Doublet Group distance statistics: 53644

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.014, 0.027, 0.039, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.027 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.010, 0.029, 0.048, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.029 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.010, 0.029, 0.049, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.029 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.007, 0.028, 0.049, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.028 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.013, 0.035, 0.056, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.035 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.003, 0.025, 0.047, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.025 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.019, 0.042, 0.065, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.042 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.012, 0.036, 0.060, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.036 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.011, 0.041, 0.071, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.041 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.029, 0.069, 0.108, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.069 std_dev=0.040
N2	A	0, -0.002, 0.051, 0.104, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.051 std_dev=0.053
O4'	A	0, 0.354, 0.598, 0.842, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.598 std_dev=0.244
OP1	B	0, 0.396, 0.659, 0.922, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.659 std_dev=0.263
P	B	0, 0.436, 0.706, 0.976, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.706 std_dev=0.270
C2'	A	0, 0.374, 0.699, 1.023, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.699 std_dev=0.325
C4'	A	0, 0.564, 0.947, 1.331, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.947 std_dev=0.383
OP2	B	0, 0.595, 0.978, 1.362, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.978 std_dev=0.383
O5'	B	0, 0.629, 1.049, 1.469, 1.457 max_d=1.457 avg_d=1.049 std_dev=0.420
C1'	B	0, 0.679, 1.117, 1.555, 1.546 max_d=1.546 avg_d=1.117 std_dev=0.438
C5'	A	0, 0.507, 0.946, 1.386, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.946 std_dev=0.439
C3'	A	0, 0.723, 1.181, 1.639, 1.502 max_d=1.502 avg_d=1.181 std_dev=0.458
C4'	B	0, 0.788, 1.276, 1.765, 1.619 max_d=1.619 avg_d=1.276 std_dev=0.488
C5'	B	0, 0.754, 1.244, 1.733, 1.715 max_d=1.715 avg_d=1.244 std_dev=0.490
O4'	B	0, 0.655, 1.188, 1.721, 1.898 max_d=1.898 avg_d=1.188 std_dev=0.533
O2'	A	0, 0.847, 1.441, 2.035, 1.906 max_d=1.906 avg_d=1.441 std_dev=0.594
C2'	B	0, 0.790, 1.436, 2.083, 2.302 max_d=2.302 avg_d=1.436 std_dev=0.647
O2'	B	0, 1.034, 1.703, 2.372, 2.331 max_d=2.331 avg_d=1.703 std_dev=0.669
O3'	A	0, 1.308, 2.124, 2.940, 2.632 max_d=2.632 avg_d=2.124 std_dev=0.816
C3'	B	0, 1.393, 2.312, 3.231, 3.202 max_d=3.202 avg_d=2.312 std_dev=0.919
O5'	A	0, 1.574, 2.535, 3.496, 2.972 max_d=2.972 avg_d=2.535 std_dev=0.961
P	A	0, 1.662, 2.685, 3.708, 3.200 max_d=3.200 avg_d=2.685 std_dev=1.023
N1	B	0, 1.818, 2.925, 4.031, 3.437 max_d=3.437 avg_d=2.925 std_dev=1.107
OP1	A	0, 1.815, 2.961, 4.108, 3.803 max_d=3.803 avg_d=2.961 std_dev=1.146
C2	B	0, 2.146, 3.460, 4.774, 4.160 max_d=4.160 avg_d=3.460 std_dev=1.314
O2	B	0, 2.260, 3.655, 5.051, 4.487 max_d=4.487 avg_d=3.655 std_dev=1.395
O3'	B	0, 2.567, 4.154, 5.740, 5.189 max_d=5.189 avg_d=4.154 std_dev=1.586
C6	B	0, 3.058, 4.917, 6.776, 5.734 max_d=5.734 avg_d=4.917 std_dev=1.859
N3	B	0, 3.159, 5.086, 7.012, 6.007 max_d=6.007 avg_d=5.086 std_dev=1.926
OP2	A	0, 3.167, 5.098, 7.029, 5.932 max_d=5.932 avg_d=5.098 std_dev=1.931
C4	B	0, 3.980, 6.399, 8.818, 7.414 max_d=7.414 avg_d=6.399 std_dev=2.419
C5	B	0, 4.022, 6.466, 8.911, 7.470 max_d=7.470 avg_d=6.466 std_dev=2.444
O4	B	0, 4.859, 7.812, 10.766, 9.043 max_d=9.043 avg_d=7.812 std_dev=2.954

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.06	0.04	0.02	0.01	0.02	0.16	0.01	0.10	0.04	0.09	0.17	0.07
C2	0.04	0.00	0.13	0.10	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.16	0.08	0.06	0.20	0.02	0.15	0.37	0.19
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.08	0.06	0.10	0.10	0.18	0.13	0.08	0.02	0.01	0.03	0.02	0.17	0.06	0.21	0.19	0.20
C3'	0.03	0.10	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.03	0.10	0.09	0.10	0.12	0.08	0.10	0.06	0.02	0.01	0.02	0.16	0.10	0.20	0.17	0.17
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.11	0.05	0.20	0.03	0.14	0.35	0.18
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.08	0.06	0.07	0.05	0.08	0.04	0.08	0.03	0.01	0.02	0.09	0.06	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.12	0.07	0.24	0.02	0.15	0.43	0.21
C5'	0.03	0.06	0.08	0.03	0.07	0.01	0.10	0.00	0.11	0.13	0.08	0.07	0.06	0.13	0.07	0.05	0.08	0.01	0.01	0.14	0.11	0.04	0.01
C6	0.03	0.02	0.06	0.10	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.11	0.12	0.07	0.25	0.01	0.16	0.47	0.23
C8	0.02	0.02	0.10	0.09	0.01	0.08	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.15	0.14	0.05	0.22	0.04	0.15	0.36	0.18
N1	0.04	0.01	0.10	0.10	0.02	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.12	0.09	0.07	0.23	0.02	0.16	0.44	0.22
N2	0.06	0.00	0.18	0.12	0.02	0.07	0.01	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.22	0.08	0.07	0.20	0.03	0.15	0.36	0.18
N3	0.04	0.01	0.13	0.08	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.16	0.09	0.06	0.18	0.03	0.14	0.33	0.17
N7	0.02	0.02	0.08	0.10	0.02	0.08	0.01	0.13	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.15	0.14	0.06	0.25	0.04	0.16	0.44	0.22
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.04	0.02	0.07	0.03	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.06	0.12	0.04	0.18	0.04	0.13	0.30	0.15
O2'	0.02	0.16	0.01	0.02	0.07	0.08	0.11	0.05	0.11	0.15	0.12	0.22	0.16	0.15	0.06	0.00	0.08	0.05	0.18	0.14	0.25	0.23	0.25
O3'	0.16	0.08	0.03	0.01	0.11	0.03	0.12	0.08	0.12	0.14	0.09	0.08	0.09	0.14	0.12	0.08	0.00	0.13	0.13	0.14	0.25	0.15	0.17
O4'	0.01	0.06	0.02	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.07	0.05	0.07	0.07	0.06	0.06	0.04	0.05	0.13	0.00	0.12	0.09	0.15	0.16	0.13
O5'	0.10	0.20	0.17	0.16	0.20	0.02	0.24	0.01	0.25	0.22	0.23	0.20	0.18	0.25	0.18	0.18	0.13	0.12	0.00	0.26	0.02	0.03	0.01
O6	0.04	0.02	0.06	0.10	0.03	0.09	0.02	0.14	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.14	0.14	0.09	0.26	0.00	0.16	0.51	0.25
OP1	0.09	0.15	0.21	0.20	0.14	0.06	0.15	0.11	0.16	0.15	0.16	0.15	0.14	0.16	0.13	0.25	0.25	0.15	0.02	0.16	0.00	0.02	0.01
OP2	0.17	0.37	0.19	0.17	0.35	0.04	0.43	0.04	0.47	0.36	0.44	0.36	0.33	0.44	0.30	0.23	0.15	0.16	0.03	0.51	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.19	0.20	0.17	0.18	0.02	0.21	0.01	0.23	0.18	0.22	0.18	0.17	0.22	0.15	0.25	0.17	0.13	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.21	0.12	0.15	0.63	0.15	0.75	0.14	0.61	0.33	0.37	0.12	0.19	0.38	0.72	0.09	0.10	0.25	0.05	0.08
C2	0.16	0.14	0.12	0.17	0.47	0.16	0.65	0.17	0.56	0.28	0.23	0.21	0.18	0.37	0.51	0.13	0.13	0.25	0.08	0.09
C2'	0.24	0.32	0.12	0.13	0.76	0.16	0.88	0.20	0.72	0.44	0.49	0.13	0.13	0.36	0.86	0.22	0.18	0.17	0.14	0.06
C3'	0.18	0.29	0.06	0.14	0.75	0.14	0.86	0.15	0.68	0.39	0.47	0.12	0.17	0.41	0.87	0.15	0.12	0.21	0.09	0.04
C4	0.16	0.15	0.14	0.17	0.52	0.16	0.69	0.15	0.58	0.29	0.27	0.19	0.20	0.37	0.58	0.12	0.11	0.25	0.11	0.07
C4'	0.16	0.25	0.11	0.16	0.70	0.17	0.80	0.15	0.63	0.35	0.43	0.10	0.20	0.40	0.81	0.10	0.09	0.27	0.05	0.07
C5	0.15	0.11	0.13	0.16	0.45	0.15	0.64	0.14	0.54	0.26	0.20	0.22	0.19	0.32	0.49	0.13	0.11	0.24	0.18	0.08
C5'	0.15	0.21	0.11	0.17	0.66	0.19	0.77	0.17	0.61	0.33	0.38	0.11	0.21	0.41	0.77	0.10	0.11	0.31	0.08	0.09
C6	0.15	0.09	0.12	0.15	0.37	0.14	0.58	0.14	0.51	0.23	0.13	0.26	0.17	0.29	0.40	0.14	0.10	0.23	0.22	0.08
C8	0.15	0.14	0.13	0.15	0.52	0.15	0.68	0.14	0.57	0.29	0.26	0.18	0.19	0.34	0.58	0.11	0.10	0.24	0.15	0.07
N1	0.15	0.10	0.12	0.15	0.38	0.15	0.58	0.15	0.52	0.24	0.15	0.26	0.17	0.30	0.40	0.15	0.12	0.25	0.18	0.08
N2	0.16	0.16	0.12	0.19	0.48	0.17	0.66	0.19	0.57	0.29	0.25	0.22	0.18	0.39	0.51	0.15	0.15	0.25	0.08	0.13
N3	0.16	0.18	0.14	0.18	0.54	0.17	0.70	0.16	0.59	0.31	0.30	0.18	0.21	0.40	0.60	0.12	0.13	0.25	0.06	0.09
N7	0.15	0.11	0.13	0.15	0.45	0.15	0.64	0.14	0.54	0.26	0.20	0.22	0.19	0.31	0.50	0.12	0.10	0.23	0.19	0.09
N9	0.16	0.17	0.13	0.16	0.56	0.16	0.71	0.14	0.59	0.31	0.30	0.16	0.20	0.37	0.63	0.11	0.10	0.25	0.09	0.07
O2'	0.29	0.31	0.23	0.28	0.72	0.32	0.83	0.34	0.67	0.42	0.46	0.19	0.28	0.50	0.81	0.29	0.30	0.18	0.17	0.14
O3'	0.12	0.23	0.17	0.28	0.70	0.26	0.78	0.23	0.58	0.30	0.43	0.17	0.33	0.57	0.84	0.10	0.16	0.31	0.08	0.13
O4'	0.19	0.23	0.19	0.23	0.62	0.23	0.74	0.19	0.59	0.33	0.37	0.17	0.27	0.43	0.72	0.14	0.14	0.31	0.06	0.13
O5'	0.28	0.35	0.18	0.10	0.81	0.07	0.94	0.05	0.77	0.48	0.53	0.13	0.15	0.27	0.92	0.23	0.11	0.33	0.18	0.19
O6	0.13	0.08	0.10	0.12	0.30	0.12	0.52	0.12	0.47	0.19	0.08	0.30	0.15	0.24	0.31	0.13	0.08	0.18	0.26	0.09
OP1	0.17	0.24	0.10	0.14	0.71	0.14	0.84	0.17	0.66	0.37	0.42	0.10	0.14	0.37	0.83	0.12	0.12	0.25	0.12	0.10
OP2	0.43	0.49	0.30	0.20	0.95	0.21	1.09	0.24	0.93	0.63	0.66	0.23	0.18	0.14	1.05	0.41	0.33	0.49	0.38	0.41
P	0.27	0.33	0.16	0.09	0.79	0.05	0.92	0.05	0.76	0.46	0.50	0.09	0.14	0.27	0.89	0.23	0.11	0.31	0.17	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.08	0.24	0.08
C2	0.01	0.00	0.08	0.15	0.01	0.12	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.13	0.02	0.10	0.28	0.25	0.16	0.21
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.14	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.23	0.10
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.03	0.13	0.25	0.02	0.01	0.08	0.01	0.10	0.08	0.22	0.12
C4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.06	0.00	0.02	0.14	0.12	0.28	0.06
C4'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.10	0.22	0.05	0.02	0.05	0.00	0.02	0.05	0.11	0.04
C5	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.03	0.01	0.08	0.12	0.22	0.50	0.25
C5'	0.02	0.19	0.01	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.15	0.04	0.17	0.35	0.05	0.03	0.10	0.02	0.01	0.05	0.07	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.09	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.06	0.01	0.10	0.14	0.25	0.51	0.28
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.07	0.09	0.27	0.07
N3	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.10	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.12	0.02	0.07	0.27	0.25	0.16	0.19
O2	0.02	0.01	0.14	0.25	0.02	0.22	0.01	0.35	0.01	0.01	0.02	0.00	0.18	0.23	0.03	0.19	0.48	0.46	0.32	0.43
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.05	0.05	0.09	0.05	0.10	0.03	0.07	0.18	0.00	0.02	0.05	0.04	0.07	0.06	0.22	0.09
O3'	0.02	0.13	0.01	0.01	0.06	0.02	0.03	0.03	0.06	0.02	0.12	0.23	0.02	0.00	0.08	0.02	0.10	0.16	0.28	0.17
O4	0.02	0.02	0.03	0.08	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.08	0.00	0.02	0.17	0.14	0.27	0.08
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.02	0.10	0.01	0.07	0.19	0.04	0.02	0.02	0.00	0.05	0.14	0.23	0.12
O5'	0.02	0.28	0.07	0.10	0.14	0.02	0.12	0.01	0.14	0.07	0.27	0.48	0.07	0.10	0.17	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.08	0.25	0.02	0.08	0.12	0.05	0.22	0.05	0.25	0.09	0.25	0.46	0.06	0.16	0.14	0.14	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.24	0.16	0.23	0.22	0.28	0.11	0.50	0.07	0.51	0.27	0.16	0.32	0.22	0.28	0.27	0.23	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.21	0.10	0.12	0.06	0.04	0.25	0.02	0.28	0.07	0.19	0.43	0.09	0.17	0.08	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00