Doublet Group distance statistics: 53752

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N7	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.000, 0.022, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N1	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
N3	A	0, 0.000, 0.031, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.031
C1'	A	0, 0.000, 0.033, 0.067, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C2	A	0, 0.000, 0.034, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.034
O6	A	0, 0.000, 0.048, 0.096, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.048 std_dev=0.048
N2	A	0, 0.000, 0.081, 0.162, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.081 std_dev=0.081
N7	B	0, 0.000, 0.197, 0.393, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.197 std_dev=0.197
C5	B	0, 0.000, 0.206, 0.412, 0.412 max_d=0.412 avg_d=0.206 std_dev=0.206
C6	B	0, 0.000, 0.261, 0.522, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.261 std_dev=0.261
N1	B	0, 0.000, 0.314, 0.628, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.314 std_dev=0.314
C2	B	0, 0.000, 0.350, 0.701, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.350 std_dev=0.350
C4	B	0, 0.000, 0.381, 0.763, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.381 std_dev=0.381
O6	B	0, 0.000, 0.405, 0.810, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.405 std_dev=0.405
C8	B	0, 0.000, 0.417, 0.835, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.417 std_dev=0.417
N2	B	0, 0.000, 0.430, 0.860, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.430 std_dev=0.430
N3	B	0, 0.000, 0.452, 0.904, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.452 std_dev=0.452
OP2	B	0, 0.000, 0.462, 0.924, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.462 std_dev=0.462
O5'	B	0, 0.000, 0.492, 0.983, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.492 std_dev=0.492
N9	B	0, 0.000, 0.528, 1.057, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.528 std_dev=0.528
P	B	0, 0.000, 0.589, 1.179, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.589 std_dev=0.589
O3'	A	0, 0.000, 0.778, 1.556, 1.556 max_d=1.556 avg_d=0.778 std_dev=0.778
C1'	B	0, 0.000, 0.808, 1.617, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.808 std_dev=0.808
OP1	B	0, 0.000, 0.819, 1.638, 1.638 max_d=1.638 avg_d=0.819 std_dev=0.819
O4'	B	0, 0.000, 0.827, 1.653, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.827 std_dev=0.827
C5'	B	0, 0.000, 0.873, 1.746, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.873 std_dev=0.873
C4'	B	0, 0.000, 0.983, 1.965, 1.965 max_d=1.965 avg_d=0.983 std_dev=0.983
C2'	B	0, 0.000, 1.006, 2.012, 2.012 max_d=2.012 avg_d=1.006 std_dev=1.006
C3'	B	0, 0.000, 1.025, 2.050, 2.050 max_d=2.050 avg_d=1.025 std_dev=1.025
C3'	A	0, 0.000, 1.223, 2.446, 2.446 max_d=2.446 avg_d=1.223 std_dev=1.223
O2'	B	0, 0.000, 1.260, 2.520, 2.520 max_d=2.520 avg_d=1.260 std_dev=1.260
O4'	A	0, 0.000, 1.300, 2.599, 2.599 max_d=2.599 avg_d=1.300 std_dev=1.300
O3'	B	0, 0.000, 1.324, 2.648, 2.648 max_d=2.648 avg_d=1.324 std_dev=1.324
C2'	A	0, 0.000, 1.378, 2.756, 2.756 max_d=2.756 avg_d=1.378 std_dev=1.378
C4'	A	0, 0.000, 1.547, 3.095, 3.095 max_d=3.095 avg_d=1.547 std_dev=1.547
O2'	A	0, 0.000, 2.350, 4.701, 4.701 max_d=4.701 avg_d=2.350 std_dev=2.350
C5'	A	0, 0.000, 2.994, 5.988, 5.988 max_d=5.988 avg_d=2.994 std_dev=2.994
O5'	A	0, 0.000, 3.458, 6.916, 6.916 max_d=6.916 avg_d=3.458 std_dev=3.458
P	A	0, 0.000, 4.606, 9.211, 9.211 max_d=9.211 avg_d=4.606 std_dev=4.606
OP2	A	0, 0.000, 4.730, 9.460, 9.460 max_d=9.460 avg_d=4.730 std_dev=4.730
OP1	A	0, 0.000, 5.023, 10.047, 10.047 max_d=10.047 avg_d=5.023 std_dev=5.023

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.00	0.42	0.30	0.27
C2	0.05	0.00	0.30	0.40	0.01	0.56	0.01	1.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.06	0.30	1.18	0.01	1.57	0.98	1.29
C2'	0.01	0.30	0.00	0.00	0.15	0.00	0.07	0.00	0.14	0.17	0.24	0.35	0.31	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.43	0.11	0.85	0.78	0.64
C3'	0.01	0.40	0.00	0.00	0.18	0.01	0.10	0.02	0.18	0.17	0.31	0.48	0.38	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.35	0.15	0.95	0.50	0.53
C4	0.01	0.01	0.15	0.18	0.00	0.27	0.00	0.51	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.02	0.17	0.42	0.00	0.51	0.14	0.37
C4'	0.01	0.56	0.00	0.01	0.27	0.00	0.16	0.01	0.28	0.19	0.45	0.66	0.52	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.24	0.40	0.08	0.07
C5	0.00	0.01	0.07	0.10	0.00	0.16	0.00	0.32	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.10	0.21	0.01	0.42	0.12	0.17
C5'	0.01	1.15	0.00	0.02	0.51	0.01	0.32	0.00	0.58	0.36	0.93	1.43	1.01	0.14	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.50	0.17	0.06	0.02
C6	0.01	0.01	0.14	0.18	0.00	0.28	0.00	0.58	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.03	0.17	0.53	0.00	0.91	0.24	0.56
C8	0.01	0.01	0.17	0.17	0.00	0.19	0.01	0.36	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.61	0.03	0.59	0.95	0.74
N1	0.03	0.01	0.24	0.31	0.01	0.45	0.00	0.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.05	0.25	0.96	0.01	1.43	0.74	1.07
N2	0.07	0.01	0.35	0.48	0.02	0.66	0.02	1.43	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.14	0.11	0.33	1.51	0.01	2.09	1.42	1.75
N3	0.04	0.01	0.31	0.38	0.01	0.52	0.01	1.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.04	0.30	0.98	0.01	1.11	0.73	0.98
N7	0.00	0.01	0.09	0.08	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.34	0.03	0.21	0.74	0.45
N9	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.15	0.01	0.19	0.39	0.24
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.10	0.14	0.09	0.04	0.03	0.00	0.02	0.02	0.47	0.08	1.03	0.96	0.75
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.05	0.11	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.23	0.02	0.98	0.28	0.41
O4'	0.01	0.30	0.01	0.00	0.17	0.00	0.10	0.01	0.17	0.12	0.25	0.33	0.30	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00	0.05	0.14	0.14	0.14	0.04
O5'	0.17	1.18	0.43	0.35	0.42	0.02	0.21	0.01	0.53	0.61	0.96	1.51	0.98	0.34	0.15	0.47	0.23	0.05	0.00	0.45	0.01	0.01	0.01
O6	0.00	0.01	0.11	0.15	0.00	0.24	0.01	0.50	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.14	0.45	0.00	0.90	0.14	0.48
OP1	0.42	1.57	0.85	0.95	0.51	0.40	0.42	0.17	0.91	0.59	1.43	2.09	1.11	0.21	0.19	1.03	0.98	0.14	0.01	0.90	0.00	0.01	0.00
OP2	0.30	0.98	0.78	0.50	0.14	0.08	0.12	0.06	0.24	0.95	0.74	1.42	0.73	0.74	0.39	0.96	0.28	0.14	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01
P	0.27	1.29	0.64	0.53	0.37	0.07	0.17	0.02	0.56	0.74	1.07	1.75	0.98	0.45	0.24	0.75	0.41	0.04	0.01	0.48	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.01	0.09	0.11	0.15	0.04	0.03	0.05	0.04	0.09	0.01	0.11	0.10	0.06	0.02	0.00	0.08	0.23	0.07	0.11	0.12	0.06	0.06	0.06
C2	0.06	0.08	0.15	0.19	0.07	0.10	0.07	0.13	0.08	0.05	0.08	0.09	0.08	0.07	0.06	0.13	0.23	0.03	0.18	0.07	0.15	0.11	0.13
C2'	0.43	0.29	0.48	0.56	0.36	0.54	0.34	0.60	0.27	0.42	0.26	0.27	0.34	0.39	0.40	0.47	0.60	0.46	0.65	0.23	0.61	0.63	0.65
C3'	0.55	0.40	0.66	0.75	0.47	0.69	0.45	0.75	0.38	0.54	0.36	0.38	0.45	0.50	0.52	0.64	0.83	0.56	0.80	0.32	0.80	0.80	0.81
C4	0.02	0.10	0.13	0.17	0.06	0.07	0.08	0.09	0.12	0.02	0.12	0.12	0.08	0.05	0.03	0.11	0.23	0.02	0.16	0.14	0.12	0.09	0.11
C4'	0.65	0.57	0.86	0.97	0.62	0.80	0.60	0.84	0.56	0.65	0.55	0.56	0.61	0.63	0.64	0.82	1.10	0.61	0.91	0.52	0.94	0.90	0.89
C5	0.02	0.12	0.12	0.16	0.07	0.06	0.09	0.08	0.14	0.02	0.14	0.14	0.09	0.05	0.04	0.10	0.21	0.03	0.15	0.18	0.12	0.08	0.09
C5'	1.41	1.09	1.67	1.85	1.25	1.66	1.20	1.74	1.05	1.39	1.01	1.05	1.21	1.30	1.36	1.62	2.02	1.40	1.82	0.93	1.94	1.85	1.84
C6	0.02	0.11	0.11	0.14	0.07	0.06	0.08	0.08	0.13	0.02	0.14	0.13	0.09	0.05	0.04	0.09	0.18	0.01	0.15	0.18	0.12	0.06	0.09
C8	0.01	0.14	0.14	0.17	0.08	0.05	0.10	0.07	0.15	0.02	0.17	0.16	0.10	0.06	0.04	0.10	0.24	0.04	0.15	0.19	0.11	0.08	0.09
N1	0.05	0.10	0.13	0.16	0.08	0.08	0.08	0.10	0.10	0.04	0.10	0.10	0.09	0.06	0.05	0.11	0.19	0.02	0.16	0.10	0.13	0.07	0.10
N2	0.10	0.08	0.18	0.21	0.09	0.15	0.08	0.17	0.06	0.09	0.07	0.08	0.09	0.08	0.09	0.16	0.26	0.07	0.21	0.03	0.16	0.13	0.16
N3	0.04	0.08	0.14	0.19	0.06	0.09	0.07	0.11	0.09	0.04	0.09	0.09	0.07	0.05	0.04	0.12	0.24	0.00	0.17	0.09	0.13	0.11	0.13
N7	0.02	0.14	0.13	0.16	0.08	0.05	0.10	0.07	0.16	0.02	0.17	0.17	0.10	0.06	0.04	0.10	0.22	0.03	0.15	0.21	0.12	0.08	0.09
N9	0.01	0.12	0.13	0.17	0.07	0.05	0.08	0.07	0.13	0.02	0.14	0.14	0.09	0.05	0.03	0.10	0.24	0.04	0.14	0.16	0.10	0.08	0.09
O2'	0.04	0.06	0.00	0.03	0.02	0.10	0.04	0.16	0.08	0.02	0.08	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.19	0.11	0.09	0.16	0.20
O3'	0.01	0.03	0.07	0.11	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.06	0.17	0.03	0.10	0.03	0.04	0.08	0.09
O4'	0.29	0.37	0.51	0.59	0.34	0.37	0.35	0.38	0.38	0.30	0.38	0.38	0.35	0.33	0.31	0.46	0.71	0.20	0.46	0.39	0.47	0.43	0.41
O5'	1.58	1.18	1.89	2.09	1.38	1.87	1.30	1.94	1.11	1.53	1.07	1.12	1.32	1.41	1.51	1.84	2.29	1.57	2.00	0.95	2.17	2.00	2.02
O6	0.00	0.11	0.08	0.10	0.06	0.03	0.07	0.05	0.14	0.00	0.15	0.13	0.08	0.03	0.02	0.06	0.14	0.03	0.12	0.21	0.10	0.03	0.06
OP1	2.72	2.06	3.09	3.33	2.34	3.09	2.15	3.14	1.84	2.52	1.84	2.01	2.30	2.27	2.55	3.07	3.58	2.73	3.11	1.54	3.30	2.99	3.09
OP2	1.76	1.10	2.15	2.44	1.39	2.18	1.24	2.28	0.95	1.60	0.91	1.03	1.33	1.38	1.60	2.12	2.73	1.78	2.27	0.70	2.63	2.25	2.34
P	2.07	1.46	2.43	2.70	1.73	2.46	1.59	2.56	1.31	1.94	1.28	1.39	1.67	1.73	1.93	2.40	2.96	2.09	2.57	1.07	2.85	2.55	2.61

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.09	0.05	0.02
C2	0.02	0.00	0.08	0.08	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.11	0.01	0.02	0.01	0.06	0.03	0.01
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.06	0.11	0.08	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.14	0.01	0.01
C3'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.05	0.11	0.07	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.17	0.04	0.03
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.08	0.03	0.00
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.07	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.02	0.01
C5	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.02
C5'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.03
C8	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.01	0.10	0.01	0.10	0.03	0.02
N1	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01
N2	0.03	0.00	0.11	0.11	0.01	0.07	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.16	0.02	0.00	0.02	0.05	0.04	0.03
N3	0.02	0.00	0.08	0.07	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.10	0.01	0.02	0.01	0.07	0.04	0.02
N7	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.10	0.01	0.10	0.00	0.04
N9	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.09	0.04	0.01
O2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.11	0.07	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.14	0.00	0.00
O3'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.07	0.16	0.10	0.06	0.00	0.03	0.00	0.01	0.06	0.01	0.21	0.08	0.06
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.09	0.05
O5'	0.03	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.07	0.00	0.06	0.10	0.04	0.00	0.02	0.10	0.05	0.02	0.06	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.01	0.04
OP1	0.09	0.06	0.14	0.17	0.08	0.12	0.09	0.10	0.08	0.10	0.07	0.05	0.07	0.10	0.09	0.14	0.21	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.03	0.01	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.08	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00