Doublet Group distance statistics: 53708

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N7	A	0, 0.001, 0.018, 0.034, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.000, 0.024, 0.049, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.024 std_dev=0.025
N1	A	0, -0.001, 0.025, 0.051, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.025 std_dev=0.026
N3	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C5	A	0, -0.005, 0.024, 0.053, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.024 std_dev=0.029
C2	A	0, -0.006, 0.023, 0.052, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.023 std_dev=0.029
N9	A	0, -0.002, 0.028, 0.058, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.028 std_dev=0.030
C8	A	0, -0.001, 0.031, 0.063, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.031 std_dev=0.032
C1'	A	0, -0.005, 0.027, 0.059, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.027 std_dev=0.032
C6	A	0, -0.010, 0.033, 0.075, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.033 std_dev=0.042
N6	A	0, -0.033, 0.099, 0.230, 0.285 max_d=0.285 avg_d=0.099 std_dev=0.132
O4'	B	0, 0.070, 0.242, 0.414, 0.386 max_d=0.386 avg_d=0.242 std_dev=0.172
O4'	A	0, -0.023, 0.163, 0.349, 0.423 max_d=0.423 avg_d=0.163 std_dev=0.186
C4'	B	0, 0.072, 0.264, 0.456, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.264 std_dev=0.192
N1	B	0, 0.077, 0.272, 0.466, 0.443 max_d=0.443 avg_d=0.272 std_dev=0.194
C1'	B	0, 0.085, 0.290, 0.496, 0.439 max_d=0.439 avg_d=0.290 std_dev=0.205
C4	B	0, 0.090, 0.306, 0.523, 0.466 max_d=0.466 avg_d=0.306 std_dev=0.217
C5'	B	0, 0.038, 0.265, 0.492, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.265 std_dev=0.227
O3'	B	0, 0.090, 0.332, 0.573, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.332 std_dev=0.241
C2'	A	0, -0.016, 0.228, 0.472, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.228 std_dev=0.244
C2'	B	0, 0.097, 0.367, 0.636, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.367 std_dev=0.270
C4'	A	0, -0.054, 0.243, 0.540, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.243 std_dev=0.297
C3'	B	0, 0.079, 0.382, 0.685, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.382 std_dev=0.303
O2'	A	0, 0.014, 0.321, 0.629, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.321 std_dev=0.307
O4	B	0, 0.086, 0.408, 0.730, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.408 std_dev=0.322
O2'	B	0, 0.111, 0.440, 0.768, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.440 std_dev=0.328
C3'	A	0, -0.030, 0.304, 0.638, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.304 std_dev=0.334
O5'	B	0, 0.032, 0.396, 0.760, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.396 std_dev=0.364
OP1	A	0, 0.015, 0.385, 0.755, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.385 std_dev=0.370
O3'	A	0, -0.039, 0.389, 0.816, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.389 std_dev=0.428
P	B	0, -0.066, 0.413, 0.893, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.413 std_dev=0.480
OP2	B	0, -0.065, 0.482, 1.029, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.482 std_dev=0.547
C5'	A	0, -0.072, 0.477, 1.027, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.477 std_dev=0.549
P	A	0, -0.080, 0.474, 1.029, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.474 std_dev=0.554
OP2	A	0, -0.089, 0.581, 1.252, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.581 std_dev=0.671
OP1	B	0, -0.123, 0.569, 1.260, 1.542 max_d=1.542 avg_d=0.569 std_dev=0.692
O5'	A	0, -0.158, 0.622, 1.402, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.622 std_dev=0.780
C6	B	0, -0.033, 0.820, 1.673, 1.996 max_d=1.996 avg_d=0.820 std_dev=0.853
C5	B	0, -0.036, 0.841, 1.717, 2.050 max_d=2.050 avg_d=0.841 std_dev=0.876
N3	B	0, -0.129, 1.035, 2.199, 2.661 max_d=2.661 avg_d=1.035 std_dev=1.164
C2	B	0, -0.150, 1.074, 2.298, 2.786 max_d=2.786 avg_d=1.074 std_dev=1.224
O2	B	0, -0.446, 1.788, 4.023, 4.939 max_d=4.939 avg_d=1.788 std_dev=2.234

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.09	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.24	0.15	0.29	0.01
C2	0.01	0.00	0.08	0.20	0.02	0.09	0.03	0.14	0.02	0.05	0.00	0.00	0.04	0.03	0.03	0.10	0.22	0.01	0.39	0.18	0.14	0.12
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.06	0.09	0.01	0.09	0.10	0.11	0.03	0.00	0.02	0.01	0.21	0.22	0.26	0.02
C3'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.11	0.00	0.06	0.01	0.07	0.04	0.14	0.19	0.02	0.02	0.05	0.03	0.00	0.00	0.26	0.35	0.24	0.09
C4	0.02	0.02	0.00	0.11	0.00	0.05	0.01	0.10	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.00	0.00	0.10	0.12	0.01	0.45	0.21	0.13	0.15
C4'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.08	0.02	0.01	0.03	0.09	0.02	0.01	0.00	0.22	0.38	0.06
C5	0.05	0.03	0.06	0.06	0.01	0.02	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.04	0.13	0.08	0.03	0.58	0.26	0.03	0.25
C5'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.10	0.00	0.10	0.00	0.10	0.06	0.13	0.12	0.05	0.09	0.07	0.09	0.01	0.00	0.00	0.36	0.40	0.02
C6	0.06	0.02	0.06	0.07	0.03	0.02	0.01	0.10	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.04	0.15	0.11	0.04	0.60	0.28	0.05	0.28
C8	0.02	0.05	0.09	0.04	0.02	0.00	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.04	0.08	0.01	0.00	0.06	0.04	0.01	0.61	0.26	0.08	0.23
N1	0.02	0.00	0.01	0.14	0.00	0.06	0.01	0.13	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.13	0.18	0.01	0.50	0.23	0.04	0.20
N3	0.01	0.00	0.09	0.19	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.20	0.01	0.34	0.17	0.18	0.09
N6	0.09	0.04	0.10	0.02	0.05	0.02	0.05	0.05	0.00	0.08	0.04	0.01	0.00	0.09	0.08	0.18	0.06	0.08	0.71	0.37	0.18	0.39
N7	0.04	0.03	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.03	0.01	0.00	0.01	0.09	0.00	0.03	0.11	0.03	0.01	0.65	0.27	0.03	0.28
N9	0.01	0.03	0.03	0.05	0.00	0.03	0.04	0.07	0.04	0.00	0.01	0.03	0.08	0.03	0.00	0.05	0.05	0.00	0.44	0.21	0.18	0.12
O2'	0.01	0.10	0.00	0.03	0.10	0.09	0.13	0.09	0.15	0.06	0.13	0.08	0.18	0.11	0.05	0.00	0.04	0.09	0.11	0.04	0.43	0.22
O3'	0.01	0.22	0.02	0.00	0.12	0.02	0.08	0.01	0.11	0.04	0.18	0.20	0.06	0.03	0.05	0.04	0.00	0.02	0.12	0.37	0.26	0.06
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.00	0.09	0.02	0.00	0.13	0.13	0.37	0.07
O5'	0.24	0.39	0.21	0.26	0.45	0.00	0.58	0.00	0.60	0.61	0.50	0.34	0.71	0.65	0.44	0.11	0.12	0.13	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.15	0.18	0.22	0.35	0.21	0.22	0.26	0.36	0.28	0.26	0.23	0.17	0.37	0.27	0.21	0.04	0.37	0.13	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.29	0.14	0.26	0.24	0.13	0.38	0.03	0.40	0.05	0.08	0.04	0.18	0.18	0.03	0.18	0.43	0.26	0.37	0.03	0.00	0.00	0.01
P	0.01	0.12	0.02	0.09	0.15	0.06	0.25	0.02	0.28	0.23	0.20	0.09	0.39	0.28	0.12	0.22	0.06	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.17	0.07	0.13	0.06	0.08	0.14	0.01	0.17	0.02	0.17	0.31	0.10	0.10	0.13	0.03	0.10	0.11	0.11	0.03
C2	0.07	0.25	0.03	0.05	0.07	0.03	0.14	0.01	0.14	0.09	0.20	0.41	0.02	0.04	0.10	0.07	0.06	0.17	0.07	0.01
C2'	0.09	0.17	0.02	0.08	0.12	0.02	0.44	0.07	0.47	0.15	0.15	0.48	0.02	0.07	0.06	0.09	0.03	0.11	0.17	0.09
C3'	0.21	0.13	0.17	0.08	0.14	0.14	0.50	0.18	0.55	0.23	0.13	0.44	0.14	0.12	0.06	0.21	0.10	0.04	0.25	0.19
C4	0.06	0.12	0.03	0.05	0.06	0.01	0.06	0.04	0.04	0.07	0.09	0.18	0.02	0.03	0.10	0.06	0.02	0.08	0.13	0.07
C4'	0.05	0.26	0.03	0.03	0.07	0.02	0.27	0.07	0.33	0.06	0.28	0.52	0.01	0.03	0.17	0.06	0.04	0.07	0.13	0.07
C5	0.11	0.26	0.08	0.04	0.07	0.07	0.12	0.10	0.10	0.11	0.21	0.43	0.07	0.04	0.09	0.11	0.08	0.03	0.18	0.13
C5'	0.12	0.21	0.11	0.06	0.07	0.10	0.25	0.13	0.33	0.09	0.25	0.43	0.10	0.14	0.18	0.11	0.04	0.05	0.18	0.13
C6	0.15	0.41	0.13	0.09	0.09	0.12	0.18	0.13	0.18	0.14	0.34	0.68	0.13	0.08	0.10	0.16	0.14	0.03	0.20	0.16
C8	0.07	0.11	0.05	0.02	0.05	0.03	0.04	0.09	0.04	0.08	0.08	0.15	0.04	0.02	0.09	0.08	0.04	0.03	0.19	0.13
N1	0.14	0.43	0.11	0.06	0.10	0.09	0.20	0.08	0.21	0.14	0.35	0.72	0.11	0.04	0.11	0.15	0.08	0.08	0.14	0.09
N3	0.03	0.08	0.03	0.09	0.07	0.06	0.06	0.02	0.04	0.05	0.07	0.11	0.04	0.06	0.11	0.03	0.09	0.16	0.07	0.01
N6	0.23	0.57	0.23	0.21	0.15	0.23	0.19	0.23	0.19	0.21	0.48	0.92	0.24	0.19	0.16	0.23	0.30	0.17	0.30	0.29
N7	0.09	0.22	0.07	0.03	0.06	0.06	0.10	0.10	0.09	0.09	0.17	0.36	0.06	0.04	0.09	0.10	0.08	0.04	0.20	0.15
N9	0.04	0.04	0.02	0.06	0.05	0.02	0.06	0.04	0.08	0.06	0.05	0.02	0.03	0.04	0.10	0.05	0.03	0.07	0.14	0.08
O2'	0.18	0.52	0.25	0.33	0.08	0.25	0.35	0.15	0.36	0.10	0.46	0.93	0.31	0.31	0.14	0.16	0.26	0.30	0.03	0.12
O3'	0.26	0.21	0.21	0.12	0.17	0.17	0.65	0.21	0.71	0.27	0.20	0.64	0.20	0.17	0.08	0.25	0.14	0.04	0.27	0.20
O4'	0.04	0.22	0.06	0.11	0.13	0.07	0.10	0.01	0.14	0.03	0.25	0.37	0.09	0.06	0.21	0.04	0.11	0.10	0.08	0.02
O5'	0.26	0.39	0.32	0.45	0.21	0.41	0.02	0.39	0.02	0.20	0.38	0.58	0.31	0.43	0.27	0.30	0.45	0.53	0.26	0.36
OP1	0.18	0.30	0.21	0.27	0.21	0.22	0.02	0.16	0.01	0.15	0.32	0.44	0.23	0.25	0.28	0.18	0.24	0.22	0.04	0.11
OP2	0.21	0.18	0.17	0.10	0.14	0.12	0.21	0.12	0.24	0.22	0.15	0.16	0.19	0.12	0.11	0.19	0.06	0.01	0.20	0.13
P	0.06	0.14	0.10	0.18	0.09	0.15	0.07	0.12	0.09	0.03	0.16	0.24	0.10	0.16	0.16	0.08	0.19	0.21	0.01	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.01	0.03	0.07	0.08	0.00	0.15	0.26	0.05	0.10
C2	0.02	0.00	0.15	0.32	0.02	0.41	0.01	0.70	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.23	0.02	0.27	0.63	0.69	0.97	0.86
C2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.03	0.00	0.15	0.03	0.20	0.02	0.10	0.28	0.01	0.06	0.02	0.00	0.07	0.30	0.07	0.11
C3'	0.03	0.32	0.01	0.00	0.02	0.00	0.27	0.01	0.34	0.02	0.23	0.61	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.22	0.04	0.01
C4	0.07	0.02	0.03	0.02	0.00	0.05	0.02	0.04	0.03	0.05	0.00	0.01	0.08	0.02	0.01	0.08	0.23	0.14	0.08	0.09
C4'	0.01	0.41	0.00	0.00	0.05	0.00	0.36	0.00	0.44	0.02	0.29	0.80	0.00	0.02	0.04	0.00	0.00	0.20	0.03	0.02
C5	0.06	0.01	0.15	0.27	0.02	0.36	0.00	0.58	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.13	0.05	0.27	0.92	0.96	0.92	0.94
C5'	0.01	0.70	0.03	0.01	0.04	0.00	0.58	0.00	0.69	0.02	0.54	1.37	0.02	0.03	0.05	0.00	0.00	0.18	0.05	0.01
C6	0.05	0.01	0.20	0.34	0.03	0.44	0.01	0.69	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.16	0.06	0.32	1.04	1.08	1.00	1.03
N1	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.06	0.05	0.06	0.02	0.21	0.24	0.06	0.12
N3	0.04	0.01	0.10	0.23	0.00	0.29	0.01	0.54	0.01	0.03	0.00	0.00	0.16	0.19	0.00	0.15	0.45	0.61	0.89	0.73
O2	0.01	0.01	0.28	0.61	0.01	0.80	0.00	1.37	0.01	0.01	0.00	0.00	0.32	0.40	0.00	0.51	1.45	1.52	1.86	1.75
O2'	0.03	0.20	0.01	0.01	0.08	0.00	0.02	0.02	0.04	0.06	0.16	0.32	0.00	0.11	0.09	0.01	0.04	0.30	0.10	0.11
O3'	0.07	0.23	0.06	0.00	0.02	0.02	0.13	0.03	0.16	0.05	0.19	0.40	0.11	0.00	0.03	0.06	0.10	0.31	0.03	0.06
O4	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.05	0.05	0.06	0.06	0.00	0.00	0.09	0.03	0.00	0.09	0.17	0.06	0.16	0.07
O4'	0.00	0.27	0.00	0.01	0.08	0.00	0.27	0.00	0.32	0.02	0.15	0.51	0.01	0.06	0.09	0.00	0.14	0.22	0.01	0.07
O5'	0.15	0.63	0.07	0.10	0.23	0.00	0.92	0.00	1.04	0.21	0.45	1.45	0.04	0.10	0.17	0.14	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.26	0.69	0.30	0.22	0.14	0.20	0.96	0.18	1.08	0.24	0.61	1.52	0.30	0.31	0.06	0.22	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.97	0.07	0.04	0.08	0.03	0.92	0.05	1.00	0.06	0.89	1.86	0.10	0.03	0.16	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.86	0.11	0.01	0.09	0.02	0.94	0.01	1.03	0.12	0.73	1.75	0.11	0.06	0.07	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00