Doublet Group distance statistics: 53689

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C5	A	0, -0.002, 0.009, 0.020, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.009 std_dev=0.011
C4	A	0, -0.001, 0.011, 0.022, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N3	A	0, -0.001, 0.013, 0.027, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.013 std_dev=0.014
N7	A	0, -0.001, 0.013, 0.028, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.013 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C2	A	0, -0.001, 0.015, 0.030, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N9	A	0, -0.002, 0.014, 0.030, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.014 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.001, 0.018, 0.034, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.018 std_dev=0.017
N6	A	0, -0.007, 0.030, 0.067, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.030 std_dev=0.037
O4'	B	0, 0.151, 0.365, 0.579, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.365 std_dev=0.214
C5'	B	0, 0.241, 0.484, 0.728, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.484 std_dev=0.243
C4'	B	0, 0.224, 0.470, 0.716, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.470 std_dev=0.246
O4'	A	0, 0.063, 0.323, 0.582, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.323 std_dev=0.259
C1'	B	0, 0.198, 0.477, 0.757, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.477 std_dev=0.279
C6	B	0, 0.202, 0.485, 0.767, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.485 std_dev=0.282
C2'	A	0, 0.010, 0.302, 0.594, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.302 std_dev=0.292
N1	B	0, 0.241, 0.533, 0.825, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.533 std_dev=0.292
O5'	B	0, 0.220, 0.514, 0.809, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.514 std_dev=0.294
C3'	B	0, 0.313, 0.634, 0.955, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.634 std_dev=0.321
O2'	A	0, -0.022, 0.303, 0.629, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.303 std_dev=0.325
C2'	B	0, 0.251, 0.580, 0.910, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.580 std_dev=0.330
O2'	B	0, 0.271, 0.610, 0.948, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.610 std_dev=0.338
C5	B	0, 0.257, 0.615, 0.973, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.615 std_dev=0.358
P	B	0, 0.208, 0.596, 0.984, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.596 std_dev=0.388
C4'	A	0, 0.068, 0.465, 0.861, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.465 std_dev=0.396
O3'	B	0, 0.395, 0.796, 1.197, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.796 std_dev=0.401
C2	B	0, 0.281, 0.703, 1.125, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.703 std_dev=0.422
C4	B	0, 0.344, 0.788, 1.232, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.788 std_dev=0.444
C3'	A	0, 0.051, 0.504, 0.958, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.504 std_dev=0.453
OP2	B	0, 0.201, 0.664, 1.127, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.664 std_dev=0.463
OP1	B	0, 0.263, 0.743, 1.222, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.743 std_dev=0.480
N3	B	0, 0.333, 0.817, 1.300, 1.511 max_d=1.511 avg_d=0.817 std_dev=0.483
O2	B	0, 0.281, 0.785, 1.289, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.785 std_dev=0.504
O4	B	0, 0.408, 0.942, 1.476, 1.639 max_d=1.639 avg_d=0.942 std_dev=0.534
OP2	A	0, 0.444, 1.013, 1.581, 1.607 max_d=1.607 avg_d=1.013 std_dev=0.568
O5'	A	0, 0.189, 0.807, 1.425, 1.613 max_d=1.613 avg_d=0.807 std_dev=0.618
P	A	0, 0.374, 1.003, 1.633, 1.764 max_d=1.764 avg_d=1.003 std_dev=0.630
O3'	A	0, 0.086, 0.746, 1.405, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.746 std_dev=0.660
C5'	A	0, 0.108, 0.792, 1.476, 1.726 max_d=1.726 avg_d=0.792 std_dev=0.684
OP1	A	0, 0.459, 1.164, 1.870, 2.018 max_d=2.018 avg_d=1.164 std_dev=0.706

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.12	0.19	0.16
C2	0.02	0.00	0.16	0.19	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.25	0.02	0.22	0.26	0.41	0.31
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.02	0.02	0.01	0.05	0.09	0.11	0.17	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.12	0.09
C3'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.01	0.06	0.15	0.14	0.18	0.03	0.12	0.04	0.02	0.01	0.02	0.07	0.09	0.05	0.06
C4	0.01	0.00	0.08	0.08	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.10	0.01	0.18	0.22	0.36	0.28
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.06	0.06	0.08	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.10	0.03	0.04
C5	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.16	0.25	0.40	0.30
C5'	0.02	0.14	0.01	0.01	0.09	0.00	0.08	0.00	0.09	0.05	0.12	0.12	0.07	0.05	0.06	0.03	0.05	0.01	0.00	0.11	0.05	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.08	0.04	0.18	0.27	0.42	0.31
C8	0.02	0.01	0.09	0.15	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.17	0.03	0.11	0.20	0.30	0.25
N1	0.01	0.00	0.11	0.14	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.18	0.02	0.21	0.28	0.43	0.32
N3	0.02	0.00	0.17	0.18	0.00	0.08	0.01	0.12	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.12	0.23	0.02	0.20	0.22	0.36	0.28
N6	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.07	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.04	0.02	0.04	0.07	0.14	0.28	0.42	0.30
N7	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.14	0.03	0.12	0.25	0.37	0.29
N9	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.14	0.19	0.29	0.25
O2'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.03	0.04	0.05	0.08	0.12	0.02	0.04	0.01	0.00	0.04	0.03	0.02	0.11	0.08	0.05
O3'	0.02	0.25	0.01	0.01	0.10	0.02	0.04	0.05	0.08	0.17	0.18	0.23	0.04	0.14	0.03	0.04	0.00	0.03	0.12	0.21	0.13	0.13
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.02	0.02	0.07	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.09	0.14	0.12	0.13
O5'	0.09	0.22	0.05	0.07	0.18	0.01	0.16	0.00	0.18	0.11	0.21	0.20	0.14	0.12	0.14	0.02	0.12	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.12	0.26	0.05	0.09	0.22	0.10	0.25	0.11	0.27	0.20	0.28	0.22	0.28	0.25	0.19	0.11	0.21	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.19	0.41	0.12	0.05	0.36	0.03	0.40	0.05	0.42	0.30	0.43	0.36	0.42	0.37	0.29	0.08	0.13	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.16	0.31	0.09	0.06	0.28	0.04	0.30	0.02	0.31	0.25	0.32	0.28	0.30	0.29	0.25	0.05	0.13	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.48	0.18	0.09	0.47	0.11	0.36	0.17	0.29	0.33	0.54	0.55	0.18	0.17	0.52	0.11	0.15	0.28	0.21	0.24
C2	0.17	0.32	0.13	0.13	0.25	0.15	0.19	0.20	0.17	0.22	0.32	0.38	0.14	0.20	0.25	0.08	0.18	0.28	0.19	0.23
C2'	0.38	0.66	0.35	0.25	0.64	0.17	0.51	0.12	0.43	0.49	0.72	0.75	0.34	0.27	0.68	0.22	0.12	0.11	0.11	0.09
C3'	0.49	0.74	0.52	0.42	0.68	0.30	0.55	0.21	0.48	0.57	0.78	0.86	0.55	0.47	0.72	0.32	0.20	0.10	0.15	0.11
C4	0.18	0.37	0.15	0.14	0.32	0.16	0.24	0.20	0.19	0.25	0.40	0.45	0.18	0.24	0.34	0.09	0.18	0.30	0.21	0.24
C4'	0.32	0.59	0.35	0.26	0.56	0.16	0.42	0.13	0.35	0.41	0.64	0.69	0.40	0.33	0.61	0.17	0.09	0.17	0.13	0.14
C5	0.19	0.33	0.18	0.21	0.26	0.21	0.18	0.24	0.15	0.22	0.34	0.42	0.22	0.32	0.27	0.12	0.22	0.32	0.22	0.25
C5'	0.39	0.62	0.46	0.38	0.56	0.27	0.43	0.19	0.37	0.45	0.66	0.73	0.54	0.49	0.61	0.24	0.12	0.13	0.10	0.10
C6	0.21	0.30	0.20	0.24	0.20	0.23	0.15	0.25	0.14	0.21	0.28	0.37	0.22	0.34	0.20	0.15	0.23	0.32	0.22	0.24
C8	0.19	0.39	0.17	0.18	0.34	0.18	0.24	0.23	0.19	0.25	0.42	0.47	0.22	0.30	0.37	0.10	0.21	0.32	0.23	0.26
N1	0.21	0.29	0.18	0.21	0.20	0.21	0.16	0.24	0.15	0.21	0.27	0.35	0.19	0.29	0.20	0.15	0.22	0.30	0.20	0.23
N3	0.17	0.37	0.13	0.10	0.33	0.13	0.25	0.19	0.21	0.25	0.40	0.44	0.14	0.18	0.35	0.08	0.17	0.28	0.20	0.23
N6	0.23	0.28	0.23	0.29	0.18	0.27	0.14	0.28	0.15	0.22	0.26	0.36	0.25	0.39	0.17	0.19	0.25	0.32	0.22	0.24
N7	0.19	0.35	0.19	0.23	0.27	0.22	0.19	0.26	0.15	0.23	0.36	0.44	0.24	0.35	0.30	0.12	0.23	0.34	0.24	0.26
N9	0.18	0.41	0.16	0.13	0.37	0.15	0.27	0.20	0.22	0.27	0.45	0.48	0.19	0.24	0.41	0.08	0.18	0.30	0.22	0.25
O2'	0.30	0.64	0.27	0.16	0.66	0.09	0.52	0.08	0.42	0.45	0.73	0.70	0.21	0.15	0.72	0.16	0.06	0.11	0.11	0.09
O3'	0.62	0.90	0.67	0.56	0.84	0.41	0.69	0.30	0.62	0.71	0.94	1.02	0.69	0.60	0.88	0.43	0.33	0.17	0.29	0.22
O4'	0.22	0.49	0.21	0.11	0.50	0.11	0.38	0.17	0.30	0.33	0.56	0.57	0.24	0.20	0.55	0.11	0.17	0.31	0.27	0.27
O5'	0.49	0.67	0.56	0.50	0.61	0.40	0.48	0.29	0.43	0.52	0.70	0.79	0.67	0.63	0.65	0.35	0.20	0.10	0.10	0.07
OP1	0.49	0.68	0.57	0.53	0.65	0.44	0.51	0.36	0.45	0.53	0.73	0.78	0.67	0.69	0.71	0.37	0.25	0.15	0.11	0.10
OP2	0.65	0.74	0.74	0.73	0.62	0.66	0.52	0.58	0.51	0.63	0.73	0.85	0.85	0.89	0.64	0.56	0.46	0.33	0.23	0.28
P	0.54	0.70	0.62	0.58	0.63	0.50	0.50	0.40	0.46	0.55	0.72	0.80	0.73	0.72	0.67	0.42	0.29	0.18	0.11	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.01	0.05	0.00	0.07	0.06	0.07	0.05
C2	0.02	0.00	0.01	0.07	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.05	0.01	0.09	0.11	0.14	0.10
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.08	0.07	0.04
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.10	0.01	0.10	0.02	0.08	0.06	0.08	0.08	0.02	0.01	0.11	0.01	0.03	0.08	0.04	0.03
C4	0.03	0.03	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.12	0.01	0.05	0.16	0.21	0.24	0.19
C4'	0.00	0.02	0.02	0.01	0.07	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.03	0.06	0.05	0.02	0.08	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02
C5	0.03	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.01	0.04	0.17	0.21	0.23	0.19
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.10	0.05	0.07	0.02	0.05	0.03	0.13	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01
C6	0.02	0.02	0.04	0.08	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.10	0.02	0.04	0.15	0.16	0.16	0.14
N1	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.06	0.04	0.01	0.09	0.10	0.12	0.09
N3	0.00	0.01	0.01	0.08	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.00	0.03	0.04	0.09	0.04	0.01	0.12	0.16	0.19	0.14
O2	0.05	0.00	0.06	0.08	0.04	0.06	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.07	0.08	0.07	0.04	0.05	0.06	0.11	0.06
O2'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.03	0.02	0.04	0.07	0.00	0.03	0.07	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.12	0.02	0.12	0.03	0.10	0.06	0.09	0.08	0.03	0.00	0.13	0.02	0.07	0.07	0.04	0.03
O4	0.05	0.05	0.07	0.11	0.01	0.08	0.01	0.13	0.02	0.04	0.04	0.07	0.07	0.13	0.00	0.06	0.18	0.24	0.27	0.22
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.06	0.00	0.07	0.05	0.05	0.04
O5'	0.07	0.09	0.04	0.03	0.16	0.01	0.17	0.00	0.15	0.09	0.12	0.05	0.02	0.07	0.18	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.11	0.08	0.08	0.21	0.04	0.21	0.03	0.16	0.10	0.16	0.06	0.04	0.07	0.24	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.14	0.07	0.04	0.24	0.02	0.23	0.01	0.16	0.12	0.19	0.11	0.04	0.04	0.27	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.10	0.04	0.03	0.19	0.02	0.19	0.01	0.14	0.09	0.14	0.06	0.03	0.03	0.22	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00