Doublet Group distance statistics: 53683

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.022, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.014, 0.024, 0.034, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.024 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.013, 0.026, 0.039, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.026 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.010, 0.024, 0.038, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.024 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.015, 0.034, 0.053, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.034 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.020, 0.044, 0.067, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.044 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.020, 0.044, 0.068, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.044 std_dev=0.024
O3'	A	0, 0.108, 0.205, 0.302, 0.319 max_d=0.319 avg_d=0.205 std_dev=0.097
C2'	A	0, 0.051, 0.154, 0.258, 0.336 max_d=0.336 avg_d=0.154 std_dev=0.103
C3'	A	0, 0.062, 0.184, 0.306, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.184 std_dev=0.122
O4'	A	0, 0.057, 0.211, 0.365, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.211 std_dev=0.154
C4'	A	0, 0.111, 0.291, 0.471, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.291 std_dev=0.180
O2'	A	0, 0.069, 0.253, 0.436, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.253 std_dev=0.183
C5'	A	0, 0.163, 0.430, 0.698, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.430 std_dev=0.268
OP2	B	0, 0.176, 0.464, 0.751, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.464 std_dev=0.288
O2'	B	0, 0.039, 0.339, 0.639, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.339 std_dev=0.300
C2'	B	0, 0.048, 0.360, 0.672, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.360 std_dev=0.312
P	A	0, 0.251, 0.601, 0.951, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.601 std_dev=0.350
C3'	B	0, 0.031, 0.397, 0.763, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.397 std_dev=0.366
OP2	A	0, 0.397, 0.800, 1.203, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.800 std_dev=0.403
O3'	B	0, 0.003, 0.410, 0.818, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.410 std_dev=0.407
C1'	B	0, 0.003, 0.426, 0.849, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.426 std_dev=0.423
P	B	0, 0.197, 0.647, 1.096, 1.470 max_d=1.470 avg_d=0.647 std_dev=0.449
N1	B	0, 0.021, 0.489, 0.957, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.489 std_dev=0.468
C4'	B	0, 0.048, 0.548, 1.047, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.548 std_dev=0.500
O4'	B	0, 0.064, 0.580, 1.097, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.580 std_dev=0.516
O5'	B	0, 0.248, 0.772, 1.296, 1.737 max_d=1.737 avg_d=0.772 std_dev=0.524
O5'	A	0, 0.568, 1.114, 1.661, 1.800 max_d=1.800 avg_d=1.114 std_dev=0.546
C5'	B	0, 0.123, 0.687, 1.252, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.687 std_dev=0.564
OP1	A	0, 0.853, 1.513, 2.172, 2.184 max_d=2.184 avg_d=1.513 std_dev=0.659
C4	B	0, 0.030, 0.692, 1.353, 2.215 max_d=2.215 avg_d=0.692 std_dev=0.661
C6	B	0, 0.316, 1.024, 1.732, 2.467 max_d=2.467 avg_d=1.024 std_dev=0.708
OP1	B	0, 0.335, 1.047, 1.759, 2.297 max_d=2.297 avg_d=1.047 std_dev=0.712
N3	B	0, 0.329, 1.074, 1.819, 2.489 max_d=2.489 avg_d=1.074 std_dev=0.745
O4	B	0, 0.065, 0.820, 1.576, 2.535 max_d=2.535 avg_d=0.820 std_dev=0.756
C2	B	0, 0.323, 1.088, 1.852, 2.547 max_d=2.547 avg_d=1.088 std_dev=0.764
C5	B	0, 0.287, 1.126, 1.964, 2.931 max_d=2.931 avg_d=1.126 std_dev=0.838
O2	B	0, 0.606, 1.829, 3.051, 4.025 max_d=4.025 avg_d=1.829 std_dev=1.222

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.28	0.41	0.26	0.18
C2	0.03	0.00	0.03	0.05	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.07	0.09	0.49	0.41	0.27	0.28
C2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.05	0.04	0.08	0.03	0.03	0.06	0.07	0.04	0.01	0.02	0.02	0.14	0.43	0.27	0.19
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.05	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.03	0.01	0.01	0.09	0.41	0.24	0.09
C4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.04	0.47	0.40	0.26	0.26
C4'	0.01	0.09	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.07	0.08	0.04	0.05	0.02	0.02	0.04	0.00	0.03	0.34	0.26	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.03	0.51	0.38	0.25	0.28
C5'	0.04	0.12	0.05	0.03	0.07	0.01	0.07	0.00	0.08	0.09	0.10	0.11	0.08	0.08	0.06	0.05	0.03	0.02	0.01	0.29	0.25	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.04	0.53	0.38	0.25	0.29
C8	0.01	0.01	0.08	0.05	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.11	0.09	0.07	0.47	0.38	0.23	0.27
N1	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.07	0.52	0.39	0.26	0.29
N3	0.03	0.00	0.03	0.05	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.06	0.09	0.45	0.42	0.27	0.26
N6	0.01	0.02	0.06	0.03	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.08	0.04	0.54	0.36	0.26	0.30
N7	0.01	0.01	0.07	0.05	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.09	0.09	0.05	0.51	0.37	0.23	0.29
N9	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.03	0.43	0.41	0.25	0.25
O2'	0.02	0.10	0.01	0.03	0.04	0.02	0.04	0.05	0.05	0.11	0.07	0.10	0.06	0.09	0.03	0.00	0.05	0.03	0.09	0.45	0.30	0.21
O3'	0.08	0.07	0.02	0.01	0.07	0.04	0.07	0.03	0.07	0.09	0.07	0.06	0.08	0.09	0.08	0.05	0.00	0.07	0.13	0.40	0.24	0.08
O4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.07	0.07	0.09	0.04	0.05	0.03	0.03	0.07	0.00	0.24	0.32	0.27	0.09
O5'	0.28	0.49	0.14	0.09	0.47	0.03	0.51	0.01	0.53	0.47	0.52	0.45	0.54	0.51	0.43	0.09	0.13	0.24	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.41	0.41	0.43	0.41	0.40	0.34	0.38	0.29	0.38	0.38	0.39	0.42	0.36	0.37	0.41	0.45	0.40	0.32	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.26	0.27	0.27	0.24	0.26	0.26	0.25	0.25	0.25	0.23	0.26	0.27	0.26	0.23	0.25	0.30	0.24	0.27	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.18	0.28	0.19	0.09	0.26	0.02	0.28	0.02	0.29	0.27	0.29	0.26	0.30	0.29	0.25	0.21	0.08	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.21	0.07	0.09	0.62	0.21	0.83	0.37	0.67	0.35	0.34	0.08	0.15	0.09	0.67	0.24	0.28	0.29	0.23	0.23
C2	0.07	0.31	0.12	0.22	0.35	0.20	0.64	0.36	0.59	0.16	0.28	0.61	0.21	0.26	0.39	0.12	0.34	0.24	0.20	0.17
C2'	0.24	0.26	0.09	0.06	0.64	0.20	0.82	0.34	0.67	0.38	0.39	0.12	0.14	0.07	0.71	0.27	0.30	0.36	0.29	0.28
C3'	0.22	0.29	0.07	0.07	0.63	0.17	0.76	0.26	0.59	0.35	0.41	0.19	0.12	0.07	0.72	0.24	0.22	0.28	0.23	0.21
C4	0.12	0.19	0.08	0.17	0.49	0.23	0.77	0.45	0.66	0.26	0.25	0.38	0.18	0.19	0.53	0.18	0.32	0.31	0.23	0.22
C4'	0.18	0.23	0.08	0.11	0.60	0.15	0.72	0.25	0.52	0.30	0.35	0.13	0.13	0.10	0.71	0.19	0.21	0.22	0.18	0.16
C5	0.13	0.22	0.11	0.22	0.47	0.29	0.77	0.53	0.66	0.25	0.24	0.47	0.17	0.22	0.52	0.22	0.32	0.39	0.27	0.28
C5'	0.15	0.17	0.09	0.12	0.51	0.14	0.64	0.27	0.47	0.24	0.27	0.15	0.15	0.11	0.63	0.16	0.22	0.27	0.21	0.19
C6	0.12	0.30	0.14	0.25	0.40	0.30	0.71	0.52	0.63	0.20	0.27	0.61	0.17	0.27	0.44	0.20	0.31	0.36	0.26	0.25
C8	0.17	0.15	0.10	0.18	0.55	0.30	0.82	0.54	0.68	0.30	0.25	0.26	0.16	0.17	0.62	0.26	0.33	0.47	0.30	0.34
N1	0.10	0.35	0.14	0.25	0.34	0.26	0.65	0.44	0.59	0.16	0.29	0.68	0.18	0.29	0.38	0.16	0.31	0.29	0.24	0.20
N3	0.08	0.23	0.09	0.17	0.45	0.17	0.72	0.34	0.64	0.23	0.26	0.43	0.20	0.21	0.47	0.12	0.34	0.21	0.18	0.16
N6	0.13	0.32	0.15	0.28	0.39	0.33	0.71	0.56	0.62	0.20	0.28	0.66	0.16	0.29	0.43	0.22	0.31	0.41	0.29	0.28
N7	0.16	0.18	0.12	0.22	0.51	0.33	0.80	0.58	0.68	0.28	0.23	0.39	0.16	0.21	0.57	0.26	0.34	0.48	0.31	0.34
N9	0.16	0.16	0.08	0.14	0.56	0.25	0.81	0.46	0.68	0.31	0.26	0.22	0.17	0.15	0.61	0.22	0.31	0.36	0.26	0.27
O2'	0.33	0.36	0.20	0.15	0.66	0.27	0.84	0.38	0.72	0.46	0.46	0.24	0.19	0.15	0.71	0.35	0.37	0.43	0.38	0.37
O3'	0.27	0.40	0.12	0.09	0.66	0.18	0.77	0.22	0.61	0.40	0.51	0.37	0.16	0.09	0.73	0.28	0.17	0.22	0.21	0.17
O4'	0.19	0.22	0.09	0.12	0.62	0.19	0.81	0.33	0.61	0.32	0.34	0.17	0.13	0.11	0.70	0.21	0.25	0.23	0.19	0.18
O5'	0.35	0.33	0.26	0.23	0.61	0.31	0.76	0.42	0.64	0.43	0.40	0.23	0.24	0.22	0.67	0.33	0.34	0.43	0.34	0.31
OP1	0.54	0.50	0.39	0.40	0.83	0.57	1.00	0.71	0.87	0.63	0.58	0.34	0.28	0.35	0.90	0.59	0.58	0.80	0.65	0.67
OP2	0.26	0.28	0.28	0.33	0.39	0.35	0.60	0.50	0.47	0.27	0.25	0.44	0.32	0.34	0.46	0.29	0.23	0.48	0.26	0.31
P	0.27	0.22	0.17	0.19	0.54	0.31	0.73	0.47	0.60	0.35	0.30	0.19	0.12	0.15	0.62	0.30	0.31	0.52	0.36	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.07	0.02	0.01	0.20	0.10	0.23	0.12
C2	0.02	0.00	0.13	0.03	0.01	0.14	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00	0.30	0.06	0.01	0.22	0.27	0.18	0.30	0.25
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.05	0.03	0.16	0.11	0.20	0.04	0.09	0.24	0.01	0.02	0.05	0.02	0.36	0.21	0.12	0.17
C3'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.01	0.08	0.06	0.09	0.02	0.02	0.07	0.02	0.01	0.04	0.00	0.27	0.27	0.19	0.17
C4	0.02	0.01	0.05	0.04	0.00	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.19	0.29	0.51	0.33
C4'	0.01	0.14	0.03	0.01	0.04	0.00	0.13	0.01	0.16	0.03	0.11	0.26	0.02	0.03	0.04	0.00	0.03	0.13	0.25	0.03
C5	0.01	0.01	0.16	0.08	0.01	0.13	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.11	0.01	0.15	0.22	0.38	0.66	0.44
C5'	0.06	0.20	0.11	0.06	0.13	0.01	0.23	0.00	0.27	0.11	0.18	0.34	0.11	0.02	0.13	0.02	0.01	0.10	0.30	0.03
C6	0.01	0.01	0.20	0.09	0.01	0.16	0.01	0.27	0.00	0.01	0.01	0.01	0.33	0.12	0.01	0.21	0.26	0.33	0.60	0.41
N1	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.03	0.21	0.14	0.36	0.22
N3	0.03	0.01	0.09	0.02	0.01	0.11	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.05	0.01	0.16	0.25	0.22	0.38	0.29
O2	0.04	0.00	0.24	0.07	0.01	0.26	0.01	0.34	0.01	0.01	0.00	0.00	0.55	0.09	0.01	0.38	0.34	0.26	0.25	0.31
O2'	0.02	0.30	0.01	0.02	0.05	0.02	0.27	0.11	0.33	0.02	0.22	0.55	0.00	0.04	0.05	0.02	0.39	0.28	0.11	0.21
O3'	0.07	0.06	0.02	0.01	0.07	0.03	0.11	0.02	0.12	0.07	0.05	0.09	0.04	0.00	0.07	0.06	0.19	0.31	0.21	0.16
O4	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.17	0.33	0.54	0.35
O4'	0.01	0.22	0.02	0.00	0.05	0.00	0.15	0.02	0.21	0.03	0.16	0.38	0.02	0.06	0.04	0.00	0.03	0.06	0.28	0.10
O5'	0.20	0.27	0.36	0.27	0.19	0.03	0.22	0.01	0.26	0.21	0.25	0.34	0.39	0.19	0.17	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.10	0.18	0.21	0.27	0.29	0.13	0.38	0.10	0.33	0.14	0.22	0.26	0.28	0.31	0.33	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.23	0.30	0.12	0.19	0.51	0.25	0.66	0.30	0.60	0.36	0.38	0.25	0.11	0.21	0.54	0.28	0.01	0.03	0.00	0.01
P	0.12	0.25	0.17	0.17	0.33	0.03	0.44	0.03	0.41	0.22	0.29	0.31	0.21	0.16	0.35	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00