Doublet Group distance statistics: 53714

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.000, 0.020, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.000, 0.027, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.000, 0.028, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C2'	A	0, 0.000, 0.332, 0.664, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.332 std_dev=0.332
O4'	A	0, 0.000, 0.334, 0.668, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.334 std_dev=0.334
OP1	A	0, 0.000, 0.435, 0.870, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.435 std_dev=0.435
O2'	B	0, 0.000, 0.450, 0.899, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.450 std_dev=0.450
C2'	B	0, 0.000, 0.477, 0.955, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.477 std_dev=0.477
C5'	A	0, 0.000, 0.566, 1.133, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.566 std_dev=0.566
C4'	A	0, 0.000, 0.614, 1.227, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.614 std_dev=0.614
P	A	0, 0.000, 0.641, 1.281, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.641 std_dev=0.641
N1	B	0, 0.000, 0.692, 1.383, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.692 std_dev=0.692
C1'	B	0, 0.000, 0.700, 1.399, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.700 std_dev=0.700
O2'	A	0, 0.000, 0.766, 1.532, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.766 std_dev=0.766
C2	B	0, 0.000, 0.813, 1.626, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.813 std_dev=0.813
C3'	A	0, 0.000, 0.817, 1.633, 1.633 max_d=1.633 avg_d=0.817 std_dev=0.817
O3'	B	0, 0.000, 0.936, 1.872, 1.872 max_d=1.872 avg_d=0.936 std_dev=0.936
O5'	A	0, 0.000, 0.992, 1.983, 1.983 max_d=1.983 avg_d=0.992 std_dev=0.992
OP2	A	0, 0.000, 1.087, 2.174, 2.174 max_d=2.174 avg_d=1.087 std_dev=1.087
C3'	B	0, 0.000, 1.166, 2.333, 2.333 max_d=2.333 avg_d=1.166 std_dev=1.166
O3'	A	0, 0.000, 1.403, 2.805, 2.805 max_d=2.805 avg_d=1.403 std_dev=1.403
N3	B	0, 0.000, 1.423, 2.846, 2.846 max_d=2.846 avg_d=1.423 std_dev=1.423
O2	B	0, 0.000, 1.595, 3.190, 3.190 max_d=3.190 avg_d=1.595 std_dev=1.595
C6	B	0, 0.000, 1.940, 3.879, 3.879 max_d=3.879 avg_d=1.940 std_dev=1.940
O4'	B	0, 0.000, 1.956, 3.912, 3.912 max_d=3.912 avg_d=1.956 std_dev=1.956
C4'	B	0, 0.000, 2.287, 4.574, 4.574 max_d=4.574 avg_d=2.287 std_dev=2.287
C4	B	0, 0.000, 2.378, 4.756, 4.756 max_d=4.756 avg_d=2.378 std_dev=2.378
C5	B	0, 0.000, 2.739, 5.477, 5.477 max_d=5.477 avg_d=2.739 std_dev=2.739
O4	B	0, 0.000, 3.092, 6.185, 6.185 max_d=6.185 avg_d=3.092 std_dev=3.092
C5'	B	0, 0.000, 3.463, 6.926, 6.926 max_d=6.926 avg_d=3.463 std_dev=3.463
O5'	B	0, 0.000, 3.703, 7.407, 7.407 max_d=7.407 avg_d=3.703 std_dev=3.703
OP2	B	0, 0.000, 4.888, 9.775, 9.775 max_d=9.775 avg_d=4.888 std_dev=4.888
P	B	0, 0.000, 4.998, 9.996, 9.996 max_d=9.996 avg_d=4.998 std_dev=4.998
OP1	B	0, 0.000, 5.762, 11.523, 11.523 max_d=11.523 avg_d=5.762 std_dev=5.762

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.06	0.15	0.72	0.28
C2	0.02	0.00	0.09	0.02	0.02	0.08	0.02	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.37	0.12	0.30	0.07	0.53	0.10
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.19	0.04	0.04	0.07	0.08	0.03	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.27	0.42	0.88	0.55
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.11	0.01	0.22	0.02	0.20	0.35	0.10	0.01	0.26	0.34	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.27	0.04
C4	0.00	0.02	0.04	0.11	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.19	0.06	0.32	0.11	0.57	0.13
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.20	0.03	0.10	0.09	0.18	0.08	0.20	0.03	0.01	0.03	0.28	0.39	0.02
C5	0.00	0.02	0.02	0.22	0.00	0.08	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.03	0.01	0.45	0.08	0.43	0.03
C5'	0.06	0.08	0.19	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.04	0.13	0.03	0.10	0.09	0.13	0.01	0.00	0.21	0.01	0.01	0.35	0.31	0.03
C6	0.01	0.00	0.04	0.20	0.00	0.05	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.19	0.09	0.03	0.48	0.05	0.36	0.01
C8	0.00	0.02	0.04	0.35	0.00	0.20	0.00	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.31	0.20	0.10	0.46	0.11	0.51	0.08
N1	0.01	0.00	0.07	0.10	0.01	0.03	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.10	0.25	0.08	0.40	0.06	0.43	0.03
N3	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01	0.10	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.39	0.13	0.23	0.10	0.61	0.16
N6	0.01	0.00	0.03	0.26	0.00	0.09	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.24	0.00	0.00	0.56	0.03	0.22	0.09
N7	0.00	0.02	0.02	0.34	0.00	0.18	0.00	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.32	0.17	0.07	0.53	0.08	0.35	0.01
N9	0.00	0.02	0.00	0.17	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.06	0.02	0.28	0.13	0.64	0.17
O2'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.20	0.22	0.00	0.19	0.31	0.10	0.02	0.24	0.32	0.17	0.00	0.06	0.15	0.25	0.50	0.97	0.58
O3'	0.23	0.37	0.02	0.01	0.19	0.03	0.03	0.21	0.09	0.20	0.25	0.39	0.00	0.17	0.06	0.06	0.00	0.17	0.14	0.60	0.03	0.26
O4'	0.00	0.12	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.08	0.13	0.00	0.07	0.02	0.15	0.17	0.00	0.18	0.14	0.54	0.07
O5'	0.06	0.30	0.27	0.02	0.32	0.03	0.45	0.01	0.48	0.46	0.40	0.23	0.56	0.53	0.28	0.25	0.14	0.18	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.15	0.07	0.42	0.17	0.11	0.28	0.08	0.35	0.05	0.11	0.06	0.10	0.03	0.08	0.13	0.50	0.60	0.14	0.03	0.00	0.00	0.00
OP2	0.72	0.53	0.88	0.27	0.57	0.39	0.43	0.31	0.36	0.51	0.43	0.61	0.22	0.35	0.64	0.97	0.03	0.54	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.28	0.10	0.55	0.04	0.13	0.02	0.03	0.03	0.01	0.08	0.03	0.16	0.09	0.01	0.17	0.58	0.26	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.40	0.28	0.63	0.30	0.85	0.89	1.51	0.88	0.26	0.31	1.04	0.13	0.28	0.28	0.80	1.75	2.94	3.19	2.73
C2	0.02	0.46	0.12	0.39	0.23	0.30	0.72	0.76	0.71	0.08	0.28	1.04	0.25	0.04	0.26	0.25	0.76	1.55	1.93	1.41
C2'	0.17	0.47	0.19	0.56	0.14	0.88	0.72	1.60	0.72	0.17	0.42	1.03	0.20	0.20	0.10	0.83	1.86	3.17	3.23	2.90
C3'	0.58	0.09	0.54	0.87	0.76	1.22	1.28	1.91	1.22	0.66	0.18	0.50	0.09	0.51	0.75	1.23	2.27	3.46	3.65	3.29
C4	0.07	0.46	0.19	0.51	0.34	0.55	0.91	1.15	0.87	0.18	0.28	1.12	0.22	0.12	0.36	0.50	1.27	2.34	2.64	2.12
C4'	0.54	0.12	0.57	0.83	0.96	1.06	1.50	1.64	1.36	0.71	0.29	0.55	0.16	0.52	0.99	1.08	1.97	3.04	3.39	2.92
C5	0.01	0.45	0.14	0.43	0.40	0.40	0.97	1.00	0.88	0.16	0.24	1.12	0.27	0.03	0.45	0.37	1.11	2.20	2.49	1.96
C5'	0.44	0.11	0.51	0.73	1.13	0.88	1.66	1.44	1.43	0.70	0.37	0.61	0.10	0.42	1.24	0.91	1.78	2.89	3.24	2.74
C6	0.05	0.44	0.08	0.33	0.38	0.21	0.91	0.74	0.81	0.12	0.22	1.08	0.29	0.06	0.44	0.19	0.81	1.76	2.10	1.55
C8	0.10	0.42	0.21	0.54	0.44	0.63	1.04	1.30	0.95	0.23	0.24	1.11	0.22	0.13	0.48	0.58	1.50	2.76	2.95	2.47
N1	0.08	0.45	0.05	0.29	0.30	0.13	0.78	0.59	0.72	0.07	0.24	1.03	0.30	0.08	0.35	0.11	0.60	1.42	1.80	1.26
N3	0.08	0.47	0.20	0.51	0.24	0.54	0.78	1.08	0.79	0.14	0.32	1.10	0.19	0.16	0.24	0.48	1.13	2.04	2.41	1.88
N6	0.09	0.43	0.04	0.27	0.42	0.09	0.93	0.60	0.80	0.10	0.19	1.07	0.31	0.14	0.50	0.10	0.68	1.62	1.97	1.41
N7	0.04	0.43	0.16	0.46	0.45	0.47	1.05	1.12	0.93	0.20	0.22	1.13	0.26	0.05	0.51	0.44	1.28	2.48	2.71	2.20
N9	0.13	0.43	0.23	0.57	0.36	0.69	0.96	1.34	0.91	0.22	0.28	1.11	0.19	0.19	0.38	0.64	1.53	2.73	2.97	2.47
O2'	0.01	0.82	0.07	0.52	0.46	0.89	0.14	1.67	0.28	0.16	0.93	1.28	0.27	0.22	0.59	0.73	1.89	3.35	3.08	2.94
O3'	1.14	0.59	1.06	1.43	1.03	1.87	1.53	2.57	1.57	1.14	0.57	0.09	0.60	1.09	0.93	1.86	2.95	4.08	4.20	3.95
O4'	0.41	0.08	0.50	0.76	0.78	0.92	1.38	1.48	1.27	0.57	0.09	0.79	0.10	0.45	0.80	0.91	1.75	2.80	3.21	2.67
O5'	0.18	0.09	0.20	0.45	0.94	0.63	1.44	1.27	1.18	0.45	0.20	0.81	0.28	0.08	1.09	0.68	1.67	2.87	3.18	2.69
OP1	0.26	0.18	0.37	0.69	0.74	0.84	1.32	1.55	1.15	0.44	0.02	0.87	0.09	0.33	0.82	0.80	1.91	3.30	3.37	2.98
OP2	0.79	0.43	0.88	1.15	1.46	1.22	2.04	1.88	1.83	1.04	0.69	0.32	0.41	0.74	1.56	1.24	2.22	3.49	3.77	3.24
P	0.37	0.03	0.46	0.73	1.07	0.84	1.62	1.50	1.39	0.63	0.30	0.70	0.01	0.35	1.19	0.85	1.87	3.15	3.39	2.90

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.05	0.16	0.02	0.00	0.08	0.12	0.47	0.15
C2	0.03	0.00	0.20	0.17	0.02	0.09	0.03	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00	0.10	0.00	0.01	0.18	0.03	0.21	0.47	0.26
C2'	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.03	0.13	0.06	0.18	0.02	0.13	0.35	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.22	0.65	0.25
C3'	0.00	0.17	0.01	0.00	0.29	0.00	0.31	0.02	0.28	0.19	0.23	0.11	0.03	0.00	0.29	0.03	0.24	0.03	0.28	0.03
C4	0.03	0.02	0.00	0.29	0.00	0.15	0.01	0.29	0.01	0.01	0.01	0.01	0.32	0.12	0.00	0.06	0.47	0.24	0.08	0.23
C4'	0.01	0.09	0.03	0.00	0.15	0.00	0.30	0.01	0.31	0.08	0.01	0.26	0.29	0.00	0.15	0.01	0.02	0.03	0.34	0.06
C5	0.02	0.03	0.13	0.31	0.01	0.30	0.00	0.51	0.01	0.02	0.02	0.03	0.53	0.16	0.00	0.22	0.80	0.52	0.36	0.56
C5'	0.01	0.06	0.06	0.02	0.29	0.01	0.51	0.00	0.50	0.16	0.05	0.31	0.20	0.08	0.31	0.04	0.00	0.02	0.19	0.01
C6	0.01	0.02	0.18	0.28	0.01	0.31	0.01	0.50	0.00	0.02	0.01	0.03	0.52	0.11	0.00	0.26	0.77	0.44	0.19	0.48
N1	0.01	0.01	0.02	0.19	0.01	0.08	0.02	0.16	0.02	0.00	0.01	0.02	0.16	0.01	0.01	0.03	0.28	0.03	0.28	0.01
N3	0.03	0.00	0.13	0.23	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.00	0.10	0.13	0.07	0.28	0.12
O2	0.05	0.00	0.35	0.11	0.01	0.26	0.03	0.31	0.03	0.02	0.00	0.00	0.42	0.06	0.01	0.34	0.38	0.48	0.72	0.56
O2'	0.05	0.10	0.01	0.03	0.32	0.29	0.53	0.20	0.52	0.16	0.06	0.42	0.00	0.01	0.35	0.21	0.24	0.04	0.57	0.08
O3'	0.16	0.00	0.02	0.00	0.12	0.00	0.16	0.08	0.11	0.01	0.06	0.06	0.01	0.00	0.13	0.06	0.31	0.33	0.09	0.23
O4	0.02	0.01	0.00	0.29	0.00	0.15	0.00	0.31	0.00	0.01	0.00	0.01	0.35	0.13	0.00	0.06	0.49	0.28	0.17	0.27
O4'	0.00	0.18	0.01	0.03	0.06	0.01	0.22	0.04	0.26	0.03	0.10	0.34	0.21	0.06	0.06	0.00	0.02	0.14	0.47	0.18
O5'	0.08	0.03	0.07	0.24	0.47	0.02	0.80	0.00	0.77	0.28	0.13	0.38	0.24	0.31	0.49	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.12	0.21	0.22	0.03	0.24	0.03	0.52	0.02	0.44	0.03	0.07	0.48	0.04	0.33	0.28	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.47	0.47	0.65	0.28	0.08	0.34	0.36	0.19	0.19	0.28	0.28	0.72	0.57	0.09	0.17	0.47	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.26	0.25	0.03	0.23	0.06	0.56	0.01	0.48	0.01	0.12	0.56	0.08	0.23	0.27	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00