Doublet Group distance statistics: 53754

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 8, 20, 24, 16, 15, 7, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.017, 0.025, 0.034, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.025 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.012, 0.020, 0.029, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.020 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.012, 0.023, 0.033, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.023 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.014, 0.025, 0.037, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.025 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.021, 0.033, 0.044, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.033 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.024, 0.036, 0.049, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.036 std_dev=0.013
N4	A	0, 0.019, 0.048, 0.077, 0.184 max_d=0.184 avg_d=0.048 std_dev=0.029
O2	A	0, 0.074, 0.105, 0.136, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.105 std_dev=0.031
C2'	A	0, 0.039, 0.162, 0.285, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.162 std_dev=0.123
O4'	A	0, 0.048, 0.178, 0.309, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.178 std_dev=0.131
O2'	A	0, 0.088, 0.244, 0.400, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.244 std_dev=0.156
C4	B	0, 0.319, 0.499, 0.680, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.499 std_dev=0.181
C4'	A	0, 0.073, 0.256, 0.439, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.256 std_dev=0.183
N1	B	0, 0.239, 0.422, 0.606, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.422 std_dev=0.184
N3	B	0, 0.365, 0.556, 0.747, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.556 std_dev=0.191
C6	B	0, 0.217, 0.410, 0.602, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.410 std_dev=0.192
C3'	A	0, 0.064, 0.262, 0.459, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.262 std_dev=0.197
C5	B	0, 0.238, 0.440, 0.642, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.440 std_dev=0.202
C1'	B	0, 0.268, 0.470, 0.672, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.470 std_dev=0.202
O4'	B	0, 0.224, 0.429, 0.634, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.429 std_dev=0.205
C2	B	0, 0.305, 0.525, 0.746, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.525 std_dev=0.221
O4	B	0, 0.373, 0.594, 0.815, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.594 std_dev=0.221
C4'	B	0, 0.232, 0.480, 0.727, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.480 std_dev=0.247
O5'	B	0, 0.205, 0.456, 0.708, 1.542 max_d=1.542 avg_d=0.456 std_dev=0.251
C2'	B	0, 0.317, 0.574, 0.831, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.574 std_dev=0.257
C3'	B	0, 0.310, 0.567, 0.824, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.567 std_dev=0.257
P	B	0, 0.156, 0.433, 0.709, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.433 std_dev=0.277
O3'	A	0, 0.116, 0.397, 0.678, 1.962 max_d=1.962 avg_d=0.397 std_dev=0.281
O2	B	0, 0.364, 0.657, 0.950, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.657 std_dev=0.293
C5'	B	0, 0.203, 0.501, 0.800, 2.014 max_d=2.014 avg_d=0.501 std_dev=0.299
C5'	A	0, 0.140, 0.468, 0.796, 2.334 max_d=2.334 avg_d=0.468 std_dev=0.328
OP2	B	0, 0.147, 0.491, 0.835, 2.413 max_d=2.413 avg_d=0.491 std_dev=0.344
OP1	B	0, 0.194, 0.553, 0.913, 2.163 max_d=2.163 avg_d=0.553 std_dev=0.359
O3'	B	0, 0.364, 0.728, 1.092, 2.441 max_d=2.441 avg_d=0.728 std_dev=0.364
P	A	0, 0.257, 0.625, 0.994, 2.539 max_d=2.539 avg_d=0.625 std_dev=0.368
O5'	A	0, 0.156, 0.530, 0.904, 2.206 max_d=2.206 avg_d=0.530 std_dev=0.374
O2'	B	0, 0.350, 0.727, 1.104, 2.635 max_d=2.635 avg_d=0.727 std_dev=0.377
OP1	A	0, 0.381, 0.761, 1.141, 2.338 max_d=2.338 avg_d=0.761 std_dev=0.380
OP2	A	0, 0.245, 0.698, 1.151, 3.571 max_d=3.571 avg_d=0.698 std_dev=0.453

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.12	0.10	0.26	0.11
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.02	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.08	0.03	0.20	0.14	0.27	0.14
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.03	0.05	0.06	0.10	0.00	0.02	0.01	0.13	0.20	0.21	0.10
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.09	0.00	0.11	0.02	0.11	0.05	0.08	0.10	0.11	0.02	0.01	0.01	0.17	0.27	0.19	0.15
C4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.11	0.03	0.27	0.21	0.30	0.21
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.06	0.08	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.13	0.21	0.06
C5	0.02	0.02	0.06	0.11	0.01	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.13	0.05	0.29	0.21	0.31	0.21
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.16	0.01	0.17	0.00	0.14	0.09	0.13	0.18	0.08	0.06	0.03	0.01	0.01	0.16	0.21	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.12	0.04	0.26	0.16	0.28	0.16
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.02	0.20	0.12	0.27	0.13
N3	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.01	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.03	0.24	0.18	0.29	0.18
N4	0.02	0.02	0.06	0.10	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.12	0.04	0.29	0.25	0.32	0.24
O2	0.04	0.01	0.10	0.11	0.02	0.05	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.12	0.13	0.05	0.16	0.12	0.27	0.12
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.05	0.03	0.08	0.07	0.12	0.00	0.04	0.05	0.07	0.18	0.22	0.08
O3'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.11	0.02	0.13	0.03	0.12	0.05	0.09	0.12	0.13	0.04	0.00	0.02	0.17	0.36	0.22	0.19
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.00	0.12	0.13	0.29	0.16
O5'	0.12	0.20	0.13	0.17	0.27	0.02	0.29	0.01	0.26	0.20	0.24	0.29	0.16	0.07	0.17	0.12	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.10	0.14	0.20	0.27	0.21	0.13	0.21	0.16	0.16	0.12	0.18	0.25	0.12	0.18	0.36	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.26	0.27	0.21	0.19	0.30	0.21	0.31	0.21	0.28	0.27	0.29	0.32	0.27	0.22	0.22	0.29	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.14	0.10	0.15	0.21	0.06	0.21	0.02	0.16	0.13	0.18	0.24	0.12	0.08	0.19	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.22	0.20	0.19	0.23	0.21	0.22	0.24	0.17	0.18	0.22	0.27	0.27	0.18	0.28	0.23	0.19	0.08	0.11	0.06
C2	0.25	0.24	0.22	0.20	0.22	0.21	0.21	0.22	0.19	0.20	0.24	0.30	0.29	0.18	0.27	0.23	0.18	0.11	0.20	0.10
C2'	0.19	0.19	0.17	0.18	0.22	0.19	0.22	0.25	0.18	0.17	0.20	0.22	0.23	0.18	0.25	0.21	0.22	0.12	0.11	0.10
C3'	0.16	0.19	0.14	0.16	0.26	0.13	0.26	0.17	0.20	0.17	0.22	0.19	0.16	0.17	0.29	0.18	0.08	0.03	0.08	0.02
C4	0.24	0.23	0.22	0.22	0.19	0.21	0.20	0.22	0.21	0.21	0.23	0.28	0.25	0.18	0.26	0.24	0.21	0.16	0.29	0.17
C4'	0.16	0.20	0.13	0.15	0.28	0.12	0.28	0.18	0.20	0.16	0.24	0.21	0.17	0.15	0.33	0.17	0.07	0.10	0.17	0.08
C5	0.24	0.22	0.20	0.23	0.21	0.22	0.20	0.23	0.21	0.21	0.23	0.26	0.23	0.19	0.28	0.25	0.23	0.18	0.31	0.20
C5'	0.19	0.26	0.19	0.21	0.37	0.14	0.36	0.16	0.27	0.23	0.32	0.25	0.19	0.23	0.43	0.19	0.12	0.19	0.30	0.16
C6	0.24	0.22	0.19	0.21	0.22	0.22	0.20	0.23	0.19	0.20	0.22	0.25	0.23	0.19	0.29	0.25	0.23	0.15	0.27	0.17
N1	0.24	0.22	0.20	0.19	0.23	0.21	0.21	0.22	0.18	0.19	0.23	0.27	0.26	0.17	0.28	0.24	0.19	0.09	0.19	0.09
N3	0.25	0.24	0.23	0.21	0.20	0.21	0.20	0.22	0.20	0.20	0.24	0.30	0.28	0.18	0.26	0.23	0.19	0.13	0.25	0.13
N4	0.25	0.25	0.23	0.24	0.19	0.22	0.22	0.23	0.23	0.23	0.24	0.29	0.26	0.20	0.24	0.24	0.23	0.19	0.33	0.19
O2	0.28	0.27	0.26	0.22	0.24	0.23	0.24	0.25	0.22	0.22	0.26	0.33	0.35	0.22	0.28	0.24	0.20	0.17	0.18	0.12
O2'	0.25	0.23	0.25	0.26	0.22	0.28	0.22	0.33	0.20	0.21	0.22	0.27	0.32	0.27	0.24	0.26	0.28	0.19	0.11	0.14
O3'	0.15	0.17	0.15	0.18	0.25	0.13	0.25	0.17	0.20	0.16	0.21	0.17	0.17	0.21	0.28	0.18	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.20	0.20	0.15	0.15	0.26	0.16	0.25	0.20	0.18	0.16	0.23	0.24	0.22	0.14	0.32	0.20	0.12	0.06	0.14	0.04
O5'	0.26	0.31	0.26	0.27	0.38	0.22	0.37	0.22	0.31	0.29	0.35	0.31	0.26	0.28	0.43	0.26	0.22	0.22	0.27	0.19
OP1	0.34	0.36	0.37	0.40	0.43	0.34	0.41	0.35	0.37	0.35	0.40	0.35	0.36	0.44	0.48	0.35	0.38	0.46	0.48	0.41
OP2	0.35	0.39	0.36	0.39	0.45	0.31	0.43	0.28	0.38	0.37	0.43	0.38	0.36	0.41	0.50	0.34	0.30	0.31	0.38	0.28
P	0.27	0.31	0.28	0.30	0.40	0.22	0.38	0.21	0.32	0.29	0.36	0.30	0.27	0.32	0.46	0.26	0.24	0.27	0.34	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.10	0.02	0.01	0.07	0.14	0.17	0.08
C2	0.02	0.00	0.09	0.11	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.10	0.01	0.04	0.14	0.13	0.27	0.14
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.08	0.08	0.02	0.07	0.16	0.01	0.02	0.05	0.01	0.14	0.17	0.23	0.14
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.15	0.01	0.16	0.02	0.15	0.09	0.13	0.13	0.02	0.01	0.16	0.01	0.17	0.15	0.16	0.13
C4	0.02	0.01	0.04	0.15	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.01	0.04	0.21	0.22	0.38	0.25
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.05	0.06	0.11	0.02	0.08	0.00	0.02	0.15	0.11	0.06
C5	0.02	0.01	0.07	0.16	0.01	0.10	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.15	0.01	0.06	0.22	0.23	0.38	0.26
C5'	0.05	0.09	0.08	0.02	0.15	0.01	0.17	0.00	0.15	0.09	0.12	0.08	0.06	0.08	0.16	0.01	0.01	0.10	0.12	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.13	0.02	0.06	0.19	0.17	0.30	0.19
N1	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.06	0.02	0.02	0.13	0.12	0.24	0.13
N3	0.02	0.00	0.07	0.13	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.10	0.01	0.04	0.17	0.17	0.33	0.19
O2	0.04	0.00	0.16	0.13	0.01	0.06	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.15	0.18	0.02	0.08	0.12	0.14	0.24	0.12
O2'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.11	0.11	0.13	0.06	0.12	0.06	0.10	0.15	0.00	0.05	0.12	0.07	0.11	0.23	0.21	0.13
O3'	0.10	0.10	0.02	0.01	0.12	0.02	0.15	0.08	0.13	0.06	0.10	0.18	0.05	0.00	0.14	0.08	0.21	0.27	0.21	0.20
O4	0.02	0.01	0.05	0.16	0.01	0.08	0.01	0.16	0.02	0.02	0.01	0.02	0.12	0.14	0.00	0.04	0.22	0.26	0.42	0.28
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.04	0.08	0.07	0.08	0.04	0.00	0.11	0.18	0.16	0.12
O5'	0.07	0.14	0.14	0.17	0.21	0.02	0.22	0.01	0.19	0.13	0.17	0.12	0.11	0.21	0.22	0.11	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.14	0.13	0.17	0.15	0.22	0.15	0.23	0.10	0.17	0.12	0.17	0.14	0.23	0.27	0.26	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.17	0.27	0.23	0.16	0.38	0.11	0.38	0.12	0.30	0.24	0.33	0.24	0.21	0.21	0.42	0.16	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.14	0.14	0.13	0.25	0.06	0.26	0.02	0.19	0.13	0.19	0.12	0.13	0.20	0.28	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00