Doublet Group distance statistics: 53647

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.002, 0.017, 0.032, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.017 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.017 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.006, 0.025, 0.044, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.019
N1	A	0, -0.002, 0.017, 0.036, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.017 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.005, 0.025, 0.045, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.025 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.007, 0.027, 0.047, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.020
C4	A	0, -0.005, 0.017, 0.038, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.017 std_dev=0.021
N3	A	0, -0.004, 0.028, 0.059, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.028 std_dev=0.032
C2	A	0, -0.007, 0.027, 0.060, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.027 std_dev=0.034
C1'	A	0, -0.006, 0.030, 0.065, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.030 std_dev=0.036
N3	B	0, 0.006, 0.081, 0.155, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.081 std_dev=0.075
N2	A	0, -0.011, 0.071, 0.153, 0.229 max_d=0.229 avg_d=0.071 std_dev=0.082
C4	B	0, 0.035, 0.119, 0.203, 0.218 max_d=0.218 avg_d=0.119 std_dev=0.084
C2'	A	0, -0.019, 0.066, 0.150, 0.231 max_d=0.231 avg_d=0.066 std_dev=0.084
C2	B	0, 0.049, 0.162, 0.274, 0.269 max_d=0.269 avg_d=0.162 std_dev=0.112
O2'	A	0, -0.024, 0.104, 0.232, 0.350 max_d=0.350 avg_d=0.104 std_dev=0.128
O3'	A	0, -0.014, 0.124, 0.261, 0.383 max_d=0.383 avg_d=0.124 std_dev=0.137
O4'	A	0, -0.037, 0.101, 0.238, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.101 std_dev=0.137
C3'	A	0, -0.049, 0.092, 0.234, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.092 std_dev=0.141
C5	B	0, 0.052, 0.193, 0.335, 0.331 max_d=0.331 avg_d=0.193 std_dev=0.141
P	A	0, 0.033, 0.177, 0.320, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.177 std_dev=0.144
N1	B	0, 0.032, 0.176, 0.319, 0.369 max_d=0.369 avg_d=0.176 std_dev=0.144
C4'	A	0, -0.042, 0.104, 0.251, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.104 std_dev=0.146
O4	B	0, 0.046, 0.193, 0.340, 0.360 max_d=0.360 avg_d=0.193 std_dev=0.147
C6	B	0, 0.050, 0.204, 0.358, 0.384 max_d=0.384 avg_d=0.204 std_dev=0.154
C1'	B	0, 0.039, 0.194, 0.349, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.194 std_dev=0.155
C2'	B	0, 0.068, 0.228, 0.389, 0.402 max_d=0.402 avg_d=0.228 std_dev=0.161
O4'	B	0, 0.073, 0.237, 0.401, 0.447 max_d=0.447 avg_d=0.237 std_dev=0.164
C3'	B	0, 0.021, 0.232, 0.442, 0.611 max_d=0.611 avg_d=0.232 std_dev=0.211
O2	B	0, 0.078, 0.290, 0.502, 0.490 max_d=0.490 avg_d=0.290 std_dev=0.212
C4'	B	0, 0.024, 0.241, 0.459, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.241 std_dev=0.218
C5'	A	0, -0.067, 0.170, 0.407, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.170 std_dev=0.237
O2'	B	0, 0.088, 0.330, 0.573, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.330 std_dev=0.243
OP2	B	0, 0.093, 0.340, 0.587, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.340 std_dev=0.247
OP1	A	0, 0.038, 0.298, 0.558, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.298 std_dev=0.260
P	B	0, 0.039, 0.305, 0.572, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.305 std_dev=0.267
O5'	B	0, 0.059, 0.329, 0.598, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.329 std_dev=0.270
O3'	B	0, 0.085, 0.365, 0.646, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.365 std_dev=0.281
OP2	A	0, 0.058, 0.346, 0.633, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.346 std_dev=0.288
OP1	B	0, 0.036, 0.381, 0.725, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.381 std_dev=0.345
O5'	A	0, -0.191, 0.276, 0.742, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.276 std_dev=0.466
C5'	B	0, 0.114, 0.594, 1.074, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.594 std_dev=0.480

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.02	0.03	0.05	0.09	0.06	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.16	0.01	0.28	0.33	0.02
C2	0.06	0.00	0.03	0.08	0.01	0.13	0.01	0.21	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.15	0.31	0.03	0.13	0.38	0.06
C2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.02	0.04	0.01	0.07	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.04	0.23	0.39	0.10
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.06	0.13	0.08	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.01	0.23	0.39	0.15
C4	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.07	0.28	0.01	0.21	0.35	0.04
C4'	0.00	0.13	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.11	0.17	0.11	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.27	0.37	0.06
C5	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.03	0.29	0.01	0.22	0.33	0.05
C5'	0.06	0.21	0.08	0.00	0.16	0.00	0.16	0.00	0.18	0.11	0.20	0.23	0.19	0.14	0.13	0.07	0.04	0.01	0.00	0.17	0.36	0.33	0.01
C6	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.07	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.07	0.02	0.06	0.33	0.01	0.19	0.33	0.07
C8	0.03	0.01	0.04	0.03	0.01	0.01	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.05	0.20	0.02	0.27	0.31	0.04
N1	0.05	0.01	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.06	0.07	0.11	0.33	0.02	0.15	0.36	0.06
N2	0.09	0.00	0.07	0.13	0.02	0.17	0.02	0.23	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.14	0.20	0.29	0.05	0.09	0.40	0.08
N3	0.06	0.01	0.04	0.08	0.00	0.11	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.08	0.14	0.28	0.02	0.16	0.38	0.05
N7	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.02	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.02	0.03	0.25	0.02	0.25	0.31	0.05
N9	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.13	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.22	0.01	0.25	0.33	0.03
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.05	0.01	0.07	0.07	0.07	0.05	0.06	0.02	0.03	0.06	0.03	0.00	0.03	0.01	0.14	0.09	0.21	0.39	0.12
O3'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.07	0.14	0.08	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.17	0.01	0.24	0.36	0.13
O4'	0.00	0.15	0.01	0.01	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.05	0.11	0.20	0.14	0.03	0.00	0.01	0.05	0.00	0.30	0.03	0.31	0.30	0.07
O5'	0.16	0.31	0.09	0.21	0.28	0.01	0.29	0.00	0.33	0.20	0.33	0.29	0.28	0.25	0.22	0.14	0.17	0.30	0.00	0.35	0.01	0.02	0.01
O6	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.05	0.01	0.17	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.09	0.01	0.03	0.35	0.00	0.21	0.31	0.08
OP1	0.28	0.13	0.23	0.23	0.21	0.27	0.22	0.36	0.19	0.27	0.15	0.09	0.16	0.25	0.25	0.21	0.24	0.31	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	0.38	0.39	0.39	0.35	0.37	0.33	0.33	0.33	0.31	0.36	0.40	0.38	0.31	0.33	0.39	0.36	0.30	0.02	0.31	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.06	0.10	0.15	0.04	0.06	0.05	0.01	0.07	0.04	0.06	0.08	0.05	0.05	0.03	0.12	0.13	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.04	0.06	0.05	0.08	0.07	0.11	0.26	0.10	0.05	0.02	0.13	0.09	0.00	0.10	0.05	0.07	0.07	0.12	0.08
C2	0.08	0.11	0.09	0.11	0.03	0.14	0.10	0.38	0.08	0.07	0.08	0.15	0.09	0.12	0.05	0.08	0.11	0.10	0.13	0.11
C2'	0.09	0.05	0.10	0.07	0.12	0.07	0.13	0.24	0.11	0.08	0.06	0.10	0.15	0.03	0.15	0.07	0.07	0.05	0.11	0.07
C3'	0.17	0.13	0.19	0.15	0.17	0.13	0.18	0.21	0.17	0.15	0.14	0.13	0.25	0.12	0.20	0.12	0.15	0.13	0.17	0.14
C4	0.04	0.10	0.06	0.09	0.03	0.13	0.09	0.35	0.05	0.04	0.09	0.17	0.05	0.11	0.04	0.05	0.09	0.08	0.13	0.09
C4'	0.19	0.17	0.21	0.17	0.21	0.15	0.21	0.24	0.19	0.18	0.18	0.17	0.25	0.13	0.23	0.14	0.19	0.18	0.21	0.19
C5	0.06	0.11	0.08	0.11	0.03	0.15	0.09	0.38	0.06	0.06	0.09	0.17	0.08	0.12	0.03	0.06	0.12	0.12	0.16	0.13
C5'	0.19	0.19	0.22	0.18	0.28	0.16	0.26	0.27	0.23	0.20	0.23	0.19	0.25	0.12	0.33	0.16	0.23	0.23	0.27	0.24
C6	0.09	0.11	0.11	0.12	0.02	0.16	0.08	0.38	0.07	0.08	0.10	0.16	0.11	0.13	0.03	0.08	0.14	0.14	0.18	0.15
C8	0.02	0.08	0.05	0.08	0.05	0.12	0.09	0.34	0.05	0.03	0.07	0.16	0.04	0.09	0.08	0.05	0.09	0.09	0.14	0.10
N1	0.10	0.11	0.11	0.12	0.03	0.15	0.09	0.38	0.09	0.09	0.08	0.15	0.12	0.13	0.05	0.10	0.14	0.13	0.17	0.14
N2	0.11	0.10	0.10	0.10	0.06	0.13	0.11	0.38	0.10	0.09	0.06	0.13	0.10	0.11	0.07	0.12	0.11	0.09	0.12	0.10
N3	0.05	0.11	0.07	0.10	0.03	0.14	0.09	0.36	0.06	0.05	0.08	0.17	0.05	0.11	0.04	0.05	0.09	0.07	0.11	0.08
N7	0.05	0.10	0.07	0.10	0.04	0.14	0.09	0.37	0.05	0.05	0.08	0.16	0.07	0.11	0.05	0.06	0.12	0.13	0.16	0.13
N9	0.01	0.08	0.04	0.07	0.05	0.11	0.09	0.32	0.05	0.02	0.06	0.16	0.03	0.07	0.08	0.04	0.07	0.06	0.12	0.08
O2'	0.05	0.05	0.06	0.06	0.07	0.09	0.08	0.25	0.07	0.06	0.01	0.12	0.09	0.05	0.11	0.10	0.07	0.09	0.11	0.09
O3'	0.18	0.12	0.20	0.17	0.16	0.15	0.17	0.17	0.17	0.15	0.12	0.10	0.26	0.14	0.18	0.13	0.17	0.16	0.18	0.17
O4'	0.18	0.12	0.18	0.17	0.15	0.16	0.19	0.26	0.19	0.16	0.11	0.11	0.21	0.13	0.14	0.16	0.20	0.19	0.21	0.20
O5'	0.23	0.28	0.23	0.20	0.37	0.24	0.38	0.46	0.36	0.30	0.31	0.23	0.15	0.18	0.38	0.26	0.26	0.27	0.33	0.29
O6	0.09	0.12	0.12	0.13	0.03	0.16	0.08	0.39	0.08	0.09	0.10	0.17	0.13	0.14	0.03	0.09	0.16	0.17	0.20	0.17
OP1	0.11	0.11	0.17	0.11	0.02	0.07	0.04	0.28	0.09	0.11	0.05	0.16	0.25	0.10	0.04	0.11	0.09	0.07	0.08	0.06
OP2	0.38	0.43	0.39	0.36	0.36	0.38	0.31	0.47	0.33	0.38	0.44	0.46	0.36	0.28	0.34	0.38	0.38	0.39	0.37	0.39
P	0.13	0.15	0.16	0.12	0.03	0.12	0.06	0.31	0.10	0.13	0.09	0.21	0.17	0.08	0.03	0.12	0.08	0.08	0.06	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.03	0.01	0.03	0.09	0.01	0.06	0.00	0.01	0.19	0.20	0.19	0.19
C2	0.04	0.00	0.06	0.04	0.00	0.03	0.01	0.22	0.02	0.01	0.00	0.01	0.12	0.08	0.01	0.04	0.17	0.16	0.17	0.16
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.06	0.02	0.10	0.10	0.10	0.02	0.03	0.13	0.01	0.01	0.06	0.01	0.17	0.17	0.13	0.15
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.12	0.03	0.02	0.14	0.00	0.00	0.09	0.02	0.04	0.07	0.05	0.04
C4	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.13	0.01	0.41	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.00	0.02	0.05	0.04	0.06	0.04
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.13	0.00	0.18	0.01	0.16	0.06	0.06	0.11	0.01	0.01	0.14	0.00	0.03	0.06	0.05	0.04
C5	0.02	0.01	0.10	0.13	0.01	0.18	0.00	0.45	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.10	0.02	0.06	0.03	0.04	0.06	0.04
C5'	0.10	0.22	0.10	0.01	0.41	0.01	0.45	0.00	0.38	0.24	0.31	0.12	0.09	0.05	0.44	0.02	0.01	0.16	0.15	0.02
C6	0.03	0.02	0.10	0.12	0.02	0.16	0.01	0.38	0.00	0.01	0.02	0.03	0.11	0.11	0.02	0.08	0.09	0.12	0.15	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.06	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.05	0.01	0.01	0.16	0.17	0.19	0.17
N3	0.03	0.00	0.03	0.02	0.00	0.06	0.01	0.31	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.07	0.01	0.02	0.11	0.10	0.11	0.10
O2	0.09	0.01	0.13	0.14	0.01	0.11	0.02	0.12	0.03	0.03	0.01	0.00	0.21	0.17	0.01	0.10	0.23	0.22	0.21	0.21
O2'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.04	0.01	0.10	0.09	0.11	0.03	0.08	0.21	0.00	0.01	0.04	0.02	0.15	0.16	0.13	0.14
O3'	0.06	0.08	0.01	0.00	0.06	0.01	0.10	0.05	0.11	0.05	0.07	0.17	0.01	0.00	0.06	0.11	0.04	0.07	0.06	0.06
O4	0.00	0.01	0.06	0.09	0.00	0.14	0.02	0.44	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.02	0.04	0.04	0.05	0.04
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.02	0.08	0.01	0.02	0.10	0.02	0.11	0.02	0.00	0.21	0.23	0.23	0.24
O5'	0.19	0.17	0.17	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01	0.09	0.16	0.11	0.23	0.15	0.04	0.04	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.20	0.16	0.17	0.07	0.04	0.06	0.04	0.16	0.12	0.17	0.10	0.22	0.16	0.07	0.04	0.23	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.19	0.17	0.13	0.05	0.06	0.05	0.06	0.15	0.15	0.19	0.11	0.21	0.13	0.06	0.05	0.23	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.19	0.16	0.15	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.12	0.17	0.10	0.21	0.14	0.06	0.04	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00