Doublet Group distance statistics: 53658

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N2	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N3	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N1	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C4	A	0, 0.000, 0.037, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.037 std_dev=0.037
O6	A	0, 0.000, 0.042, 0.085, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.042 std_dev=0.042
N9	A	0, 0.000, 0.045, 0.091, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.045 std_dev=0.045
N7	A	0, 0.000, 0.057, 0.114, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.057 std_dev=0.057
C8	A	0, 0.000, 0.077, 0.154, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.077 std_dev=0.077
C6	B	0, 0.000, 0.434, 0.868, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.434 std_dev=0.434
OP2	B	0, 0.000, 0.466, 0.932, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.466 std_dev=0.466
O3'	A	0, 0.000, 0.590, 1.180, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.590 std_dev=0.590
N3	B	0, 0.000, 0.627, 1.255, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.627 std_dev=0.627
OP1	B	0, 0.000, 0.684, 1.368, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.684 std_dev=0.684
P	B	0, 0.000, 0.726, 1.451, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.726 std_dev=0.726
N1	B	0, 0.000, 0.886, 1.772, 1.772 max_d=1.772 avg_d=0.886 std_dev=0.886
C2	B	0, 0.000, 1.118, 2.237, 2.237 max_d=2.237 avg_d=1.118 std_dev=1.118
C3'	A	0, 0.000, 1.135, 2.270, 2.270 max_d=2.270 avg_d=1.135 std_dev=1.135
O4'	A	0, 0.000, 1.279, 2.558, 2.558 max_d=2.558 avg_d=1.279 std_dev=1.279
C2'	A	0, 0.000, 1.324, 2.648, 2.648 max_d=2.648 avg_d=1.324 std_dev=1.324
C4	B	0, 0.000, 1.331, 2.662, 2.662 max_d=2.662 avg_d=1.331 std_dev=1.331
C5	B	0, 0.000, 1.362, 2.724, 2.724 max_d=2.724 avg_d=1.362 std_dev=1.362
O5'	B	0, 0.000, 1.364, 2.728, 2.728 max_d=2.728 avg_d=1.364 std_dev=1.364
C4'	A	0, 0.000, 1.571, 3.142, 3.142 max_d=3.142 avg_d=1.571 std_dev=1.571
C1'	B	0, 0.000, 1.983, 3.965, 3.965 max_d=3.965 avg_d=1.983 std_dev=1.983
O2	B	0, 0.000, 2.124, 4.247, 4.247 max_d=4.247 avg_d=2.124 std_dev=2.124
O4	B	0, 0.000, 2.195, 4.390, 4.390 max_d=4.390 avg_d=2.195 std_dev=2.195
O2'	A	0, 0.000, 2.218, 4.436, 4.436 max_d=4.436 avg_d=2.218 std_dev=2.218
O4'	B	0, 0.000, 2.415, 4.830, 4.830 max_d=4.830 avg_d=2.415 std_dev=2.415
C2'	B	0, 0.000, 2.455, 4.911, 4.911 max_d=4.911 avg_d=2.455 std_dev=2.455
C5'	B	0, 0.000, 2.626, 5.251, 5.251 max_d=5.251 avg_d=2.626 std_dev=2.626
O2'	B	0, 0.000, 2.950, 5.899, 5.899 max_d=5.899 avg_d=2.950 std_dev=2.950
C5'	A	0, 0.000, 2.971, 5.943, 5.943 max_d=5.943 avg_d=2.971 std_dev=2.971
C4'	B	0, 0.000, 2.972, 5.945, 5.945 max_d=5.945 avg_d=2.972 std_dev=2.972
C3'	B	0, 0.000, 3.052, 6.104, 6.104 max_d=6.104 avg_d=3.052 std_dev=3.052
O5'	A	0, 0.000, 3.488, 6.976, 6.976 max_d=6.976 avg_d=3.488 std_dev=3.488
OP1	A	0, 0.000, 3.972, 7.944, 7.944 max_d=7.944 avg_d=3.972 std_dev=3.972
P	A	0, 0.000, 4.265, 8.530, 8.530 max_d=8.530 avg_d=4.265 std_dev=4.265
O3'	B	0, 0.000, 4.331, 8.661, 8.661 max_d=8.661 avg_d=4.331 std_dev=4.331
OP2	A	0, 0.000, 5.059, 10.118, 10.118 max_d=10.118 avg_d=5.059 std_dev=5.059

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.44	0.02	0.03	0.53	0.19
C2	0.00	0.00	0.39	0.36	0.00	0.25	0.00	0.59	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.05	0.01	1.43	0.00	1.03	2.13	1.42
C2'	0.00	0.39	0.00	0.00	0.16	0.02	0.04	0.02	0.13	0.28	0.28	0.49	0.38	0.18	0.05	0.00	0.01	0.01	0.46	0.09	0.24	0.70	0.38
C3'	0.01	0.36	0.00	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.10	0.25	0.25	0.47	0.34	0.18	0.04	0.02	0.00	0.00	0.16	0.05	0.01	0.25	0.06
C4	0.00	0.00	0.16	0.13	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.02	0.01	0.86	0.01	0.42	1.21	0.71
C4'	0.01	0.25	0.02	0.01	0.07	0.00	0.05	0.01	0.02	0.24	0.15	0.36	0.25	0.20	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.31	0.10	0.23
C5	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.01	0.04	0.62	0.01	0.27	1.00	0.51
C5'	0.00	0.59	0.02	0.01	0.15	0.01	0.10	0.00	0.05	0.52	0.35	0.84	0.57	0.45	0.13	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.13	0.07	0.01
C6	0.01	0.00	0.13	0.10	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.03	0.03	0.82	0.00	0.50	1.34	0.77
C8	0.01	0.01	0.28	0.25	0.00	0.24	0.00	0.52	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.03	0.05	0.04	0.02	0.24	0.24	0.09
N1	0.01	0.00	0.28	0.25	0.01	0.15	0.01	0.35	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.05	0.01	1.18	0.00	0.84	1.85	1.17
N2	0.00	0.00	0.49	0.47	0.00	0.36	0.00	0.84	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.28	0.07	0.02	1.71	0.00	1.39	2.65	1.82
N3	0.00	0.00	0.38	0.34	0.00	0.25	0.00	0.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.04	0.02	1.36	0.00	0.85	1.84	1.24
N7	0.01	0.01	0.18	0.18	0.00	0.20	0.00	0.45	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.17	0.02	0.09	0.45	0.07
N9	0.00	0.01	0.05	0.04	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.46	0.02	0.05	0.66	0.27
O2'	0.02	0.24	0.00	0.02	0.14	0.01	0.11	0.02	0.17	0.05	0.22	0.28	0.21	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.42	0.16	0.20	0.76	0.37
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.05	0.07	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.38	0.01	0.21
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.05	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.23	0.03	0.30	0.12	0.11
O5'	0.44	1.43	0.46	0.16	0.86	0.01	0.62	0.00	0.82	0.04	1.18	1.71	1.36	0.17	0.46	0.42	0.03	0.23	0.00	0.70	0.01	0.00	0.00
O6	0.02	0.00	0.09	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.16	0.04	0.03	0.70	0.00	0.43	1.22	0.66
OP1	0.03	1.03	0.24	0.01	0.42	0.31	0.27	0.13	0.50	0.24	0.84	1.39	0.85	0.09	0.05	0.20	0.38	0.30	0.01	0.43	0.00	0.00	0.00
OP2	0.53	2.13	0.70	0.25	1.21	0.10	1.00	0.07	1.34	0.24	1.85	2.65	1.84	0.45	0.66	0.76	0.01	0.12	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00
P	0.19	1.42	0.38	0.06	0.71	0.23	0.51	0.01	0.77	0.09	1.17	1.82	1.24	0.07	0.27	0.37	0.21	0.11	0.00	0.66	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.54	0.07	1.13	1.38	0.73	0.70	0.55	0.37	0.11	0.18	0.36	0.27	1.16	1.72	1.11	0.26	0.38	0.00	0.01	0.13
C2	0.04	0.17	0.30	0.69	0.07	0.11	0.12	0.12	0.15	0.01	0.18	0.25	0.25	0.89	0.06	0.18	0.12	0.09	0.05	0.00
C2'	0.47	0.25	1.15	1.56	1.11	0.90	0.75	0.68	0.22	0.01	0.77	0.07	1.13	1.97	1.64	0.32	0.71	0.48	0.43	0.55
C3'	0.96	0.18	1.67	2.04	0.86	1.37	0.56	1.06	0.05	0.40	0.42	0.44	1.77	2.56	1.43	0.77	0.97	0.65	0.47	0.70
C4	0.16	0.15	0.62	0.89	0.32	0.21	0.11	0.05	0.04	0.02	0.31	0.17	0.56	1.06	0.40	0.15	0.17	0.08	0.03	0.03
C4'	1.49	0.75	2.20	2.43	0.33	1.72	0.10	1.27	0.51	0.93	0.14	1.04	2.42	2.92	0.88	1.19	1.13	0.68	0.41	0.75
C5	0.17	0.37	0.26	0.46	0.06	0.23	0.16	0.42	0.07	0.17	0.33	0.53	0.20	0.52	0.03	0.54	0.05	0.15	0.06	0.07
C5'	2.03	1.02	2.84	3.13	0.06	2.38	0.33	1.94	1.00	1.36	0.33	1.25	3.10	3.69	0.67	1.76	1.79	1.43	0.95	1.39
C6	0.46	0.50	0.11	0.07	0.22	0.60	0.44	0.75	0.14	0.30	0.26	0.78	0.16	0.10	0.44	0.85	0.25	0.21	0.09	0.17
C8	0.11	0.20	0.65	0.80	0.37	0.10	0.15	0.14	0.01	0.03	0.38	0.21	0.61	0.91	0.51	0.26	0.11	0.09	0.03	0.01
N1	0.34	0.37	0.09	0.17	0.17	0.44	0.40	0.62	0.18	0.21	0.19	0.59	0.13	0.28	0.31	0.66	0.19	0.19	0.10	0.15
N2	0.12	0.08	0.27	0.74	0.04	0.28	0.12	0.08	0.18	0.06	0.11	0.14	0.23	1.02	0.06	0.02	0.24	0.04	0.04	0.05
N3	0.30	0.05	0.70	1.08	0.31	0.44	0.15	0.16	0.08	0.11	0.23	0.03	0.63	1.33	0.42	0.07	0.29	0.03	0.02	0.08
N7	0.17	0.38	0.33	0.46	0.11	0.24	0.10	0.43	0.03	0.17	0.37	0.54	0.27	0.49	0.03	0.55	0.05	0.15	0.05	0.06
N9	0.31	0.07	0.85	1.07	0.52	0.38	0.31	0.09	0.03	0.08	0.36	0.00	0.82	1.27	0.75	0.02	0.24	0.05	0.02	0.07
O2'	0.13	0.76	0.48	0.94	1.59	0.35	1.28	0.21	0.79	0.56	1.23	0.56	0.39	1.32	2.11	0.21	0.26	0.08	0.19	0.18
O3'	0.68	0.05	1.32	1.65	1.04	1.04	0.89	0.70	0.30	0.15	0.51	0.40	1.44	2.18	1.57	0.50	0.54	0.12	0.06	0.24
O4'	1.26	0.75	1.87	2.00	0.19	1.29	0.05	0.82	0.45	0.84	0.26	1.01	2.01	2.36	0.62	0.88	0.74	0.23	0.08	0.36
O5'	2.55	1.50	3.32	3.81	0.51	3.05	0.97	2.70	1.65	1.92	0.83	1.64	3.41	4.38	0.11	2.38	2.60	2.25	1.79	2.22
O6	0.72	0.64	0.39	0.30	0.42	0.98	0.61	1.07	0.15	0.43	0.23	1.05	0.44	0.35	0.78	1.17	0.44	0.27	0.12	0.26
OP1	2.53	1.36	3.20	3.85	0.26	3.29	0.68	2.97	1.42	1.77	0.65	1.58	3.44	4.74	0.38	2.50	2.66	2.40	1.67	2.25
OP2	3.09	1.92	3.71	4.47	1.13	3.84	1.71	3.69	2.38	2.48	1.31	1.94	3.72	5.05	0.53	3.08	3.68	3.53	2.85	3.37
P	2.81	1.64	3.51	4.18	0.66	3.51	1.14	3.20	1.86	2.11	0.96	1.77	3.64	4.95	0.03	2.75	3.01	2.71	2.04	2.60

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.01	0.00	0.05	0.15	0.03	0.03
C2	0.00	0.00	0.16	0.13	0.00	0.09	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.13	0.00	0.19	0.02	0.19	0.01	0.01
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.13	0.18	0.00	0.12	0.27	0.00	0.03	0.01	0.02	0.30	0.47	0.21	0.33
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.24	0.00	0.25	0.00	0.21	0.14	0.19	0.05	0.01	0.01	0.25	0.02	0.04	0.08	0.06	0.07
C4	0.00	0.00	0.00	0.24	0.00	0.07	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.05	0.00	0.01	0.20	0.10	0.39	0.27
C4'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.07	0.00	0.18	0.00	0.20	0.04	0.04	0.22	0.19	0.01	0.07	0.00	0.00	0.13	0.12	0.01
C5	0.01	0.00	0.13	0.25	0.00	0.18	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	0.10	0.01	0.13	0.32	0.03	0.58	0.40
C5'	0.04	0.16	0.13	0.00	0.04	0.00	0.19	0.00	0.21	0.00	0.11	0.31	0.06	0.16	0.04	0.00	0.00	0.27	0.24	0.00
C6	0.01	0.00	0.18	0.21	0.00	0.20	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	0.05	0.01	0.18	0.29	0.05	0.45	0.33
N1	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.09	0.01	0.01	0.07	0.13	0.13	0.10
N3	0.00	0.00	0.12	0.19	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.00	0.14	0.06	0.16	0.15	0.11
O2	0.00	0.00	0.27	0.05	0.00	0.22	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.24	0.00	0.33	0.15	0.24	0.18	0.13
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.27	0.19	0.45	0.06	0.45	0.16	0.05	0.32	0.00	0.05	0.28	0.11	0.23	0.45	0.20	0.29
O3'	0.24	0.13	0.03	0.01	0.05	0.01	0.10	0.16	0.05	0.09	0.05	0.24	0.05	0.00	0.07	0.15	0.14	0.27	0.25	0.15
O4	0.01	0.00	0.01	0.25	0.00	0.07	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.28	0.07	0.00	0.02	0.23	0.08	0.46	0.32
O4'	0.00	0.19	0.02	0.02	0.01	0.00	0.13	0.00	0.18	0.01	0.14	0.33	0.11	0.15	0.02	0.00	0.07	0.10	0.05	0.10
O5'	0.05	0.02	0.30	0.04	0.20	0.00	0.32	0.00	0.29	0.07	0.06	0.15	0.23	0.14	0.23	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.15	0.19	0.47	0.08	0.10	0.13	0.03	0.27	0.05	0.13	0.16	0.24	0.45	0.27	0.08	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.03	0.01	0.21	0.06	0.39	0.12	0.58	0.24	0.45	0.13	0.15	0.18	0.20	0.25	0.46	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.01	0.33	0.07	0.27	0.01	0.40	0.00	0.33	0.10	0.11	0.13	0.29	0.15	0.32	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00