Doublet Group distance statistics: 53637

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 2, 2, 3, 6, 4, 3, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.008, 0.016, 0.023, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.011, 0.023, 0.036, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.016, 0.029, 0.042, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.029 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.021, 0.035, 0.050, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.035 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.018, 0.033, 0.048, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.033 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.005, 0.021, 0.036, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.021 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.025, 0.046, 0.067, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.046 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.033, 0.068, 0.104, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.068 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.038, 0.141, 0.244, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.141 std_dev=0.103
C2'	A	0, 0.056, 0.165, 0.274, 0.521 max_d=0.521 avg_d=0.165 std_dev=0.109
O2'	A	0, 0.096, 0.234, 0.372, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.234 std_dev=0.138
C4'	A	0, 0.071, 0.221, 0.371, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.221 std_dev=0.150
C3'	A	0, 0.088, 0.256, 0.425, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.256 std_dev=0.168
P	B	0, 0.249, 0.479, 0.709, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.479 std_dev=0.230
O3'	A	0, 0.131, 0.373, 0.615, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.373 std_dev=0.242
O5'	A	0, 0.085, 0.342, 0.599, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.342 std_dev=0.257
C5'	A	0, 0.108, 0.369, 0.629, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.369 std_dev=0.260
OP2	B	0, 0.323, 0.595, 0.868, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.595 std_dev=0.272
P	A	0, 0.126, 0.531, 0.937, 1.799 max_d=1.799 avg_d=0.531 std_dev=0.406
OP1	B	0, 0.419, 0.849, 1.278, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.849 std_dev=0.429
OP1	A	0, 0.128, 0.597, 1.066, 2.246 max_d=2.246 avg_d=0.597 std_dev=0.469
O5'	B	0, 0.362, 0.851, 1.340, 1.706 max_d=1.706 avg_d=0.851 std_dev=0.489
OP2	A	0, 0.143, 0.670, 1.196, 1.995 max_d=1.995 avg_d=0.670 std_dev=0.527
C5'	B	0, 0.229, 0.765, 1.302, 2.141 max_d=2.141 avg_d=0.765 std_dev=0.536
C4'	B	0, 0.169, 0.859, 1.549, 3.431 max_d=3.431 avg_d=0.859 std_dev=0.690
O4'	B	0, 0.121, 0.860, 1.599, 3.819 max_d=3.819 avg_d=0.860 std_dev=0.739
C3'	B	0, 0.138, 0.908, 1.678, 3.982 max_d=3.982 avg_d=0.908 std_dev=0.770
C5	B	0, -0.010, 0.783, 1.575, 4.023 max_d=4.023 avg_d=0.783 std_dev=0.792
C6	B	0, -0.005, 0.804, 1.613, 4.147 max_d=4.147 avg_d=0.804 std_dev=0.809
C4	B	0, -0.059, 0.775, 1.609, 4.190 max_d=4.190 avg_d=0.775 std_dev=0.834
O4	B	0, -0.037, 0.800, 1.638, 4.166 max_d=4.166 avg_d=0.800 std_dev=0.837
N1	B	0, -0.015, 0.833, 1.681, 4.450 max_d=4.450 avg_d=0.833 std_dev=0.848
N3	B	0, -0.038, 0.819, 1.677, 4.464 max_d=4.464 avg_d=0.819 std_dev=0.857
C2	B	0, -0.008, 0.855, 1.718, 4.611 max_d=4.611 avg_d=0.855 std_dev=0.863
C1'	B	0, 0.007, 0.893, 1.778, 4.680 max_d=4.680 avg_d=0.893 std_dev=0.885
O2	B	0, 0.034, 0.928, 1.822, 4.882 max_d=4.882 avg_d=0.928 std_dev=0.894
O3'	B	0, 0.171, 1.065, 1.959, 4.517 max_d=4.517 avg_d=1.065 std_dev=0.894
C2'	B	0, 0.023, 0.969, 1.914, 5.010 max_d=5.010 avg_d=0.969 std_dev=0.946
O2'	B	0, -0.029, 1.128, 2.285, 6.071 max_d=6.071 avg_d=1.128 std_dev=1.157

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.03	0.07	0.15	0.07
C2	0.04	0.00	0.13	0.14	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.18	0.04	0.10	0.03	0.13	0.25	0.15
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.07	0.02	0.05	0.02	0.08	0.07	0.10	0.15	0.12	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.07	0.08	0.16	0.06
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.10	0.10	0.12	0.16	0.13	0.09	0.04	0.03	0.01	0.01	0.10	0.10	0.10	0.16	0.07
C4	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.09	0.02	0.11	0.22	0.13
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.06	0.06	0.07	0.05	0.05	0.03	0.06	0.02	0.00	0.02	0.06	0.08	0.11	0.03
C5	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.02	0.10	0.01	0.14	0.24	0.16
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.08	0.08	0.07	0.07	0.06	0.08	0.04	0.06	0.03	0.01	0.01	0.09	0.08	0.08	0.02
C6	0.03	0.02	0.08	0.10	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.09	0.12	0.03	0.11	0.01	0.17	0.26	0.18
C8	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02	0.10	0.03	0.12	0.20	0.14
N1	0.03	0.01	0.10	0.12	0.02	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.13	0.16	0.04	0.11	0.03	0.15	0.26	0.17
N2	0.05	0.01	0.15	0.16	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.18	0.23	0.06	0.10	0.04	0.13	0.25	0.14
N3	0.04	0.01	0.12	0.13	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.16	0.04	0.09	0.03	0.11	0.22	0.13
N7	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02	0.11	0.03	0.16	0.24	0.17
N9	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.08	0.02	0.09	0.18	0.11
O2'	0.02	0.15	0.01	0.03	0.07	0.06	0.07	0.06	0.09	0.05	0.13	0.18	0.13	0.05	0.03	0.00	0.05	0.04	0.06	0.09	0.11	0.15	0.07
O3'	0.01	0.18	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.03	0.12	0.11	0.16	0.23	0.16	0.11	0.04	0.05	0.00	0.02	0.13	0.12	0.14	0.18	0.09
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.04	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.09	0.03	0.08	0.12	0.06
O5'	0.06	0.10	0.06	0.10	0.09	0.02	0.10	0.01	0.11	0.10	0.11	0.10	0.09	0.11	0.08	0.06	0.13	0.09	0.00	0.13	0.01	0.02	0.01
O6	0.03	0.03	0.07	0.10	0.02	0.06	0.01	0.09	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.09	0.12	0.03	0.13	0.00	0.20	0.28	0.20
OP1	0.07	0.13	0.08	0.10	0.11	0.08	0.14	0.08	0.17	0.12	0.15	0.13	0.11	0.16	0.09	0.11	0.14	0.08	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.25	0.16	0.16	0.22	0.11	0.24	0.08	0.26	0.20	0.26	0.25	0.22	0.24	0.18	0.15	0.18	0.12	0.02	0.28	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.15	0.06	0.07	0.13	0.03	0.16	0.02	0.18	0.14	0.17	0.14	0.13	0.17	0.11	0.07	0.09	0.06	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.28	0.28	0.17	0.28	0.18	0.29	0.15	0.29	0.28	0.29	0.29	0.33	0.19	0.31	0.29	0.22	0.18	0.27	0.14
C2	0.27	0.25	0.25	0.20	0.30	0.16	0.28	0.12	0.27	0.26	0.27	0.24	0.26	0.24	0.37	0.30	0.21	0.20	0.31	0.13
C2'	0.29	0.32	0.28	0.13	0.37	0.18	0.35	0.12	0.32	0.31	0.36	0.33	0.35	0.11	0.42	0.28	0.19	0.14	0.20	0.13
C3'	0.36	0.41	0.34	0.19	0.45	0.23	0.42	0.15	0.39	0.38	0.45	0.42	0.42	0.17	0.51	0.33	0.21	0.17	0.21	0.13
C4	0.31	0.32	0.28	0.18	0.37	0.18	0.36	0.13	0.34	0.32	0.35	0.31	0.31	0.21	0.42	0.31	0.23	0.21	0.32	0.14
C4'	0.28	0.30	0.25	0.11	0.32	0.16	0.32	0.11	0.30	0.28	0.32	0.31	0.33	0.10	0.35	0.28	0.20	0.15	0.24	0.11
C5	0.36	0.39	0.31	0.21	0.46	0.21	0.44	0.16	0.41	0.38	0.43	0.38	0.34	0.23	0.52	0.34	0.28	0.26	0.37	0.16
C5'	0.32	0.35	0.28	0.12	0.37	0.19	0.36	0.11	0.34	0.33	0.37	0.36	0.37	0.11	0.39	0.31	0.20	0.17	0.26	0.10
C6	0.37	0.40	0.31	0.24	0.48	0.22	0.46	0.19	0.43	0.39	0.44	0.38	0.33	0.26	0.54	0.36	0.30	0.29	0.40	0.18
C8	0.37	0.40	0.33	0.20	0.45	0.21	0.43	0.15	0.40	0.38	0.43	0.40	0.38	0.21	0.50	0.34	0.26	0.24	0.34	0.15
N1	0.32	0.33	0.28	0.22	0.41	0.18	0.39	0.16	0.36	0.33	0.36	0.31	0.28	0.27	0.47	0.32	0.27	0.26	0.39	0.16
N2	0.24	0.20	0.25	0.22	0.25	0.18	0.21	0.14	0.20	0.21	0.21	0.21	0.25	0.27	0.32	0.31	0.18	0.17	0.24	0.13
N3	0.27	0.24	0.25	0.17	0.27	0.16	0.26	0.12	0.27	0.26	0.25	0.25	0.28	0.21	0.32	0.30	0.20	0.18	0.28	0.13
N7	0.40	0.43	0.34	0.22	0.50	0.23	0.47	0.18	0.44	0.42	0.47	0.42	0.39	0.23	0.55	0.36	0.29	0.27	0.37	0.16
N9	0.32	0.33	0.29	0.18	0.37	0.19	0.36	0.13	0.34	0.33	0.36	0.33	0.34	0.20	0.41	0.31	0.23	0.21	0.31	0.14
O2'	0.25	0.26	0.25	0.14	0.26	0.19	0.26	0.19	0.25	0.25	0.26	0.27	0.31	0.14	0.30	0.27	0.23	0.17	0.21	0.18
O3'	0.42	0.48	0.43	0.31	0.52	0.31	0.47	0.23	0.44	0.44	0.52	0.49	0.51	0.30	0.57	0.37	0.24	0.21	0.19	0.20
O4'	0.27	0.27	0.28	0.18	0.27	0.18	0.29	0.15	0.29	0.27	0.27	0.28	0.33	0.21	0.29	0.29	0.23	0.20	0.29	0.15
O5'	0.34	0.37	0.28	0.13	0.40	0.19	0.39	0.13	0.36	0.35	0.40	0.38	0.36	0.11	0.44	0.31	0.25	0.19	0.28	0.08
O6	0.42	0.45	0.35	0.27	0.53	0.27	0.51	0.24	0.48	0.44	0.49	0.43	0.37	0.29	0.59	0.40	0.35	0.34	0.43	0.21
OP1	0.42	0.44	0.36	0.19	0.45	0.26	0.44	0.15	0.43	0.43	0.46	0.46	0.46	0.15	0.47	0.39	0.25	0.23	0.29	0.11
OP2	0.55	0.58	0.47	0.31	0.61	0.36	0.58	0.27	0.56	0.56	0.61	0.59	0.56	0.28	0.64	0.50	0.35	0.32	0.38	0.23
P	0.41	0.44	0.34	0.17	0.46	0.24	0.45	0.16	0.43	0.42	0.46	0.45	0.42	0.15	0.49	0.38	0.27	0.24	0.32	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.01	0.13	0.15	0.23	0.20
C2	0.02	0.00	0.13	0.09	0.01	0.02	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.01	0.19	0.12	0.02	0.05	0.22	0.15	0.28	0.16
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.06	0.01	0.10	0.03	0.12	0.03	0.10	0.24	0.01	0.02	0.07	0.01	0.09	0.20	0.20	0.13
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.17	0.01	0.25	0.03	0.25	0.09	0.10	0.18	0.02	0.01	0.18	0.01	0.09	0.29	0.17	0.10
C4	0.02	0.01	0.06	0.17	0.00	0.11	0.01	0.23	0.01	0.02	0.01	0.02	0.10	0.18	0.01	0.04	0.35	0.26	0.37	0.25
C4'	0.02	0.02	0.01	0.01	0.11	0.00	0.15	0.01	0.15	0.05	0.05	0.08	0.06	0.02	0.12	0.01	0.02	0.09	0.09	0.10
C5	0.02	0.01	0.10	0.25	0.01	0.15	0.00	0.28	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.27	0.02	0.06	0.40	0.29	0.38	0.29
C5'	0.03	0.10	0.03	0.03	0.23	0.01	0.28	0.00	0.25	0.12	0.15	0.08	0.05	0.02	0.25	0.02	0.01	0.08	0.03	0.02
C6	0.02	0.02	0.12	0.25	0.01	0.15	0.00	0.25	0.00	0.01	0.02	0.02	0.07	0.26	0.02	0.07	0.36	0.22	0.30	0.22
N1	0.01	0.01	0.03	0.09	0.02	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.08	0.02	0.01	0.23	0.15	0.26	0.17
N3	0.01	0.01	0.10	0.10	0.01	0.05	0.02	0.15	0.02	0.01	0.00	0.02	0.17	0.12	0.01	0.04	0.28	0.19	0.32	0.19
O2	0.05	0.01	0.24	0.18	0.02	0.08	0.02	0.08	0.02	0.02	0.02	0.00	0.32	0.25	0.03	0.09	0.17	0.14	0.27	0.17
O2'	0.02	0.19	0.01	0.02	0.10	0.06	0.06	0.05	0.07	0.05	0.17	0.32	0.00	0.04	0.12	0.07	0.08	0.17	0.17	0.09
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.18	0.02	0.27	0.02	0.26	0.08	0.12	0.25	0.04	0.00	0.19	0.01	0.15	0.43	0.24	0.15
O4	0.03	0.02	0.07	0.18	0.01	0.12	0.02	0.25	0.02	0.02	0.01	0.03	0.12	0.19	0.00	0.04	0.37	0.30	0.41	0.29
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.01	0.04	0.09	0.07	0.01	0.04	0.00	0.12	0.24	0.26	0.27
O5'	0.13	0.22	0.09	0.09	0.35	0.02	0.40	0.01	0.36	0.23	0.28	0.17	0.08	0.15	0.37	0.12	0.00	0.03	0.03	0.02
OP1	0.15	0.15	0.20	0.29	0.26	0.09	0.29	0.08	0.22	0.15	0.19	0.14	0.17	0.43	0.30	0.24	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.28	0.20	0.17	0.37	0.09	0.38	0.03	0.30	0.26	0.32	0.27	0.17	0.24	0.41	0.26	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.16	0.13	0.10	0.25	0.10	0.29	0.02	0.22	0.17	0.19	0.17	0.09	0.15	0.29	0.27	0.02	0.01	0.01	0.00