Doublet Group distance statistics: 53741

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 3, 2, 16, 15, 7, 8, 3, 1, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.015, 0.021, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.015 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.003, 0.014, 0.026, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.014 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.007, 0.019, 0.032, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.004, 0.019, 0.033, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.013, 0.029, 0.044, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.029 std_dev=0.016
O6	A	0, 0.015, 0.035, 0.056, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.035 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.040, 0.060, 0.080, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.060 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.020, 0.042, 0.065, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.042 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.006, 0.035, 0.064, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.035 std_dev=0.029
C5	B	0, 0.365, 0.544, 0.723, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.544 std_dev=0.179
N7	B	0, 0.506, 0.718, 0.930, 1.515 max_d=1.515 avg_d=0.718 std_dev=0.212
O6	B	0, 0.323, 0.535, 0.747, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.535 std_dev=0.212
C6	B	0, 0.320, 0.537, 0.754, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.537 std_dev=0.217
C4	B	0, 0.316, 0.548, 0.779, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.548 std_dev=0.231
N9	B	0, 0.362, 0.594, 0.825, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.594 std_dev=0.232
C8	B	0, 0.506, 0.755, 1.004, 1.728 max_d=1.728 avg_d=0.755 std_dev=0.249
C1'	B	0, 0.337, 0.596, 0.856, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.596 std_dev=0.259
N3	B	0, 0.468, 0.748, 1.029, 1.430 max_d=1.430 avg_d=0.748 std_dev=0.280
N1	B	0, 0.476, 0.758, 1.039, 1.725 max_d=1.725 avg_d=0.758 std_dev=0.282
C2'	B	0, 1.035, 1.339, 1.644, 2.386 max_d=2.386 avg_d=1.339 std_dev=0.304
C2	B	0, 0.578, 0.893, 1.208, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.893 std_dev=0.315
O4'	A	0, 1.151, 1.519, 1.886, 1.786 max_d=1.786 avg_d=1.519 std_dev=0.367
C2'	A	0, 1.224, 1.595, 1.967, 2.074 max_d=2.074 avg_d=1.595 std_dev=0.371
N2	B	0, 0.815, 1.234, 1.653, 2.603 max_d=2.603 avg_d=1.234 std_dev=0.419
O3'	A	0, 1.903, 2.326, 2.749, 2.940 max_d=2.940 avg_d=2.326 std_dev=0.423
C3'	A	0, 1.652, 2.087, 2.523, 2.660 max_d=2.660 avg_d=2.087 std_dev=0.436
O4'	B	0, 1.189, 1.643, 2.098, 3.040 max_d=3.040 avg_d=1.643 std_dev=0.455
O2'	B	0, 2.159, 2.617, 3.075, 4.182 max_d=4.182 avg_d=2.617 std_dev=0.458
C3'	B	0, 1.172, 1.644, 2.116, 3.338 max_d=3.338 avg_d=1.644 std_dev=0.472
C4'	A	0, 1.737, 2.242, 2.746, 2.593 max_d=2.593 avg_d=2.242 std_dev=0.504
C4'	B	0, 1.566, 2.103, 2.641, 4.009 max_d=4.009 avg_d=2.103 std_dev=0.537
O3'	B	0, 1.589, 2.156, 2.724, 4.214 max_d=4.214 avg_d=2.156 std_dev=0.568
O2'	A	0, 1.796, 2.404, 3.012, 3.010 max_d=3.010 avg_d=2.404 std_dev=0.608
O5'	A	0, 2.788, 3.485, 4.181, 4.391 max_d=4.391 avg_d=3.485 std_dev=0.697
C5'	A	0, 2.685, 3.441, 4.197, 4.259 max_d=4.259 avg_d=3.441 std_dev=0.756
C5'	B	0, 2.341, 3.123, 3.904, 5.733 max_d=5.733 avg_d=3.123 std_dev=0.782
O5'	B	0, 2.044, 2.862, 3.679, 6.264 max_d=6.264 avg_d=2.862 std_dev=0.818
P	A	0, 3.442, 4.303, 5.164, 5.011 max_d=5.011 avg_d=4.303 std_dev=0.861
OP1	A	0, 4.034, 4.957, 5.880, 5.748 max_d=5.748 avg_d=4.957 std_dev=0.923
OP2	A	0, 3.289, 4.363, 5.437, 5.227 max_d=5.227 avg_d=4.363 std_dev=1.074
P	B	0, 3.036, 4.199, 5.362, 9.276 max_d=9.276 avg_d=4.199 std_dev=1.163
OP2	B	0, 2.568, 3.840, 5.112, 10.161 max_d=10.161 avg_d=3.840 std_dev=1.272
OP1	B	0, 3.835, 5.259, 6.683, 10.640 max_d=10.640 avg_d=5.259 std_dev=1.424

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.21	0.00	0.15	0.02	0.22	0.18	0.14
C2	0.03	0.00	0.27	0.16	0.01	0.16	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.26	0.25	0.27	0.29	0.01	0.49	0.42	0.38
C2'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.14	0.01	0.07	0.12	0.12	0.15	0.21	0.33	0.27	0.09	0.02	0.00	0.04	0.02	0.30	0.09	0.48	0.42	0.33
C3'	0.02	0.16	0.00	0.00	0.16	0.00	0.20	0.02	0.21	0.19	0.19	0.16	0.14	0.22	0.13	0.02	0.01	0.01	0.10	0.23	0.46	0.22	0.22
C4	0.01	0.01	0.14	0.16	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.16	0.14	0.30	0.01	0.50	0.42	0.40
C4'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.19	0.10	0.23	0.16	0.16	0.06	0.16	0.03	0.00	0.02	0.07	0.23	0.16	0.08
C5	0.01	0.01	0.07	0.20	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.12	0.06	0.39	0.01	0.71	0.57	0.56
C5'	0.05	0.24	0.12	0.02	0.14	0.01	0.18	0.00	0.18	0.28	0.20	0.30	0.22	0.27	0.13	0.07	0.12	0.01	0.01	0.21	0.18	0.18	0.01
C6	0.01	0.01	0.12	0.21	0.01	0.06	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.15	0.12	0.39	0.00	0.77	0.61	0.59
C8	0.01	0.01	0.15	0.19	0.01	0.19	0.01	0.28	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.34	0.09	0.15	0.41	0.02	0.63	0.51	0.53
N1	0.03	0.00	0.21	0.19	0.01	0.10	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.20	0.21	0.34	0.01	0.65	0.53	0.50
N2	0.04	0.00	0.33	0.16	0.01	0.23	0.01	0.30	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.38	0.30	0.33	0.28	0.02	0.43	0.38	0.33
N3	0.03	0.00	0.27	0.14	0.00	0.16	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.26	0.25	0.27	0.26	0.01	0.40	0.35	0.32
N7	0.01	0.01	0.09	0.22	0.00	0.16	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.30	0.11	0.08	0.45	0.03	0.81	0.64	0.64
N9	0.00	0.02	0.02	0.13	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.11	0.01	0.28	0.02	0.42	0.36	0.35
O2'	0.02	0.26	0.00	0.02	0.07	0.16	0.12	0.07	0.08	0.34	0.14	0.38	0.26	0.30	0.12	0.00	0.06	0.11	0.21	0.12	0.47	0.44	0.30
O3'	0.21	0.25	0.04	0.01	0.16	0.03	0.12	0.12	0.15	0.09	0.20	0.30	0.25	0.11	0.11	0.06	0.00	0.14	0.13	0.14	0.43	0.22	0.21
O4'	0.00	0.27	0.02	0.01	0.14	0.00	0.06	0.01	0.12	0.15	0.21	0.33	0.27	0.08	0.01	0.11	0.14	0.00	0.09	0.08	0.16	0.24	0.16
O5'	0.15	0.29	0.30	0.10	0.30	0.02	0.39	0.01	0.39	0.41	0.34	0.28	0.26	0.45	0.28	0.21	0.13	0.09	0.00	0.44	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.09	0.23	0.01	0.07	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.12	0.14	0.08	0.44	0.00	0.89	0.69	0.67
OP1	0.22	0.49	0.48	0.46	0.50	0.23	0.71	0.18	0.77	0.63	0.65	0.43	0.40	0.81	0.42	0.47	0.43	0.16	0.02	0.89	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.42	0.42	0.22	0.42	0.16	0.57	0.18	0.61	0.51	0.53	0.38	0.35	0.64	0.36	0.44	0.22	0.24	0.02	0.69	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.38	0.33	0.22	0.40	0.08	0.56	0.01	0.59	0.53	0.50	0.33	0.32	0.64	0.35	0.30	0.21	0.16	0.00	0.67	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.17	0.14	0.15	0.14	0.27	0.14	0.48	0.17	0.15	0.19	0.19	0.15	0.14	0.14	0.21	0.19	0.27	0.56	0.20	0.87	1.03	0.77
C2	0.14	0.15	0.11	0.12	0.13	0.20	0.13	0.35	0.16	0.14	0.17	0.17	0.14	0.13	0.13	0.15	0.15	0.21	0.43	0.18	0.63	0.83	0.54
C2'	0.38	0.36	0.47	0.39	0.36	0.33	0.35	0.41	0.35	0.37	0.35	0.36	0.36	0.36	0.37	0.53	0.45	0.32	0.47	0.34	0.83	0.95	0.69
C3'	0.23	0.28	0.30	0.25	0.24	0.26	0.24	0.45	0.28	0.22	0.30	0.30	0.25	0.22	0.22	0.36	0.31	0.26	0.52	0.30	0.85	1.04	0.76
C4	0.14	0.18	0.11	0.13	0.14	0.22	0.14	0.40	0.18	0.14	0.19	0.19	0.15	0.14	0.14	0.15	0.15	0.22	0.46	0.20	0.72	0.89	0.62
C4'	0.36	0.22	0.25	0.32	0.27	0.50	0.24	0.69	0.20	0.33	0.20	0.22	0.25	0.28	0.32	0.29	0.31	0.52	0.75	0.18	0.98	1.19	0.94
C5	0.14	0.20	0.12	0.13	0.15	0.20	0.16	0.35	0.19	0.15	0.21	0.22	0.17	0.15	0.15	0.14	0.15	0.20	0.40	0.21	0.65	0.79	0.52
C5'	0.42	0.27	0.30	0.38	0.33	0.55	0.30	0.73	0.25	0.40	0.24	0.26	0.31	0.34	0.39	0.32	0.35	0.58	0.78	0.23	0.97	1.17	0.94
C6	0.15	0.21	0.13	0.13	0.17	0.18	0.17	0.30	0.20	0.16	0.22	0.23	0.18	0.16	0.16	0.15	0.14	0.18	0.35	0.22	0.56	0.70	0.42
C8	0.14	0.19	0.11	0.14	0.15	0.23	0.15	0.40	0.19	0.15	0.21	0.22	0.16	0.14	0.14	0.15	0.16	0.22	0.46	0.21	0.75	0.88	0.62
N1	0.15	0.18	0.12	0.12	0.15	0.18	0.15	0.30	0.18	0.15	0.19	0.20	0.16	0.15	0.15	0.14	0.14	0.18	0.36	0.20	0.54	0.71	0.43
N2	0.14	0.14	0.13	0.13	0.12	0.21	0.12	0.36	0.15	0.14	0.15	0.15	0.13	0.12	0.13	0.16	0.16	0.22	0.44	0.18	0.61	0.83	0.55
N3	0.14	0.15	0.12	0.13	0.13	0.23	0.13	0.41	0.16	0.14	0.17	0.17	0.13	0.13	0.13	0.17	0.17	0.24	0.49	0.18	0.73	0.92	0.65
N7	0.15	0.21	0.12	0.14	0.16	0.21	0.16	0.36	0.20	0.15	0.22	0.24	0.18	0.15	0.15	0.14	0.16	0.20	0.41	0.22	0.68	0.80	0.54
N9	0.14	0.18	0.12	0.14	0.14	0.24	0.14	0.43	0.18	0.14	0.20	0.20	0.15	0.14	0.14	0.17	0.17	0.24	0.50	0.20	0.79	0.94	0.68
O2'	0.47	0.37	0.51	0.42	0.40	0.42	0.38	0.50	0.35	0.44	0.35	0.37	0.39	0.41	0.44	0.59	0.45	0.44	0.57	0.34	0.91	1.03	0.79
O3'	0.40	0.35	0.36	0.37	0.36	0.49	0.35	0.69	0.34	0.39	0.35	0.36	0.35	0.36	0.38	0.41	0.38	0.50	0.77	0.34	1.03	1.26	1.00
O4'	0.43	0.29	0.32	0.40	0.35	0.56	0.33	0.74	0.28	0.42	0.27	0.28	0.33	0.37	0.40	0.33	0.37	0.58	0.80	0.25	1.02	1.19	0.97
O5'	0.28	0.31	0.31	0.35	0.28	0.39	0.29	0.55	0.32	0.29	0.33	0.32	0.29	0.29	0.28	0.30	0.39	0.39	0.61	0.35	0.86	0.99	0.77
O6	0.17	0.24	0.15	0.15	0.19	0.17	0.19	0.28	0.22	0.17	0.25	0.26	0.21	0.18	0.18	0.17	0.16	0.17	0.31	0.24	0.50	0.62	0.35
OP1	0.43	0.73	0.57	0.56	0.57	0.48	0.59	0.61	0.72	0.42	0.78	0.79	0.63	0.49	0.47	0.55	0.63	0.43	0.68	0.78	0.89	1.06	0.82
OP2	0.34	0.48	0.45	0.42	0.41	0.36	0.43	0.44	0.49	0.36	0.51	0.50	0.43	0.40	0.37	0.45	0.48	0.34	0.50	0.53	0.81	0.74	0.63
P	0.29	0.47	0.40	0.39	0.37	0.35	0.40	0.48	0.48	0.32	0.51	0.50	0.40	0.36	0.32	0.39	0.45	0.33	0.55	0.54	0.85	0.86	0.70

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.02	0.11	0.25	0.07
C2	0.03	0.00	0.14	0.23	0.01	0.24	0.01	0.39	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.24	0.18	0.49	0.01	0.52	0.64	0.54
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.06	0.10	0.16	0.14	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.16	0.06	0.27	0.17	0.13
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.11	0.00	0.08	0.03	0.11	0.13	0.18	0.28	0.22	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.21	0.10	0.36	0.20	0.19
C4	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.11	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.11	0.09	0.22	0.01	0.21	0.35	0.18
C4'	0.01	0.24	0.01	0.00	0.11	0.00	0.08	0.01	0.11	0.15	0.18	0.31	0.23	0.11	0.05	0.06	0.02	0.00	0.01	0.10	0.14	0.22	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.08	0.03	0.21	0.01	0.23	0.43	0.15
C5'	0.03	0.39	0.02	0.03	0.18	0.01	0.16	0.00	0.20	0.26	0.30	0.51	0.35	0.23	0.10	0.06	0.04	0.02	0.01	0.20	0.12	0.23	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.11	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.12	0.07	0.25	0.00	0.27	0.47	0.20
C8	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.15	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.14	0.11	0.37	0.01	0.37	0.57	0.36
N1	0.02	0.00	0.10	0.18	0.01	0.18	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.19	0.13	0.37	0.01	0.40	0.55	0.40
N2	0.04	0.00	0.16	0.28	0.01	0.31	0.01	0.51	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.24	0.31	0.23	0.65	0.02	0.74	0.90	0.78
N3	0.03	0.00	0.14	0.22	0.00	0.23	0.01	0.35	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.22	0.19	0.44	0.01	0.43	0.51	0.45
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.11	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.07	0.33	0.01	0.37	0.61	0.33
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.17	0.01	0.17	0.33	0.12
O2'	0.02	0.19	0.00	0.02	0.09	0.06	0.07	0.06	0.10	0.08	0.15	0.24	0.18	0.06	0.03	0.00	0.04	0.05	0.10	0.09	0.29	0.20	0.11
O3'	0.02	0.24	0.01	0.01	0.11	0.02	0.08	0.04	0.12	0.14	0.19	0.31	0.22	0.11	0.05	0.04	0.00	0.02	0.20	0.11	0.51	0.31	0.26
O4'	0.00	0.18	0.01	0.01	0.09	0.00	0.03	0.02	0.07	0.11	0.13	0.23	0.19	0.07	0.01	0.05	0.02	0.00	0.07	0.05	0.09	0.30	0.13
O5'	0.09	0.49	0.16	0.21	0.22	0.01	0.21	0.01	0.25	0.37	0.37	0.65	0.44	0.33	0.17	0.10	0.20	0.07	0.00	0.24	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.10	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.05	0.24	0.00	0.28	0.52	0.19
OP1	0.11	0.52	0.27	0.36	0.21	0.14	0.23	0.12	0.27	0.37	0.40	0.74	0.43	0.37	0.17	0.29	0.51	0.09	0.02	0.28	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.64	0.17	0.20	0.35	0.22	0.43	0.23	0.47	0.57	0.55	0.90	0.51	0.61	0.33	0.20	0.31	0.30	0.02	0.52	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.54	0.13	0.19	0.18	0.04	0.15	0.01	0.20	0.36	0.40	0.78	0.45	0.33	0.12	0.11	0.26	0.13	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00