Doublet Group distance statistics: 53638

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 5, 3, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.015, 0.022, 0.030, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.022 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.019, 0.028, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.028 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.014, 0.022, 0.031, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.022 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.008, 0.018, 0.027, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.018, 0.027, 0.037, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.027 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.022, 0.033, 0.043, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.033 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.011, 0.023, 0.034, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.023 std_dev=0.011
N2	A	0, 0.015, 0.031, 0.047, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.031 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.019, 0.036, 0.053, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.036 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.037, 0.054, 0.072, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.054 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.018, 0.037, 0.056, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.037 std_dev=0.019
P	B	0, 0.187, 0.338, 0.488, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.338 std_dev=0.150
O4'	A	0, 0.124, 0.281, 0.439, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.281 std_dev=0.158
C2'	A	0, 0.183, 0.347, 0.510, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.347 std_dev=0.164
O3'	A	0, 0.200, 0.380, 0.560, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.380 std_dev=0.180
C3'	A	0, 0.209, 0.395, 0.582, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.395 std_dev=0.187
C4'	A	0, 0.143, 0.331, 0.520, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.331 std_dev=0.189
O5'	B	0, 0.126, 0.356, 0.587, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.356 std_dev=0.231
C4	B	0, 0.357, 0.605, 0.853, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.605 std_dev=0.248
OP2	B	0, 0.112, 0.366, 0.621, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.366 std_dev=0.255
C5	B	0, 0.270, 0.533, 0.795, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.533 std_dev=0.262
N3	B	0, 0.410, 0.675, 0.940, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.675 std_dev=0.265
O2'	A	0, 0.243, 0.517, 0.791, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.517 std_dev=0.274
C6	B	0, 0.245, 0.521, 0.798, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.521 std_dev=0.276
C2	B	0, 0.384, 0.666, 0.948, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.666 std_dev=0.282
O4	B	0, 0.373, 0.656, 0.939, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.656 std_dev=0.283
N1	B	0, 0.279, 0.568, 0.857, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.568 std_dev=0.289
OP1	B	0, 0.192, 0.505, 0.818, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.505 std_dev=0.313
O2	B	0, 0.415, 0.757, 1.099, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.757 std_dev=0.342
C5'	A	0, 0.328, 0.671, 1.014, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.671 std_dev=0.343
C5'	B	0, 0.090, 0.435, 0.779, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.435 std_dev=0.345
C1'	B	0, 0.190, 0.553, 0.915, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.553 std_dev=0.362
O4'	B	0, 0.126, 0.505, 0.884, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.505 std_dev=0.379
O5'	A	0, 0.291, 0.685, 1.078, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.685 std_dev=0.393
P	A	0, 0.226, 0.631, 1.035, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.631 std_dev=0.404
OP1	A	0, 0.195, 0.606, 1.016, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.606 std_dev=0.411
C2'	B	0, 0.145, 0.556, 0.967, 1.552 max_d=1.552 avg_d=0.556 std_dev=0.411
C4'	B	0, 0.042, 0.470, 0.897, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.470 std_dev=0.428
O2'	B	0, 0.265, 0.706, 1.147, 1.679 max_d=1.679 avg_d=0.706 std_dev=0.441
C3'	B	0, 0.048, 0.514, 0.980, 1.778 max_d=1.778 avg_d=0.514 std_dev=0.466
OP2	A	0, 0.321, 0.821, 1.321, 1.842 max_d=1.842 avg_d=0.821 std_dev=0.500
O3'	B	0, 0.083, 0.597, 1.110, 1.978 max_d=1.978 avg_d=0.597 std_dev=0.513

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.04	0.01	0.12	0.14	0.10
C2	0.02	0.00	0.09	0.04	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.08	0.12	0.15	0.01	0.16	0.26	0.18
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.09	0.04	0.07	0.07	0.11	0.09	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.09	0.04	0.13	0.06	0.05
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.06	0.02	0.06	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.16	0.03	0.05
C4	0.01	0.01	0.05	0.02	0.00	0.06	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.05	0.06	0.15	0.01	0.15	0.24	0.17
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.07	0.08	0.09	0.07	0.08	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.12	0.05	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.07	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.05	0.03	0.20	0.01	0.18	0.29	0.21
C5'	0.07	0.18	0.09	0.01	0.18	0.00	0.22	0.00	0.23	0.21	0.21	0.18	0.16	0.23	0.16	0.07	0.04	0.01	0.01	0.25	0.05	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.08	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.05	0.06	0.22	0.00	0.19	0.32	0.24
C8	0.01	0.01	0.07	0.06	0.00	0.07	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.07	0.07	0.20	0.01	0.18	0.24	0.19
N1	0.01	0.00	0.07	0.02	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.06	0.10	0.18	0.00	0.18	0.30	0.22
N2	0.02	0.00	0.11	0.06	0.01	0.09	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.26	0.10	0.15	0.14	0.01	0.16	0.25	0.18
N3	0.02	0.00	0.09	0.04	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.07	0.12	0.12	0.01	0.14	0.22	0.16
N7	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.08	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.06	0.04	0.23	0.01	0.20	0.29	0.22
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.13	0.01	0.14	0.20	0.15
O2'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.11	0.02	0.08	0.07	0.11	0.10	0.17	0.26	0.20	0.08	0.04	0.00	0.04	0.02	0.07	0.09	0.14	0.05	0.05
O3'	0.06	0.08	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.04	0.05	0.07	0.06	0.10	0.07	0.06	0.05	0.04	0.00	0.08	0.09	0.05	0.17	0.07	0.08
O4'	0.00	0.12	0.02	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.07	0.10	0.15	0.12	0.04	0.01	0.02	0.08	0.00	0.04	0.05	0.13	0.16	0.12
O5'	0.04	0.15	0.09	0.06	0.15	0.01	0.20	0.01	0.22	0.20	0.18	0.14	0.12	0.23	0.13	0.07	0.09	0.04	0.00	0.25	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.08	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.05	0.05	0.25	0.00	0.21	0.36	0.26
OP1	0.12	0.16	0.13	0.16	0.15	0.12	0.18	0.05	0.19	0.18	0.18	0.16	0.14	0.20	0.14	0.14	0.17	0.13	0.02	0.21	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.26	0.06	0.03	0.24	0.05	0.29	0.06	0.32	0.24	0.30	0.25	0.22	0.29	0.20	0.05	0.07	0.16	0.01	0.36	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.18	0.05	0.05	0.17	0.04	0.21	0.01	0.24	0.19	0.22	0.18	0.16	0.22	0.15	0.05	0.08	0.12	0.00	0.26	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.14	0.07	0.06	0.13	0.07	0.12	0.12	0.11	0.09	0.17	0.17	0.10	0.09	0.20	0.12	0.10	0.15	0.16	0.09
C2	0.08	0.20	0.08	0.08	0.18	0.07	0.09	0.13	0.06	0.09	0.23	0.23	0.10	0.06	0.21	0.14	0.12	0.17	0.14	0.10
C2'	0.16	0.14	0.15	0.15	0.12	0.16	0.19	0.18	0.19	0.15	0.15	0.16	0.14	0.16	0.13	0.18	0.16	0.18	0.22	0.16
C3'	0.14	0.15	0.10	0.11	0.14	0.12	0.15	0.14	0.15	0.14	0.17	0.17	0.11	0.13	0.15	0.16	0.10	0.16	0.18	0.11
C4	0.08	0.13	0.12	0.12	0.16	0.11	0.15	0.18	0.14	0.06	0.19	0.18	0.13	0.09	0.23	0.10	0.14	0.16	0.13	0.11
C4'	0.11	0.11	0.08	0.07	0.10	0.08	0.13	0.12	0.13	0.10	0.13	0.14	0.10	0.10	0.13	0.13	0.09	0.21	0.14	0.10
C5	0.20	0.23	0.24	0.23	0.26	0.21	0.27	0.26	0.26	0.21	0.28	0.25	0.23	0.19	0.30	0.19	0.20	0.17	0.12	0.14
C5'	0.13	0.11	0.14	0.13	0.11	0.13	0.16	0.19	0.16	0.12	0.12	0.13	0.14	0.14	0.13	0.14	0.19	0.27	0.19	0.19
C6	0.26	0.30	0.30	0.29	0.28	0.27	0.28	0.31	0.30	0.27	0.31	0.32	0.29	0.25	0.29	0.24	0.24	0.18	0.13	0.16
C8	0.17	0.18	0.20	0.19	0.23	0.18	0.25	0.24	0.22	0.17	0.21	0.20	0.19	0.15	0.31	0.17	0.17	0.15	0.12	0.12
N1	0.13	0.21	0.21	0.20	0.20	0.17	0.18	0.24	0.19	0.15	0.24	0.25	0.21	0.16	0.22	0.12	0.20	0.18	0.12	0.14
N2	0.19	0.25	0.12	0.10	0.22	0.14	0.15	0.10	0.15	0.20	0.26	0.27	0.14	0.12	0.22	0.25	0.13	0.18	0.20	0.10
N3	0.10	0.19	0.07	0.05	0.19	0.07	0.09	0.12	0.09	0.11	0.23	0.22	0.09	0.07	0.22	0.15	0.11	0.16	0.15	0.10
N7	0.25	0.28	0.28	0.26	0.32	0.25	0.32	0.29	0.30	0.27	0.32	0.30	0.27	0.22	0.36	0.24	0.21	0.17	0.12	0.14
N9	0.08	0.10	0.11	0.11	0.13	0.11	0.16	0.18	0.14	0.07	0.15	0.15	0.11	0.09	0.22	0.11	0.13	0.15	0.13	0.10
O2'	0.21	0.19	0.22	0.23	0.16	0.23	0.24	0.26	0.24	0.20	0.20	0.22	0.19	0.21	0.17	0.24	0.27	0.33	0.35	0.31
O3'	0.17	0.22	0.11	0.11	0.22	0.13	0.16	0.12	0.16	0.18	0.24	0.23	0.13	0.15	0.25	0.18	0.10	0.18	0.21	0.13
O4'	0.11	0.12	0.12	0.10	0.12	0.08	0.15	0.14	0.15	0.11	0.15	0.15	0.15	0.11	0.16	0.12	0.16	0.26	0.16	0.16
O5'	0.12	0.10	0.11	0.09	0.10	0.09	0.15	0.11	0.16	0.11	0.11	0.12	0.12	0.12	0.12	0.14	0.14	0.30	0.11	0.15
O6	0.38	0.40	0.40	0.40	0.33	0.39	0.34	0.39	0.37	0.38	0.38	0.44	0.39	0.36	0.33	0.38	0.29	0.20	0.17	0.20
OP1	0.20	0.19	0.18	0.16	0.19	0.15	0.21	0.10	0.21	0.19	0.20	0.20	0.20	0.18	0.20	0.21	0.19	0.40	0.11	0.21
OP2	0.21	0.17	0.18	0.18	0.15	0.19	0.21	0.17	0.22	0.19	0.16	0.19	0.18	0.21	0.15	0.24	0.28	0.48	0.22	0.31
P	0.17	0.15	0.15	0.13	0.15	0.13	0.19	0.09	0.20	0.16	0.16	0.17	0.16	0.17	0.16	0.20	0.20	0.41	0.12	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.07	0.10	0.06
C2	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.09	0.01	0.07	0.12	0.12	0.17	0.13
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.06	0.06	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.04	0.02	0.12	0.17	0.14	0.13
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.06	0.03	0.06	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.10	0.18	0.10	0.12
C4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.01	0.02	0.14	0.18	0.18	0.15
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.06	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.05	0.09	0.02
C5	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.04	0.01	0.05	0.12	0.16	0.16	0.13
C5'	0.03	0.12	0.06	0.03	0.13	0.01	0.12	0.00	0.10	0.08	0.13	0.13	0.06	0.03	0.14	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.04	0.01	0.06	0.10	0.11	0.14	0.10
N1	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.09	0.09	0.11	0.08
N3	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.08	0.01	0.05	0.14	0.16	0.20	0.16
O2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.13	0.01	0.13	0.12	0.12	0.21	0.14
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.06	0.09	0.02	0.07	0.14	0.00	0.03	0.05	0.02	0.15	0.26	0.17	0.19
O3'	0.04	0.09	0.01	0.00	0.05	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.08	0.13	0.03	0.00	0.06	0.04	0.10	0.21	0.08	0.12
O4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.15	0.21	0.21	0.17
O4'	0.00	0.07	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.05	0.13	0.02	0.04	0.03	0.00	0.09	0.12	0.17	0.11
O5'	0.06	0.12	0.12	0.10	0.14	0.02	0.12	0.01	0.10	0.09	0.14	0.12	0.15	0.10	0.15	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.07	0.12	0.17	0.18	0.18	0.05	0.16	0.02	0.11	0.09	0.16	0.12	0.26	0.21	0.21	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.17	0.14	0.10	0.18	0.09	0.16	0.07	0.14	0.11	0.20	0.21	0.17	0.08	0.21	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.13	0.13	0.12	0.15	0.02	0.13	0.01	0.10	0.08	0.16	0.14	0.19	0.12	0.17	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00