Doublet Group distance statistics: 53712

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.000, 0.002, 0.004, 0.004 max_d=0.004 avg_d=0.002 std_dev=0.002
C6	A	0, 0.000, 0.002, 0.004, 0.004 max_d=0.004 avg_d=0.002 std_dev=0.002
C1'	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N6	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
O4'	A	0, 0.000, 0.107, 0.213, 0.213 max_d=0.213 avg_d=0.107 std_dev=0.107
C4'	A	0, 0.000, 0.179, 0.357, 0.357 max_d=0.357 avg_d=0.179 std_dev=0.179
C2'	A	0, 0.000, 0.182, 0.364, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.182 std_dev=0.182
C3'	A	0, 0.000, 0.287, 0.573, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.287 std_dev=0.287
C5'	A	0, 0.000, 0.297, 0.595, 0.595 max_d=0.595 avg_d=0.297 std_dev=0.297
O2'	A	0, 0.000, 0.325, 0.650, 0.650 max_d=0.650 avg_d=0.325 std_dev=0.325
O2'	B	0, 0.000, 0.367, 0.735, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.367 std_dev=0.367
O3'	A	0, 0.000, 0.449, 0.899, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.449 std_dev=0.449
O5'	A	0, 0.000, 0.572, 1.144, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.572 std_dev=0.572
P	A	0, 0.000, 0.576, 1.152, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.576 std_dev=0.576
C2'	B	0, 0.000, 0.795, 1.590, 1.590 max_d=1.590 avg_d=0.795 std_dev=0.795
C1'	B	0, 0.000, 0.812, 1.625, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.812 std_dev=0.812
O4'	B	0, 0.000, 0.834, 1.668, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.834 std_dev=0.834
OP2	A	0, 0.000, 1.137, 2.275, 2.275 max_d=2.275 avg_d=1.137 std_dev=1.137
C4'	B	0, 0.000, 1.147, 2.293, 2.293 max_d=2.293 avg_d=1.147 std_dev=1.147
C3'	B	0, 0.000, 1.171, 2.341, 2.341 max_d=2.341 avg_d=1.171 std_dev=1.171
OP1	A	0, 0.000, 1.256, 2.511, 2.511 max_d=2.511 avg_d=1.256 std_dev=1.256
O3'	B	0, 0.000, 1.256, 2.513, 2.513 max_d=2.513 avg_d=1.256 std_dev=1.256
N1	B	0, 0.000, 1.382, 2.764, 2.764 max_d=2.764 avg_d=1.382 std_dev=1.382
C2	B	0, 0.000, 1.713, 3.426, 3.426 max_d=3.426 avg_d=1.713 std_dev=1.713
O2	B	0, 0.000, 1.766, 3.531, 3.531 max_d=3.531 avg_d=1.766 std_dev=1.766
C5'	B	0, 0.000, 1.901, 3.801, 3.801 max_d=3.801 avg_d=1.901 std_dev=1.901
C6	B	0, 0.000, 1.917, 3.834, 3.834 max_d=3.834 avg_d=1.917 std_dev=1.917
N3	B	0, 0.000, 2.296, 4.593, 4.593 max_d=4.593 avg_d=2.296 std_dev=2.296
O5'	B	0, 0.000, 2.323, 4.647, 4.647 max_d=4.647 avg_d=2.323 std_dev=2.323
C5	B	0, 0.000, 2.419, 4.839, 4.839 max_d=4.839 avg_d=2.419 std_dev=2.419
C4	B	0, 0.000, 2.569, 5.139, 5.139 max_d=5.139 avg_d=2.569 std_dev=2.569
O4	B	0, 0.000, 3.102, 6.204, 6.204 max_d=6.204 avg_d=3.102 std_dev=3.102
P	B	0, 0.000, 3.189, 6.378, 6.378 max_d=6.378 avg_d=3.189 std_dev=3.189
OP2	B	0, 0.000, 3.593, 7.185, 7.185 max_d=7.185 avg_d=3.593 std_dev=3.593
OP1	B	0, 0.000, 4.098, 8.195, 8.195 max_d=8.195 avg_d=4.098 std_dev=4.098

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.55	0.09	0.17
C2	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.10	0.01	0.04	0.01	0.73	0.37	0.20
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.01	0.04	0.03	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.29	0.07	0.13
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.06	0.12	0.02	0.02	0.08	0.12	0.05	0.02	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.06
C4	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.02	0.03	0.74	0.34	0.20
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.07	0.03	0.01	0.06	0.07	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.11	0.05
C5	0.00	0.02	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.08	0.80	0.47	0.19
C5'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.05	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.24	0.00
C6	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.03	0.08	0.80	0.52	0.18
C8	0.00	0.01	0.06	0.12	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.02	0.13	0.79	0.40	0.16
N1	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.02	0.03	0.04	0.78	0.46	0.20
N3	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.02	0.03	0.00	0.69	0.29	0.20
N6	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.11	0.04	0.11	0.81	0.61	0.16
N7	0.00	0.02	0.06	0.12	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.15	0.02	0.13	0.84	0.53	0.16
N9	0.00	0.02	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.04	0.70	0.26	0.19
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.06	0.02	0.03	0.03	0.05	0.01	0.08	0.10	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.21	0.02	0.09
O3'	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.09	0.03	0.08	0.14	0.02	0.02	0.11	0.15	0.07	0.03	0.00	0.00	0.04	0.25	0.06	0.02
O4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.51	0.00	0.12
O5'	0.01	0.01	0.05	0.05	0.03	0.01	0.08	0.00	0.08	0.13	0.04	0.00	0.11	0.13	0.04	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.55	0.73	0.29	0.04	0.74	0.14	0.80	0.01	0.80	0.79	0.78	0.69	0.81	0.84	0.70	0.21	0.25	0.51	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.37	0.07	0.00	0.34	0.11	0.47	0.24	0.52	0.40	0.46	0.29	0.61	0.53	0.26	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.20	0.13	0.06	0.20	0.05	0.19	0.00	0.18	0.16	0.20	0.20	0.16	0.16	0.19	0.09	0.02	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.61	0.07	0.35	0.46	0.53	0.15	0.80	0.03	0.24	0.67	0.87	0.10	0.57	0.54	0.16	0.68	1.11	0.09	0.61
C2	0.01	0.50	0.10	0.17	0.36	0.25	0.13	0.29	0.02	0.18	0.52	0.70	0.20	0.29	0.40	0.05	0.23	0.22	0.51	0.06
C2'	0.11	0.43	0.26	0.56	0.22	0.73	0.12	1.06	0.24	0.03	0.47	0.73	0.23	0.76	0.30	0.36	0.99	1.48	0.45	0.96
C3'	0.06	0.55	0.20	0.53	0.34	0.71	0.04	1.08	0.17	0.11	0.61	0.86	0.18	0.75	0.44	0.33	1.00	1.56	0.47	1.00
C4	0.12	0.71	0.02	0.19	0.59	0.35	0.30	0.49	0.15	0.33	0.79	0.97	0.13	0.38	0.67	0.06	0.37	0.53	0.38	0.15
C4'	0.07	0.66	0.07	0.41	0.50	0.60	0.15	0.95	0.01	0.25	0.74	0.94	0.07	0.64	0.60	0.21	0.84	1.42	0.29	0.84
C5	0.19	0.88	0.06	0.07	0.82	0.22	0.50	0.31	0.32	0.46	1.01	1.11	0.11	0.27	0.93	0.04	0.16	0.21	0.70	0.13
C5'	0.13	0.78	0.01	0.33	0.66	0.55	0.28	0.89	0.12	0.34	0.89	1.05	0.02	0.57	0.78	0.16	0.77	1.32	0.17	0.75
C6	0.19	0.89	0.06	0.01	0.86	0.11	0.55	0.12	0.37	0.48	1.03	1.08	0.13	0.17	0.96	0.10	0.02	0.12	0.95	0.39
C8	0.19	0.88	0.05	0.16	0.82	0.35	0.47	0.52	0.29	0.45	1.01	1.12	0.08	0.38	0.94	0.02	0.36	0.58	0.43	0.16
N1	0.11	0.70	0.00	0.02	0.63	0.09	0.38	0.07	0.24	0.36	0.78	0.88	0.17	0.16	0.69	0.09	0.03	0.16	0.90	0.40
N3	0.02	0.51	0.11	0.27	0.35	0.40	0.10	0.53	0.01	0.17	0.54	0.75	0.17	0.42	0.40	0.13	0.45	0.60	0.23	0.24
N6	0.23	0.98	0.12	0.10	1.06	0.01	0.73	0.03	0.51	0.57	1.20	1.10	0.12	0.08	1.20	0.17	0.20	0.40	1.22	0.62
N7	0.23	0.96	0.09	0.07	0.94	0.24	0.59	0.36	0.39	0.52	1.12	1.18	0.09	0.29	1.08	0.05	0.19	0.28	0.69	0.09
N9	0.13	0.74	0.01	0.24	0.62	0.41	0.31	0.62	0.16	0.34	0.83	1.00	0.10	0.45	0.72	0.08	0.48	0.76	0.23	0.32
O2'	0.27	0.19	0.42	0.75	0.05	0.88	0.36	1.25	0.44	0.17	0.20	0.48	0.34	0.95	0.01	0.50	1.20	1.80	0.78	1.23
O3'	0.16	0.43	0.31	0.67	0.18	0.83	0.22	1.25	0.33	0.02	0.48	0.76	0.24	0.89	0.27	0.44	1.22	1.88	0.77	1.29
O4'	0.16	0.73	0.02	0.28	0.61	0.48	0.29	0.77	0.15	0.35	0.81	0.98	0.01	0.52	0.70	0.10	0.64	1.13	0.05	0.59
O5'	0.17	0.89	0.05	0.28	0.77	0.52	0.36	0.85	0.17	0.41	1.02	1.17	0.00	0.51	0.92	0.14	0.71	1.19	0.04	0.66
OP1	0.58	0.09	0.69	0.93	0.07	1.12	0.30	1.34	0.49	0.33	0.26	0.30	0.79	1.15	0.23	0.79	1.20	1.53	0.45	1.05
OP2	0.55	1.41	0.39	0.07	1.41	0.17	0.94	0.46	0.69	0.89	1.63	1.66	0.25	0.22	1.62	0.24	0.27	0.67	0.54	0.14
P	0.02	0.77	0.08	0.38	0.71	0.63	0.29	0.91	0.08	0.29	0.94	1.02	0.16	0.61	0.88	0.27	0.76	1.16	0.02	0.66

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.07	0.49	0.24
C2	0.00	0.00	0.16	0.13	0.01	0.00	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.20	0.01	0.08	0.13	0.39	0.81	0.49
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.06	0.04	0.04	0.01	0.09	0.02	0.14	0.24	0.01	0.05	0.08	0.01	0.04	0.06	0.32	0.14
C3'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.08	0.00	0.02	0.00	0.07	0.02	0.13	0.19	0.01	0.02	0.09	0.02	0.04	0.15	0.11	0.03
C4	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.00	0.00	0.13	0.00	0.02	0.00	0.00	0.06	0.10	0.01	0.01	0.16	0.62	0.84	0.56
C4'	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.05	0.00	0.00	0.02	0.18	0.18	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.08	0.14	0.58	0.70	0.47
C5'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.13	0.00	0.11	0.00	0.08	0.09	0.13	0.10	0.08	0.05	0.13	0.00	0.01	0.22	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.07	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.11	0.11	0.41	0.61	0.39
N1	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.00	0.11	0.31	0.68	0.40
N3	0.00	0.00	0.14	0.13	0.00	0.00	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.19	0.01	0.06	0.16	0.53	0.89	0.56
O2	0.01	0.00	0.24	0.19	0.00	0.01	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.29	0.01	0.14	0.12	0.32	0.82	0.48
O2'	0.00	0.14	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03	0.08	0.06	0.02	0.12	0.23	0.00	0.06	0.07	0.01	0.02	0.22	0.26	0.05
O3'	0.04	0.20	0.05	0.02	0.10	0.05	0.03	0.05	0.07	0.06	0.19	0.29	0.06	0.00	0.12	0.05	0.02	0.33	0.06	0.09
O4	0.03	0.01	0.08	0.09	0.01	0.00	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.02	0.16	0.70	0.83	0.58
O4'	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.06	0.14	0.01	0.05	0.02	0.00	0.07	0.03	0.37	0.15
O5'	0.02	0.13	0.04	0.04	0.16	0.02	0.14	0.01	0.11	0.11	0.16	0.12	0.02	0.02	0.16	0.07	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.07	0.39	0.06	0.15	0.62	0.18	0.58	0.22	0.41	0.31	0.53	0.32	0.22	0.33	0.70	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.49	0.81	0.32	0.11	0.84	0.18	0.70	0.06	0.61	0.68	0.89	0.82	0.26	0.06	0.83	0.37	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.49	0.14	0.03	0.56	0.05	0.47	0.01	0.39	0.40	0.56	0.48	0.05	0.09	0.58	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00