Doublet Group distance statistics: 53742

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 1, 4, 16, 12, 7, 9, 5, 4, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 1, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.020, 0.025, 0.031, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.025 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.014, 0.021, 0.028, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.021 std_dev=0.007
O6	A	0, 0.035, 0.045, 0.055, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.045 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.018 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.044, 0.056, 0.068, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.056 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.040, 0.052, 0.064, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.052 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.062, 0.075, 0.088, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.075 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.063, 0.079, 0.095, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.079 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.030, 0.049, 0.067, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.049 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.083, 0.102, 0.120, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.102 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.120, 0.149, 0.178, 0.235 max_d=0.235 avg_d=0.149 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.418, 0.558, 0.699, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.558 std_dev=0.140
C2'	A	0, 0.252, 0.440, 0.629, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.440 std_dev=0.189
C6	B	0, 0.405, 0.595, 0.786, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.595 std_dev=0.191
O6	B	0, 0.384, 0.590, 0.796, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.590 std_dev=0.206
C4'	A	0, 0.662, 0.898, 1.134, 1.800 max_d=1.800 avg_d=0.898 std_dev=0.236
N1	B	0, 0.538, 0.776, 1.015, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.776 std_dev=0.238
C5	B	0, 0.455, 0.694, 0.934, 1.546 max_d=1.546 avg_d=0.694 std_dev=0.239
N3	B	0, 0.523, 0.769, 1.015, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.769 std_dev=0.246
C2	B	0, 0.631, 0.877, 1.124, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.877 std_dev=0.247
C4	B	0, 0.432, 0.700, 0.968, 1.802 max_d=1.802 avg_d=0.700 std_dev=0.268
O2'	A	0, 1.076, 1.367, 1.658, 1.853 max_d=1.853 avg_d=1.367 std_dev=0.291
N7	B	0, 0.672, 0.986, 1.301, 2.000 max_d=2.000 avg_d=0.986 std_dev=0.314
N2	B	0, 0.844, 1.191, 1.537, 1.807 max_d=1.807 avg_d=1.191 std_dev=0.347
C3'	A	0, 1.179, 1.531, 1.883, 1.782 max_d=1.782 avg_d=1.531 std_dev=0.352
C5'	A	0, 1.155, 1.536, 1.917, 2.917 max_d=2.917 avg_d=1.536 std_dev=0.381
N9	B	0, 0.519, 0.906, 1.293, 2.433 max_d=2.433 avg_d=0.906 std_dev=0.387
C8	B	0, 0.703, 1.111, 1.518, 2.505 max_d=2.505 avg_d=1.111 std_dev=0.408
P	A	0, 2.150, 2.576, 3.001, 3.401 max_d=3.401 avg_d=2.576 std_dev=0.425
O5'	A	0, 2.054, 2.523, 2.991, 2.996 max_d=2.996 avg_d=2.523 std_dev=0.468
O2'	B	0, 1.287, 1.760, 2.234, 3.029 max_d=3.029 avg_d=1.760 std_dev=0.473
C1'	B	0, 0.485, 0.979, 1.474, 2.918 max_d=2.918 avg_d=0.979 std_dev=0.494
C2'	B	0, 1.058, 1.581, 2.105, 3.514 max_d=3.514 avg_d=1.581 std_dev=0.523
OP1	A	0, 2.215, 2.835, 3.455, 5.944 max_d=5.944 avg_d=2.835 std_dev=0.620
O3'	A	0, 1.997, 2.625, 3.253, 3.091 max_d=3.091 avg_d=2.625 std_dev=0.628
O4'	B	0, 1.645, 2.427, 3.209, 4.647 max_d=4.647 avg_d=2.427 std_dev=0.782
OP2	A	0, 3.043, 3.849, 4.654, 4.647 max_d=4.647 avg_d=3.849 std_dev=0.805
C3'	B	0, 2.024, 2.866, 3.708, 5.385 max_d=5.385 avg_d=2.866 std_dev=0.842
O3'	B	0, 2.374, 3.305, 4.235, 6.038 max_d=6.038 avg_d=3.305 std_dev=0.931
C4'	B	0, 2.344, 3.283, 4.223, 5.854 max_d=5.854 avg_d=3.283 std_dev=0.939
OP1	B	0, 5.139, 6.318, 7.497, 8.693 max_d=8.693 avg_d=6.318 std_dev=1.179
C5'	B	0, 3.615, 4.867, 6.119, 7.605 max_d=7.605 avg_d=4.867 std_dev=1.252
O5'	B	0, 3.745, 5.045, 6.345, 7.600 max_d=7.600 avg_d=5.045 std_dev=1.300
P	B	0, 4.759, 6.295, 7.831, 8.586 max_d=8.586 avg_d=6.295 std_dev=1.536
OP2	B	0, 5.065, 6.786, 8.507, 9.376 max_d=9.376 avg_d=6.786 std_dev=1.721

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.18	0.01	0.16	0.01	0.25	0.19	0.18
C2	0.03	0.00	0.19	0.09	0.01	0.12	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.30	0.36	0.19	0.37	0.01	0.40	0.46	0.36
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.10	0.01	0.06	0.14	0.09	0.09	0.15	0.22	0.18	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.23	0.07	0.32	0.29	0.20
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.15	0.02	0.13	0.24	0.09	0.13	0.08	0.23	0.12	0.02	0.01	0.01	0.07	0.16	0.47	0.17	0.20
C4	0.01	0.01	0.10	0.08	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.18	0.10	0.32	0.01	0.42	0.40	0.33
C4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.08	0.09	0.10	0.14	0.10	0.08	0.04	0.17	0.03	0.00	0.02	0.08	0.21	0.10	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.15	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.06	0.05	0.38	0.01	0.53	0.51	0.42
C5'	0.06	0.21	0.14	0.02	0.10	0.01	0.07	0.00	0.12	0.13	0.18	0.26	0.18	0.09	0.04	0.04	0.14	0.01	0.01	0.11	0.16	0.17	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.13	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.12	0.09	0.41	0.01	0.56	0.57	0.46
C8	0.01	0.01	0.09	0.24	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.19	0.17	0.10	0.36	0.01	0.53	0.44	0.42
N1	0.02	0.00	0.15	0.09	0.01	0.10	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.29	0.25	0.15	0.41	0.01	0.49	0.55	0.42
N2	0.03	0.01	0.22	0.13	0.01	0.14	0.01	0.26	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.33	0.47	0.22	0.37	0.02	0.37	0.46	0.35
N3	0.02	0.00	0.18	0.08	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.27	0.36	0.18	0.32	0.01	0.36	0.37	0.30
N7	0.01	0.01	0.05	0.23	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.14	0.05	0.39	0.01	0.60	0.53	0.47
N9	0.00	0.01	0.02	0.12	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.13	0.07	0.01	0.27	0.01	0.40	0.32	0.30
O2'	0.01	0.30	0.00	0.02	0.21	0.17	0.23	0.04	0.27	0.19	0.29	0.33	0.27	0.22	0.13	0.00	0.04	0.12	0.18	0.27	0.32	0.31	0.17
O3'	0.18	0.36	0.02	0.01	0.18	0.03	0.06	0.14	0.12	0.17	0.25	0.47	0.36	0.14	0.07	0.04	0.00	0.12	0.13	0.07	0.73	0.29	0.37
O4'	0.01	0.19	0.01	0.01	0.10	0.00	0.05	0.01	0.09	0.10	0.15	0.22	0.18	0.05	0.01	0.12	0.12	0.00	0.16	0.07	0.22	0.17	0.18
O5'	0.16	0.37	0.23	0.07	0.32	0.02	0.38	0.01	0.41	0.36	0.41	0.37	0.32	0.39	0.27	0.18	0.13	0.16	0.00	0.44	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.07	0.16	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.27	0.07	0.07	0.44	0.00	0.62	0.64	0.50
OP1	0.25	0.40	0.32	0.47	0.42	0.21	0.53	0.16	0.56	0.53	0.49	0.37	0.36	0.60	0.40	0.32	0.73	0.22	0.02	0.62	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.46	0.29	0.17	0.40	0.10	0.51	0.17	0.57	0.44	0.55	0.46	0.37	0.53	0.32	0.31	0.29	0.17	0.02	0.64	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.36	0.20	0.20	0.33	0.04	0.42	0.02	0.46	0.42	0.42	0.35	0.30	0.47	0.30	0.17	0.37	0.18	0.00	0.50	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.11	0.24	0.26	0.12	0.22	0.11	0.27	0.11	0.15	0.12	0.12	0.11	0.13	0.14	0.44	0.27	0.22	0.31	0.12	0.40	0.71	0.41
C2	0.13	0.11	0.20	0.23	0.10	0.18	0.10	0.29	0.12	0.13	0.12	0.12	0.10	0.12	0.12	0.37	0.20	0.15	0.33	0.14	0.53	0.74	0.43
C2'	0.22	0.24	0.40	0.22	0.22	0.22	0.20	0.33	0.22	0.19	0.24	0.25	0.23	0.18	0.21	0.66	0.26	0.15	0.28	0.22	0.48	0.66	0.35
C3'	0.22	0.17	0.41	0.25	0.17	0.28	0.15	0.41	0.16	0.20	0.18	0.19	0.17	0.16	0.19	0.65	0.28	0.21	0.26	0.17	0.44	0.66	0.30
C4	0.14	0.10	0.21	0.27	0.10	0.19	0.10	0.27	0.10	0.14	0.10	0.10	0.09	0.13	0.13	0.41	0.24	0.17	0.31	0.11	0.46	0.70	0.40
C4'	0.22	0.15	0.25	0.28	0.18	0.27	0.17	0.31	0.16	0.22	0.15	0.15	0.16	0.20	0.20	0.43	0.28	0.30	0.31	0.15	0.33	0.70	0.40
C5	0.14	0.09	0.20	0.29	0.11	0.18	0.10	0.27	0.09	0.16	0.09	0.10	0.09	0.14	0.13	0.41	0.25	0.15	0.30	0.09	0.46	0.67	0.38
C5'	0.28	0.22	0.23	0.33	0.25	0.32	0.24	0.31	0.22	0.27	0.21	0.22	0.24	0.26	0.27	0.37	0.31	0.38	0.37	0.21	0.35	0.73	0.45
C6	0.14	0.09	0.19	0.28	0.11	0.17	0.11	0.27	0.09	0.16	0.09	0.10	0.10	0.15	0.14	0.38	0.23	0.13	0.29	0.09	0.48	0.66	0.37
C8	0.15	0.09	0.22	0.31	0.11	0.21	0.10	0.27	0.09	0.16	0.09	0.10	0.09	0.14	0.14	0.44	0.29	0.18	0.32	0.09	0.42	0.68	0.39
N1	0.13	0.10	0.18	0.25	0.10	0.16	0.10	0.28	0.10	0.15	0.10	0.10	0.09	0.14	0.13	0.36	0.20	0.13	0.31	0.11	0.52	0.70	0.40
N2	0.13	0.14	0.22	0.22	0.12	0.19	0.12	0.33	0.15	0.14	0.16	0.15	0.13	0.13	0.12	0.35	0.21	0.16	0.37	0.18	0.59	0.81	0.49
N3	0.13	0.11	0.21	0.24	0.11	0.19	0.10	0.28	0.11	0.13	0.12	0.12	0.10	0.12	0.12	0.39	0.22	0.17	0.32	0.13	0.49	0.74	0.43
N7	0.15	0.09	0.22	0.32	0.11	0.20	0.11	0.27	0.09	0.16	0.09	0.10	0.10	0.15	0.14	0.42	0.29	0.16	0.31	0.09	0.44	0.66	0.38
N9	0.15	0.10	0.22	0.28	0.11	0.21	0.10	0.27	0.10	0.15	0.10	0.11	0.10	0.13	0.13	0.43	0.27	0.19	0.31	0.11	0.43	0.70	0.40
O2'	0.36	0.40	0.58	0.31	0.37	0.29	0.35	0.38	0.37	0.32	0.39	0.41	0.39	0.32	0.34	0.84	0.32	0.23	0.27	0.36	0.47	0.63	0.31
O3'	0.63	0.43	0.82	0.63	0.51	0.69	0.47	0.82	0.39	0.59	0.38	0.41	0.49	0.52	0.58	1.03	0.62	0.61	0.59	0.33	0.76	0.81	0.56
O4'	0.29	0.22	0.24	0.37	0.25	0.33	0.24	0.31	0.22	0.29	0.21	0.21	0.24	0.27	0.28	0.36	0.35	0.37	0.39	0.20	0.37	0.74	0.47
O5'	0.35	0.42	0.33	0.37	0.37	0.31	0.37	0.26	0.40	0.34	0.43	0.44	0.39	0.34	0.35	0.46	0.34	0.38	0.46	0.41	0.41	0.78	0.51
O6	0.15	0.10	0.20	0.30	0.13	0.16	0.13	0.26	0.11	0.17	0.10	0.11	0.11	0.16	0.15	0.38	0.24	0.14	0.29	0.11	0.48	0.63	0.35
OP1	0.35	0.50	0.36	0.44	0.42	0.35	0.43	0.34	0.48	0.35	0.52	0.53	0.45	0.38	0.37	0.45	0.44	0.36	0.45	0.51	0.44	0.74	0.49
OP2	0.48	0.64	0.51	0.46	0.55	0.36	0.54	0.26	0.60	0.45	0.64	0.68	0.59	0.47	0.49	0.63	0.42	0.45	0.55	0.60	0.51	0.83	0.57
P	0.33	0.46	0.37	0.34	0.38	0.26	0.39	0.22	0.43	0.32	0.47	0.49	0.42	0.34	0.34	0.52	0.32	0.33	0.44	0.45	0.45	0.75	0.48

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.18	0.00	0.20	0.02	0.19	0.40	0.20
C2	0.02	0.00	0.24	0.23	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.15	0.11	0.18	0.01	0.31	0.44	0.20
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.13	0.01	0.08	0.14	0.12	0.12	0.19	0.29	0.23	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.31	0.10	0.27	0.48	0.36
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.20	0.00	0.23	0.04	0.26	0.16	0.26	0.23	0.20	0.21	0.14	0.01	0.01	0.02	0.09	0.27	0.07	0.22	0.10
C4	0.01	0.01	0.13	0.20	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.09	0.06	0.22	0.01	0.31	0.47	0.24
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.09	0.07	0.07	0.05	0.09	0.05	0.19	0.01	0.00	0.02	0.09	0.15	0.19	0.04
C5	0.01	0.01	0.08	0.23	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.11	0.03	0.26	0.01	0.39	0.53	0.29
C5'	0.08	0.14	0.14	0.04	0.15	0.00	0.18	0.00	0.18	0.18	0.16	0.13	0.12	0.20	0.14	0.06	0.13	0.01	0.02	0.20	0.13	0.16	0.02
C6	0.02	0.01	0.12	0.26	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.14	0.05	0.24	0.00	0.41	0.54	0.29
C8	0.01	0.01	0.12	0.16	0.00	0.09	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.09	0.07	0.31	0.01	0.37	0.56	0.34
N1	0.02	0.00	0.19	0.26	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.14	0.09	0.21	0.01	0.36	0.48	0.24
N2	0.03	0.00	0.29	0.23	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.18	0.12	0.16	0.01	0.28	0.42	0.17
N3	0.02	0.00	0.23	0.20	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.14	0.10	0.18	0.01	0.27	0.42	0.19
N7	0.01	0.01	0.07	0.21	0.01	0.09	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.25	0.13	0.04	0.30	0.01	0.44	0.59	0.36
N9	0.01	0.01	0.03	0.14	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.06	0.01	0.24	0.01	0.28	0.47	0.25
O2'	0.02	0.13	0.00	0.01	0.11	0.19	0.18	0.06	0.17	0.23	0.13	0.18	0.12	0.25	0.13	0.00	0.04	0.12	0.22	0.20	0.19	0.45	0.30
O3'	0.18	0.15	0.02	0.01	0.09	0.01	0.11	0.13	0.14	0.09	0.14	0.18	0.14	0.13	0.06	0.04	0.00	0.13	0.21	0.18	0.19	0.29	0.21
O4'	0.00	0.11	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.07	0.09	0.12	0.10	0.04	0.01	0.12	0.13	0.00	0.14	0.04	0.27	0.32	0.16
O5'	0.20	0.18	0.31	0.09	0.22	0.02	0.26	0.02	0.24	0.31	0.21	0.16	0.18	0.30	0.24	0.22	0.21	0.14	0.00	0.26	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.10	0.27	0.01	0.09	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.18	0.04	0.26	0.00	0.45	0.57	0.32
OP1	0.19	0.31	0.27	0.07	0.31	0.15	0.39	0.13	0.41	0.37	0.36	0.28	0.27	0.44	0.28	0.19	0.19	0.27	0.02	0.45	0.00	0.01	0.01
OP2	0.40	0.44	0.48	0.22	0.47	0.19	0.53	0.16	0.54	0.56	0.48	0.42	0.42	0.59	0.47	0.45	0.29	0.32	0.01	0.57	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.20	0.36	0.10	0.24	0.04	0.29	0.02	0.29	0.34	0.24	0.17	0.19	0.36	0.25	0.30	0.21	0.16	0.00	0.32	0.01	0.00	0.00