Doublet Group distance statistics: 53717

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.000, 0.021, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C5	A	0, 0.000, 0.037, 0.074, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.037 std_dev=0.037
N3	A	0, 0.000, 0.037, 0.075, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.037 std_dev=0.037
N1	A	0, 0.000, 0.040, 0.080, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.040 std_dev=0.040
C4	A	0, 0.000, 0.053, 0.106, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.053 std_dev=0.053
N9	A	0, 0.000, 0.060, 0.119, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.060 std_dev=0.060
N6	A	0, 0.000, 0.065, 0.130, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.065 std_dev=0.065
N7	A	0, 0.000, 0.075, 0.150, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.075 std_dev=0.075
C8	A	0, 0.000, 0.098, 0.197, 0.197 max_d=0.197 avg_d=0.098 std_dev=0.098
O4'	A	0, 0.000, 0.289, 0.578, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.289 std_dev=0.289
O4'	B	0, 0.000, 0.292, 0.584, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.292 std_dev=0.292
C2'	A	0, 0.000, 0.320, 0.639, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.320 std_dev=0.320
C4'	B	0, 0.000, 0.320, 0.640, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.320 std_dev=0.320
O2'	B	0, 0.000, 0.333, 0.665, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.333 std_dev=0.333
C1'	B	0, 0.000, 0.337, 0.673, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.337 std_dev=0.337
C3'	B	0, 0.000, 0.370, 0.739, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.370 std_dev=0.370
C2'	B	0, 0.000, 0.377, 0.754, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.377 std_dev=0.377
O3'	B	0, 0.000, 0.380, 0.760, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.380 std_dev=0.380
O2'	A	0, 0.000, 0.421, 0.841, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.421 std_dev=0.421
O5'	A	0, 0.000, 0.429, 0.857, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.429 std_dev=0.429
C3'	A	0, 0.000, 0.484, 0.969, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.484 std_dev=0.484
N1	B	0, 0.000, 0.495, 0.991, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.495 std_dev=0.495
C4'	A	0, 0.000, 0.521, 1.042, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.521 std_dev=0.521
C2	B	0, 0.000, 0.529, 1.059, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.529 std_dev=0.529
P	A	0, 0.000, 0.550, 1.100, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.550 std_dev=0.550
C5'	B	0, 0.000, 0.551, 1.103, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.551 std_dev=0.551
O2	B	0, 0.000, 0.615, 1.230, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.615 std_dev=0.615
N3	B	0, 0.000, 0.746, 1.493, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.746 std_dev=0.746
C5'	A	0, 0.000, 0.819, 1.638, 1.638 max_d=1.638 avg_d=0.819 std_dev=0.819
C6	B	0, 0.000, 0.833, 1.666, 1.666 max_d=1.666 avg_d=0.833 std_dev=0.833
O5'	B	0, 0.000, 0.853, 1.706, 1.706 max_d=1.706 avg_d=0.853 std_dev=0.853
C4	B	0, 0.000, 0.906, 1.812, 1.812 max_d=1.812 avg_d=0.906 std_dev=0.906
O3'	A	0, 0.000, 0.941, 1.882, 1.882 max_d=1.882 avg_d=0.941 std_dev=0.941
C5	B	0, 0.000, 0.997, 1.994, 1.994 max_d=1.994 avg_d=0.997 std_dev=0.997
O4	B	0, 0.000, 1.051, 2.102, 2.102 max_d=2.102 avg_d=1.051 std_dev=1.051
OP1	A	0, 0.000, 1.425, 2.850, 2.850 max_d=2.850 avg_d=1.425 std_dev=1.425
P	B	0, 0.000, 1.467, 2.934, 2.934 max_d=2.934 avg_d=1.467 std_dev=1.467
OP2	B	0, 0.000, 1.604, 3.208, 3.208 max_d=3.208 avg_d=1.604 std_dev=1.604
OP1	B	0, 0.000, 1.720, 3.440, 3.440 max_d=3.440 avg_d=1.720 std_dev=1.720
OP2	A	0, 0.000, 1.826, 3.652, 3.652 max_d=3.652 avg_d=1.826 std_dev=1.826

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.22	0.09	0.17	0.16
C2	0.02	0.00	0.19	0.18	0.00	0.01	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.24	0.05	0.28	0.34	0.57	0.22
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.12	0.02	0.12	0.07	0.16	0.01	0.19	0.16	0.16	0.05	0.04	0.00	0.01	0.01	0.09	0.00	0.13	0.09
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.12	0.00	0.12	0.01	0.17	0.01	0.19	0.15	0.18	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.04	0.04
C4	0.01	0.00	0.12	0.12	0.00	0.05	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.13	0.03	0.27	0.33	0.52	0.21
C4'	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.07	0.15	0.04	0.00	0.08	0.14	0.08	0.06	0.02	0.00	0.00	0.01	0.26	0.04
C5	0.01	0.01	0.12	0.12	0.00	0.09	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.17	0.02	0.27	0.45	0.69	0.22
C5'	0.12	0.27	0.07	0.01	0.30	0.00	0.38	0.00	0.38	0.42	0.33	0.24	0.41	0.44	0.29	0.02	0.09	0.00	0.00	0.02	0.23	0.02
C6	0.01	0.00	0.16	0.17	0.00	0.07	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.24	0.03	0.27	0.48	0.77	0.23
C8	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.24	0.40	0.55	0.20
N1	0.01	0.00	0.19	0.19	0.00	0.04	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.27	0.04	0.28	0.43	0.70	0.23
N3	0.01	0.00	0.16	0.15	0.00	0.00	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.17	0.04	0.27	0.28	0.46	0.21
N6	0.01	0.00	0.16	0.18	0.00	0.08	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.27	0.02	0.27	0.56	0.88	0.23
N7	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.14	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.10	0.01	0.24	0.51	0.74	0.21
N9	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00	0.08	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.25	0.27	0.40	0.19
O2'	0.01	0.21	0.00	0.02	0.12	0.06	0.11	0.02	0.17	0.01	0.21	0.18	0.17	0.05	0.03	0.00	0.08	0.05	0.05	0.07	0.03	0.04
O3'	0.05	0.24	0.01	0.01	0.13	0.02	0.17	0.09	0.24	0.00	0.27	0.17	0.27	0.10	0.03	0.08	0.00	0.09	0.11	0.28	0.15	0.04
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.29	0.02	0.01	0.19
O5'	0.22	0.28	0.09	0.01	0.27	0.00	0.27	0.00	0.27	0.24	0.28	0.27	0.27	0.24	0.25	0.05	0.11	0.29	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.09	0.34	0.00	0.11	0.33	0.01	0.45	0.02	0.48	0.40	0.43	0.28	0.56	0.51	0.27	0.07	0.28	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.57	0.13	0.04	0.52	0.26	0.69	0.23	0.77	0.55	0.70	0.46	0.88	0.74	0.40	0.03	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01
P	0.16	0.22	0.09	0.04	0.21	0.04	0.22	0.02	0.23	0.20	0.23	0.21	0.23	0.21	0.19	0.04	0.04	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.37	0.16	0.16	0.44	0.03	0.32	0.04	0.23	0.23	0.47	0.41	0.10	0.19	0.50	0.01	0.14	0.22	0.09	0.26
C2	0.07	0.33	0.16	0.18	0.34	0.04	0.24	0.07	0.17	0.19	0.38	0.40	0.10	0.22	0.38	0.02	0.15	0.25	0.10	0.27
C2'	0.32	0.54	0.37	0.35	0.61	0.22	0.53	0.22	0.45	0.44	0.62	0.55	0.33	0.38	0.65	0.20	0.34	0.48	0.34	0.50
C3'	0.36	0.56	0.38	0.36	0.67	0.25	0.60	0.25	0.51	0.48	0.65	0.54	0.33	0.37	0.71	0.24	0.39	0.55	0.41	0.57
C4	0.09	0.36	0.17	0.19	0.44	0.05	0.33	0.08	0.24	0.23	0.46	0.39	0.10	0.22	0.49	0.00	0.19	0.28	0.15	0.31
C4'	0.11	0.31	0.15	0.15	0.41	0.05	0.33	0.06	0.24	0.22	0.41	0.31	0.11	0.17	0.46	0.02	0.16	0.28	0.12	0.31
C5	0.12	0.37	0.20	0.22	0.49	0.09	0.41	0.14	0.30	0.27	0.49	0.35	0.11	0.24	0.55	0.04	0.26	0.38	0.24	0.41
C5'	0.18	0.01	0.14	0.12	0.10	0.22	0.04	0.19	0.04	0.08	0.09	0.04	0.16	0.09	0.16	0.25	0.10	0.05	0.14	0.05
C6	0.12	0.37	0.20	0.23	0.48	0.11	0.41	0.16	0.32	0.27	0.48	0.34	0.11	0.24	0.52	0.06	0.29	0.42	0.28	0.44
C8	0.12	0.38	0.19	0.21	0.52	0.07	0.42	0.11	0.31	0.27	0.51	0.35	0.11	0.23	0.59	0.02	0.24	0.35	0.22	0.38
N1	0.11	0.35	0.20	0.21	0.39	0.09	0.32	0.14	0.25	0.24	0.42	0.39	0.11	0.24	0.43	0.04	0.24	0.37	0.21	0.38
N3	0.07	0.34	0.15	0.16	0.36	0.02	0.25	0.04	0.17	0.19	0.41	0.40	0.09	0.21	0.41	0.03	0.12	0.21	0.07	0.24
N6	0.14	0.36	0.20	0.24	0.54	0.14	0.49	0.21	0.39	0.30	0.50	0.23	0.10	0.24	0.58	0.10	0.36	0.52	0.38	0.54
N7	0.12	0.37	0.20	0.22	0.54	0.09	0.45	0.15	0.34	0.28	0.51	0.32	0.11	0.24	0.61	0.05	0.28	0.41	0.28	0.44
N9	0.10	0.37	0.17	0.19	0.46	0.05	0.36	0.08	0.26	0.24	0.48	0.39	0.10	0.22	0.53	0.00	0.18	0.28	0.15	0.31
O2'	0.35	0.56	0.39	0.37	0.60	0.25	0.51	0.23	0.44	0.45	0.62	0.59	0.36	0.40	0.64	0.22	0.33	0.46	0.32	0.48
O3'	0.49	0.67	0.48	0.44	0.78	0.36	0.73	0.35	0.65	0.60	0.75	0.64	0.43	0.42	0.81	0.37	0.49	0.69	0.53	0.70
O4'	0.05	0.32	0.08	0.08	0.40	0.04	0.28	0.01	0.18	0.18	0.43	0.34	0.02	0.08	0.48	0.05	0.07	0.13	0.01	0.19
O5'	0.42	0.64	0.46	0.47	0.80	0.35	0.73	0.37	0.62	0.56	0.77	0.59	0.39	0.47	0.87	0.32	0.51	0.65	0.52	0.69
OP1	0.28	0.19	0.25	0.24	0.03	0.30	0.05	0.27	0.13	0.20	0.10	0.26	0.26	0.21	0.00	0.32	0.17	0.04	0.19	0.03
OP2	0.91	1.21	0.84	0.82	1.47	0.76	1.37	0.82	1.22	1.12	1.39	1.11	0.71	0.72	1.56	0.82	1.00	1.12	1.05	1.20
P	0.38	0.59	0.40	0.41	0.79	0.31	0.72	0.35	0.61	0.53	0.73	0.52	0.33	0.40	0.86	0.30	0.50	0.64	0.51	0.68

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.05	0.00	0.04	0.03	0.00	0.14	0.37	0.14	0.32
C2	0.04	0.00	0.20	0.19	0.00	0.11	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.19	0.23	0.01	0.03	0.21	0.33	0.12	0.31
C2'	0.00	0.20	0.00	0.01	0.07	0.01	0.03	0.03	0.07	0.04	0.16	0.32	0.01	0.03	0.10	0.01	0.02	0.11	0.10	0.09
C3'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.03	0.01	0.12	0.03	0.17	0.02	0.16	0.33	0.01	0.01	0.07	0.01	0.09	0.09	0.24	0.09
C4	0.03	0.00	0.07	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.04	0.00	0.03	0.11	0.20	0.05	0.19
C4'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.09	0.19	0.03	0.03	0.04	0.01	0.03	0.17	0.01	0.11
C5	0.02	0.01	0.03	0.12	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.00	0.03	0.02	0.17	0.03	0.16
C5'	0.03	0.13	0.03	0.03	0.03	0.01	0.08	0.00	0.10	0.03	0.11	0.20	0.02	0.02	0.06	0.03	0.00	0.06	0.03	0.00
C6	0.01	0.01	0.07	0.17	0.01	0.10	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.17	0.01	0.03	0.03	0.24	0.08	0.23
N1	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.02	0.14	0.32	0.12	0.30
N3	0.04	0.00	0.16	0.16	0.00	0.09	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.19	0.00	0.04	0.18	0.27	0.09	0.26
O2	0.05	0.00	0.32	0.33	0.00	0.19	0.01	0.20	0.02	0.02	0.00	0.00	0.31	0.41	0.01	0.04	0.25	0.38	0.15	0.34
O2'	0.00	0.19	0.01	0.01	0.09	0.03	0.00	0.02	0.04	0.05	0.17	0.31	0.00	0.05	0.12	0.05	0.00	0.11	0.08	0.10
O3'	0.04	0.23	0.03	0.01	0.04	0.03	0.14	0.02	0.17	0.03	0.19	0.41	0.05	0.00	0.08	0.03	0.17	0.29	0.40	0.24
O4	0.03	0.01	0.10	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.08	0.00	0.04	0.12	0.17	0.05	0.17
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.03	0.04	0.00	0.22	0.49	0.27	0.42
O5'	0.14	0.21	0.02	0.09	0.11	0.03	0.02	0.00	0.03	0.14	0.18	0.25	0.00	0.17	0.12	0.22	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.37	0.33	0.11	0.09	0.20	0.17	0.17	0.06	0.24	0.32	0.27	0.38	0.11	0.29	0.17	0.49	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.14	0.12	0.10	0.24	0.05	0.01	0.03	0.03	0.08	0.12	0.09	0.15	0.08	0.40	0.05	0.27	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.32	0.31	0.09	0.09	0.19	0.11	0.16	0.00	0.23	0.30	0.26	0.34	0.10	0.24	0.17	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00