Doublet Group distance statistics: 53672

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 6, 6, 2, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.008, 0.014, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.010, 0.018, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.018 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.010, 0.019, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.032, 0.045, 0.058, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.045 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.022, 0.036, 0.049, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.036 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.027, 0.044, 0.061, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.044 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.055, 0.079, 0.103, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.079 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.043, 0.070, 0.097, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.070 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.051, 0.083, 0.114, 0.164 max_d=0.164 avg_d=0.083 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.135, 0.221, 0.307, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.221 std_dev=0.086
C2'	A	0, 0.181, 0.291, 0.401, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.291 std_dev=0.110
C4'	A	0, 0.190, 0.332, 0.474, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.332 std_dev=0.142
O2'	A	0, 0.244, 0.389, 0.534, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.389 std_dev=0.145
C3'	A	0, 0.242, 0.409, 0.576, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.409 std_dev=0.167
O2'	B	0, 0.084, 0.260, 0.435, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.260 std_dev=0.176
C2'	B	0, 0.104, 0.285, 0.467, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.285 std_dev=0.181
O5'	A	0, 0.375, 0.612, 0.849, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.612 std_dev=0.237
C5'	A	0, 0.357, 0.605, 0.853, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.605 std_dev=0.248
O3'	A	0, 0.344, 0.595, 0.846, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.595 std_dev=0.251
P	A	0, 0.429, 0.706, 0.983, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.706 std_dev=0.277
OP2	A	0, 0.483, 0.773, 1.062, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.773 std_dev=0.289
OP1	A	0, 0.531, 0.868, 1.206, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.868 std_dev=0.337
C1'	B	0, -0.135, 0.323, 0.782, 2.123 max_d=2.123 avg_d=0.323 std_dev=0.459
C3'	B	0, 0.006, 0.480, 0.953, 2.413 max_d=2.413 avg_d=0.480 std_dev=0.473
N1	B	0, -0.184, 0.404, 0.992, 2.763 max_d=2.763 avg_d=0.404 std_dev=0.588
C2	B	0, -0.221, 0.455, 1.132, 3.134 max_d=3.134 avg_d=0.455 std_dev=0.677
O2	B	0, -0.253, 0.436, 1.126, 3.110 max_d=3.110 avg_d=0.436 std_dev=0.689
O3'	B	0, -0.060, 0.630, 1.320, 3.493 max_d=3.493 avg_d=0.630 std_dev=0.690
O4'	B	0, -0.239, 0.482, 1.203, 3.448 max_d=3.448 avg_d=0.482 std_dev=0.721
C6	B	0, -0.236, 0.493, 1.223, 3.492 max_d=3.492 avg_d=0.493 std_dev=0.730
C4'	B	0, -0.182, 0.548, 1.277, 3.574 max_d=3.574 avg_d=0.548 std_dev=0.730
C5	B	0, -0.215, 0.630, 1.476, 4.096 max_d=4.096 avg_d=0.630 std_dev=0.845
N3	B	0, -0.247, 0.601, 1.448, 4.009 max_d=4.009 avg_d=0.601 std_dev=0.848
C4	B	0, -0.192, 0.706, 1.605, 4.364 max_d=4.364 avg_d=0.706 std_dev=0.898
O5'	B	0, -0.107, 0.842, 1.792, 4.694 max_d=4.694 avg_d=0.842 std_dev=0.950
O4	B	0, -0.132, 0.916, 1.964, 5.194 max_d=5.194 avg_d=0.916 std_dev=1.048
C5'	B	0, -0.208, 0.847, 1.902, 5.231 max_d=5.231 avg_d=0.847 std_dev=1.055
P	B	0, -0.443, 0.890, 2.224, 6.379 max_d=6.379 avg_d=0.890 std_dev=1.334
OP2	B	0, -0.569, 0.837, 2.243, 6.523 max_d=6.523 avg_d=0.837 std_dev=1.406
OP1	B	0, -0.304, 1.217, 2.739, 7.477 max_d=7.477 avg_d=1.217 std_dev=1.522

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.09	0.12	0.08
C2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.03	0.09	0.12	0.20	0.13
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.06	0.06	0.07	0.06	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.14	0.12	0.08
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.07	0.05	0.06	0.06	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01	0.08	0.17	0.13	0.10
C4	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.04	0.02	0.10	0.13	0.19	0.13
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.09	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.13	0.17	0.23	0.17
C5'	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.06	0.04	0.03	0.06	0.06	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.08	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.13	0.17	0.24	0.18
C8	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.08	0.03	0.14	0.17	0.21	0.16
N1	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.02	0.11	0.15	0.22	0.16
N3	0.02	0.00	0.07	0.06	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.04	0.08	0.10	0.18	0.12
N6	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.08	0.02	0.14	0.21	0.27	0.20
N7	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.08	0.03	0.15	0.20	0.25	0.19
N9	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.10	0.12	0.17	0.12
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.05	0.03	0.05	0.03	0.07	0.04	0.08	0.09	0.07	0.05	0.02	0.00	0.03	0.03	0.05	0.16	0.11	0.08
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.08	0.07	0.07	0.08	0.08	0.03	0.03	0.00	0.01	0.12	0.24	0.21	0.16
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.08	0.12	0.09
O5'	0.06	0.09	0.05	0.08	0.10	0.02	0.13	0.01	0.13	0.14	0.11	0.08	0.14	0.15	0.10	0.05	0.12	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.09	0.12	0.14	0.17	0.13	0.09	0.17	0.08	0.17	0.17	0.15	0.10	0.21	0.20	0.12	0.16	0.24	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.20	0.12	0.13	0.19	0.04	0.23	0.02	0.24	0.21	0.22	0.18	0.27	0.25	0.17	0.11	0.21	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.13	0.08	0.10	0.13	0.03	0.17	0.01	0.18	0.16	0.16	0.12	0.20	0.19	0.12	0.08	0.16	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.14	0.07	0.13	0.15	0.24	0.16	0.27	0.16	0.15	0.15	0.13	0.11	0.16	0.15	0.26	0.22	0.11	0.32	0.24
C2	0.32	0.36	0.14	0.16	0.36	0.17	0.35	0.25	0.34	0.34	0.37	0.36	0.18	0.42	0.37	0.36	0.12	0.24	0.10	0.13
C2'	0.21	0.25	0.11	0.09	0.23	0.15	0.21	0.15	0.21	0.22	0.25	0.28	0.14	0.14	0.24	0.22	0.14	0.15	0.24	0.11
C3'	0.23	0.31	0.10	0.10	0.30	0.16	0.26	0.16	0.24	0.26	0.33	0.36	0.14	0.18	0.32	0.24	0.15	0.16	0.27	0.13
C4	0.11	0.18	0.07	0.12	0.17	0.17	0.14	0.24	0.12	0.14	0.19	0.22	0.11	0.24	0.18	0.15	0.13	0.15	0.14	0.08
C4'	0.27	0.32	0.07	0.10	0.34	0.23	0.32	0.25	0.30	0.29	0.35	0.33	0.12	0.14	0.36	0.33	0.22	0.12	0.38	0.27
C5	0.15	0.22	0.09	0.11	0.21	0.15	0.18	0.24	0.17	0.18	0.23	0.25	0.12	0.26	0.23	0.17	0.11	0.19	0.10	0.08
C5'	0.27	0.34	0.08	0.10	0.38	0.25	0.35	0.28	0.32	0.30	0.38	0.33	0.12	0.13	0.40	0.34	0.24	0.14	0.41	0.29
C6	0.25	0.31	0.12	0.13	0.32	0.14	0.30	0.24	0.29	0.29	0.33	0.32	0.15	0.33	0.34	0.27	0.12	0.27	0.11	0.14
C8	0.06	0.11	0.05	0.11	0.11	0.20	0.07	0.26	0.06	0.06	0.13	0.14	0.09	0.16	0.13	0.15	0.16	0.12	0.22	0.15
N1	0.32	0.38	0.14	0.15	0.40	0.16	0.38	0.27	0.37	0.36	0.39	0.37	0.17	0.41	0.41	0.37	0.15	0.30	0.16	0.19
N3	0.19	0.25	0.10	0.14	0.24	0.16	0.21	0.23	0.20	0.22	0.25	0.28	0.14	0.32	0.24	0.21	0.11	0.15	0.10	0.05
N6	0.26	0.33	0.13	0.12	0.36	0.13	0.34	0.24	0.32	0.31	0.35	0.34	0.15	0.33	0.37	0.29	0.13	0.31	0.16	0.19
N7	0.08	0.16	0.07	0.11	0.15	0.16	0.11	0.25	0.10	0.11	0.17	0.19	0.10	0.20	0.17	0.12	0.13	0.17	0.15	0.10
N9	0.07	0.10	0.05	0.12	0.09	0.21	0.07	0.26	0.06	0.06	0.11	0.13	0.09	0.17	0.11	0.17	0.17	0.11	0.23	0.16
O2'	0.29	0.37	0.12	0.08	0.33	0.13	0.30	0.11	0.29	0.32	0.36	0.42	0.16	0.22	0.34	0.25	0.14	0.10	0.28	0.14
O3'	0.27	0.41	0.15	0.16	0.40	0.15	0.34	0.14	0.30	0.32	0.45	0.48	0.18	0.29	0.43	0.23	0.16	0.23	0.28	0.14
O4'	0.24	0.23	0.11	0.17	0.27	0.31	0.28	0.35	0.27	0.24	0.25	0.21	0.13	0.17	0.27	0.35	0.29	0.19	0.44	0.34
O5'	0.23	0.28	0.09	0.10	0.31	0.24	0.28	0.28	0.26	0.25	0.31	0.28	0.13	0.10	0.33	0.30	0.23	0.13	0.35	0.24
OP1	0.25	0.30	0.14	0.15	0.35	0.25	0.32	0.29	0.29	0.28	0.35	0.30	0.19	0.21	0.38	0.33	0.25	0.14	0.39	0.28
OP2	0.28	0.30	0.13	0.18	0.34	0.33	0.33	0.40	0.31	0.29	0.33	0.29	0.13	0.14	0.36	0.37	0.33	0.21	0.44	0.35
P	0.28	0.32	0.10	0.14	0.37	0.31	0.35	0.37	0.33	0.31	0.36	0.31	0.12	0.11	0.39	0.38	0.31	0.19	0.45	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.13	0.16	0.10
C2	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.01	0.02	0.11	0.09	0.16	0.06
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.03	0.06	0.11	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.06	0.17	0.07
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.13	0.01	0.14	0.03	0.12	0.08	0.12	0.12	0.02	0.01	0.15	0.01	0.11	0.08	0.20	0.11
C4	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.16	0.00	0.03	0.18	0.10	0.15	0.11
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.05	0.05	0.05	0.02	0.08	0.00	0.02	0.14	0.07	0.05
C5	0.02	0.01	0.05	0.14	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.17	0.01	0.04	0.19	0.10	0.15	0.11
C5'	0.01	0.05	0.02	0.03	0.10	0.01	0.11	0.00	0.09	0.04	0.07	0.05	0.05	0.03	0.11	0.01	0.01	0.15	0.04	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.01	0.03	0.16	0.09	0.16	0.07
N1	0.00	0.01	0.03	0.08	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.01	0.10	0.09	0.16	0.06
N3	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.14	0.01	0.02	0.15	0.09	0.15	0.07
O2	0.03	0.00	0.11	0.12	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.14	0.02	0.04	0.08	0.10	0.16	0.07
O2'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.06	0.10	0.00	0.04	0.05	0.05	0.03	0.14	0.12	0.05
O3'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.16	0.02	0.17	0.03	0.14	0.08	0.14	0.14	0.04	0.00	0.19	0.01	0.15	0.12	0.27	0.15
O4	0.02	0.01	0.06	0.15	0.00	0.08	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.19	0.00	0.03	0.20	0.12	0.16	0.13
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.03	0.00	0.11	0.19	0.19	0.15
O5'	0.06	0.11	0.05	0.11	0.18	0.02	0.19	0.01	0.16	0.10	0.15	0.08	0.03	0.15	0.20	0.11	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.13	0.09	0.06	0.08	0.10	0.14	0.10	0.15	0.09	0.09	0.09	0.10	0.14	0.12	0.12	0.19	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.16	0.17	0.20	0.15	0.07	0.15	0.04	0.16	0.16	0.15	0.16	0.12	0.27	0.16	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.06	0.07	0.11	0.11	0.05	0.11	0.02	0.07	0.06	0.07	0.07	0.05	0.15	0.13	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00