Doublet Group distance statistics: 53747

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.005, 0.009, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.006, 0.013, 0.021, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.013
O6	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.010, 0.025, 0.041, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.025 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.007, 0.028, 0.049, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.007, 0.031, 0.056, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.031 std_dev=0.025
C2'	A	0, 0.080, 0.230, 0.380, 0.462 max_d=0.462 avg_d=0.230 std_dev=0.150
O4'	A	0, 0.054, 0.216, 0.377, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.216 std_dev=0.161
C4'	A	0, 0.125, 0.352, 0.578, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.352 std_dev=0.227
O6	B	0, 0.291, 0.581, 0.871, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.581 std_dev=0.290
C6	B	0, 0.248, 0.544, 0.840, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.544 std_dev=0.296
N7	B	0, 0.203, 0.515, 0.827, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.515 std_dev=0.312
C5	B	0, 0.147, 0.461, 0.775, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.461 std_dev=0.314
C3'	A	0, 0.101, 0.450, 0.799, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.450 std_dev=0.349
C4	B	0, 0.139, 0.499, 0.859, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.499 std_dev=0.360
C5'	A	0, 0.137, 0.506, 0.875, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.506 std_dev=0.369
N1	B	0, 0.288, 0.668, 1.047, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.668 std_dev=0.379
N9	B	0, 0.205, 0.590, 0.976, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.590 std_dev=0.385
N3	B	0, 0.178, 0.575, 0.971, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.575 std_dev=0.396
C8	B	0, 0.210, 0.607, 1.004, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.607 std_dev=0.397
C2	B	0, 0.268, 0.675, 1.081, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.675 std_dev=0.407
O2'	A	0, 0.023, 0.433, 0.842, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.433 std_dev=0.410
C1'	B	0, 0.229, 0.707, 1.186, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.707 std_dev=0.479
C2'	B	0, 0.200, 0.701, 1.202, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.701 std_dev=0.501
N2	B	0, 0.329, 0.838, 1.346, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.838 std_dev=0.509
O4'	B	0, 0.345, 0.897, 1.449, 1.609 max_d=1.609 avg_d=0.897 std_dev=0.552
C3'	B	0, 0.296, 0.860, 1.425, 1.645 max_d=1.645 avg_d=0.860 std_dev=0.564
O2'	B	0, 0.199, 0.775, 1.350, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.775 std_dev=0.575
O5'	B	0, 0.454, 1.072, 1.690, 2.048 max_d=2.048 avg_d=1.072 std_dev=0.618
C4'	B	0, 0.364, 0.992, 1.619, 1.898 max_d=1.898 avg_d=0.992 std_dev=0.627
O3'	B	0, 0.375, 1.041, 1.706, 1.968 max_d=1.968 avg_d=1.041 std_dev=0.666
C5'	B	0, 0.432, 1.154, 1.877, 2.327 max_d=2.327 avg_d=1.154 std_dev=0.723
O3'	A	0, -0.007, 0.791, 1.590, 2.423 max_d=2.423 avg_d=0.791 std_dev=0.798
O5'	A	0, -0.006, 0.882, 1.769, 2.426 max_d=2.426 avg_d=0.882 std_dev=0.887
P	B	0, 0.162, 1.156, 2.150, 2.680 max_d=2.680 avg_d=1.156 std_dev=0.994
P	A	0, -0.053, 0.942, 1.937, 2.917 max_d=2.917 avg_d=0.942 std_dev=0.995
OP1	B	0, 0.415, 1.423, 2.430, 3.216 max_d=3.216 avg_d=1.423 std_dev=1.008
OP1	A	0, 0.346, 1.397, 2.448, 2.913 max_d=2.913 avg_d=1.397 std_dev=1.051
OP2	A	0, 0.238, 1.301, 2.365, 3.181 max_d=3.181 avg_d=1.301 std_dev=1.064
OP2	B	0, 0.186, 1.407, 2.628, 3.073 max_d=3.073 avg_d=1.407 std_dev=1.221

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.03	0.23	0.00	0.25	0.01	0.27	0.26	0.35
C2	0.02	0.00	0.09	0.04	0.00	0.12	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.34	0.15	0.45	0.01	0.83	0.47	0.61
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.02	0.02	0.14	0.04	0.07	0.07	0.12	0.09	0.05	0.02	0.00	0.05	0.01	0.22	0.03	0.07	0.10	0.19
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.16	0.25	0.10	0.03	0.03	0.25	0.14	0.03	0.01	0.01	0.29	0.19	0.04	0.29	0.24
C4	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.18	0.07	0.48	0.01	0.66	0.49	0.62
C4'	0.00	0.12	0.02	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.09	0.10	0.11	0.15	0.11	0.10	0.05	0.19	0.04	0.00	0.01	0.09	0.04	0.05	0.12
C5	0.01	0.00	0.02	0.18	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.06	0.03	0.59	0.01	0.76	0.64	0.76
C5'	0.05	0.26	0.14	0.01	0.18	0.01	0.17	0.00	0.21	0.08	0.26	0.30	0.23	0.11	0.09	0.08	0.18	0.02	0.01	0.21	0.03	0.20	0.03
C6	0.01	0.00	0.04	0.16	0.00	0.09	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.10	0.06	0.59	0.00	0.88	0.67	0.80
C8	0.01	0.00	0.07	0.25	0.00	0.10	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.15	0.08	0.62	0.01	0.52	0.59	0.70
N1	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.11	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.23	0.11	0.52	0.00	0.90	0.58	0.72
N2	0.03	0.00	0.12	0.03	0.01	0.15	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.44	0.18	0.42	0.01	0.86	0.43	0.56
N3	0.02	0.00	0.09	0.03	0.00	0.11	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.35	0.15	0.40	0.00	0.70	0.42	0.53
N7	0.00	0.00	0.05	0.25	0.00	0.10	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.13	0.05	0.66	0.01	0.68	0.72	0.81
N9	0.00	0.01	0.02	0.14	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.08	0.00	0.46	0.01	0.48	0.44	0.56
O2'	0.03	0.15	0.00	0.03	0.14	0.19	0.20	0.08	0.20	0.22	0.16	0.17	0.14	0.24	0.13	0.00	0.12	0.15	0.26	0.23	0.09	0.12	0.27
O3'	0.23	0.34	0.05	0.01	0.18	0.04	0.06	0.18	0.10	0.15	0.23	0.44	0.35	0.13	0.08	0.12	0.00	0.15	0.29	0.05	0.09	0.49	0.27
O4'	0.00	0.15	0.01	0.01	0.07	0.00	0.03	0.02	0.06	0.08	0.11	0.18	0.15	0.05	0.00	0.15	0.15	0.00	0.08	0.03	0.28	0.28	0.32
O5'	0.25	0.45	0.22	0.29	0.48	0.01	0.59	0.01	0.59	0.62	0.52	0.42	0.40	0.66	0.46	0.26	0.29	0.08	0.00	0.63	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.03	0.19	0.01	0.09	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.05	0.03	0.63	0.00	0.94	0.75	0.87
OP1	0.27	0.83	0.07	0.04	0.66	0.04	0.76	0.03	0.88	0.52	0.90	0.86	0.70	0.68	0.48	0.09	0.09	0.28	0.01	0.94	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.47	0.10	0.29	0.49	0.05	0.64	0.20	0.67	0.59	0.58	0.43	0.42	0.72	0.44	0.12	0.49	0.28	0.01	0.75	0.01	0.00	0.01
P	0.35	0.61	0.19	0.24	0.62	0.12	0.76	0.03	0.80	0.70	0.72	0.56	0.53	0.81	0.56	0.27	0.27	0.32	0.01	0.87	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.10	0.14	0.18	0.06	0.18	0.06	0.20	0.11	0.13	0.13	0.13	0.07	0.09	0.11	0.14	0.22	0.17	0.19	0.15	0.63	0.82	0.25
C2	0.16	0.12	0.14	0.12	0.11	0.15	0.11	0.13	0.11	0.18	0.14	0.14	0.10	0.16	0.15	0.15	0.12	0.18	0.12	0.15	0.63	0.64	0.19
C2'	0.15	0.19	0.11	0.08	0.15	0.10	0.15	0.12	0.19	0.15	0.20	0.20	0.16	0.14	0.14	0.12	0.08	0.16	0.12	0.21	0.71	0.67	0.21
C3'	0.19	0.10	0.19	0.23	0.10	0.23	0.09	0.22	0.10	0.18	0.12	0.13	0.09	0.13	0.15	0.19	0.25	0.24	0.22	0.13	0.40	0.97	0.23
C4	0.14	0.14	0.13	0.12	0.10	0.14	0.10	0.13	0.12	0.17	0.15	0.17	0.10	0.15	0.13	0.14	0.14	0.17	0.13	0.15	0.64	0.64	0.20
C4'	0.24	0.05	0.24	0.30	0.13	0.32	0.11	0.34	0.05	0.23	0.05	0.04	0.10	0.18	0.20	0.24	0.32	0.30	0.33	0.07	0.53	1.00	0.35
C5	0.15	0.18	0.13	0.12	0.12	0.14	0.13	0.15	0.16	0.20	0.20	0.23	0.14	0.18	0.15	0.15	0.13	0.18	0.16	0.19	0.67	0.51	0.28
C5'	0.32	0.20	0.31	0.35	0.25	0.37	0.24	0.39	0.20	0.32	0.20	0.19	0.23	0.29	0.30	0.31	0.37	0.37	0.37	0.19	0.60	0.96	0.37
C6	0.17	0.21	0.15	0.14	0.14	0.16	0.15	0.17	0.19	0.22	0.24	0.26	0.16	0.21	0.17	0.16	0.15	0.19	0.19	0.22	0.67	0.46	0.33
C8	0.14	0.16	0.13	0.13	0.10	0.14	0.11	0.15	0.14	0.18	0.19	0.21	0.12	0.15	0.13	0.14	0.15	0.17	0.16	0.17	0.68	0.56	0.25
N1	0.17	0.18	0.14	0.13	0.14	0.15	0.15	0.14	0.16	0.21	0.20	0.21	0.14	0.20	0.17	0.16	0.12	0.19	0.16	0.19	0.64	0.49	0.27
N2	0.17	0.10	0.15	0.16	0.11	0.18	0.10	0.17	0.11	0.18	0.12	0.11	0.10	0.16	0.15	0.15	0.15	0.20	0.15	0.16	0.63	0.71	0.23
N3	0.15	0.11	0.14	0.14	0.09	0.15	0.09	0.15	0.11	0.16	0.13	0.13	0.09	0.13	0.13	0.14	0.16	0.18	0.13	0.14	0.63	0.73	0.20
N7	0.15	0.20	0.13	0.13	0.12	0.15	0.13	0.17	0.17	0.20	0.22	0.25	0.14	0.18	0.15	0.15	0.15	0.18	0.19	0.20	0.70	0.48	0.31
N9	0.14	0.13	0.13	0.14	0.09	0.15	0.09	0.15	0.12	0.16	0.15	0.16	0.09	0.13	0.12	0.13	0.16	0.17	0.15	0.15	0.65	0.68	0.20
O2'	0.17	0.26	0.16	0.15	0.21	0.09	0.22	0.12	0.27	0.18	0.28	0.27	0.22	0.19	0.18	0.16	0.20	0.17	0.11	0.30	0.71	0.78	0.26
O3'	0.68	0.46	0.70	0.76	0.56	0.76	0.53	0.75	0.44	0.65	0.42	0.43	0.52	0.59	0.63	0.70	0.77	0.74	0.76	0.40	0.25	1.51	0.77
O4'	0.26	0.05	0.27	0.33	0.16	0.35	0.14	0.38	0.06	0.26	0.05	0.04	0.11	0.21	0.23	0.26	0.36	0.32	0.37	0.06	0.64	0.96	0.39
O5'	0.34	0.36	0.35	0.37	0.33	0.38	0.34	0.40	0.37	0.35	0.38	0.37	0.33	0.34	0.34	0.34	0.39	0.38	0.38	0.39	0.65	0.82	0.37
O6	0.18	0.27	0.17	0.19	0.16	0.19	0.18	0.22	0.23	0.23	0.29	0.33	0.19	0.23	0.18	0.18	0.21	0.20	0.25	0.27	0.69	0.43	0.42
OP1	0.78	0.97	0.80	0.72	0.87	0.69	0.87	0.64	0.94	0.77	0.99	1.01	0.92	0.80	0.81	0.82	0.73	0.72	0.61	0.96	0.88	0.71	0.52
OP2	0.41	0.58	0.46	0.40	0.47	0.34	0.48	0.27	0.55	0.39	0.60	0.62	0.52	0.42	0.42	0.47	0.41	0.36	0.28	0.58	0.70	0.63	0.27
P	0.39	0.61	0.46	0.41	0.50	0.33	0.52	0.29	0.61	0.40	0.65	0.65	0.54	0.45	0.42	0.46	0.44	0.31	0.29	0.65	0.76	0.53	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.34	0.15	0.10
C2	0.02	0.00	0.11	0.16	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.19	0.01	0.23	0.00	0.55	0.11	0.28
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.06	0.09	0.14	0.11	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.18	0.30	0.09
C3'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.00	0.08	0.02	0.11	0.06	0.15	0.19	0.15	0.05	0.03	0.03	0.01	0.01	0.07	0.11	0.21	0.38	0.12
C4	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.10	0.01	0.18	0.01	0.55	0.15	0.24
C4'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.08	0.03	0.08	0.08	0.06	0.05	0.03	0.07	0.01	0.00	0.01	0.08	0.19	0.26	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.01	0.20	0.01	0.65	0.26	0.28
C5'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.11	0.01	0.13	0.00	0.16	0.08	0.16	0.14	0.12	0.12	0.08	0.07	0.01	0.02	0.01	0.18	0.21	0.30	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.13	0.01	0.23	0.00	0.68	0.27	0.32
C8	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.02	0.09	0.01	0.61	0.30	0.19
N1	0.02	0.00	0.09	0.15	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.17	0.01	0.25	0.00	0.63	0.18	0.32
N2	0.03	0.00	0.14	0.19	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.22	0.02	0.24	0.00	0.52	0.10	0.28
N3	0.02	0.00	0.11	0.15	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.16	0.01	0.20	0.01	0.50	0.10	0.24
N7	0.00	0.00	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.07	0.02	0.15	0.01	0.69	0.37	0.26
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.12	0.01	0.49	0.16	0.18
O2'	0.01	0.12	0.00	0.03	0.06	0.07	0.06	0.07	0.08	0.03	0.11	0.14	0.10	0.04	0.02	0.00	0.03	0.05	0.07	0.08	0.26	0.30	0.04
O3'	0.01	0.19	0.01	0.01	0.10	0.01	0.09	0.01	0.13	0.07	0.17	0.22	0.16	0.07	0.04	0.03	0.00	0.01	0.09	0.14	0.39	0.53	0.18
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.02	0.31	0.12	0.09
O5'	0.06	0.23	0.06	0.07	0.18	0.01	0.20	0.01	0.23	0.09	0.25	0.24	0.20	0.15	0.12	0.07	0.09	0.06	0.00	0.25	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.00	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.14	0.02	0.25	0.00	0.74	0.34	0.35
OP1	0.34	0.55	0.18	0.21	0.55	0.19	0.65	0.21	0.68	0.61	0.63	0.52	0.50	0.69	0.49	0.26	0.39	0.31	0.02	0.74	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.11	0.30	0.38	0.15	0.26	0.26	0.30	0.27	0.30	0.18	0.10	0.10	0.37	0.16	0.30	0.53	0.12	0.02	0.34	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.28	0.09	0.12	0.24	0.03	0.28	0.01	0.32	0.19	0.32	0.28	0.24	0.26	0.18	0.04	0.18	0.09	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00