Doublet Group distance statistics: 53755

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 6, 20, 23, 6, 7, 4, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.015, 0.021, 0.026, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.021 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.012, 0.020, 0.027, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.020 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.030, 0.037, 0.045, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.037 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.018, 0.026, 0.033, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.026 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.020, 0.029, 0.037, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.029 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.010, 0.020, 0.029, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.021, 0.032, 0.042, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.032 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.068, 0.091, 0.114, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.091 std_dev=0.023
N4	A	0, 0.012, 0.041, 0.069, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.041 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.045, 0.128, 0.212, 0.416 max_d=0.416 avg_d=0.128 std_dev=0.083
C2'	A	0, 0.077, 0.169, 0.261, 0.468 max_d=0.468 avg_d=0.169 std_dev=0.092
O2'	A	0, 0.089, 0.209, 0.328, 0.508 max_d=0.508 avg_d=0.209 std_dev=0.119
C3'	A	0, 0.136, 0.282, 0.429, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.282 std_dev=0.146
C4'	A	0, 0.082, 0.243, 0.404, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.243 std_dev=0.161
C6	B	0, 0.198, 0.367, 0.537, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.367 std_dev=0.169
N1	B	0, 0.261, 0.433, 0.605, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.433 std_dev=0.172
O5'	A	0, 0.119, 0.330, 0.542, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.330 std_dev=0.211
C5	B	0, 0.151, 0.363, 0.574, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.363 std_dev=0.212
C2	B	0, 0.300, 0.518, 0.737, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.518 std_dev=0.219
O3'	A	0, 0.193, 0.421, 0.648, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.421 std_dev=0.227
C5'	A	0, 0.098, 0.326, 0.554, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.326 std_dev=0.228
N3	B	0, 0.254, 0.483, 0.712, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.483 std_dev=0.229
O4'	B	0, 0.272, 0.508, 0.744, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.508 std_dev=0.236
C4	B	0, 0.162, 0.401, 0.640, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.401 std_dev=0.239
C1'	B	0, 0.290, 0.538, 0.786, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.538 std_dev=0.248
O5'	B	0, 0.279, 0.554, 0.829, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.554 std_dev=0.275
P	B	0, 0.258, 0.536, 0.815, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.536 std_dev=0.279
C4'	B	0, 0.255, 0.540, 0.825, 1.345 max_d=1.345 avg_d=0.540 std_dev=0.285
C5'	B	0, 0.344, 0.633, 0.922, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.633 std_dev=0.289
P	A	0, 0.195, 0.496, 0.796, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.496 std_dev=0.300
OP2	B	0, 0.342, 0.646, 0.950, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.646 std_dev=0.304
O2	B	0, 0.385, 0.691, 0.997, 1.788 max_d=1.788 avg_d=0.691 std_dev=0.306
O4	B	0, 0.226, 0.536, 0.846, 1.642 max_d=1.642 avg_d=0.536 std_dev=0.310
C3'	B	0, 0.256, 0.608, 0.960, 1.912 max_d=1.912 avg_d=0.608 std_dev=0.352
C2'	B	0, 0.294, 0.656, 1.018, 1.953 max_d=1.953 avg_d=0.656 std_dev=0.362
OP1	B	0, 0.384, 0.756, 1.129, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.756 std_dev=0.373
OP2	A	0, 0.166, 0.579, 0.991, 2.180 max_d=2.180 avg_d=0.579 std_dev=0.412
O3'	B	0, 0.319, 0.750, 1.181, 2.508 max_d=2.508 avg_d=0.750 std_dev=0.431
O2'	B	0, 0.391, 0.828, 1.265, 2.328 max_d=2.328 avg_d=0.828 std_dev=0.437
OP1	A	0, 0.179, 0.649, 1.118, 3.003 max_d=3.003 avg_d=0.649 std_dev=0.470

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.10	0.13	0.15	0.11
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.15	0.20	0.26	0.18
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.05	0.10	0.00	0.02	0.01	0.06	0.17	0.11	0.08
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.01	0.09	0.02	0.09	0.05	0.07	0.08	0.09	0.02	0.01	0.01	0.06	0.21	0.12	0.09
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.03	0.19	0.28	0.35	0.24
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.04	0.07	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.12	0.09	0.03
C5	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.04	0.20	0.28	0.34	0.24
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.15	0.01	0.17	0.00	0.14	0.09	0.12	0.16	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.13	0.12	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.10	0.03	0.18	0.22	0.27	0.20
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.15	0.18	0.23	0.17
N3	0.02	0.00	0.06	0.07	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.17	0.24	0.31	0.21
N4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.07	0.01	0.16	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.04	0.20	0.31	0.38	0.26
O2	0.03	0.01	0.10	0.09	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.12	0.04	0.13	0.18	0.24	0.16
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.03	0.07	0.06	0.11	0.00	0.04	0.04	0.04	0.18	0.10	0.06
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.09	0.02	0.11	0.03	0.10	0.05	0.09	0.11	0.12	0.04	0.00	0.02	0.11	0.31	0.23	0.17
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.04	0.02	0.00	0.11	0.12	0.15	0.12
O5'	0.10	0.15	0.06	0.06	0.19	0.02	0.20	0.01	0.18	0.15	0.17	0.20	0.13	0.04	0.11	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.20	0.17	0.21	0.28	0.12	0.28	0.13	0.22	0.18	0.24	0.31	0.18	0.18	0.31	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.26	0.11	0.12	0.35	0.09	0.34	0.12	0.27	0.23	0.31	0.38	0.24	0.10	0.23	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.18	0.08	0.09	0.24	0.03	0.24	0.02	0.20	0.17	0.21	0.26	0.16	0.06	0.17	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.26	0.20	0.16	0.20	0.19	0.21	0.20	0.15	0.18	0.23	0.36	0.28	0.17	0.24	0.23	0.16	0.05	0.08	0.04
C2	0.26	0.25	0.24	0.22	0.17	0.25	0.20	0.26	0.18	0.18	0.22	0.36	0.31	0.22	0.23	0.27	0.23	0.12	0.14	0.11
C2'	0.24	0.26	0.19	0.15	0.20	0.18	0.21	0.20	0.16	0.19	0.23	0.33	0.26	0.16	0.23	0.23	0.17	0.08	0.08	0.07
C3'	0.22	0.22	0.15	0.10	0.19	0.14	0.20	0.11	0.15	0.18	0.19	0.26	0.20	0.12	0.22	0.24	0.08	0.03	0.06	0.02
C4	0.27	0.26	0.24	0.23	0.15	0.25	0.21	0.24	0.21	0.23	0.21	0.33	0.28	0.23	0.22	0.27	0.21	0.14	0.22	0.15
C4'	0.23	0.23	0.17	0.10	0.21	0.15	0.22	0.11	0.16	0.18	0.21	0.30	0.24	0.12	0.25	0.24	0.07	0.08	0.10	0.04
C5	0.23	0.23	0.19	0.20	0.16	0.21	0.18	0.21	0.17	0.19	0.21	0.29	0.22	0.20	0.24	0.24	0.19	0.16	0.25	0.16
C5'	0.23	0.25	0.17	0.11	0.28	0.15	0.28	0.08	0.21	0.21	0.25	0.29	0.21	0.12	0.33	0.25	0.07	0.16	0.16	0.10
C6	0.22	0.22	0.17	0.18	0.18	0.20	0.19	0.20	0.14	0.17	0.21	0.29	0.22	0.19	0.25	0.23	0.17	0.13	0.21	0.14
N1	0.23	0.24	0.19	0.16	0.18	0.20	0.20	0.21	0.14	0.16	0.21	0.33	0.25	0.17	0.23	0.23	0.18	0.07	0.14	0.07
N3	0.30	0.26	0.27	0.25	0.16	0.28	0.21	0.27	0.22	0.23	0.21	0.36	0.32	0.25	0.23	0.30	0.24	0.14	0.18	0.14
N4	0.31	0.31	0.28	0.27	0.21	0.27	0.24	0.25	0.25	0.28	0.27	0.37	0.31	0.27	0.24	0.29	0.23	0.17	0.25	0.17
O2	0.28	0.27	0.28	0.25	0.20	0.29	0.21	0.31	0.20	0.18	0.25	0.41	0.37	0.27	0.25	0.29	0.27	0.19	0.13	0.15
O2'	0.29	0.31	0.27	0.22	0.23	0.23	0.23	0.25	0.20	0.25	0.27	0.39	0.34	0.24	0.24	0.26	0.20	0.13	0.07	0.10
O3'	0.23	0.20	0.16	0.09	0.17	0.15	0.17	0.08	0.15	0.18	0.18	0.24	0.20	0.11	0.19	0.26	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.23	0.24	0.18	0.12	0.20	0.17	0.22	0.15	0.15	0.17	0.22	0.33	0.26	0.14	0.26	0.23	0.11	0.05	0.10	0.03
O5'	0.25	0.29	0.20	0.18	0.33	0.17	0.31	0.14	0.24	0.25	0.31	0.31	0.22	0.20	0.38	0.25	0.14	0.19	0.20	0.15
OP1	0.37	0.38	0.39	0.40	0.44	0.37	0.42	0.37	0.37	0.37	0.41	0.39	0.39	0.44	0.50	0.39	0.39	0.50	0.48	0.43
OP2	0.33	0.42	0.34	0.34	0.51	0.28	0.45	0.26	0.37	0.37	0.48	0.43	0.33	0.37	0.59	0.31	0.29	0.38	0.37	0.31
P	0.28	0.34	0.27	0.27	0.41	0.23	0.37	0.21	0.30	0.30	0.38	0.35	0.27	0.30	0.48	0.29	0.23	0.31	0.33	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.08	0.15	0.11
C2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.03	0.02	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.09	0.01	0.03	0.10	0.11	0.16	0.12
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.03	0.08	0.02	0.05	0.12	0.01	0.02	0.06	0.01	0.08	0.13	0.17	0.11
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.01	0.09	0.02	0.08	0.06	0.09	0.12	0.02	0.01	0.09	0.01	0.07	0.15	0.13	0.09
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.00	0.03	0.14	0.15	0.18	0.15
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.05	0.04	0.08	0.03	0.06	0.00	0.01	0.06	0.06	0.04
C5	0.02	0.02	0.07	0.09	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.11	0.01	0.04	0.15	0.15	0.18	0.15
C5'	0.02	0.06	0.03	0.02	0.10	0.01	0.12	0.00	0.10	0.06	0.08	0.05	0.06	0.06	0.11	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.08	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.01	0.05	0.12	0.12	0.16	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.02	0.09	0.10	0.15	0.12
N3	0.02	0.00	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.10	0.01	0.03	0.12	0.13	0.17	0.13
O2	0.04	0.00	0.12	0.12	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.13	0.02	0.06	0.09	0.10	0.16	0.13
O2'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.11	0.08	0.11	0.06	0.09	0.05	0.10	0.11	0.00	0.04	0.12	0.05	0.05	0.11	0.15	0.08
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.10	0.03	0.11	0.06	0.10	0.05	0.10	0.13	0.04	0.00	0.11	0.02	0.12	0.23	0.19	0.15
O4	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.11	0.00	0.04	0.15	0.17	0.20	0.17
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.03	0.06	0.05	0.02	0.04	0.00	0.07	0.10	0.17	0.15
O5'	0.06	0.10	0.08	0.07	0.14	0.01	0.15	0.01	0.12	0.09	0.12	0.09	0.05	0.12	0.15	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.11	0.13	0.15	0.15	0.06	0.15	0.05	0.12	0.10	0.13	0.10	0.11	0.23	0.17	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.16	0.17	0.13	0.18	0.06	0.18	0.02	0.16	0.15	0.17	0.16	0.15	0.19	0.20	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.12	0.11	0.09	0.15	0.04	0.15	0.01	0.13	0.12	0.13	0.13	0.08	0.15	0.17	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00