Doublet Group distance statistics: 53657

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C2	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
N1	A	0, 0.000, 0.038, 0.076, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.038
O6	A	0, 0.000, 0.068, 0.135, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.068 std_dev=0.068
C5'	B	0, 0.000, 0.122, 0.243, 0.243 max_d=0.243 avg_d=0.122 std_dev=0.122
C4'	B	0, 0.000, 0.307, 0.613, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.307 std_dev=0.307
OP1	B	0, 0.000, 0.312, 0.624, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.312 std_dev=0.312
P	B	0, 0.000, 0.321, 0.643, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.321 std_dev=0.321
O5'	B	0, 0.000, 0.506, 1.011, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.506 std_dev=0.506
C2'	A	0, 0.000, 0.549, 1.099, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.549 std_dev=0.549
OP2	B	0, 0.000, 0.558, 1.116, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.558 std_dev=0.558
O4'	A	0, 0.000, 0.614, 1.229, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.614 std_dev=0.614
O4'	B	0, 0.000, 0.644, 1.289, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.644 std_dev=0.644
C3'	B	0, 0.000, 0.809, 1.618, 1.618 max_d=1.618 avg_d=0.809 std_dev=0.809
O2'	B	0, 0.000, 0.857, 1.714, 1.714 max_d=1.714 avg_d=0.857 std_dev=0.857
O2'	A	0, 0.000, 0.929, 1.858, 1.858 max_d=1.858 avg_d=0.929 std_dev=0.929
C1'	B	0, 0.000, 0.969, 1.937, 1.937 max_d=1.937 avg_d=0.969 std_dev=0.969
O3'	B	0, 0.000, 0.995, 1.990, 1.990 max_d=1.990 avg_d=0.995 std_dev=0.995
C2'	B	0, 0.000, 1.001, 2.001, 2.001 max_d=2.001 avg_d=1.001 std_dev=1.001
C3'	A	0, 0.000, 1.168, 2.336, 2.336 max_d=2.336 avg_d=1.168 std_dev=1.168
C4'	A	0, 0.000, 1.205, 2.410, 2.410 max_d=2.410 avg_d=1.205 std_dev=1.205
OP1	A	0, 0.000, 1.265, 2.530, 2.530 max_d=2.530 avg_d=1.265 std_dev=1.265
C6	B	0, 0.000, 1.518, 3.035, 3.035 max_d=3.035 avg_d=1.518 std_dev=1.518
C5'	A	0, 0.000, 1.559, 3.117, 3.117 max_d=3.117 avg_d=1.559 std_dev=1.559
N1	B	0, 0.000, 1.594, 3.188, 3.188 max_d=3.188 avg_d=1.594 std_dev=1.594
O5'	A	0, 0.000, 1.619, 3.238, 3.238 max_d=3.238 avg_d=1.619 std_dev=1.619
O3'	A	0, 0.000, 1.677, 3.353, 3.353 max_d=3.353 avg_d=1.677 std_dev=1.677
P	A	0, 0.000, 2.014, 4.028, 4.028 max_d=4.028 avg_d=2.014 std_dev=2.014
C5	B	0, 0.000, 2.107, 4.214, 4.214 max_d=4.214 avg_d=2.107 std_dev=2.107
C2	B	0, 0.000, 2.307, 4.614, 4.614 max_d=4.614 avg_d=2.307 std_dev=2.307
O2	B	0, 0.000, 2.409, 4.818, 4.818 max_d=4.818 avg_d=2.409 std_dev=2.409
OP2	A	0, 0.000, 2.773, 5.546, 5.546 max_d=5.546 avg_d=2.773 std_dev=2.773
C4	B	0, 0.000, 2.860, 5.721, 5.721 max_d=5.721 avg_d=2.860 std_dev=2.860
N3	B	0, 0.000, 2.914, 5.827, 5.827 max_d=5.827 avg_d=2.914 std_dev=2.914
O4	B	0, 0.000, 3.464, 6.929, 6.929 max_d=6.929 avg_d=3.464 std_dev=3.464

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.04	0.04	0.02	0.01	0.00	0.25	0.01	0.16	0.02	0.06	0.39	0.10
C2	0.04	0.00	0.22	0.27	0.01	0.02	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.16	0.09	0.21	0.19	0.03	0.44	0.11	0.36
C2'	0.00	0.22	0.00	0.01	0.13	0.02	0.06	0.14	0.10	0.13	0.16	0.27	0.23	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.35	0.08	0.38	0.43	0.34
C3'	0.00	0.27	0.01	0.00	0.32	0.00	0.43	0.03	0.44	0.38	0.36	0.22	0.22	0.45	0.28	0.02	0.00	0.00	0.03	0.50	0.03	0.01	0.04
C4	0.02	0.01	0.13	0.32	0.00	0.10	0.01	0.19	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.22	0.02	0.13	0.20	0.01	0.40	0.12	0.32
C4'	0.00	0.02	0.02	0.00	0.10	0.00	0.21	0.01	0.18	0.32	0.07	0.08	0.04	0.31	0.15	0.30	0.02	0.00	0.03	0.25	0.19	0.20	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.43	0.01	0.21	0.00	0.36	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.32	0.20	0.08	0.38	0.00	0.58	0.08	0.56
C5'	0.01	0.10	0.14	0.03	0.19	0.01	0.36	0.00	0.35	0.45	0.21	0.03	0.05	0.49	0.21	0.11	0.10	0.02	0.01	0.45	0.29	0.17	0.03
C6	0.03	0.01	0.10	0.44	0.01	0.18	0.01	0.35	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.33	0.20	0.11	0.43	0.01	0.65	0.16	0.64
C8	0.01	0.02	0.13	0.38	0.02	0.32	0.00	0.45	0.00	0.00	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.35	0.23	0.06	0.33	0.02	0.46	0.01	0.42
N1	0.05	0.01	0.16	0.36	0.02	0.07	0.02	0.21	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.27	0.06	0.19	0.31	0.04	0.55	0.03	0.51
N2	0.04	0.00	0.27	0.22	0.00	0.08	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.08	0.18	0.24	0.15	0.04	0.41	0.15	0.31
N3	0.04	0.01	0.23	0.22	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.11	0.15	0.21	0.11	0.02	0.35	0.20	0.24
N7	0.02	0.03	0.07	0.45	0.03	0.31	0.01	0.49	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.39	0.30	0.01	0.47	0.02	0.65	0.18	0.65
N9	0.01	0.01	0.01	0.28	0.00	0.15	0.00	0.21	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.21	0.03	0.04	0.11	0.00	0.29	0.21	0.19
O2'	0.00	0.16	0.00	0.02	0.22	0.30	0.32	0.11	0.33	0.35	0.27	0.08	0.11	0.39	0.21	0.00	0.02	0.28	0.22	0.37	0.38	0.28	0.27
O3'	0.25	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.20	0.10	0.20	0.23	0.06	0.18	0.15	0.30	0.03	0.02	0.00	0.16	0.27	0.30	0.19	0.35	0.28
O4'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.13	0.00	0.08	0.02	0.11	0.06	0.19	0.24	0.21	0.01	0.04	0.28	0.16	0.00	0.19	0.08	0.16	0.49	0.16
O5'	0.16	0.19	0.35	0.03	0.20	0.03	0.38	0.01	0.43	0.33	0.31	0.15	0.11	0.47	0.11	0.22	0.27	0.19	0.00	0.54	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.03	0.08	0.50	0.01	0.25	0.00	0.45	0.01	0.02	0.04	0.04	0.02	0.02	0.00	0.37	0.30	0.08	0.54	0.00	0.78	0.32	0.80
OP1	0.06	0.44	0.38	0.03	0.40	0.19	0.58	0.29	0.65	0.46	0.55	0.41	0.35	0.65	0.29	0.38	0.19	0.16	0.01	0.78	0.00	0.00	0.01
OP2	0.39	0.11	0.43	0.01	0.12	0.20	0.08	0.17	0.16	0.01	0.03	0.15	0.20	0.18	0.21	0.28	0.35	0.49	0.01	0.32	0.00	0.00	0.01
P	0.10	0.36	0.34	0.04	0.32	0.03	0.56	0.03	0.64	0.42	0.51	0.31	0.24	0.65	0.19	0.27	0.28	0.16	0.01	0.80	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.01	0.38	0.44	0.09	0.16	0.12	0.09	0.12	0.07	0.02	0.05	0.49	0.66	0.11	0.04	0.10	0.02	0.03	0.04
C2	0.15	0.22	0.37	0.41	0.33	0.15	0.30	0.07	0.26	0.22	0.27	0.17	0.42	0.58	0.38	0.03	0.14	0.05	0.01	0.02
C2'	0.34	0.41	0.01	0.07	0.33	0.23	0.29	0.29	0.29	0.34	0.41	0.48	0.13	0.32	0.32	0.45	0.28	0.33	0.37	0.40
C3'	0.36	0.43	0.09	0.03	0.30	0.25	0.24	0.25	0.25	0.34	0.41	0.52	0.01	0.12	0.27	0.42	0.22	0.21	0.24	0.26
C4	0.14	0.21	0.42	0.45	0.32	0.15	0.30	0.06	0.25	0.21	0.26	0.15	0.48	0.64	0.37	0.01	0.14	0.03	0.01	0.03
C4'	0.08	0.14	0.18	0.26	0.02	0.04	0.09	0.06	0.07	0.05	0.11	0.25	0.24	0.41	0.05	0.13	0.11	0.15	0.11	0.07
C5	0.24	0.39	0.49	0.50	0.53	0.19	0.47	0.07	0.39	0.35	0.47	0.34	0.51	0.67	0.61	0.08	0.20	0.03	0.08	0.02
C5'	0.17	0.18	0.08	0.15	0.01	0.07	0.04	0.06	0.00	0.11	0.13	0.29	0.12	0.28	0.04	0.22	0.02	0.04	0.02	0.01
C6	0.30	0.52	0.52	0.52	0.68	0.20	0.59	0.08	0.48	0.45	0.62	0.47	0.51	0.65	0.77	0.14	0.24	0.04	0.13	0.06
C8	0.19	0.29	0.49	0.50	0.41	0.18	0.37	0.08	0.31	0.27	0.35	0.23	0.54	0.69	0.48	0.04	0.17	0.02	0.05	0.00
N1	0.25	0.42	0.45	0.46	0.56	0.18	0.50	0.07	0.41	0.37	0.51	0.37	0.46	0.60	0.64	0.11	0.21	0.07	0.09	0.03
N2	0.11	0.14	0.30	0.35	0.23	0.14	0.22	0.07	0.20	0.16	0.17	0.09	0.37	0.50	0.26	0.02	0.12	0.06	0.02	0.04
N3	0.09	0.10	0.35	0.40	0.20	0.14	0.20	0.06	0.17	0.13	0.13	0.05	0.43	0.59	0.23	0.02	0.10	0.03	0.03	0.05
N7	0.26	0.43	0.53	0.53	0.57	0.20	0.50	0.09	0.41	0.38	0.52	0.38	0.55	0.70	0.66	0.10	0.21	0.02	0.10	0.03
N9	0.11	0.15	0.41	0.45	0.25	0.15	0.24	0.06	0.21	0.16	0.19	0.09	0.49	0.65	0.30	0.02	0.12	0.02	0.00	0.04
O2'	0.10	0.03	0.53	0.59	0.02	0.24	0.03	0.14	0.08	0.05	0.06	0.08	0.69	0.88	0.03	0.04	0.08	0.03	0.09	0.10
O3'	0.11	0.22	0.13	0.22	0.05	0.05	0.05	0.11	0.04	0.09	0.19	0.35	0.17	0.32	0.03	0.11	0.14	0.21	0.18	0.16
O4'	0.15	0.10	0.45	0.52	0.23	0.26	0.29	0.24	0.27	0.18	0.13	0.01	0.51	0.71	0.26	0.07	0.28	0.29	0.23	0.20
O5'	0.31	0.28	0.06	0.01	0.10	0.24	0.07	0.24	0.13	0.23	0.21	0.38	0.04	0.11	0.03	0.37	0.14	0.15	0.13	0.18
O6	0.41	0.71	0.60	0.57	0.90	0.25	0.77	0.12	0.63	0.60	0.84	0.66	0.56	0.67	1.02	0.23	0.32	0.01	0.22	0.13
OP1	0.26	0.17	0.01	0.01	0.06	0.28	0.11	0.38	0.17	0.20	0.12	0.21	0.08	0.15	0.00	0.39	0.31	0.47	0.44	0.46
OP2	0.20	0.11	0.01	0.07	0.19	0.14	0.22	0.07	0.10	0.06	0.02	0.26	0.08	0.14	0.29	0.23	0.11	0.19	0.24	0.15
P	0.45	0.38	0.23	0.19	0.18	0.42	0.18	0.42	0.26	0.35	0.29	0.47	0.21	0.09	0.10	0.52	0.31	0.33	0.30	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.00	0.01	0.08	0.06	0.01
C2	0.02	0.00	0.08	0.12	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.13	0.04	0.06	0.03	0.01	0.14	0.04
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.07	0.11	0.00	0.01	0.08	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01
C3'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.15	0.00	0.08	0.01	0.04	0.07	0.14	0.12	0.02	0.00	0.18	0.00	0.02	0.07	0.01	0.00
C4	0.01	0.02	0.05	0.15	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.19	0.02	0.02	0.10	0.12	0.23	0.12
C4'	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.09	0.03	0.08	0.01	0.01	0.11	0.01	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.03	0.00	0.10	0.12	0.22	0.13
C5'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.09	0.01	0.09	0.00	0.09	0.05	0.04	0.02	0.10	0.01	0.11	0.01	0.00	0.13	0.01	0.02
C6	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.02	0.07	0.06	0.16	0.10
N1	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.03	0.02	0.03	0.00	0.13	0.05
N3	0.02	0.00	0.07	0.14	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.18	0.03	0.07	0.05	0.04	0.18	0.06
O2	0.03	0.00	0.11	0.12	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.11	0.04	0.10	0.01	0.06	0.11	0.00
O2'	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.09	0.04	0.10	0.04	0.03	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.07	0.05	0.03	0.04	0.05
O3'	0.04	0.13	0.01	0.00	0.19	0.03	0.12	0.01	0.06	0.06	0.18	0.11	0.04	0.00	0.24	0.03	0.06	0.04	0.02	0.03
O4	0.03	0.04	0.08	0.18	0.02	0.08	0.03	0.11	0.02	0.03	0.03	0.04	0.00	0.24	0.00	0.01	0.12	0.17	0.27	0.15
O4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.07	0.10	0.07	0.03	0.01	0.00	0.04	0.11	0.03	0.01
O5'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.10	0.01	0.10	0.00	0.07	0.03	0.05	0.01	0.05	0.06	0.12	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00
OP1	0.08	0.01	0.08	0.07	0.12	0.11	0.12	0.13	0.06	0.00	0.04	0.06	0.03	0.04	0.17	0.11	0.04	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.14	0.01	0.01	0.23	0.01	0.22	0.01	0.16	0.13	0.18	0.11	0.04	0.02	0.27	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.01	0.04	0.01	0.00	0.12	0.01	0.13	0.02	0.10	0.05	0.06	0.00	0.05	0.03	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00