Doublet Group distance statistics: 53707

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.006, 0.021, 0.037, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.002, 0.021, 0.040, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.021 std_dev=0.019
C5	A	0, 0.006, 0.030, 0.053, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.030 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.013, 0.051, 0.089, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.051 std_dev=0.038
N6	A	0, 0.015, 0.055, 0.095, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.055 std_dev=0.040
N7	A	0, 0.015, 0.072, 0.128, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.072 std_dev=0.056
C8	A	0, 0.016, 0.074, 0.132, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.074 std_dev=0.058
O4'	B	0, 0.075, 0.262, 0.448, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.262 std_dev=0.187
C4'	B	0, 0.094, 0.323, 0.552, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.323 std_dev=0.229
C3'	B	0, 0.090, 0.334, 0.578, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.334 std_dev=0.244
C2'	B	0, 0.101, 0.353, 0.605, 0.572 max_d=0.572 avg_d=0.353 std_dev=0.252
O2'	B	0, 0.107, 0.370, 0.633, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.370 std_dev=0.263
C1'	B	0, 0.091, 0.365, 0.639, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.365 std_dev=0.274
O3'	B	0, 0.111, 0.427, 0.744, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.427 std_dev=0.317
C5'	B	0, 0.086, 0.461, 0.835, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.461 std_dev=0.374
O4'	A	0, 0.169, 0.582, 0.995, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.582 std_dev=0.413
O5'	B	0, 0.094, 0.511, 0.928, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.511 std_dev=0.417
N1	B	0, 0.010, 0.443, 0.877, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.443 std_dev=0.434
C2'	A	0, 0.187, 0.640, 1.092, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.640 std_dev=0.453
C2	B	0, 0.108, 0.579, 1.050, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.579 std_dev=0.471
O2	B	0, 0.188, 0.666, 1.144, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.666 std_dev=0.478
C6	B	0, -0.117, 0.525, 1.167, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.525 std_dev=0.642
N3	B	0, 0.074, 0.717, 1.360, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.717 std_dev=0.643
OP2	A	0, 0.201, 0.877, 1.553, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.877 std_dev=0.676
C4'	A	0, 0.285, 0.976, 1.668, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.976 std_dev=0.691
P	A	0, 0.261, 0.984, 1.707, 1.716 max_d=1.716 avg_d=0.984 std_dev=0.723
O5'	A	0, 0.302, 1.037, 1.772, 1.615 max_d=1.615 avg_d=1.037 std_dev=0.735
P	B	0, 0.002, 0.748, 1.495, 1.767 max_d=1.767 avg_d=0.748 std_dev=0.746
C3'	A	0, 0.307, 1.057, 1.807, 1.658 max_d=1.658 avg_d=1.057 std_dev=0.750
C5	B	0, -0.039, 0.765, 1.569, 1.876 max_d=1.876 avg_d=0.765 std_dev=0.804
C4	B	0, 0.003, 0.820, 1.637, 1.935 max_d=1.935 avg_d=0.820 std_dev=0.817
C5'	A	0, 0.341, 1.169, 1.997, 1.806 max_d=1.806 avg_d=1.169 std_dev=0.828
O2'	A	0, 0.345, 1.179, 2.012, 1.786 max_d=1.786 avg_d=1.179 std_dev=0.834
OP1	A	0, 0.340, 1.191, 2.042, 1.933 max_d=1.933 avg_d=1.191 std_dev=0.851
OP1	B	0, 0.183, 1.103, 2.024, 2.254 max_d=2.254 avg_d=1.103 std_dev=0.921
OP2	B	0, 0.068, 1.004, 1.939, 2.252 max_d=2.252 avg_d=1.004 std_dev=0.935
O4	B	0, 0.079, 1.049, 2.018, 2.338 max_d=2.338 avg_d=1.049 std_dev=0.969
O3'	A	0, 0.472, 1.630, 2.789, 2.587 max_d=2.587 avg_d=1.630 std_dev=1.159

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.15	0.00	0.12	0.11	0.18	0.13
C2	0.00	0.00	0.16	0.17	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.07	0.04	0.05	0.11	0.07
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.12	0.08	0.07	0.13	0.16	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.29	0.33	0.27
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.18	0.00	0.23	0.01	0.24	0.19	0.22	0.14	0.27	0.23	0.15	0.01	0.00	0.02	0.03	0.09	0.05	0.02
C4	0.01	0.00	0.09	0.18	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.04	0.03	0.04	0.06	0.13	0.08
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.08	0.11	0.05	0.01	0.10	0.12	0.06	0.19	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.23	0.00	0.09	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.11	0.01	0.03	0.05	0.13	0.06
C5'	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.07	0.02	0.03	0.07	0.08	0.01	0.07	0.13	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.24	0.01	0.08	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.12	0.01	0.03	0.06	0.13	0.06
C8	0.01	0.02	0.07	0.19	0.01	0.11	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.19	0.12	0.07	0.02	0.06	0.17	0.08
N1	0.01	0.01	0.13	0.22	0.00	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.07	0.05	0.02	0.04	0.11	0.06
N3	0.00	0.00	0.16	0.14	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.07	0.06	0.07	0.12	0.09
N6	0.02	0.01	0.06	0.27	0.01	0.10	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.16	0.01	0.07	0.09	0.15	0.08
N7	0.01	0.01	0.03	0.23	0.01	0.12	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.16	0.05	0.05	0.07	0.16	0.07
N9	0.00	0.01	0.01	0.15	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.03	0.01	0.06	0.07	0.16	0.10
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.11	0.19	0.18	0.07	0.17	0.19	0.12	0.03	0.20	0.21	0.11	0.00	0.04	0.13	0.15	0.19	0.36	0.22
O3'	0.15	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.11	0.13	0.12	0.12	0.07	0.08	0.16	0.16	0.03	0.04	0.00	0.10	0.16	0.19	0.20	0.17
O4'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.13	0.10	0.00	0.08	0.05	0.13	0.11
O5'	0.12	0.04	0.23	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.06	0.07	0.05	0.06	0.15	0.16	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.11	0.05	0.29	0.09	0.06	0.04	0.05	0.03	0.06	0.06	0.04	0.07	0.09	0.07	0.07	0.19	0.19	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.11	0.33	0.05	0.13	0.01	0.13	0.01	0.13	0.17	0.11	0.12	0.15	0.16	0.16	0.36	0.20	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.07	0.27	0.02	0.08	0.02	0.06	0.01	0.06	0.08	0.06	0.09	0.08	0.07	0.10	0.22	0.17	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.40	0.22	0.08	0.45	0.04	0.44	0.09	0.41	0.38	0.44	0.37	0.16	0.08	0.45	0.21	0.12	0.20	0.05	0.08
C2	0.24	0.24	0.18	0.08	0.26	0.04	0.27	0.06	0.28	0.26	0.25	0.21	0.16	0.06	0.23	0.20	0.12	0.19	0.03	0.07
C2'	0.43	0.54	0.37	0.25	0.56	0.17	0.53	0.11	0.49	0.50	0.57	0.53	0.33	0.27	0.57	0.31	0.10	0.06	0.20	0.10
C3'	0.33	0.40	0.28	0.19	0.43	0.15	0.43	0.13	0.40	0.39	0.42	0.37	0.24	0.26	0.42	0.26	0.08	0.02	0.18	0.11
C4	0.27	0.32	0.19	0.06	0.35	0.01	0.36	0.09	0.35	0.32	0.34	0.29	0.17	0.10	0.33	0.20	0.12	0.20	0.03	0.08
C4'	0.30	0.40	0.24	0.09	0.44	0.02	0.42	0.06	0.39	0.37	0.43	0.38	0.19	0.14	0.42	0.21	0.09	0.15	0.04	0.05
C5	0.24	0.27	0.17	0.04	0.30	0.01	0.31	0.11	0.30	0.28	0.29	0.25	0.16	0.13	0.28	0.18	0.13	0.21	0.08	0.12
C5'	0.30	0.39	0.22	0.07	0.43	0.01	0.41	0.09	0.38	0.36	0.43	0.37	0.19	0.16	0.42	0.21	0.11	0.17	0.01	0.08
C6	0.20	0.21	0.15	0.05	0.22	0.03	0.23	0.10	0.24	0.22	0.21	0.19	0.16	0.12	0.20	0.15	0.14	0.21	0.13	0.14
C8	0.27	0.34	0.18	0.03	0.38	0.01	0.38	0.12	0.36	0.33	0.37	0.31	0.16	0.15	0.37	0.19	0.13	0.22	0.05	0.11
N1	0.19	0.18	0.15	0.06	0.19	0.04	0.21	0.07	0.21	0.20	0.18	0.17	0.16	0.09	0.17	0.16	0.13	0.19	0.11	0.11
N3	0.28	0.32	0.21	0.09	0.34	0.04	0.35	0.07	0.34	0.33	0.33	0.29	0.17	0.07	0.32	0.21	0.11	0.19	0.03	0.07
N6	0.16	0.16	0.12	0.05	0.16	0.04	0.17	0.13	0.17	0.16	0.16	0.15	0.15	0.13	0.13	0.12	0.18	0.23	0.20	0.20
N7	0.24	0.29	0.17	0.04	0.33	0.02	0.33	0.12	0.32	0.29	0.32	0.27	0.16	0.16	0.31	0.18	0.14	0.23	0.09	0.13
N9	0.29	0.36	0.20	0.06	0.40	0.02	0.40	0.10	0.37	0.35	0.39	0.33	0.16	0.11	0.39	0.20	0.12	0.21	0.01	0.08
O2'	0.32	0.52	0.24	0.07	0.55	0.09	0.48	0.19	0.42	0.43	0.57	0.54	0.15	0.10	0.58	0.18	0.14	0.34	0.02	0.15
O3'	0.28	0.34	0.21	0.07	0.35	0.08	0.34	0.10	0.33	0.32	0.36	0.33	0.18	0.12	0.33	0.23	0.13	0.19	0.05	0.10
O4'	0.30	0.39	0.22	0.10	0.43	0.10	0.42	0.14	0.39	0.37	0.42	0.36	0.17	0.09	0.42	0.22	0.19	0.25	0.06	0.14
O5'	0.29	0.38	0.20	0.04	0.43	0.01	0.41	0.11	0.38	0.36	0.41	0.35	0.17	0.19	0.41	0.21	0.12	0.19	0.04	0.10
OP1	0.27	0.37	0.16	0.03	0.44	0.03	0.43	0.12	0.39	0.35	0.42	0.33	0.13	0.23	0.44	0.20	0.12	0.20	0.04	0.10
OP2	0.30	0.40	0.17	0.03	0.48	0.01	0.48	0.11	0.43	0.39	0.45	0.35	0.14	0.24	0.48	0.24	0.12	0.20	0.05	0.11
P	0.31	0.42	0.20	0.03	0.49	0.01	0.47	0.11	0.43	0.40	0.46	0.38	0.17	0.20	0.48	0.24	0.13	0.20	0.04	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.14	0.04
C2	0.00	0.00	0.03	0.09	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.00	0.00	0.10	0.07	0.12	0.11
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.06	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.05	0.11	0.04
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.12	0.00	0.12	0.01	0.10	0.06	0.11	0.09	0.01	0.01	0.15	0.01	0.04	0.06	0.05	0.02
C4	0.01	0.00	0.03	0.12	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.00	0.01	0.18	0.13	0.12	0.17
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.06	0.04	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.08	0.08	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.01	0.01	0.17	0.11	0.08	0.14
C5'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.13	0.00	0.12	0.00	0.09	0.06	0.11	0.07	0.04	0.02	0.15	0.01	0.01	0.10	0.04	0.01
C6	0.00	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.11	0.01	0.01	0.12	0.07	0.10	0.07
N1	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.00	0.07	0.04	0.12	0.06
N3	0.00	0.00	0.03	0.11	0.00	0.06	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.00	0.01	0.15	0.11	0.13	0.14
O2	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.08	0.00	0.00	0.09	0.06	0.13	0.10
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.02	0.04	0.08	0.00	0.05	0.02	0.04	0.01	0.10	0.08	0.01
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.14	0.01	0.14	0.02	0.11	0.05	0.11	0.08	0.05	0.00	0.18	0.02	0.03	0.11	0.06	0.04
O4	0.01	0.00	0.04	0.15	0.00	0.09	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.18	0.00	0.01	0.22	0.17	0.17	0.21
O4'	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.00	0.05	0.04	0.16	0.05
O5'	0.01	0.10	0.03	0.04	0.18	0.02	0.17	0.01	0.12	0.07	0.15	0.09	0.01	0.03	0.22	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.03	0.07	0.05	0.06	0.13	0.08	0.11	0.10	0.07	0.04	0.11	0.06	0.10	0.11	0.17	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.14	0.12	0.11	0.05	0.12	0.08	0.08	0.04	0.10	0.12	0.13	0.13	0.08	0.06	0.17	0.16	0.02	0.02	0.00	0.00
P	0.04	0.11	0.04	0.02	0.17	0.02	0.14	0.01	0.07	0.06	0.14	0.10	0.01	0.04	0.21	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00