Doublet Group distance statistics: 53681

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 2, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.007, 0.014, 0.022, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N6	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.023 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.007, 0.022, 0.036, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.009, 0.031, 0.053, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.031 std_dev=0.022
C2'	A	0, 0.028, 0.087, 0.146, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.087 std_dev=0.059
O4'	A	0, 0.000, 0.072, 0.144, 0.239 max_d=0.239 avg_d=0.072 std_dev=0.072
C4'	A	0, 0.023, 0.187, 0.352, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.187 std_dev=0.164
O2'	A	0, 0.034, 0.201, 0.369, 0.490 max_d=0.490 avg_d=0.201 std_dev=0.168
C3'	A	0, 0.075, 0.250, 0.424, 0.459 max_d=0.459 avg_d=0.250 std_dev=0.174
C5'	A	0, 0.009, 0.254, 0.498, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.254 std_dev=0.244
O5'	A	0, 0.007, 0.362, 0.718, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.362 std_dev=0.356
C1'	B	0, 0.212, 0.633, 1.055, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.633 std_dev=0.421
C2'	B	0, 0.233, 0.657, 1.081, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.657 std_dev=0.424
O3'	A	0, 0.065, 0.490, 0.916, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.490 std_dev=0.426
O4'	B	0, 0.211, 0.650, 1.089, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.650 std_dev=0.439
O2'	B	0, 0.211, 0.675, 1.139, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.675 std_dev=0.464
C4'	B	0, 0.234, 0.713, 1.192, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.713 std_dev=0.479
C3'	B	0, 0.281, 0.785, 1.289, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.785 std_dev=0.504
N1	B	0, 0.288, 0.799, 1.310, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.799 std_dev=0.511
O3'	B	0, 0.299, 0.822, 1.346, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.822 std_dev=0.523
OP2	A	0, 0.023, 0.575, 1.128, 1.515 max_d=1.515 avg_d=0.575 std_dev=0.553
C2	B	0, 0.330, 0.897, 1.465, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.897 std_dev=0.568
C6	B	0, 0.317, 0.893, 1.468, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.893 std_dev=0.576
C5'	B	0, 0.272, 0.856, 1.441, 1.566 max_d=1.566 avg_d=0.856 std_dev=0.584
O2	B	0, 0.336, 0.955, 1.574, 1.613 max_d=1.613 avg_d=0.955 std_dev=0.619
P	A	0, 0.024, 0.657, 1.290, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.657 std_dev=0.633
N3	B	0, 0.383, 1.019, 1.654, 1.692 max_d=1.692 avg_d=1.019 std_dev=0.635
C5	B	0, 0.359, 1.038, 1.717, 1.735 max_d=1.735 avg_d=1.038 std_dev=0.679
C4	B	0, 0.395, 1.093, 1.791, 1.827 max_d=1.827 avg_d=1.093 std_dev=0.698
O4	B	0, 0.448, 1.248, 2.047, 2.084 max_d=2.084 avg_d=1.248 std_dev=0.800
P	B	0, 0.414, 1.219, 2.025, 1.994 max_d=1.994 avg_d=1.219 std_dev=0.806
O5'	B	0, 0.340, 1.146, 1.952, 2.087 max_d=2.087 avg_d=1.146 std_dev=0.806
OP1	B	0, 0.427, 1.245, 2.063, 2.080 max_d=2.080 avg_d=1.245 std_dev=0.818
OP2	B	0, 0.457, 1.282, 2.108, 2.141 max_d=2.141 avg_d=1.282 std_dev=0.826
OP1	A	0, -0.132, 1.731, 3.593, 4.104 max_d=4.104 avg_d=1.731 std_dev=1.863

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	1.05	0.05	0.30
C2	0.04	0.00	0.06	0.08	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.17	0.08	0.05	0.03	1.49	0.23	0.48
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.06	0.03	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.69	0.05	0.24
C3'	0.02	0.08	0.00	0.00	0.11	0.00	0.16	0.01	0.15	0.18	0.12	0.07	0.18	0.20	0.11	0.01	0.00	0.01	0.12	0.36	0.06	0.21
C4	0.02	0.02	0.03	0.11	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.03	0.03	1.44	0.21	0.48
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.09	0.02	0.03	0.07	0.09	0.04	0.09	0.03	0.01	0.01	0.36	0.19	0.13
C5	0.02	0.02	0.03	0.16	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.19	0.03	0.07	1.50	0.29	0.54
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.08	0.11	0.05	0.02	0.11	0.12	0.05	0.08	0.02	0.02	0.00	0.10	0.30	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.15	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.19	0.04	0.07	1.55	0.32	0.55
C8	0.02	0.03	0.05	0.18	0.01	0.09	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.22	0.03	0.07	1.36	0.25	0.51
N1	0.03	0.00	0.04	0.12	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.15	0.13	0.05	0.04	1.55	0.28	0.52
N3	0.03	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.07	0.05	0.03	1.40	0.18	0.44
N6	0.02	0.02	0.03	0.18	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.24	0.04	0.11	1.54	0.36	0.58
N7	0.02	0.02	0.04	0.20	0.01	0.09	0.00	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.25	0.03	0.10	1.44	0.33	0.56
N9	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.11	0.01	0.02	1.32	0.16	0.44
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.09	0.09	0.07	0.08	0.10	0.03	0.15	0.16	0.09	0.03	0.04	0.00	0.09	0.08	0.08	0.68	0.11	0.26
O3'	0.03	0.08	0.03	0.00	0.11	0.03	0.19	0.02	0.19	0.22	0.13	0.07	0.24	0.25	0.11	0.09	0.00	0.03	0.22	0.07	0.18	0.18
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.05	0.05	0.04	0.03	0.01	0.08	0.03	0.00	0.13	0.91	0.08	0.22
O5'	0.06	0.03	0.03	0.12	0.03	0.01	0.07	0.00	0.07	0.07	0.04	0.03	0.11	0.10	0.02	0.08	0.22	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	1.05	1.49	0.69	0.36	1.44	0.36	1.50	0.10	1.55	1.36	1.55	1.40	1.54	1.44	1.32	0.68	0.07	0.91	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.23	0.05	0.06	0.21	0.19	0.29	0.30	0.32	0.25	0.28	0.18	0.36	0.33	0.16	0.11	0.18	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.30	0.48	0.24	0.21	0.48	0.13	0.54	0.01	0.55	0.51	0.52	0.44	0.58	0.56	0.44	0.26	0.18	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.09	0.19	0.27	0.09	0.17	0.10	0.20	0.09	0.08	0.10	0.12	0.24	0.37	0.09	0.09	0.27	0.12	0.29	0.21
C2	0.11	0.12	0.30	0.26	0.10	0.16	0.13	0.10	0.11	0.07	0.10	0.22	0.45	0.31	0.11	0.07	0.07	0.13	0.19	0.10
C2'	0.08	0.09	0.23	0.29	0.10	0.20	0.12	0.22	0.11	0.08	0.09	0.11	0.29	0.37	0.10	0.10	0.27	0.13	0.27	0.20
C3'	0.08	0.08	0.23	0.28	0.07	0.19	0.08	0.21	0.08	0.07	0.08	0.11	0.28	0.34	0.07	0.09	0.27	0.15	0.27	0.20
C4	0.03	0.08	0.22	0.25	0.10	0.13	0.11	0.12	0.09	0.06	0.09	0.09	0.35	0.34	0.11	0.06	0.12	0.03	0.22	0.11
C4'	0.10	0.12	0.13	0.20	0.11	0.13	0.12	0.17	0.11	0.10	0.11	0.15	0.15	0.27	0.10	0.13	0.26	0.15	0.27	0.20
C5	0.08	0.14	0.20	0.21	0.16	0.11	0.17	0.08	0.15	0.13	0.15	0.13	0.32	0.31	0.17	0.10	0.07	0.08	0.18	0.09
C5'	0.09	0.11	0.13	0.20	0.09	0.13	0.09	0.17	0.09	0.09	0.10	0.15	0.14	0.28	0.08	0.12	0.27	0.15	0.29	0.22
C6	0.13	0.16	0.22	0.20	0.20	0.13	0.22	0.10	0.20	0.17	0.18	0.18	0.35	0.28	0.21	0.14	0.11	0.16	0.16	0.12
C8	0.07	0.14	0.17	0.22	0.14	0.11	0.12	0.11	0.11	0.11	0.15	0.15	0.24	0.33	0.15	0.08	0.15	0.03	0.23	0.12
N1	0.12	0.13	0.26	0.22	0.16	0.14	0.20	0.11	0.18	0.13	0.13	0.23	0.40	0.28	0.17	0.13	0.13	0.19	0.17	0.14
N3	0.08	0.09	0.28	0.29	0.08	0.18	0.10	0.14	0.08	0.06	0.08	0.14	0.42	0.35	0.09	0.05	0.14	0.04	0.23	0.12
N6	0.18	0.25	0.21	0.19	0.29	0.14	0.30	0.13	0.27	0.24	0.26	0.25	0.31	0.27	0.30	0.19	0.18	0.21	0.17	0.18
N7	0.10	0.17	0.17	0.20	0.19	0.10	0.17	0.08	0.15	0.15	0.19	0.18	0.26	0.31	0.20	0.11	0.08	0.05	0.19	0.09
N9	0.03	0.09	0.20	0.25	0.10	0.14	0.09	0.15	0.08	0.07	0.10	0.10	0.28	0.36	0.10	0.06	0.19	0.05	0.25	0.15
O2'	0.17	0.18	0.19	0.24	0.22	0.19	0.25	0.21	0.24	0.19	0.19	0.17	0.22	0.31	0.22	0.21	0.25	0.19	0.22	0.19
O3'	0.07	0.08	0.16	0.19	0.09	0.14	0.13	0.16	0.13	0.08	0.08	0.12	0.21	0.23	0.09	0.12	0.19	0.21	0.17	0.15
O4'	0.10	0.14	0.13	0.23	0.11	0.14	0.10	0.19	0.09	0.10	0.13	0.19	0.14	0.33	0.10	0.12	0.29	0.15	0.31	0.23
O5'	0.12	0.16	0.06	0.12	0.14	0.08	0.13	0.11	0.12	0.13	0.15	0.20	0.08	0.19	0.13	0.14	0.18	0.11	0.22	0.14
OP1	1.55	1.57	1.74	1.75	1.66	1.58	1.67	1.56	1.63	1.59	1.61	1.50	1.71	1.79	1.68	1.46	1.73	1.47	1.83	1.66
OP2	0.22	0.35	0.06	0.19	0.27	0.09	0.20	0.15	0.19	0.26	0.34	0.45	0.07	0.37	0.27	0.21	0.25	0.18	0.30	0.22
P	0.38	0.36	0.53	0.58	0.42	0.48	0.43	0.51	0.42	0.38	0.38	0.31	0.53	0.64	0.43	0.35	0.62	0.44	0.69	0.57

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.01	0.07	0.07	0.22	0.07
C2	0.02	0.00	0.08	0.08	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.01	0.02	0.17	0.09	0.21	0.06
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.14	0.00	0.03	0.03	0.01	0.02	0.08	0.22	0.09
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.08	0.13	0.01	0.01	0.06	0.01	0.08	0.09	0.20	0.11
C4	0.03	0.01	0.03	0.05	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.06	0.26	0.11	0.15	0.10
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.07	0.03	0.05	0.05	0.03	0.01	0.09	0.00	0.02	0.11	0.15	0.05
C5	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.10	0.27	0.10	0.17	0.10
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.12	0.01	0.15	0.00	0.12	0.05	0.08	0.06	0.03	0.03	0.15	0.00	0.00	0.14	0.07	0.01
C6	0.04	0.01	0.05	0.04	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.10	0.21	0.08	0.22	0.07
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.15	0.07	0.23	0.07
N3	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.02	0.22	0.10	0.18	0.06
O2	0.04	0.00	0.14	0.13	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.11	0.15	0.03	0.06	0.15	0.11	0.21	0.08
O2'	0.02	0.05	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.11	0.00	0.08	0.02	0.03	0.06	0.11	0.21	0.09
O3'	0.02	0.09	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.03	0.07	0.02	0.08	0.15	0.08	0.00	0.06	0.02	0.20	0.13	0.22	0.16
O4	0.03	0.01	0.03	0.06	0.01	0.09	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.06	0.00	0.07	0.30	0.14	0.13	0.13
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.10	0.02	0.02	0.06	0.03	0.02	0.07	0.00	0.08	0.07	0.20	0.06
O5'	0.07	0.17	0.02	0.08	0.26	0.02	0.27	0.00	0.21	0.15	0.22	0.15	0.06	0.20	0.30	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.07	0.09	0.08	0.09	0.11	0.11	0.10	0.14	0.08	0.07	0.10	0.11	0.11	0.13	0.14	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.21	0.22	0.20	0.15	0.15	0.17	0.07	0.22	0.23	0.18	0.21	0.21	0.22	0.13	0.20	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.06	0.09	0.11	0.10	0.05	0.10	0.01	0.07	0.07	0.06	0.08	0.09	0.16	0.13	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00