Doublet Group distance statistics: 53655

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.000, 0.021, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.000, 0.024, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
C1'	A	0, 0.000, 0.036, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.036 std_dev=0.036
N9	A	0, 0.000, 0.036, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.036 std_dev=0.036
O5'	B	0, 0.000, 0.247, 0.494, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.247 std_dev=0.247
OP1	B	0, 0.000, 0.423, 0.846, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.423 std_dev=0.423
P	B	0, 0.000, 0.473, 0.945, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.473 std_dev=0.473
O4'	A	0, 0.000, 0.849, 1.697, 1.697 max_d=1.697 avg_d=0.849 std_dev=0.849
C2'	A	0, 0.000, 0.999, 1.997, 1.997 max_d=1.997 avg_d=0.999 std_dev=0.999
O3'	A	0, 0.000, 1.115, 2.230, 2.230 max_d=2.230 avg_d=1.115 std_dev=1.115
C3'	A	0, 0.000, 1.127, 2.255, 2.255 max_d=2.255 avg_d=1.127 std_dev=1.127
OP2	B	0, 0.000, 1.176, 2.351, 2.351 max_d=2.351 avg_d=1.176 std_dev=1.176
C4'	A	0, 0.000, 1.178, 2.356, 2.356 max_d=2.356 avg_d=1.178 std_dev=1.178
C5'	B	0, 0.000, 1.437, 2.874, 2.874 max_d=2.874 avg_d=1.437 std_dev=1.437
O2'	A	0, 0.000, 1.548, 3.097, 3.097 max_d=3.097 avg_d=1.548 std_dev=1.548
C4'	B	0, 0.000, 1.819, 3.638, 3.638 max_d=3.638 avg_d=1.819 std_dev=1.819
O5'	A	0, 0.000, 1.823, 3.646, 3.646 max_d=3.646 avg_d=1.823 std_dev=1.823
O3'	B	0, 0.000, 1.875, 3.750, 3.750 max_d=3.750 avg_d=1.875 std_dev=1.875
C5'	A	0, 0.000, 1.893, 3.786, 3.786 max_d=3.786 avg_d=1.893 std_dev=1.893
C3'	B	0, 0.000, 1.895, 3.790, 3.790 max_d=3.790 avg_d=1.895 std_dev=1.895
P	A	0, 0.000, 1.961, 3.922, 3.922 max_d=3.922 avg_d=1.961 std_dev=1.961
OP1	A	0, 0.000, 2.127, 4.254, 4.254 max_d=4.254 avg_d=2.127 std_dev=2.127
C2'	B	0, 0.000, 3.013, 6.025, 6.025 max_d=6.025 avg_d=3.013 std_dev=3.013
O2'	B	0, 0.000, 3.125, 6.250, 6.250 max_d=6.250 avg_d=3.125 std_dev=3.125
O4'	B	0, 0.000, 3.148, 6.297, 6.297 max_d=6.297 avg_d=3.148 std_dev=3.148
OP2	A	0, 0.000, 3.244, 6.488, 6.488 max_d=6.488 avg_d=3.244 std_dev=3.244
C1'	B	0, 0.000, 3.716, 7.432, 7.432 max_d=7.432 avg_d=3.716 std_dev=3.716
N1	B	0, 0.000, 4.739, 9.479, 9.479 max_d=9.479 avg_d=4.739 std_dev=4.739
C6	B	0, 0.000, 4.887, 9.775, 9.775 max_d=9.775 avg_d=4.887 std_dev=4.887
C2	B	0, 0.000, 5.641, 11.281, 11.281 max_d=11.281 avg_d=5.641 std_dev=5.641
O2	B	0, 0.000, 5.705, 11.409, 11.409 max_d=11.409 avg_d=5.705 std_dev=5.705
C5	B	0, 0.000, 5.807, 11.615, 11.615 max_d=11.615 avg_d=5.807 std_dev=5.807
N3	B	0, 0.000, 6.540, 13.080, 13.080 max_d=13.080 avg_d=6.540 std_dev=6.540
C4	B	0, 0.000, 6.673, 13.346, 13.346 max_d=13.346 avg_d=6.673 std_dev=6.673
O4	B	0, 0.000, 7.553, 15.107, 15.107 max_d=15.107 avg_d=7.553 std_dev=7.553

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.03	0.01	0.04	0.04	0.04	0.00	0.00	0.02	0.24	0.00	0.13	0.03	0.13	0.73	0.22
C2	0.04	0.00	0.49	0.33	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.42	0.06	0.22	0.02	0.01	0.17	0.83	0.23
C2'	0.00	0.49	0.00	0.00	0.25	0.00	0.14	0.15	0.24	0.21	0.39	0.58	0.47	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.11	0.19	0.50	0.29	0.21
C3'	0.01	0.33	0.00	0.00	0.25	0.01	0.26	0.00	0.31	0.10	0.34	0.34	0.29	0.18	0.13	0.02	0.01	0.02	0.16	0.32	0.38	0.14	0.28
C4	0.02	0.00	0.25	0.25	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.02	0.12	0.13	0.02	0.11	1.01	0.35
C4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.04	0.10	0.01	0.05	0.02	0.09	0.04	0.22	0.00	0.00	0.00	0.06	0.15	0.31	0.00
C5	0.02	0.00	0.14	0.26	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.03	0.05	0.20	0.01	0.06	1.24	0.47
C5'	0.05	0.09	0.15	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.05	0.07	0.12	0.09	0.03	0.02	0.06	0.18	0.00	0.00	0.01	0.17	0.34	0.01
C6	0.03	0.01	0.24	0.31	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.09	0.10	0.17	0.00	0.08	1.22	0.45
C8	0.01	0.01	0.21	0.10	0.01	0.10	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.43	0.06	0.13	0.33	0.00	0.02	1.39	0.58
N1	0.04	0.00	0.39	0.34	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.09	0.17	0.08	0.01	0.14	1.02	0.33
N2	0.04	0.00	0.58	0.34	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	0.06	0.27	0.06	0.02	0.21	0.66	0.13
N3	0.04	0.00	0.47	0.29	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.41	0.00	0.21	0.03	0.02	0.16	0.78	0.22
N7	0.00	0.01	0.09	0.18	0.00	0.09	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.36	0.00	0.06	0.31	0.00	0.01	1.45	0.59
N9	0.00	0.00	0.01	0.13	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.10	0.00	0.20	0.02	0.07	1.06	0.39
O2'	0.02	0.42	0.00	0.02	0.07	0.22	0.11	0.06	0.00	0.43	0.23	0.60	0.41	0.36	0.15	0.00	0.01	0.14	0.12	0.07	0.32	0.33	0.07
O3'	0.24	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.18	0.09	0.06	0.09	0.06	0.00	0.00	0.10	0.01	0.00	0.15	0.09	0.11	0.16	0.02	0.23
O4'	0.00	0.22	0.02	0.02	0.12	0.00	0.05	0.00	0.10	0.13	0.17	0.27	0.21	0.06	0.00	0.14	0.15	0.00	0.24	0.07	0.05	0.82	0.39
O5'	0.13	0.02	0.11	0.16	0.13	0.00	0.20	0.00	0.17	0.33	0.08	0.06	0.03	0.31	0.20	0.12	0.09	0.24	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00
O6	0.03	0.01	0.19	0.32	0.02	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.07	0.11	0.07	0.20	0.00	0.06	1.34	0.51
OP1	0.13	0.17	0.50	0.38	0.11	0.15	0.06	0.17	0.08	0.02	0.14	0.21	0.16	0.01	0.07	0.32	0.16	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00
OP2	0.73	0.83	0.29	0.14	1.01	0.31	1.24	0.34	1.22	1.39	1.02	0.66	0.78	1.45	1.06	0.33	0.02	0.82	0.00	1.34	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.23	0.21	0.28	0.35	0.00	0.47	0.01	0.45	0.58	0.33	0.13	0.22	0.59	0.39	0.07	0.23	0.39	0.00	0.51	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	1.03	1.32	0.23	0.17	1.10	0.94	0.84	0.93	0.81	1.06	1.31	1.50	0.19	0.32	1.12	1.45	0.07	0.28	0.46	0.01
C2	1.43	1.64	0.79	0.39	1.72	1.00	1.66	0.96	1.61	1.60	1.71	1.57	0.42	0.24	1.73	1.67	0.12	0.25	0.30	0.01
C2'	0.83	1.13	0.02	0.10	0.83	0.66	0.52	0.56	0.51	0.83	1.10	1.37	0.32	0.51	0.84	1.21	0.31	0.75	0.02	0.43
C3'	0.99	1.22	0.21	0.19	0.89	0.94	0.61	0.89	0.63	0.95	1.16	1.46	0.15	0.22	0.89	1.40	0.00	0.51	0.36	0.12
C4	1.53	1.87	0.75	0.48	1.78	1.14	1.57	1.02	1.51	1.67	1.91	1.94	0.33	0.06	1.81	1.82	0.13	0.27	0.33	0.03
C4'	1.21	1.38	0.46	0.54	1.03	1.29	0.76	1.29	0.80	1.13	1.30	1.63	0.06	0.15	1.00	1.66	0.43	0.08	0.84	0.33
C5	1.92	2.40	1.10	0.74	2.32	1.25	2.07	1.01	1.96	2.14	2.46	2.46	0.68	0.23	2.36	2.07	0.16	0.29	0.20	0.09
C5'	1.53	1.71	0.79	0.91	1.30	1.58	1.01	1.51	1.06	1.43	1.61	2.00	0.41	0.59	1.27	1.94	0.66	0.04	0.99	0.49
C6	2.14	2.68	1.36	0.85	2.70	1.24	2.49	0.96	2.37	2.47	2.78	2.63	0.97	0.31	2.73	2.17	0.16	0.29	0.06	0.15
C8	1.66	2.16	0.81	0.62	1.99	1.20	1.66	1.01	1.56	1.82	2.21	2.34	0.37	0.19	2.05	1.89	0.15	0.28	0.31	0.05
N1	1.87	2.23	1.19	0.67	2.37	1.12	2.29	0.94	2.20	2.17	2.34	2.10	0.81	0.06	2.38	1.96	0.15	0.28	0.10	0.11
N2	1.11	1.21	0.61	0.18	1.35	0.76	1.39	0.83	1.35	1.25	1.27	1.10	0.30	0.44	1.35	1.31	0.09	0.19	0.36	0.06
N3	1.27	1.49	0.57	0.29	1.45	1.00	1.32	0.99	1.28	1.37	1.52	1.51	0.18	0.31	1.46	1.60	0.11	0.24	0.41	0.03
N7	1.95	2.53	1.09	0.79	2.39	1.26	2.06	1.00	1.93	2.17	2.60	2.68	0.68	0.36	2.46	2.05	0.16	0.29	0.20	0.10
N9	1.41	1.78	0.59	0.43	1.61	1.11	1.34	1.01	1.28	1.51	1.80	1.92	0.16	0.06	1.65	1.73	0.13	0.27	0.39	0.01
O2'	0.47	0.82	0.38	0.53	0.53	0.31	0.19	0.26	0.16	0.49	0.81	1.07	0.68	0.95	0.57	0.89	0.55	0.79	0.20	0.57
O3'	1.07	1.25	0.31	0.29	0.93	1.09	0.68	1.10	0.71	1.01	1.18	1.46	0.04	0.15	0.91	1.53	0.24	0.22	0.67	0.17
O4'	1.33	1.54	0.58	0.64	1.25	1.38	1.00	1.39	1.01	1.30	1.49	1.74	0.13	0.20	1.25	1.77	0.54	0.09	0.94	0.45
O5'	1.13	1.30	0.42	0.63	0.90	1.30	0.62	1.31	0.67	1.03	1.20	1.58	0.00	0.32	0.87	1.58	0.50	0.05	0.95	0.39
O6	2.41	3.19	1.63	1.01	3.22	1.23	2.93	0.87	2.75	2.88	3.33	3.11	1.28	0.52	3.25	2.21	0.16	0.29	0.09	0.22
OP1	1.49	1.77	0.76	0.97	1.32	1.56	0.98	1.50	1.01	1.42	1.68	2.10	0.35	0.75	1.31	1.88	0.69	0.10	1.04	0.53
OP2	0.48	0.68	0.18	0.03	0.37	0.58	0.11	0.59	0.13	0.42	0.63	0.93	0.64	0.26	0.37	0.85	0.24	0.86	0.24	0.39
P	0.91	1.15	0.19	0.41	0.79	1.03	0.49	1.04	0.50	0.85	1.09	1.44	0.26	0.13	0.79	1.33	0.23	0.31	0.68	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.25	0.01	0.00	0.41	0.91	0.15	0.50
C2	0.01	0.00	0.06	0.17	0.00	0.23	0.00	0.32	0.01	0.00	0.00	0.00	0.31	0.17	0.00	0.21	0.16	0.94	0.31	0.29
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.19	0.07	0.01	0.05	0.10	0.01	0.03	0.03	0.00	0.56	0.83	0.40	0.65
C3'	0.00	0.17	0.01	0.00	0.29	0.00	0.31	0.02	0.27	0.18	0.23	0.08	0.00	0.00	0.30	0.00	0.15	0.20	0.07	0.17
C4	0.00	0.00	0.02	0.29	0.00	0.13	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.30	0.11	0.00	0.02	0.40	1.45	0.03	0.71
C4'	0.01	0.23	0.01	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.22	0.31	0.21	0.02	0.15	0.00	0.02	0.25	0.04	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.31	0.01	0.01	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00	0.18	0.24	0.01	0.13	0.66	1.75	0.46	1.07
C5'	0.07	0.32	0.19	0.02	0.13	0.01	0.13	0.00	0.22	0.03	0.32	0.49	0.01	0.13	0.17	0.01	0.01	0.23	0.06	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.27	0.01	0.04	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.21	0.01	0.18	0.73	1.65	0.53	1.06
N1	0.00	0.00	0.01	0.18	0.01	0.08	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.16	0.04	0.01	0.00	0.43	1.18	0.11	0.62
N3	0.01	0.00	0.05	0.23	0.00	0.22	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00	0.00	0.35	0.06	0.00	0.15	0.20	1.11	0.29	0.39
O2	0.02	0.00	0.10	0.08	0.00	0.31	0.00	0.49	0.01	0.00	0.00	0.00	0.35	0.36	0.00	0.36	0.06	0.62	0.59	0.02
O2'	0.01	0.31	0.01	0.00	0.30	0.21	0.18	0.01	0.09	0.16	0.35	0.35	0.00	0.02	0.34	0.18	0.34	0.60	0.27	0.45
O3'	0.25	0.17	0.03	0.00	0.11	0.02	0.24	0.13	0.21	0.04	0.06	0.36	0.02	0.00	0.14	0.19	0.29	0.39	0.25	0.30
O4	0.01	0.00	0.03	0.30	0.00	0.15	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.34	0.14	0.00	0.03	0.37	1.47	0.02	0.70
O4'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.02	0.00	0.13	0.01	0.18	0.00	0.15	0.36	0.18	0.19	0.03	0.00	0.21	0.70	0.02	0.25
O5'	0.41	0.16	0.56	0.15	0.40	0.02	0.66	0.01	0.73	0.43	0.20	0.06	0.34	0.29	0.37	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.91	0.94	0.83	0.20	1.45	0.25	1.75	0.23	1.65	1.18	1.11	0.62	0.60	0.39	1.47	0.70	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.15	0.31	0.40	0.07	0.03	0.04	0.46	0.06	0.53	0.11	0.29	0.59	0.27	0.25	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.50	0.29	0.65	0.17	0.71	0.03	1.07	0.02	1.06	0.62	0.39	0.02	0.45	0.30	0.70	0.25	0.01	0.00	0.00	0.00