Doublet Group distance statistics: 53730

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.001, 0.003, 0.005, 0.005 max_d=0.005 avg_d=0.003 std_dev=0.002
C2	A	0, 0.001, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.002, 0.005, 0.009, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.002, 0.006, 0.009, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.001, 0.005, 0.010, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N4	A	0, 0.007, 0.032, 0.057, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.032 std_dev=0.025
O4'	A	0, 0.041, 0.148, 0.255, 0.249 max_d=0.249 avg_d=0.148 std_dev=0.107
C2'	A	0, 0.040, 0.158, 0.276, 0.283 max_d=0.283 avg_d=0.158 std_dev=0.118
O2'	A	0, 0.036, 0.183, 0.330, 0.360 max_d=0.360 avg_d=0.183 std_dev=0.147
C4'	A	0, 0.068, 0.232, 0.396, 0.361 max_d=0.361 avg_d=0.232 std_dev=0.164
C3'	A	0, 0.070, 0.255, 0.439, 0.430 max_d=0.430 avg_d=0.255 std_dev=0.184
O3'	A	0, 0.106, 0.376, 0.646, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.376 std_dev=0.270
OP1	B	0, 0.107, 0.381, 0.654, 0.632 max_d=0.632 avg_d=0.381 std_dev=0.274
C5'	A	0, 0.120, 0.411, 0.702, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.411 std_dev=0.291
P	B	0, 0.114, 0.433, 0.753, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.433 std_dev=0.320
OP2	B	0, 0.036, 0.434, 0.833, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.434 std_dev=0.399
O5'	B	0, 0.131, 0.557, 0.982, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.557 std_dev=0.425
C5'	B	0, 0.177, 0.705, 1.233, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.705 std_dev=0.528
C4'	B	0, 0.280, 0.970, 1.660, 1.546 max_d=1.546 avg_d=0.970 std_dev=0.690
C3'	B	0, 0.316, 1.089, 1.862, 1.714 max_d=1.714 avg_d=1.089 std_dev=0.773
O3'	B	0, 0.337, 1.152, 1.967, 1.771 max_d=1.771 avg_d=1.152 std_dev=0.815
O5'	A	0, -0.001, 0.846, 1.694, 2.005 max_d=2.005 avg_d=0.846 std_dev=0.848
OP1	A	0, 0.328, 1.189, 2.050, 2.011 max_d=2.011 avg_d=1.189 std_dev=0.861
P	A	0, 0.235, 1.159, 2.083, 2.261 max_d=2.261 avg_d=1.159 std_dev=0.924
C5	B	0, 0.365, 1.316, 2.267, 2.212 max_d=2.212 avg_d=1.316 std_dev=0.951
C6	B	0, 0.398, 1.403, 2.409, 2.301 max_d=2.301 avg_d=1.403 std_dev=1.005
C4	B	0, 0.256, 1.264, 2.272, 2.467 max_d=2.467 avg_d=1.264 std_dev=1.008
O4'	B	0, 0.335, 1.354, 2.372, 2.457 max_d=2.457 avg_d=1.354 std_dev=1.019
O4	B	0, 0.190, 1.213, 2.235, 2.501 max_d=2.501 avg_d=1.213 std_dev=1.022
OP2	A	0, 0.353, 1.436, 2.519, 2.615 max_d=2.615 avg_d=1.436 std_dev=1.083
N1	B	0, 0.357, 1.459, 2.561, 2.662 max_d=2.662 avg_d=1.459 std_dev=1.102
C2'	B	0, 0.435, 1.575, 2.715, 2.661 max_d=2.661 avg_d=1.575 std_dev=1.140
N3	B	0, 0.165, 1.327, 2.488, 2.829 max_d=2.829 avg_d=1.327 std_dev=1.162
C1'	B	0, 0.407, 1.592, 2.778, 2.843 max_d=2.843 avg_d=1.592 std_dev=1.185
C2	B	0, 0.218, 1.432, 2.647, 2.969 max_d=2.969 avg_d=1.432 std_dev=1.214
O2'	B	0, 0.524, 1.864, 3.204, 3.094 max_d=3.094 avg_d=1.864 std_dev=1.340
O2	B	0, 0.115, 1.513, 2.912, 3.373 max_d=3.373 avg_d=1.513 std_dev=1.399

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.11	0.15	0.08
C2	0.00	0.00	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.05	0.28	0.26	0.20	0.27
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.27	0.24	0.11	0.22
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.41	0.35	0.14	0.33
C4	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.50	0.44	0.39	0.49
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.24	0.02
C5	0.00	0.00	0.06	0.04	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.06	0.03	0.56	0.47	0.41	0.52
C5'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.09	0.03	0.01	0.05	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.36	0.01
C6	0.00	0.00	0.08	0.06	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.07	0.05	0.49	0.38	0.25	0.41
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.31	0.25	0.15	0.26
N3	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.04	0.38	0.35	0.29	0.37
N4	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.55	0.51	0.49	0.56
O2	0.01	0.01	0.10	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.06	0.09	0.16	0.18	0.20	0.18
O2'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.04	0.01	0.05	0.09	0.11	0.05
O3'	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.07	0.01	0.03	0.03	0.06	0.04	0.00	0.03	0.37	0.37	0.16	0.32
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.09	0.01	0.03	0.00	0.09	0.01	0.33	0.08
O5'	0.12	0.28	0.27	0.41	0.50	0.01	0.56	0.01	0.49	0.31	0.38	0.55	0.16	0.05	0.37	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.11	0.26	0.24	0.35	0.44	0.07	0.47	0.12	0.38	0.25	0.35	0.51	0.18	0.09	0.37	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.20	0.11	0.14	0.39	0.24	0.41	0.36	0.25	0.15	0.29	0.49	0.20	0.11	0.16	0.33	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.27	0.22	0.33	0.49	0.02	0.52	0.01	0.41	0.26	0.37	0.56	0.18	0.05	0.32	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.25	0.23	0.09	0.29	0.07	0.27	0.26	0.25	0.25	0.27	0.24	0.26	0.08	0.29	0.19	0.24	0.17	0.13	0.06
C2	0.25	0.24	0.23	0.11	0.35	0.08	0.41	0.20	0.35	0.28	0.26	0.19	0.23	0.09	0.31	0.23	0.23	0.17	0.12	0.05
C2'	0.37	0.45	0.40	0.20	0.39	0.12	0.27	0.22	0.29	0.38	0.47	0.49	0.45	0.22	0.41	0.29	0.33	0.10	0.12	0.01
C3'	0.48	0.61	0.46	0.25	0.55	0.17	0.38	0.16	0.39	0.49	0.64	0.66	0.52	0.24	0.60	0.40	0.39	0.10	0.06	0.04
C4	0.35	0.40	0.25	0.09	0.51	0.07	0.52	0.13	0.45	0.40	0.44	0.38	0.21	0.03	0.50	0.35	0.27	0.18	0.05	0.04
C4'	0.34	0.42	0.31	0.12	0.41	0.08	0.33	0.21	0.32	0.36	0.45	0.43	0.35	0.11	0.44	0.30	0.30	0.17	0.08	0.03
C5	0.37	0.46	0.27	0.09	0.55	0.07	0.49	0.17	0.42	0.42	0.52	0.45	0.24	0.02	0.59	0.36	0.28	0.19	0.06	0.06
C5'	0.43	0.52	0.35	0.16	0.53	0.13	0.44	0.13	0.41	0.45	0.55	0.53	0.39	0.11	0.57	0.40	0.36	0.14	0.06	0.07
C6	0.32	0.41	0.26	0.08	0.49	0.03	0.41	0.21	0.35	0.36	0.46	0.41	0.25	0.04	0.53	0.29	0.27	0.18	0.07	0.05
N1	0.27	0.31	0.24	0.08	0.38	0.04	0.36	0.23	0.31	0.30	0.34	0.29	0.24	0.06	0.40	0.23	0.25	0.17	0.10	0.05
N3	0.28	0.28	0.22	0.10	0.40	0.06	0.49	0.15	0.41	0.32	0.31	0.23	0.20	0.07	0.36	0.28	0.24	0.17	0.08	0.03
N4	0.41	0.46	0.27	0.12	0.54	0.12	0.58	0.06	0.51	0.46	0.49	0.43	0.20	0.02	0.52	0.43	0.29	0.18	0.16	0.08
O2	0.24	0.18	0.25	0.15	0.28	0.13	0.39	0.22	0.35	0.26	0.18	0.12	0.26	0.12	0.24	0.20	0.20	0.16	0.17	0.08
O2'	0.28	0.29	0.34	0.17	0.21	0.11	0.19	0.28	0.21	0.26	0.27	0.33	0.42	0.22	0.18	0.20	0.28	0.12	0.18	0.06
O3'	0.54	0.68	0.54	0.30	0.55	0.22	0.35	0.14	0.38	0.54	0.71	0.78	0.62	0.31	0.58	0.43	0.43	0.06	0.06	0.06
O4'	0.23	0.27	0.20	0.07	0.32	0.06	0.30	0.25	0.27	0.26	0.30	0.25	0.23	0.06	0.34	0.20	0.22	0.21	0.11	0.06
O5'	0.14	0.17	0.16	0.28	0.18	0.39	0.15	0.67	0.16	0.14	0.21	0.20	0.16	0.28	0.23	0.17	0.18	0.66	0.50	0.50
OP1	0.09	0.23	0.10	0.23	0.22	0.32	0.08	0.61	0.07	0.12	0.28	0.28	0.11	0.26	0.29	0.06	0.15	0.67	0.44	0.47
OP2	0.07	0.24	0.03	0.22	0.29	0.32	0.12	0.59	0.06	0.12	0.32	0.28	0.02	0.27	0.39	0.08	0.19	0.67	0.40	0.46
P	0.06	0.16	0.08	0.27	0.18	0.37	0.07	0.65	0.07	0.07	0.22	0.19	0.09	0.30	0.26	0.10	0.19	0.70	0.47	0.51

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.28	0.26	0.02	0.17
C2	0.00	0.00	0.09	0.13	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.14	0.02	0.03	0.31	0.16	0.06	0.15
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.02	0.11	0.01	0.06	0.18	0.00	0.01	0.02	0.02	0.11	0.14	0.13	0.04
C3'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.11	0.04	0.12	0.20	0.03	0.01	0.11	0.02	0.03	0.12	0.22	0.07
C4	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.27	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.00	0.02	0.37	0.16	0.03	0.17
C4'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.10	0.07	0.09	0.06	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.19	0.17	0.01
C5	0.01	0.01	0.09	0.08	0.01	0.11	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.10	0.01	0.02	0.42	0.23	0.10	0.22
C5'	0.07	0.18	0.02	0.02	0.27	0.00	0.29	0.00	0.26	0.19	0.23	0.13	0.04	0.08	0.29	0.02	0.01	0.32	0.23	0.01
C6	0.01	0.00	0.11	0.11	0.01	0.10	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.12	0.01	0.03	0.43	0.28	0.08	0.23
N1	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.34	0.23	0.01	0.18
N3	0.00	0.00	0.06	0.12	0.01	0.09	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.01	0.03	0.33	0.14	0.05	0.15
O2	0.00	0.00	0.18	0.20	0.02	0.06	0.01	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.23	0.03	0.05	0.27	0.15	0.09	0.13
O2'	0.02	0.06	0.00	0.03	0.03	0.05	0.06	0.04	0.06	0.02	0.04	0.11	0.00	0.06	0.02	0.11	0.05	0.07	0.20	0.07
O3'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.04	0.00	0.10	0.08	0.12	0.02	0.12	0.23	0.06	0.00	0.09	0.01	0.22	0.15	0.29	0.20
O4	0.00	0.02	0.02	0.11	0.00	0.12	0.01	0.29	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.09	0.00	0.02	0.34	0.10	0.01	0.14
O4'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.03	0.05	0.11	0.01	0.02	0.00	0.33	0.38	0.08	0.26
O5'	0.28	0.31	0.11	0.03	0.37	0.01	0.42	0.01	0.43	0.34	0.33	0.27	0.05	0.22	0.34	0.33	0.00	0.03	0.03	0.00
OP1	0.26	0.16	0.14	0.12	0.16	0.19	0.23	0.32	0.28	0.23	0.14	0.15	0.07	0.15	0.10	0.38	0.03	0.00	0.02	0.00
OP2	0.02	0.06	0.13	0.22	0.03	0.17	0.10	0.23	0.08	0.01	0.05	0.09	0.20	0.29	0.01	0.08	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.17	0.15	0.04	0.07	0.17	0.01	0.22	0.01	0.23	0.18	0.15	0.13	0.07	0.20	0.14	0.26	0.00	0.00	0.01	0.00