Doublet Group distance statistics: 53758

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 1, 7, 6, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.007, 0.015, 0.024, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.013, 0.021, 0.030, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.021 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.002, 0.012, 0.023, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.003, 0.013, 0.024, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.013 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.027, 0.045, 0.063, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.045 std_dev=0.018
N4	A	0, 0.025, 0.045, 0.065, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.045 std_dev=0.020
O4'	A	0, 0.052, 0.134, 0.215, 0.326 max_d=0.326 avg_d=0.134 std_dev=0.081
C2'	A	0, 0.063, 0.173, 0.283, 0.395 max_d=0.395 avg_d=0.173 std_dev=0.110
C4'	A	0, 0.084, 0.214, 0.345, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.214 std_dev=0.131
O2'	A	0, 0.100, 0.242, 0.384, 0.521 max_d=0.521 avg_d=0.242 std_dev=0.142
C3'	A	0, 0.108, 0.260, 0.411, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.260 std_dev=0.152
N1	B	0, 0.264, 0.425, 0.586, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.425 std_dev=0.161
C1'	B	0, 0.347, 0.546, 0.745, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.546 std_dev=0.199
O4'	B	0, 0.366, 0.568, 0.771, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.568 std_dev=0.202
C2	B	0, 0.300, 0.508, 0.717, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.508 std_dev=0.208
C6	B	0, 0.128, 0.343, 0.558, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.343 std_dev=0.215
C5'	A	0, 0.134, 0.354, 0.574, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.354 std_dev=0.220
O5'	B	0, 0.300, 0.528, 0.756, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.528 std_dev=0.228
C5	B	0, 0.117, 0.352, 0.586, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.352 std_dev=0.234
N3	B	0, 0.236, 0.472, 0.708, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.472 std_dev=0.236
C4	B	0, 0.159, 0.396, 0.633, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.396 std_dev=0.237
O3'	A	0, 0.171, 0.408, 0.645, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.408 std_dev=0.237
C4'	B	0, 0.371, 0.623, 0.875, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.623 std_dev=0.252
C2'	B	0, 0.349, 0.601, 0.853, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.601 std_dev=0.252
P	B	0, 0.293, 0.555, 0.817, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.555 std_dev=0.262
O2	B	0, 0.410, 0.684, 0.958, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.684 std_dev=0.274
O4	B	0, 0.267, 0.547, 0.827, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.547 std_dev=0.280
C3'	B	0, 0.282, 0.567, 0.853, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.567 std_dev=0.286
OP2	B	0, 0.311, 0.597, 0.883, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.597 std_dev=0.286
C5'	B	0, 0.306, 0.656, 1.007, 1.530 max_d=1.530 avg_d=0.656 std_dev=0.351
O2'	B	0, 0.390, 0.745, 1.100, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.745 std_dev=0.355
O3'	B	0, 0.341, 0.709, 1.077, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.709 std_dev=0.368
OP1	B	0, 0.343, 0.728, 1.113, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.728 std_dev=0.385
O5'	A	0, -0.072, 0.387, 0.846, 2.301 max_d=2.301 avg_d=0.387 std_dev=0.459
P	A	0, -0.032, 0.508, 1.047, 2.670 max_d=2.670 avg_d=0.508 std_dev=0.540
OP2	A	0, 0.011, 0.563, 1.115, 2.735 max_d=2.735 avg_d=0.563 std_dev=0.552
OP1	A	0, 0.026, 0.616, 1.205, 2.881 max_d=2.881 avg_d=0.616 std_dev=0.589

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.10	0.11	0.13	0.09
C2	0.03	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.02	0.24	0.24	0.24	0.23
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.06	0.05	0.11	0.00	0.01	0.01	0.15	0.19	0.09	0.13
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.09	0.04	0.07	0.08	0.11	0.01	0.01	0.01	0.21	0.26	0.11	0.18
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.09	0.03	0.35	0.36	0.39	0.36
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.04	0.05	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.10	0.13	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.03	0.36	0.35	0.37	0.36
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.09	0.01	0.12	0.00	0.10	0.05	0.07	0.11	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.12	0.19	0.02
C6	0.01	0.02	0.04	0.09	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.10	0.03	0.30	0.27	0.26	0.27
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.02	0.22	0.20	0.20	0.20
N3	0.03	0.01	0.06	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.02	0.30	0.31	0.33	0.30
N4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.03	0.38	0.41	0.45	0.41
O2	0.04	0.01	0.11	0.11	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.13	0.04	0.19	0.20	0.20	0.18
O2'	0.02	0.08	0.00	0.01	0.06	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.08	0.06	0.12	0.00	0.03	0.03	0.05	0.13	0.08	0.05
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.09	0.02	0.11	0.02	0.10	0.04	0.08	0.10	0.13	0.03	0.00	0.01	0.19	0.31	0.17	0.21
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.10	0.10	0.20	0.12
O5'	0.10	0.24	0.15	0.21	0.35	0.01	0.36	0.01	0.30	0.22	0.30	0.38	0.19	0.05	0.19	0.10	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.11	0.24	0.19	0.26	0.36	0.10	0.35	0.12	0.27	0.20	0.31	0.41	0.20	0.13	0.31	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.24	0.09	0.11	0.39	0.13	0.37	0.19	0.26	0.20	0.33	0.45	0.20	0.08	0.17	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.23	0.13	0.18	0.36	0.02	0.36	0.02	0.27	0.20	0.30	0.41	0.18	0.05	0.21	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.17	0.16	0.18	0.22	0.18	0.25	0.23	0.22	0.15	0.19	0.21	0.20	0.19	0.26	0.18	0.12	0.05	0.10	0.04
C2	0.19	0.19	0.17	0.15	0.17	0.17	0.18	0.15	0.17	0.14	0.19	0.24	0.22	0.16	0.22	0.19	0.12	0.08	0.19	0.09
C2'	0.15	0.16	0.16	0.20	0.23	0.18	0.26	0.24	0.22	0.15	0.19	0.17	0.18	0.21	0.26	0.17	0.14	0.07	0.10	0.07
C3'	0.16	0.20	0.17	0.22	0.30	0.16	0.32	0.19	0.26	0.20	0.25	0.19	0.15	0.22	0.34	0.17	0.05	0.02	0.07	0.01
C4	0.21	0.24	0.19	0.15	0.18	0.16	0.17	0.14	0.17	0.18	0.25	0.30	0.23	0.15	0.24	0.20	0.17	0.14	0.25	0.15
C4'	0.15	0.19	0.16	0.22	0.29	0.17	0.31	0.23	0.25	0.18	0.24	0.18	0.15	0.23	0.34	0.17	0.04	0.05	0.11	0.04
C5	0.19	0.23	0.17	0.15	0.23	0.15	0.21	0.14	0.19	0.18	0.26	0.28	0.20	0.15	0.29	0.19	0.18	0.16	0.26	0.17
C5'	0.17	0.22	0.18	0.22	0.34	0.16	0.35	0.18	0.28	0.21	0.28	0.20	0.16	0.23	0.40	0.18	0.06	0.11	0.18	0.10
C6	0.17	0.20	0.16	0.15	0.24	0.15	0.25	0.15	0.21	0.17	0.23	0.24	0.18	0.15	0.30	0.18	0.16	0.13	0.22	0.14
N1	0.17	0.18	0.15	0.15	0.21	0.16	0.23	0.15	0.20	0.15	0.20	0.22	0.19	0.16	0.26	0.18	0.12	0.06	0.16	0.08
N3	0.21	0.22	0.20	0.16	0.16	0.17	0.16	0.14	0.15	0.17	0.21	0.29	0.25	0.16	0.22	0.21	0.14	0.11	0.22	0.12
N4	0.22	0.27	0.21	0.16	0.17	0.17	0.18	0.16	0.17	0.20	0.27	0.34	0.26	0.16	0.22	0.21	0.19	0.17	0.27	0.17
O2	0.19	0.18	0.19	0.18	0.18	0.21	0.18	0.20	0.16	0.13	0.19	0.24	0.25	0.19	0.21	0.20	0.13	0.12	0.18	0.11
O2'	0.19	0.18	0.21	0.27	0.22	0.27	0.25	0.38	0.23	0.18	0.20	0.20	0.24	0.29	0.25	0.21	0.21	0.14	0.10	0.11
O3'	0.16	0.21	0.19	0.25	0.31	0.16	0.33	0.23	0.27	0.21	0.26	0.19	0.13	0.26	0.35	0.17	0.01	0.02	0.02	0.01
O4'	0.16	0.17	0.15	0.19	0.25	0.18	0.28	0.23	0.23	0.16	0.21	0.20	0.18	0.20	0.30	0.17	0.08	0.03	0.11	0.02
O5'	0.26	0.36	0.29	0.30	0.49	0.21	0.48	0.20	0.39	0.33	0.43	0.33	0.23	0.30	0.55	0.23	0.30	0.20	0.36	0.26
OP1	0.32	0.41	0.37	0.39	0.55	0.29	0.52	0.29	0.43	0.38	0.49	0.39	0.31	0.41	0.62	0.29	0.39	0.36	0.49	0.39
OP2	0.24	0.38	0.28	0.28	0.52	0.17	0.46	0.18	0.35	0.32	0.47	0.37	0.22	0.30	0.62	0.19	0.28	0.24	0.32	0.24
P	0.26	0.37	0.30	0.31	0.51	0.21	0.48	0.20	0.38	0.33	0.45	0.35	0.24	0.32	0.59	0.22	0.31	0.25	0.38	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.12	0.13	0.17	0.11
C2	0.03	0.00	0.09	0.12	0.01	0.04	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.14	0.02	0.04	0.24	0.23	0.26	0.22
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.02	0.09	0.02	0.06	0.16	0.01	0.01	0.05	0.01	0.18	0.21	0.12	0.15
C3'	0.02	0.12	0.00	0.00	0.10	0.01	0.11	0.02	0.11	0.06	0.12	0.16	0.01	0.01	0.10	0.01	0.25	0.28	0.09	0.19
C4	0.03	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.13	0.00	0.03	0.35	0.34	0.36	0.33
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.06	0.06	0.05	0.02	0.08	0.00	0.02	0.10	0.17	0.02
C5	0.02	0.02	0.08	0.11	0.00	0.09	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.14	0.01	0.04	0.36	0.34	0.35	0.34
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.15	0.01	0.16	0.00	0.12	0.07	0.11	0.06	0.06	0.04	0.16	0.02	0.01	0.11	0.25	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.11	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.13	0.01	0.04	0.32	0.28	0.26	0.26
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.02	0.23	0.22	0.22	0.20
N3	0.03	0.01	0.06	0.12	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.14	0.01	0.04	0.30	0.29	0.32	0.28
O2	0.05	0.01	0.16	0.16	0.02	0.06	0.03	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.14	0.20	0.02	0.07	0.20	0.20	0.24	0.18
O2'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.07	0.05	0.07	0.06	0.07	0.04	0.08	0.14	0.00	0.05	0.08	0.05	0.05	0.11	0.12	0.05
O3'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.13	0.02	0.14	0.04	0.13	0.06	0.14	0.20	0.05	0.00	0.14	0.02	0.23	0.31	0.15	0.21
O4	0.03	0.02	0.05	0.10	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.02	0.08	0.14	0.00	0.04	0.37	0.38	0.41	0.37
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.07	0.05	0.02	0.04	0.00	0.08	0.07	0.22	0.11
O5'	0.12	0.24	0.18	0.25	0.35	0.02	0.36	0.01	0.32	0.23	0.30	0.20	0.05	0.23	0.37	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.23	0.21	0.28	0.34	0.10	0.34	0.11	0.28	0.22	0.29	0.20	0.11	0.31	0.38	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.26	0.12	0.09	0.36	0.17	0.35	0.25	0.26	0.22	0.32	0.24	0.12	0.15	0.41	0.22	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.22	0.15	0.19	0.33	0.02	0.34	0.02	0.26	0.20	0.28	0.18	0.05	0.21	0.37	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00