Doublet Group distance statistics: 53761

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 3, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.009, 0.020, 0.032, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N4	A	0, 0.015, 0.052, 0.089, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.052 std_dev=0.037
O2	A	0, 0.025, 0.062, 0.099, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.062 std_dev=0.037
C2'	A	0, -0.001, 0.168, 0.337, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.168 std_dev=0.169
O4'	A	0, -0.032, 0.140, 0.312, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.140 std_dev=0.172
C6	B	0, 0.256, 0.434, 0.612, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.434 std_dev=0.178
N3	B	0, 0.293, 0.471, 0.650, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.471 std_dev=0.179
O2'	A	0, 0.081, 0.265, 0.449, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.265 std_dev=0.184
C4	B	0, 0.233, 0.417, 0.602, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.417 std_dev=0.185
N1	B	0, 0.228, 0.421, 0.613, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.421 std_dev=0.192
C2	B	0, 0.234, 0.428, 0.622, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.428 std_dev=0.194
C5	B	0, 0.138, 0.348, 0.557, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.348 std_dev=0.210
C4'	A	0, -0.009, 0.238, 0.485, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.238 std_dev=0.247
O4	B	0, 0.312, 0.575, 0.839, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.575 std_dev=0.263
C3'	A	0, -0.059, 0.213, 0.485, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.213 std_dev=0.272
O4'	B	0, 0.229, 0.510, 0.791, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.510 std_dev=0.281
O2	B	0, 0.260, 0.550, 0.841, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.550 std_dev=0.291
O3'	A	0, -0.009, 0.333, 0.675, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.333 std_dev=0.342
C1'	B	0, 0.194, 0.556, 0.917, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.556 std_dev=0.361
O5'	B	0, 0.052, 0.437, 0.822, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.437 std_dev=0.385
C5'	B	0, 0.099, 0.515, 0.932, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.515 std_dev=0.416
P	B	0, 0.011, 0.437, 0.862, 1.558 max_d=1.558 avg_d=0.437 std_dev=0.425
C5'	A	0, 0.082, 0.509, 0.936, 1.587 max_d=1.587 avg_d=0.509 std_dev=0.427
OP2	B	0, 0.042, 0.474, 0.906, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.474 std_dev=0.432
C4'	B	0, 0.088, 0.546, 1.004, 1.706 max_d=1.706 avg_d=0.546 std_dev=0.458
O5'	A	0, 0.137, 0.600, 1.063, 1.768 max_d=1.768 avg_d=0.600 std_dev=0.463
OP1	B	0, 0.057, 0.592, 1.127, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.592 std_dev=0.535
P	A	0, 0.299, 0.845, 1.392, 2.057 max_d=2.057 avg_d=0.845 std_dev=0.546
OP1	A	0, 0.264, 0.831, 1.398, 1.993 max_d=1.993 avg_d=0.831 std_dev=0.567
OP2	A	0, 0.396, 0.973, 1.550, 2.266 max_d=2.266 avg_d=0.973 std_dev=0.577
C2'	B	0, 0.068, 0.650, 1.233, 2.063 max_d=2.063 avg_d=0.650 std_dev=0.583
C3'	B	0, 0.038, 0.625, 1.212, 2.109 max_d=2.109 avg_d=0.625 std_dev=0.587
O3'	B	0, 0.021, 0.784, 1.547, 2.825 max_d=2.825 avg_d=0.784 std_dev=0.763
O2'	B	0, 0.085, 0.859, 1.632, 2.739 max_d=2.739 avg_d=0.859 std_dev=0.773

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.06	0.08	0.06
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.07	0.05	0.12	0.14	0.18	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.03	0.05	0.01	0.07	0.01	0.05	0.04	0.11	0.00	0.02	0.01	0.02	0.11	0.07	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.06	0.05	0.08	0.02	0.01	0.01	0.03	0.13	0.07	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.17	0.21	0.26	0.23
C4'	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.03	0.05	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.07	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.07	0.05	0.18	0.23	0.26	0.23
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.13	0.00	0.14	0.00	0.12	0.08	0.11	0.14	0.08	0.05	0.04	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.06	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.08	0.06	0.16	0.18	0.19	0.19
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.11	0.13	0.15	0.13
N3	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.04	0.15	0.18	0.23	0.19
N4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.07	0.02	0.19	0.24	0.29	0.25
O2	0.05	0.00	0.11	0.08	0.01	0.04	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.10	0.10	0.09	0.11	0.12	0.15	0.12
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.03	0.04	0.05	0.05	0.05	0.01	0.05	0.04	0.10	0.00	0.04	0.03	0.03	0.11	0.06	0.04
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.06	0.02	0.07	0.04	0.08	0.03	0.08	0.07	0.10	0.04	0.00	0.02	0.06	0.17	0.10	0.09
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.04	0.02	0.09	0.03	0.02	0.00	0.05	0.04	0.12	0.09
O5'	0.04	0.12	0.02	0.03	0.17	0.01	0.18	0.01	0.16	0.11	0.15	0.19	0.11	0.03	0.06	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.14	0.11	0.13	0.21	0.07	0.23	0.03	0.18	0.13	0.18	0.24	0.12	0.11	0.17	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.08	0.18	0.07	0.07	0.26	0.03	0.26	0.02	0.19	0.15	0.23	0.29	0.15	0.06	0.10	0.12	0.02	0.02	0.00	0.00
P	0.06	0.15	0.04	0.06	0.23	0.01	0.23	0.01	0.19	0.13	0.19	0.25	0.12	0.04	0.09	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.23	0.15	0.21	0.24	0.22	0.18	0.25	0.16	0.11	0.28	0.29	0.20	0.22	0.31	0.18	0.17	0.05	0.08	0.08
C2	0.29	0.20	0.27	0.30	0.21	0.31	0.17	0.29	0.23	0.18	0.27	0.29	0.33	0.29	0.33	0.32	0.18	0.10	0.13	0.11
C2'	0.08	0.21	0.11	0.19	0.23	0.19	0.19	0.25	0.16	0.10	0.26	0.26	0.15	0.21	0.28	0.12	0.19	0.08	0.12	0.11
C3'	0.12	0.18	0.08	0.10	0.19	0.10	0.18	0.13	0.16	0.13	0.20	0.21	0.12	0.14	0.22	0.14	0.07	0.02	0.04	0.04
C4	0.30	0.23	0.26	0.29	0.13	0.29	0.16	0.27	0.23	0.24	0.21	0.30	0.29	0.28	0.30	0.30	0.19	0.14	0.19	0.15
C4'	0.10	0.19	0.07	0.09	0.21	0.09	0.20	0.12	0.17	0.11	0.22	0.23	0.11	0.13	0.25	0.10	0.05	0.05	0.05	0.03
C5	0.21	0.19	0.18	0.24	0.17	0.23	0.13	0.24	0.17	0.17	0.22	0.24	0.20	0.24	0.30	0.22	0.19	0.15	0.21	0.16
C5'	0.14	0.19	0.11	0.10	0.24	0.10	0.26	0.09	0.22	0.16	0.22	0.20	0.13	0.12	0.28	0.15	0.06	0.14	0.13	0.10
C6	0.17	0.20	0.16	0.22	0.22	0.22	0.15	0.24	0.15	0.13	0.25	0.24	0.18	0.24	0.31	0.19	0.19	0.13	0.19	0.15
N1	0.19	0.21	0.18	0.23	0.23	0.24	0.17	0.25	0.18	0.12	0.28	0.27	0.22	0.23	0.33	0.23	0.17	0.08	0.13	0.10
N3	0.35	0.22	0.32	0.33	0.16	0.34	0.17	0.30	0.26	0.25	0.23	0.31	0.37	0.32	0.32	0.35	0.20	0.13	0.17	0.14
N4	0.34	0.29	0.30	0.32	0.10	0.31	0.18	0.28	0.26	0.29	0.22	0.35	0.33	0.31	0.23	0.32	0.20	0.16	0.21	0.16
O2	0.31	0.20	0.31	0.32	0.22	0.35	0.17	0.31	0.23	0.16	0.28	0.31	0.39	0.32	0.33	0.35	0.20	0.12	0.12	0.12
O2'	0.15	0.28	0.19	0.25	0.27	0.25	0.22	0.31	0.21	0.19	0.31	0.34	0.19	0.27	0.30	0.18	0.25	0.11	0.13	0.14
O3'	0.14	0.17	0.08	0.05	0.14	0.07	0.14	0.06	0.13	0.13	0.16	0.20	0.10	0.10	0.16	0.17	0.02	0.01	0.02	0.01
O4'	0.11	0.21	0.10	0.14	0.23	0.16	0.18	0.18	0.15	0.10	0.27	0.27	0.15	0.17	0.30	0.13	0.09	0.03	0.04	0.02
O5'	0.20	0.23	0.17	0.14	0.29	0.13	0.31	0.09	0.27	0.22	0.25	0.22	0.18	0.14	0.31	0.19	0.10	0.15	0.16	0.12
OP1	0.15	0.21	0.15	0.11	0.30	0.11	0.28	0.14	0.21	0.19	0.26	0.20	0.12	0.10	0.35	0.15	0.15	0.26	0.18	0.18
OP2	0.22	0.30	0.19	0.13	0.37	0.10	0.34	0.07	0.27	0.26	0.35	0.30	0.18	0.13	0.42	0.17	0.11	0.18	0.16	0.13
P	0.20	0.26	0.16	0.10	0.34	0.09	0.33	0.05	0.27	0.24	0.30	0.25	0.15	0.09	0.37	0.17	0.10	0.19	0.16	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.07	0.07	0.07
C2	0.02	0.00	0.09	0.12	0.00	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.12	0.01	0.05	0.07	0.06	0.09	0.07
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.09	0.02	0.07	0.16	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.04	0.03	0.02
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.01	0.10	0.07	0.12	0.15	0.02	0.01	0.12	0.01	0.05	0.07	0.06	0.05
C4	0.01	0.00	0.04	0.11	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.00	0.03	0.09	0.10	0.13	0.09
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.04	0.04	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02
C5	0.02	0.02	0.07	0.10	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.13	0.01	0.03	0.09	0.10	0.12	0.10
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.08	0.01	0.08	0.00	0.07	0.05	0.06	0.05	0.04	0.03	0.09	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.10	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.11	0.01	0.04	0.08	0.08	0.09	0.09
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.02	0.07	0.06	0.08	0.07
N3	0.01	0.00	0.07	0.12	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.01	0.04	0.08	0.07	0.11	0.07
O2	0.04	0.00	0.16	0.15	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.13	0.16	0.02	0.07	0.09	0.08	0.09	0.08
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.04	0.04	0.07	0.04	0.07	0.02	0.04	0.13	0.00	0.09	0.04	0.04	0.02	0.04	0.02	0.02
O3'	0.02	0.12	0.03	0.01	0.14	0.01	0.13	0.03	0.11	0.06	0.14	0.16	0.09	0.00	0.16	0.02	0.12	0.17	0.14	0.14
O4	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.16	0.00	0.04	0.10	0.12	0.15	0.10
O4'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.02	0.04	0.07	0.04	0.02	0.04	0.00	0.11	0.12	0.12	0.12
O5'	0.07	0.07	0.02	0.05	0.09	0.01	0.09	0.01	0.08	0.07	0.08	0.09	0.02	0.12	0.10	0.11	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.07	0.06	0.04	0.07	0.10	0.04	0.10	0.06	0.08	0.06	0.07	0.08	0.04	0.17	0.12	0.12	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.09	0.03	0.06	0.13	0.02	0.12	0.02	0.09	0.08	0.11	0.09	0.02	0.14	0.15	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.07	0.02	0.05	0.09	0.02	0.10	0.01	0.09	0.07	0.07	0.08	0.02	0.14	0.10	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00