Doublet Group distance statistics: 53669

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 4, 2, 1, 4, 2, 1, 4, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.006, 0.010, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.001, 0.008, 0.016, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.011 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.001, 0.013, 0.024, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.002, 0.015, 0.027, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.002, 0.019, 0.036, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.019 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.003, 0.022, 0.042, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.022 std_dev=0.019
O2'	B	0, 0.430, 0.714, 0.997, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.714 std_dev=0.284
O2	B	0, 0.340, 0.651, 0.962, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.651 std_dev=0.311
C2'	B	0, 0.437, 0.765, 1.093, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.765 std_dev=0.328
C1'	B	0, 0.460, 0.817, 1.174, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.817 std_dev=0.357
C3'	B	0, 0.521, 0.918, 1.315, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.918 std_dev=0.397
O3'	B	0, 0.508, 0.913, 1.317, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.913 std_dev=0.404
C2	B	0, 0.273, 0.695, 1.118, 2.169 max_d=2.169 avg_d=0.695 std_dev=0.422
N1	B	0, 0.421, 0.876, 1.330, 2.093 max_d=2.093 avg_d=0.876 std_dev=0.455
O4'	A	0, -0.221, 0.287, 0.796, 2.561 max_d=2.561 avg_d=0.287 std_dev=0.508
C2'	A	0, -0.240, 0.283, 0.807, 2.634 max_d=2.634 avg_d=0.283 std_dev=0.523
C4'	B	0, 0.449, 0.989, 1.528, 2.820 max_d=2.820 avg_d=0.989 std_dev=0.539
O4'	B	0, 0.425, 0.972, 1.520, 2.842 max_d=2.842 avg_d=0.972 std_dev=0.547
N3	B	0, 0.210, 0.812, 1.415, 3.156 max_d=3.156 avg_d=0.812 std_dev=0.603
C4'	A	0, -0.251, 0.380, 1.011, 3.148 max_d=3.148 avg_d=0.380 std_dev=0.631
C6	B	0, 0.560, 1.218, 1.876, 2.919 max_d=2.919 avg_d=1.218 std_dev=0.658
O2'	A	0, -0.307, 0.369, 1.044, 3.405 max_d=3.405 avg_d=0.369 std_dev=0.675
C3'	A	0, -0.309, 0.432, 1.174, 3.750 max_d=3.750 avg_d=0.432 std_dev=0.741
C4	B	0, 0.260, 1.049, 1.837, 3.985 max_d=3.985 avg_d=1.049 std_dev=0.788
C5	B	0, 0.489, 1.294, 2.100, 3.800 max_d=3.800 avg_d=1.294 std_dev=0.805
C5'	B	0, 0.332, 1.205, 2.077, 4.675 max_d=4.675 avg_d=1.205 std_dev=0.873
O3'	A	0, -0.383, 0.573, 1.528, 4.862 max_d=4.862 avg_d=0.573 std_dev=0.955
O4	B	0, 0.157, 1.125, 2.092, 4.952 max_d=4.952 avg_d=1.125 std_dev=0.968
O5'	B	0, 0.331, 1.374, 2.417, 5.483 max_d=5.483 avg_d=1.374 std_dev=1.043
C5'	A	0, -0.485, 0.730, 1.945, 6.070 max_d=6.070 avg_d=0.730 std_dev=1.215
O5'	A	0, -0.671, 0.819, 2.310, 7.534 max_d=7.534 avg_d=0.819 std_dev=1.490
P	B	0, 0.151, 1.648, 3.144, 7.914 max_d=7.914 avg_d=1.648 std_dev=1.497
OP1	B	0, 0.235, 1.755, 3.275, 8.074 max_d=8.074 avg_d=1.755 std_dev=1.520
OP2	B	0, 0.029, 1.736, 3.442, 8.961 max_d=8.961 avg_d=1.736 std_dev=1.707
P	A	0, -0.964, 1.152, 3.268, 10.681 max_d=10.681 avg_d=1.152 std_dev=2.116
OP2	A	0, -1.016, 1.283, 3.582, 11.663 max_d=11.663 avg_d=1.283 std_dev=2.299
OP1	A	0, -1.046, 1.275, 3.596, 11.731 max_d=11.731 avg_d=1.275 std_dev=2.321

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.08	0.08	0.13	0.07
C2	0.02	0.00	0.12	0.21	0.00	0.33	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.31	0.16	0.32	0.55	0.67	0.89	0.75
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.06	0.10	0.12	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.19	0.21	0.14	0.17
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.11	0.00	0.09	0.01	0.11	0.14	0.17	0.20	0.10	0.12	0.06	0.01	0.01	0.01	0.27	0.28	0.11	0.23
C4	0.01	0.00	0.07	0.11	0.00	0.15	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.09	0.16	0.13	0.16	0.30	0.22
C4'	0.01	0.33	0.01	0.00	0.15	0.00	0.07	0.00	0.13	0.18	0.25	0.32	0.09	0.12	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.16	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.09	0.06	0.13	0.13	0.22	0.13
C5'	0.01	0.58	0.01	0.01	0.24	0.00	0.13	0.00	0.24	0.31	0.44	0.53	0.18	0.23	0.07	0.03	0.02	0.01	0.00	0.06	0.23	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.13	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.14	0.11	0.12	0.11	0.17	0.29	0.21
C8	0.01	0.00	0.06	0.14	0.00	0.18	0.00	0.31	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.10	0.17	0.54	0.55	0.62	0.56
N1	0.01	0.00	0.10	0.17	0.00	0.25	0.00	0.44	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.24	0.14	0.23	0.36	0.48	0.65	0.54
N3	0.02	0.00	0.12	0.20	0.00	0.32	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.15	0.33	0.50	0.57	0.76	0.65
N6	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.11	0.07	0.12	0.14	0.24	0.15
N7	0.01	0.00	0.04	0.12	0.00	0.12	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.10	0.10	0.45	0.48	0.56	0.48
N9	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.18	0.17	0.21	0.16
O2'	0.01	0.31	0.00	0.01	0.15	0.03	0.08	0.03	0.14	0.14	0.24	0.30	0.11	0.08	0.03	0.00	0.04	0.03	0.05	0.11	0.09	0.05
O3'	0.02	0.16	0.01	0.01	0.09	0.01	0.09	0.02	0.11	0.10	0.14	0.15	0.11	0.10	0.05	0.04	0.00	0.01	0.21	0.28	0.08	0.20
O4'	0.00	0.32	0.01	0.01	0.16	0.00	0.06	0.01	0.12	0.17	0.23	0.33	0.07	0.10	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.03	0.18	0.07
O5'	0.08	0.55	0.19	0.27	0.13	0.01	0.13	0.00	0.11	0.54	0.36	0.50	0.12	0.45	0.18	0.05	0.21	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.08	0.67	0.21	0.28	0.16	0.06	0.13	0.06	0.17	0.55	0.48	0.57	0.14	0.48	0.17	0.11	0.28	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.89	0.14	0.11	0.30	0.16	0.22	0.23	0.29	0.62	0.65	0.76	0.24	0.56	0.21	0.09	0.08	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.75	0.17	0.23	0.22	0.01	0.13	0.01	0.21	0.56	0.54	0.65	0.15	0.48	0.16	0.05	0.20	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.34	0.15	0.17	0.61	0.18	0.51	0.21	0.37	0.27	0.54	0.25	0.21	0.17	0.74	0.17	0.36	0.46	0.69	0.45
C2	0.15	0.35	0.09	0.06	0.38	0.24	0.28	0.25	0.21	0.22	0.41	0.40	0.08	0.12	0.43	0.19	0.09	0.15	0.20	0.08
C2'	0.26	0.32	0.29	0.35	0.59	0.29	0.56	0.36	0.45	0.34	0.47	0.25	0.24	0.34	0.70	0.28	0.53	0.69	0.89	0.65
C3'	0.40	0.31	0.31	0.26	0.20	0.38	0.18	0.29	0.20	0.29	0.22	0.46	0.45	0.27	0.31	0.40	0.16	0.27	0.43	0.21
C4	0.08	0.31	0.08	0.09	0.45	0.21	0.34	0.20	0.22	0.18	0.44	0.30	0.13	0.14	0.54	0.15	0.13	0.21	0.37	0.16
C4'	0.48	0.29	0.49	0.44	0.14	0.50	0.10	0.38	0.21	0.32	0.16	0.42	0.63	0.48	0.30	0.46	0.18	0.14	0.28	0.11
C5	0.14	0.30	0.08	0.06	0.41	0.26	0.31	0.28	0.20	0.19	0.42	0.31	0.08	0.11	0.50	0.22	0.09	0.15	0.24	0.08
C5'	0.97	0.81	0.97	0.94	0.56	0.97	0.65	0.87	0.79	0.86	0.65	0.85	1.03	0.94	0.40	0.94	0.70	0.57	0.40	0.57
C6	0.22	0.33	0.13	0.08	0.38	0.33	0.29	0.38	0.22	0.24	0.40	0.36	0.10	0.09	0.45	0.31	0.19	0.22	0.12	0.19
C8	0.09	0.27	0.08	0.09	0.48	0.21	0.37	0.21	0.24	0.17	0.44	0.24	0.12	0.13	0.60	0.16	0.14	0.22	0.43	0.19
N1	0.23	0.35	0.14	0.09	0.37	0.33	0.28	0.37	0.23	0.26	0.40	0.40	0.12	0.10	0.41	0.30	0.20	0.22	0.10	0.20
N3	0.08	0.34	0.08	0.10	0.44	0.19	0.34	0.18	0.24	0.21	0.45	0.36	0.16	0.15	0.50	0.12	0.16	0.24	0.39	0.20
N6	0.28	0.34	0.16	0.12	0.38	0.40	0.30	0.48	0.26	0.27	0.40	0.36	0.14	0.08	0.44	0.38	0.30	0.34	0.16	0.33
N7	0.13	0.28	0.08	0.06	0.43	0.26	0.33	0.28	0.21	0.17	0.42	0.27	0.08	0.11	0.54	0.22	0.09	0.15	0.29	0.09
N9	0.08	0.30	0.10	0.12	0.51	0.19	0.40	0.18	0.27	0.19	0.47	0.25	0.16	0.15	0.62	0.13	0.21	0.30	0.50	0.27
O2'	0.56	0.66	0.60	0.69	1.00	0.60	1.01	0.75	0.89	0.72	0.83	0.46	0.40	0.63	1.10	0.60	0.98	1.16	1.40	1.14
O3'	0.33	0.29	0.24	0.19	0.20	0.28	0.20	0.21	0.17	0.24	0.21	0.44	0.38	0.20	0.30	0.31	0.23	0.43	0.62	0.37
O4'	0.38	0.14	0.41	0.39	0.28	0.46	0.14	0.36	0.10	0.18	0.24	0.26	0.58	0.46	0.46	0.38	0.16	0.16	0.28	0.12
O5'	1.07	0.84	1.12	1.10	0.65	1.11	0.80	1.02	0.94	0.97	0.69	0.83	1.15	1.11	0.48	1.06	0.86	0.73	0.52	0.72
OP1	1.45	1.21	1.50	1.53	1.19	1.51	1.39	1.44	1.48	1.40	1.11	1.09	1.43	1.52	1.01	1.46	1.34	1.19	1.04	1.21
OP2	1.86	1.57	1.88	1.89	1.46	1.90	1.71	1.86	1.86	1.81	1.41	1.39	1.73	1.81	1.21	1.88	1.76	1.62	1.47	1.65
P	1.50	1.21	1.58	1.60	1.09	1.57	1.32	1.51	1.46	1.42	1.06	1.10	1.52	1.59	0.87	1.51	1.39	1.25	1.07	1.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.11	0.15	0.10
C2	0.01	0.00	0.08	0.06	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.07	0.00	0.05	0.14	0.17	0.25	0.16
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.02	0.08	0.01	0.06	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.15	0.17	0.10
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.05	0.09	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.14	0.10	0.07
C4	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.21	0.27	0.37	0.27
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.05	0.03	0.03	0.00	0.01	0.05	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.06	0.06	0.00	0.04	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.24	0.30	0.39	0.32
C5'	0.03	0.04	0.02	0.01	0.10	0.00	0.14	0.00	0.14	0.07	0.06	0.05	0.05	0.05	0.11	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.07	0.00	0.04	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.08	0.00	0.06	0.23	0.26	0.33	0.28
N1	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.15	0.18	0.24	0.18
N3	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.17	0.22	0.31	0.21
O2	0.01	0.00	0.14	0.09	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.13	0.01	0.08	0.10	0.13	0.21	0.12
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.02	0.05	0.06	0.05	0.07	0.01	0.06	0.16	0.00	0.04	0.02	0.03	0.02	0.08	0.12	0.04
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.04	0.03	0.08	0.05	0.08	0.02	0.06	0.13	0.04	0.00	0.04	0.02	0.08	0.12	0.09	0.07
O4	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.22	0.30	0.40	0.30
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.02	0.06	0.01	0.03	0.08	0.03	0.02	0.02	0.00	0.06	0.06	0.07	0.06
O5'	0.09	0.14	0.07	0.03	0.21	0.01	0.24	0.00	0.23	0.15	0.17	0.10	0.02	0.08	0.22	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.11	0.17	0.15	0.14	0.27	0.05	0.30	0.03	0.26	0.18	0.22	0.13	0.08	0.12	0.30	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.15	0.25	0.17	0.10	0.37	0.03	0.39	0.01	0.33	0.24	0.31	0.21	0.12	0.09	0.40	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.16	0.10	0.07	0.27	0.01	0.32	0.01	0.28	0.18	0.21	0.12	0.04	0.07	0.30	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00