Doublet Group distance statistics: 53713

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C6	A	0, 0.000, 0.024, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.024 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C5	A	0, 0.000, 0.031, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N1	A	0, 0.000, 0.034, 0.067, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.034
C4	A	0, 0.000, 0.044, 0.087, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.044 std_dev=0.044
N9	A	0, 0.000, 0.050, 0.100, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.050 std_dev=0.050
N7	A	0, 0.000, 0.066, 0.132, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.066 std_dev=0.066
N6	A	0, 0.000, 0.069, 0.138, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.069 std_dev=0.069
C8	A	0, 0.000, 0.086, 0.172, 0.172 max_d=0.172 avg_d=0.086 std_dev=0.086
O4'	A	0, 0.000, 0.218, 0.436, 0.436 max_d=0.436 avg_d=0.218 std_dev=0.218
C2'	A	0, 0.000, 0.321, 0.641, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.321 std_dev=0.321
O2'	B	0, 0.000, 0.332, 0.665, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.332 std_dev=0.332
C2'	B	0, 0.000, 0.358, 0.715, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.358 std_dev=0.358
C1'	B	0, 0.000, 0.514, 1.028, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.514 std_dev=0.514
O3'	B	0, 0.000, 0.575, 1.151, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.575 std_dev=0.575
O2	B	0, 0.000, 0.683, 1.365, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.683 std_dev=0.683
C4'	A	0, 0.000, 0.776, 1.553, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.776 std_dev=0.776
C3'	B	0, 0.000, 0.784, 1.568, 1.568 max_d=1.568 avg_d=0.784 std_dev=0.784
C2	B	0, 0.000, 0.826, 1.652, 1.652 max_d=1.652 avg_d=0.826 std_dev=0.826
N1	B	0, 0.000, 0.908, 1.815, 1.815 max_d=1.815 avg_d=0.908 std_dev=0.908
O4'	B	0, 0.000, 1.090, 2.179, 2.179 max_d=2.179 avg_d=1.090 std_dev=1.090
O2'	A	0, 0.000, 1.092, 2.183, 2.183 max_d=2.183 avg_d=1.092 std_dev=1.092
C3'	A	0, 0.000, 1.220, 2.440, 2.440 max_d=2.440 avg_d=1.220 std_dev=1.220
C5'	A	0, 0.000, 1.276, 2.551, 2.551 max_d=2.551 avg_d=1.276 std_dev=1.276
C4'	B	0, 0.000, 1.582, 3.164, 3.164 max_d=3.164 avg_d=1.582 std_dev=1.582
N3	B	0, 0.000, 1.643, 3.287, 3.287 max_d=3.287 avg_d=1.643 std_dev=1.643
C6	B	0, 0.000, 1.844, 3.689, 3.689 max_d=3.689 avg_d=1.844 std_dev=1.844
O5'	A	0, 0.000, 2.005, 4.009, 4.009 max_d=4.009 avg_d=2.005 std_dev=2.005
O3'	A	0, 0.000, 2.196, 4.392, 4.392 max_d=4.392 avg_d=2.196 std_dev=2.196
C5'	B	0, 0.000, 2.513, 5.026, 5.026 max_d=5.026 avg_d=2.513 std_dev=2.513
O5'	B	0, 0.000, 2.608, 5.216, 5.216 max_d=5.216 avg_d=2.608 std_dev=2.608
C4	B	0, 0.000, 2.646, 5.291, 5.291 max_d=5.291 avg_d=2.646 std_dev=2.646
C5	B	0, 0.000, 2.721, 5.442, 5.442 max_d=5.442 avg_d=2.721 std_dev=2.721
P	A	0, 0.000, 2.850, 5.700, 5.700 max_d=5.700 avg_d=2.850 std_dev=2.850
OP2	A	0, 0.000, 2.891, 5.781, 5.781 max_d=5.781 avg_d=2.891 std_dev=2.891
OP2	B	0, 0.000, 3.264, 6.528, 6.528 max_d=6.528 avg_d=3.264 std_dev=3.264
O4	B	0, 0.000, 3.399, 6.798, 6.798 max_d=6.798 avg_d=3.399 std_dev=3.399
OP1	A	0, 0.000, 3.503, 7.005, 7.005 max_d=7.005 avg_d=3.503 std_dev=3.503
P	B	0, 0.000, 3.759, 7.517, 7.517 max_d=7.517 avg_d=3.759 std_dev=3.759
OP1	B	0, 0.000, 4.944, 9.887, 9.887 max_d=9.887 avg_d=4.944 std_dev=4.944

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.21	0.00	0.22	0.12	0.33	0.24
C2	0.01	0.00	0.03	0.18	0.01	0.19	0.01	0.47	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.33	0.23	0.13	0.51	0.67	0.19	0.52
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.15	0.03	0.08	0.00	0.03	0.05	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.56	0.55	0.58	0.58
C3'	0.03	0.18	0.01	0.00	0.28	0.00	0.44	0.00	0.44	0.54	0.31	0.12	0.53	0.57	0.32	0.00	0.01	0.02	0.31	0.44	0.04	0.28
C4	0.00	0.01	0.00	0.28	0.00	0.20	0.00	0.36	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.27	0.01	0.08	0.17	0.21	0.16	0.09
C4'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.20	0.00	0.30	0.00	0.33	0.26	0.28	0.13	0.39	0.32	0.17	0.23	0.03	0.00	0.01	0.02	0.25	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.44	0.00	0.30	0.00	0.47	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.30	0.28	0.07	0.15	0.11	0.25	0.03
C5'	0.02	0.47	0.15	0.00	0.36	0.00	0.47	0.00	0.58	0.24	0.56	0.35	0.65	0.40	0.20	0.06	0.15	0.01	0.00	0.16	0.35	0.01
C6	0.02	0.00	0.03	0.44	0.01	0.33	0.02	0.58	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.34	0.23	0.12	0.36	0.36	0.04	0.28
C8	0.00	0.01	0.08	0.54	0.00	0.26	0.01	0.24	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.17	0.55	0.02	0.35	0.43	0.71	0.52
N1	0.02	0.00	0.00	0.31	0.01	0.28	0.01	0.56	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.35	0.01	0.13	0.51	0.61	0.15	0.49
N3	0.00	0.01	0.03	0.12	0.00	0.13	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.28	0.29	0.11	0.36	0.50	0.07	0.35
N6	0.03	0.00	0.05	0.53	0.02	0.39	0.02	0.65	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.34	0.40	0.12	0.36	0.33	0.06	0.27
N7	0.00	0.01	0.06	0.57	0.00	0.32	0.00	0.40	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.25	0.57	0.02	0.14	0.26	0.58	0.32
N9	0.00	0.01	0.03	0.32	0.00	0.17	0.00	0.20	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.18	0.13	0.02	0.14	0.12	0.41	0.23
O2'	0.01	0.33	0.00	0.00	0.27	0.23	0.30	0.06	0.34	0.17	0.35	0.28	0.34	0.25	0.18	0.00	0.09	0.20	0.31	0.24	0.40	0.33
O3'	0.21	0.23	0.01	0.01	0.01	0.03	0.28	0.15	0.23	0.55	0.01	0.29	0.40	0.57	0.13	0.09	0.00	0.16	0.11	0.18	0.37	0.00
O4'	0.00	0.13	0.01	0.02	0.08	0.00	0.07	0.01	0.12	0.02	0.13	0.11	0.12	0.02	0.02	0.20	0.16	0.00	0.04	0.18	0.01	0.04
O5'	0.22	0.51	0.56	0.31	0.17	0.01	0.15	0.00	0.36	0.35	0.51	0.36	0.36	0.14	0.14	0.31	0.11	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.12	0.67	0.55	0.44	0.21	0.02	0.11	0.16	0.36	0.43	0.61	0.50	0.33	0.26	0.12	0.24	0.18	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.33	0.19	0.58	0.04	0.16	0.25	0.25	0.35	0.04	0.71	0.15	0.07	0.06	0.58	0.41	0.40	0.37	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.24	0.52	0.58	0.28	0.09	0.04	0.03	0.01	0.28	0.52	0.49	0.35	0.27	0.32	0.23	0.33	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.26	0.19	0.05	0.12	0.16	0.11	0.05	0.16	0.23	0.20	0.34	0.23	0.10	0.00	0.25	0.38	1.01	0.49	0.78
C2	0.31	0.26	0.11	0.15	0.16	0.05	0.17	0.21	0.21	0.26	0.20	0.32	0.15	0.06	0.05	0.20	0.55	1.18	0.46	0.82
C2'	0.24	0.21	0.16	0.06	0.03	0.16	0.01	0.05	0.08	0.17	0.13	0.33	0.18	0.11	0.12	0.23	0.40	1.07	0.51	0.82
C3'	0.34	0.46	0.30	0.04	0.35	0.20	0.28	0.02	0.29	0.36	0.44	0.55	0.24	0.14	0.24	0.29	0.22	0.82	0.29	0.62
C4	0.30	0.32	0.13	0.18	0.25	0.00	0.24	0.31	0.26	0.30	0.29	0.37	0.19	0.03	0.14	0.17	0.66	1.44	0.69	1.07
C4'	0.39	0.50	0.38	0.11	0.51	0.23	0.48	0.06	0.45	0.46	0.53	0.52	0.33	0.24	0.43	0.32	0.14	0.69	0.25	0.56
C5	0.31	0.39	0.08	0.27	0.41	0.15	0.41	0.55	0.38	0.37	0.42	0.38	0.15	0.10	0.33	0.08	0.93	1.90	0.96	1.40
C5'	0.75	0.93	0.74	0.43	1.08	0.48	1.07	0.27	0.98	0.90	1.02	0.86	0.65	0.56	1.03	0.62	0.12	0.51	0.00	0.35
C6	0.31	0.41	0.02	0.32	0.48	0.24	0.47	0.66	0.43	0.40	0.46	0.37	0.09	0.15	0.41	0.02	1.06	2.06	1.01	1.49
C8	0.30	0.38	0.12	0.23	0.37	0.09	0.36	0.46	0.34	0.35	0.39	0.39	0.19	0.04	0.28	0.12	0.84	1.79	0.96	1.35
N1	0.32	0.37	0.03	0.27	0.36	0.15	0.37	0.50	0.37	0.36	0.36	0.35	0.07	0.14	0.27	0.08	0.87	1.69	0.75	1.19
N3	0.30	0.25	0.15	0.10	0.11	0.13	0.11	0.11	0.16	0.23	0.18	0.33	0.20	0.01	0.01	0.24	0.44	1.05	0.43	0.76
N6	0.28	0.45	0.03	0.38	0.64	0.38	0.62	0.87	0.53	0.43	0.57	0.34	0.04	0.20	0.61	0.07	1.29	2.49	1.26	1.78
N7	0.31	0.42	0.08	0.29	0.47	0.19	0.46	0.62	0.42	0.39	0.46	0.40	0.15	0.10	0.41	0.06	1.01	2.07	1.10	1.55
N9	0.30	0.32	0.15	0.15	0.24	0.03	0.23	0.27	0.25	0.29	0.29	0.37	0.21	0.01	0.13	0.18	0.62	1.40	0.71	1.06
O2'	0.01	0.19	0.06	0.15	0.48	0.10	0.45	0.05	0.32	0.18	0.34	0.04	0.05	0.08	0.68	0.06	0.44	1.03	0.54	0.81
O3'	0.20	0.03	0.20	0.42	0.19	0.27	0.30	0.38	0.30	0.18	0.05	0.11	0.31	0.36	0.29	0.22	0.58	1.08	0.59	0.92
O4'	0.38	0.42	0.35	0.08	0.40	0.23	0.41	0.03	0.41	0.41	0.42	0.42	0.36	0.24	0.31	0.32	0.22	0.79	0.36	0.64
O5'	1.08	1.11	1.07	0.87	1.31	0.90	1.40	0.70	1.35	1.20	1.18	0.96	0.95	1.10	1.23	0.98	0.51	0.18	0.38	0.02
OP1	1.47	1.41	1.48	1.42	1.68	1.45	1.86	1.33	1.81	1.58	1.49	1.19	1.31	1.71	1.59	1.45	1.17	0.59	1.03	0.70
OP2	0.88	0.90	0.85	0.69	1.25	0.66	1.40	0.42	1.30	1.04	1.02	0.65	0.72	0.99	1.19	0.75	0.24	0.58	0.11	0.31
P	1.24	1.26	1.23	1.08	1.58	1.07	1.72	0.88	1.64	1.40	1.37	1.03	1.07	1.35	1.52	1.15	0.73	0.03	0.60	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.23	0.00	0.00	0.00	0.09	0.22	0.08
C2	0.01	0.00	0.13	0.07	0.01	0.18	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.18	0.01	0.17	0.39	0.71	0.03	0.28
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.02	0.11	0.07	0.15	0.01	0.08	0.24	0.00	0.02	0.03	0.01	0.17	0.36	0.00	0.21
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.27	0.01	0.46	0.04	0.47	0.17	0.05	0.33	0.02	0.00	0.26	0.02	0.07	0.01	0.10	0.02
C4	0.00	0.01	0.01	0.27	0.00	0.12	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.30	0.05	0.00	0.02	0.35	0.13	1.07	0.61
C4'	0.01	0.18	0.02	0.01	0.12	0.00	0.32	0.01	0.35	0.06	0.09	0.42	0.25	0.00	0.13	0.00	0.02	0.13	0.10	0.01
C5	0.01	0.01	0.11	0.46	0.00	0.32	0.00	0.54	0.00	0.00	0.00	0.01	0.29	0.15	0.00	0.14	0.84	0.77	1.61	1.16
C5'	0.01	0.32	0.07	0.04	0.19	0.01	0.54	0.00	0.56	0.09	0.17	0.73	0.18	0.18	0.22	0.01	0.00	0.27	0.28	0.00
C6	0.01	0.01	0.15	0.47	0.00	0.35	0.00	0.56	0.00	0.00	0.00	0.02	0.23	0.12	0.00	0.18	0.84	0.75	1.40	1.07
N1	0.00	0.01	0.01	0.17	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.02	0.16	0.08	0.00	0.00	0.16	0.01	0.57	0.31
N3	0.01	0.00	0.08	0.05	0.01	0.09	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.09	0.01	0.11	0.18	0.53	0.37	0.02
O2	0.03	0.01	0.24	0.33	0.01	0.42	0.01	0.73	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.31	0.01	0.30	0.99	1.42	0.67	0.96
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.30	0.25	0.29	0.18	0.23	0.16	0.24	0.05	0.00	0.03	0.38	0.17	0.04	0.26	0.05	0.12
O3'	0.23	0.18	0.02	0.00	0.05	0.00	0.15	0.18	0.12	0.08	0.09	0.31	0.03	0.00	0.04	0.14	0.25	0.35	0.19	0.15
O4	0.00	0.01	0.03	0.26	0.00	0.13	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.38	0.04	0.00	0.04	0.37	0.14	1.19	0.67
O4'	0.00	0.17	0.01	0.02	0.02	0.00	0.14	0.01	0.18	0.00	0.11	0.30	0.17	0.14	0.04	0.00	0.03	0.08	0.11	0.15
O5'	0.00	0.39	0.17	0.07	0.35	0.02	0.84	0.00	0.84	0.16	0.18	0.99	0.04	0.25	0.37	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.09	0.71	0.36	0.01	0.13	0.13	0.77	0.27	0.75	0.01	0.53	1.42	0.26	0.35	0.14	0.08	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.22	0.03	0.00	0.10	1.07	0.10	1.61	0.28	1.40	0.57	0.37	0.67	0.05	0.19	1.19	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.28	0.21	0.02	0.61	0.01	1.16	0.00	1.07	0.31	0.02	0.96	0.12	0.15	0.67	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00