.019, 0.035, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.019 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.001, 0.019, 0.037, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.019 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.025 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.006, 0.029, 0.052, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.029 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.006, 0.032, 0.058, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.032 std_dev=0.026
N2	A	0, -0.002, 0.032, 0.065, 0.198 max_d=0.198 avg_d=0.032 std_dev=0.033
C2'	A	0, 0.006, 0.099, 0.192, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.099 std_dev=0.093
O4'	A	0, -0.022, 0.087, 0.195, 0.496 max_d=0.496 avg_d=0.087 std_dev=0.109
O2'	A	0, 0.045, 0.167, 0.289, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.167 std_dev=0.122
P	B	0, 0.118, 0.260, 0.403, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.260 std_dev=0.142
OP2	B	0, 0.111, 0.259, 0.407, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.259 std_dev=0.148
C5'	B	0, 0.099, 0.248, 0.397, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.248 std_dev=0.149
C1'	B	0, 0.081, 0.244, 0.406, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.244 std_dev=0.162
O4'	B	0, 0.083, 0.248, 0.413, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.248 std_dev=0.165
C4'	B	0, 0.079, 0.245, 0.411, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.245 std_dev=0.166
O5'	B	0, 0.098, 0.265, 0.433, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.265 std_dev=0.168
C3'	A	0, -0.005, 0.164, 0.332, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.164 std_dev=0.169
OP1	B	0, 0.137, 0.309, 0.481, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.309 std_dev=0.172
N1	B	0, 0.072, 0.248, 0.424, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.248 std_dev=0.176
O3'	A	0, 0.031, 0.210, 0.390, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.210 std_dev=0.179
C2	B	0, 0.068, 0.259, 0.450, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.259 std_dev=0.191
N3	B	0, 0.081, 0.272, 0.464, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.272 std_dev=0.192
C3'	B	0, 0.070, 0.275, 0.479, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.275 std_dev=0.204
C2'	B	0, 0.077, 0.288, 0.499, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.288 std_dev=0.211
C6	B	0, 0.065, 0.280, 0.495, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.280 std_dev=0.215
C4	B	0, 0.067, 0.284, 0.501, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.284 std_dev=0.217
O3'	B	0, 0.083, 0.316, 0.549, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.316 std_dev=0.233
C4'	A	0, -0.058, 0.176, 0.409, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.176 std_dev=0.234
O2	B	0, 0.056, 0.298, 0.539, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.298 std_dev=0.242
C5	B	0, 0.051, 0.297, 0.544, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.297 std_dev=0.246
O2'	B	0, 0.129, 0.375, 0.622, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.375 std_dev=0.247
O4	B	0, 0.073, 0.330, 0.586, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.330 std_dev=0.257
P	A	0, 0.033, 0.307, 0.580, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.307 std_dev=0.274
OP1	A	0, 0.062, 0.382, 0.703, 1.844 max_d=1.844 avg_d=0.382 std_dev=0.320
O5'	A	0, -0.051, 0.327, 0.705, 1.871 max_d=1.871 avg_d=0.327 std_dev=0.378
OP2	A	0, 0.062, 0.470, 0.879, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.470 std_dev=0.409
C5'	A	0, -0.132, 0.322, 0.776, 1.859 max_d=1.859 avg_d=0.322 std_dev=0.454

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.09	0.02	0.20	0.31	0.13
C2	0.04	0.00	0.07	0.05	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.07	0.08	0.19	0.01	0.11	0.26	0.11
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.05	0.06	0.09	0.07	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.17	0.04	0.22	0.33	0.18
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.07	0.05	0.07	0.04	0.07	0.04	0.02	0.01	0.02	0.27	0.06	0.20	0.36	0.22
C4	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.04	0.04	0.18	0.01	0.13	0.26	0.10
C4'	0.02	0.07	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.09	0.04	0.10	0.07	0.09	0.03	0.07	0.02	0.00	0.02	0.05	0.15	0.30	0.08
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.05	0.02	0.22	0.01	0.10	0.26	0.12
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.09	0.01	0.15	0.00	0.14	0.21	0.10	0.10	0.07	0.22	0.10	0.06	0.05	0.02	0.01	0.18	0.21	0.30	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.04	0.24	0.01	0.09	0.26	0.13
C8	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.09	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.04	0.20	0.01	0.15	0.27	0.13
N1	0.03	0.00	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.06	0.06	0.22	0.01	0.09	0.26	0.11
N2	0.05	0.00	0.09	0.07	0.01	0.10	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.10	0.10	0.19	0.02	0.12	0.27	0.11
N3	0.04	0.01	0.07	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.07	0.17	0.01	0.13	0.27	0.11
N7	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.02	0.23	0.01	0.12	0.28	0.15
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.16	0.01	0.16	0.28	0.11
O2'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.06	0.07	0.06	0.06	0.08	0.06	0.09	0.13	0.10	0.06	0.03	0.00	0.04	0.04	0.15	0.08	0.21	0.35	0.18
O3'	0.03	0.07	0.02	0.01	0.04	0.02	0.05	0.05	0.05	0.07	0.06	0.10	0.06	0.07	0.04	0.04	0.00	0.03	0.31	0.06	0.20	0.37	0.22
O4'	0.00	0.08	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.02	0.04	0.04	0.06	0.10	0.07	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.11	0.04	0.20	0.33	0.13
O5'	0.09	0.19	0.17	0.27	0.18	0.02	0.22	0.01	0.24	0.20	0.22	0.19	0.17	0.23	0.16	0.15	0.31	0.11	0.00	0.26	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.06	0.04	0.26	0.00	0.10	0.28	0.16
OP1	0.20	0.11	0.22	0.20	0.13	0.15	0.10	0.21	0.09	0.15	0.09	0.12	0.13	0.12	0.16	0.21	0.20	0.20	0.03	0.10	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.26	0.33	0.36	0.26	0.30	0.26	0.30	0.26	0.27	0.26	0.27	0.27	0.28	0.28	0.35	0.37	0.33	0.02	0.28	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.11	0.18	0.22	0.10	0.08	0.12	0.01	0.13	0.13	0.11	0.11	0.11	0.15	0.11	0.18	0.22	0.13	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.15	0.12	0.10	0.16	0.10	0.22	0.10	0.19	0.12	0.14	0.24	0.17	0.11	0.20	0.09	0.11	0.09	0.09	0.09
C2	0.11	0.13	0.11	0.09	0.12	0.09	0.20	0.09	0.19	0.11	0.11	0.19	0.15	0.10	0.14	0.09	0.10	0.09	0.09	0.09
C2'	0.14	0.17	0.15	0.13	0.18	0.12	0.23	0.12	0.21	0.15	0.16	0.24	0.20	0.14	0.21	0.13	0.11	0.11	0.10	0.09
C3'	0.11	0.12	0.12	0.11	0.19	0.11	0.24	0.11	0.20	0.12	0.13	0.19	0.18	0.12	0.24	0.11	0.10	0.10	0.09	0.08
C4	0.11	0.13	0.10	0.09	0.13	0.09	0.21	0.09	0.19	0.11	0.11	0.22	0.16	0.10	0.16	0.08	0.10	0.09	0.09	0.08
C4'	0.16	0.16	0.17	0.16	0.28	0.16	0.31	0.15	0.27	0.19	0.20	0.18	0.22	0.17	0.33	0.16	0.18	0.15	0.15	0.15
C5	0.10	0.13	0.10	0.08	0.13	0.08	0.21	0.09	0.19	0.11	0.11	0.21	0.16	0.09	0.16	0.08	0.09	0.10	0.11	0.09
C5'	0.17	0.21	0.18	0.16	0.34	0.14	0.35	0.12	0.29	0.22	0.27	0.20	0.22	0.16	0.42	0.15	0.16	0.16	0.14	0.14
C6	0.11	0.13	0.10	0.09	0.13	0.09	0.21	0.10	0.19	0.11	0.11	0.20	0.16	0.09	0.15	0.09	0.10	0.11	0.12	0.10
C8	0.10	0.15	0.11	0.08	0.15	0.08	0.22	0.08	0.19	0.12	0.13	0.23	0.17	0.10	0.19	0.08	0.09	0.09	0.10	0.09
N1	0.12	0.13	0.11	0.10	0.13	0.09	0.20	0.10	0.19	0.12	0.12	0.19	0.16	0.10	0.15	0.10	0.10	0.10	0.11	0.09
N2	0.12	0.14	0.12	0.10	0.14	0.10	0.19	0.11	0.19	0.13	0.13	0.19	0.15	0.10	0.14	0.10	0.11	0.09	0.10	0.10
N3	0.11	0.13	0.11	0.09	0.12	0.10	0.20	0.10	0.19	0.11	0.10	0.21	0.16	0.10	0.14	0.09	0.10	0.09	0.09	0.09
N7	0.10	0.14	0.10	0.08	0.15	0.08	0.22	0.09	0.19	0.11	0.12	0.22	0.17	0.09	0.18	0.08	0.09	0.10	0.11	0.09
N9	0.11	0.15	0.11	0.09	0.15	0.09	0.22	0.09	0.19	0.12	0.13	0.23	0.17	0.10	0.19	0.09	0.10	0.09	0.09	0.08
O2'	0.16	0.19	0.16	0.15	0.23	0.14	0.27	0.15	0.24	0.18	0.20	0.24	0.19	0.15	0.26	0.16	0.15	0.15	0.13	0.13
O3'	0.12	0.14	0.12	0.12	0.18	0.12	0.22	0.12	0.19	0.13	0.15	0.21	0.16	0.13	0.23	0.13	0.12	0.10	0.09	0.09
O4'	0.12	0.16	0.13	0.12	0.19	0.12	0.24	0.12	0.20	0.14	0.16	0.24	0.18	0.13	0.23	0.11	0.14	0.13	0.13	0.13
O5'	0.11	0.15	0.12	0.11	0.09	0.12	0.10	0.12	0.10	0.11	0.14	0.22	0.18	0.12	0.11	0.11	0.14	0.20	0.19	0.18
O6	0.11	0.13	0.11	0.10	0.14	0.10	0.21	0.11	0.19	0.12	0.12	0.19	0.16	0.10	0.15	0.10	0.11	0.14	0.15	0.12
OP1	0.16	0.13	0.16	0.16	0.23	0.16	0.29	0.16	0.26	0.17	0.16	0.15	0.21	0.17	0.29	0.16	0.15	0.13	0.13	0.13
OP2	0.34	0.31	0.34	0.32	0.40	0.32	0.44	0.30	0.41	0.35	0.35	0.29	0.40	0.33	0.45	0.32	0.30	0.30	0.30	0.29
P	0.15	0.13	0.16	0.14	0.20	0.15	0.25	0.14	0.22	0.15	0.15	0.16	0.23	0.16	0.25	0.14	0.14	0.14	0.13	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.10	0.14	0.07
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.01	0.02	0.09	0.14	0.14	0.09
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.08	0.03	0.04	0.11	0.00	0.01	0.06	0.01	0.04	0.11	0.13	0.07
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.07	0.04	0.05	0.09	0.02	0.01	0.07	0.02	0.05	0.10	0.11	0.07
C4	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.03	0.12	0.16	0.12	0.12
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.04	0.06	0.03	0.04	0.00	0.01	0.06	0.10	0.04
C5	0.02	0.01	0.08	0.08	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.09	0.01	0.04	0.12	0.16	0.12	0.12
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.08	0.05	0.06	0.04	0.06	0.04	0.09	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.07	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.04	0.11	0.14	0.12	0.10
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.08	0.13	0.13	0.09
N3	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.01	0.02	0.10	0.15	0.13	0.10
O2	0.04	0.01	0.11	0.09	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.10	0.01	0.04	0.08	0.15	0.16	0.10
O2'	0.03	0.05	0.00	0.02	0.06	0.06	0.07	0.06	0.06	0.03	0.05	0.09	0.00	0.03	0.07	0.06	0.05	0.10	0.14	0.08
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.03	0.09	0.04	0.08	0.03	0.05	0.10	0.03	0.00	0.08	0.02	0.08	0.12	0.10	0.09
O4	0.02	0.01	0.06	0.07	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.03	0.13	0.17	0.12	0.13
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.02	0.04	0.06	0.02	0.03	0.00	0.05	0.11	0.15	0.09
O5'	0.04	0.09	0.04	0.05	0.12	0.01	0.12	0.01	0.11	0.08	0.10	0.08	0.05	0.08	0.13	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.14	0.11	0.10	0.16	0.06	0.16	0.02	0.14	0.13	0.15	0.15	0.10	0.12	0.17	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.14	0.14	0.13	0.11	0.12	0.10	0.12	0.06	0.12	0.13	0.13	0.16	0.14	0.10	0.12	0.15	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.09	0.07	0.07	0.12	0.04	0.12	0.01	0.10	0.09	0.10	0.10	0.08	0.09	0.13	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00