Doublet Group distance statistics: 53763

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 1, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.005, 0.008, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.002, 0.006, 0.009, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.021 std_dev=0.014
N4	A	0, 0.010, 0.028, 0.045, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.028 std_dev=0.018
O4'	A	0, 0.007, 0.174, 0.341, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.174 std_dev=0.167
C2'	A	0, 0.024, 0.232, 0.439, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.232 std_dev=0.207
C6	B	0, 0.310, 0.557, 0.804, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.557 std_dev=0.247
C4'	A	0, 0.047, 0.295, 0.543, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.295 std_dev=0.248
C5	B	0, 0.395, 0.662, 0.928, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.662 std_dev=0.267
C4	B	0, 0.408, 0.697, 0.986, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.697 std_dev=0.289
N1	B	0, 0.311, 0.604, 0.898, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.604 std_dev=0.293
C3'	A	0, 0.082, 0.398, 0.714, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.398 std_dev=0.316
O2'	A	0, 0.089, 0.411, 0.732, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.411 std_dev=0.321
C2	B	0, 0.449, 0.796, 1.143, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.796 std_dev=0.347
N3	B	0, 0.408, 0.766, 1.125, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.766 std_dev=0.358
O4'	B	0, 0.221, 0.586, 0.951, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.586 std_dev=0.365
O4	B	0, 0.498, 0.870, 1.242, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.870 std_dev=0.372
C5'	A	0, 0.083, 0.529, 0.976, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.529 std_dev=0.447
O5'	B	0, 0.239, 0.693, 1.147, 1.694 max_d=1.694 avg_d=0.693 std_dev=0.454
C4'	B	0, 0.129, 0.592, 1.055, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.592 std_dev=0.463
C5'	B	0, 0.187, 0.656, 1.125, 1.701 max_d=1.701 avg_d=0.656 std_dev=0.469
O3'	A	0, 0.120, 0.592, 1.064, 1.592 max_d=1.592 avg_d=0.592 std_dev=0.472
C1'	B	0, 0.300, 0.773, 1.246, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.773 std_dev=0.473
O2	B	0, 0.560, 1.075, 1.591, 1.530 max_d=1.530 avg_d=1.075 std_dev=0.515
C3'	B	0, 0.231, 0.763, 1.294, 1.887 max_d=1.887 avg_d=0.763 std_dev=0.532
O5'	A	0, 0.139, 0.695, 1.251, 1.937 max_d=1.937 avg_d=0.695 std_dev=0.556
P	B	0, 0.197, 0.793, 1.389, 2.036 max_d=2.036 avg_d=0.793 std_dev=0.596
OP2	B	0, 0.289, 0.940, 1.592, 2.186 max_d=2.186 avg_d=0.940 std_dev=0.652
O3'	B	0, 0.223, 0.887, 1.551, 2.371 max_d=2.371 avg_d=0.887 std_dev=0.664
P	A	0, 0.395, 1.067, 1.740, 2.368 max_d=2.368 avg_d=1.067 std_dev=0.673
C2'	B	0, 0.357, 1.098, 1.839, 2.088 max_d=2.088 avg_d=1.098 std_dev=0.741
OP1	B	0, 0.184, 0.972, 1.760, 2.597 max_d=2.597 avg_d=0.972 std_dev=0.788
OP2	A	0, 0.431, 1.221, 2.010, 2.650 max_d=2.650 avg_d=1.221 std_dev=0.789
OP1	A	0, 0.509, 1.305, 2.101, 2.596 max_d=2.596 avg_d=1.305 std_dev=0.796
O2'	B	0, 0.340, 1.630, 2.919, 3.675 max_d=3.675 avg_d=1.630 std_dev=1.290

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.13	0.11	0.06
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.06	0.02	0.17	0.23	0.27	0.19
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.08	0.02	0.03	0.04	0.12	0.00	0.02	0.01	0.03	0.26	0.07	0.08
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.12	0.00	0.17	0.01	0.17	0.07	0.07	0.13	0.10	0.01	0.01	0.03	0.02	0.28	0.05	0.10
C4	0.01	0.00	0.03	0.12	0.00	0.11	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.13	0.02	0.31	0.39	0.46	0.36
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.11	0.00	0.15	0.01	0.14	0.06	0.06	0.12	0.03	0.05	0.01	0.00	0.02	0.12	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.08	0.17	0.00	0.15	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.19	0.03	0.36	0.41	0.47	0.38
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.21	0.01	0.26	0.00	0.23	0.12	0.14	0.24	0.04	0.06	0.03	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.17	0.00	0.14	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.18	0.03	0.31	0.31	0.33	0.28
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.07	0.02	0.18	0.21	0.23	0.17
N3	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.07	0.02	0.23	0.31	0.37	0.28
N4	0.01	0.00	0.04	0.13	0.00	0.12	0.01	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.15	0.03	0.34	0.45	0.53	0.41
O2	0.01	0.00	0.12	0.10	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.14	0.03	0.11	0.19	0.22	0.14
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.03	0.05	0.04	0.06	0.04	0.02	0.07	0.03	0.15	0.00	0.02	0.03	0.03	0.23	0.05	0.05
O3'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.13	0.01	0.19	0.03	0.18	0.07	0.07	0.15	0.14	0.02	0.00	0.01	0.05	0.33	0.08	0.13
O4'	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.06	0.06	0.14	0.12
O5'	0.06	0.17	0.03	0.02	0.31	0.02	0.36	0.01	0.31	0.18	0.23	0.34	0.11	0.03	0.05	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.13	0.23	0.26	0.28	0.39	0.12	0.41	0.05	0.31	0.21	0.31	0.45	0.19	0.23	0.33	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.27	0.07	0.05	0.46	0.03	0.47	0.02	0.33	0.23	0.37	0.53	0.22	0.05	0.08	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.19	0.08	0.10	0.36	0.02	0.38	0.01	0.28	0.17	0.28	0.41	0.14	0.05	0.13	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.23	0.21	0.21	0.15	0.24	0.21	0.25	0.24	0.16	0.22	0.33	0.38	0.25	0.21	0.24	0.14	0.05	0.04	0.05
C2	0.40	0.27	0.38	0.33	0.15	0.32	0.22	0.31	0.32	0.25	0.26	0.39	0.59	0.40	0.21	0.32	0.22	0.12	0.14	0.12
C2'	0.19	0.20	0.19	0.19	0.13	0.22	0.16	0.26	0.19	0.13	0.19	0.27	0.30	0.23	0.16	0.20	0.16	0.08	0.04	0.07
C3'	0.09	0.18	0.25	0.10	0.13	0.08	0.13	0.14	0.12	0.10	0.18	0.23	0.11	0.13	0.15	0.10	0.05	0.03	0.04	0.01
C4	0.33	0.35	0.33	0.29	0.22	0.24	0.12	0.23	0.20	0.25	0.38	0.46	0.41	0.33	0.30	0.25	0.21	0.18	0.26	0.19
C4'	0.09	0.20	0.23	0.10	0.20	0.09	0.19	0.14	0.15	0.10	0.23	0.26	0.12	0.12	0.23	0.11	0.03	0.06	0.13	0.06
C5	0.28	0.35	0.24	0.27	0.26	0.21	0.09	0.21	0.15	0.23	0.39	0.42	0.28	0.24	0.33	0.22	0.23	0.24	0.31	0.25
C5'	0.13	0.26	0.33	0.16	0.30	0.06	0.28	0.10	0.21	0.19	0.30	0.29	0.25	0.19	0.33	0.09	0.09	0.10	0.21	0.11
C6	0.27	0.31	0.22	0.24	0.21	0.21	0.12	0.21	0.16	0.21	0.32	0.38	0.28	0.22	0.27	0.23	0.21	0.22	0.26	0.22
N1	0.31	0.27	0.25	0.25	0.16	0.25	0.19	0.24	0.24	0.20	0.27	0.37	0.40	0.28	0.22	0.26	0.17	0.10	0.13	0.11
N3	0.41	0.31	0.42	0.33	0.16	0.31	0.19	0.29	0.28	0.27	0.30	0.45	0.59	0.42	0.23	0.30	0.22	0.14	0.19	0.15
N4	0.32	0.36	0.36	0.30	0.25	0.24	0.12	0.23	0.18	0.24	0.41	0.47	0.39	0.36	0.34	0.24	0.23	0.20	0.30	0.22
O2	0.45	0.23	0.46	0.40	0.15	0.42	0.27	0.41	0.37	0.28	0.22	0.36	0.76	0.51	0.19	0.40	0.29	0.21	0.17	0.19
O2'	0.22	0.21	0.22	0.23	0.13	0.26	0.15	0.29	0.18	0.15	0.20	0.29	0.40	0.28	0.15	0.23	0.16	0.08	0.03	0.07
O3'	0.13	0.16	0.36	0.08	0.11	0.06	0.11	0.09	0.12	0.13	0.15	0.20	0.17	0.16	0.11	0.11	0.01	0.03	0.01	0.00
O4'	0.18	0.17	0.15	0.16	0.17	0.16	0.26	0.19	0.23	0.11	0.19	0.26	0.24	0.16	0.24	0.18	0.10	0.03	0.09	0.03
O5'	0.17	0.31	0.34	0.24	0.35	0.11	0.32	0.11	0.26	0.24	0.35	0.33	0.33	0.25	0.37	0.11	0.13	0.09	0.18	0.10
OP1	0.53	0.55	0.74	0.64	0.56	0.52	0.58	0.50	0.56	0.55	0.55	0.54	0.80	0.69	0.55	0.45	0.55	0.44	0.57	0.48
OP2	0.30	0.41	0.45	0.45	0.48	0.25	0.44	0.20	0.36	0.36	0.45	0.41	0.54	0.44	0.53	0.21	0.25	0.15	0.21	0.17
P	0.29	0.39	0.47	0.42	0.46	0.27	0.44	0.24	0.37	0.35	0.43	0.39	0.51	0.44	0.49	0.22	0.29	0.20	0.31	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.28	0.01	0.00	0.21	0.19	0.32	0.22
C2	0.01	0.00	0.15	0.22	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.19	0.00	0.08	0.12	0.15	0.29	0.18
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.03	0.01	0.11	0.22	0.14	0.02	0.10	0.27	0.00	0.02	0.03	0.01	0.46	0.50	0.60	0.50
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.33	0.00	0.34	0.03	0.29	0.20	0.28	0.21	0.02	0.01	0.34	0.02	0.08	0.11	0.10	0.09
C4	0.01	0.00	0.03	0.33	0.00	0.11	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.33	0.14	0.00	0.02	0.10	0.15	0.25	0.15
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.11	0.00	0.15	0.01	0.14	0.06	0.07	0.06	0.28	0.02	0.11	0.00	0.02	0.05	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.11	0.34	0.00	0.15	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.33	0.22	0.00	0.07	0.13	0.17	0.28	0.17
C5'	0.09	0.07	0.22	0.03	0.07	0.01	0.09	0.00	0.07	0.06	0.06	0.10	0.06	0.19	0.08	0.02	0.01	0.07	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.14	0.29	0.00	0.14	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.17	0.00	0.09	0.12	0.18	0.32	0.20
N1	0.00	0.01	0.02	0.20	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.08	0.01	0.01	0.14	0.17	0.31	0.20
N3	0.01	0.00	0.10	0.28	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.26	0.13	0.01	0.06	0.09	0.14	0.27	0.16
O2	0.02	0.00	0.27	0.21	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.37	0.01	0.13	0.15	0.16	0.29	0.19
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.33	0.28	0.33	0.06	0.28	0.18	0.26	0.15	0.00	0.06	0.35	0.20	0.34	0.39	0.64	0.41
O3'	0.28	0.19	0.02	0.01	0.14	0.02	0.22	0.19	0.17	0.08	0.13	0.37	0.06	0.00	0.18	0.21	0.23	0.36	0.28	0.27
O4	0.01	0.00	0.03	0.34	0.00	0.11	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.35	0.18	0.00	0.03	0.12	0.16	0.23	0.14
O4'	0.00	0.08	0.01	0.02	0.02	0.00	0.07	0.02	0.09	0.01	0.06	0.13	0.20	0.21	0.03	0.00	0.08	0.07	0.13	0.08
O5'	0.21	0.12	0.46	0.08	0.10	0.02	0.13	0.01	0.12	0.14	0.09	0.15	0.34	0.23	0.12	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.19	0.15	0.50	0.11	0.15	0.05	0.17	0.07	0.18	0.17	0.14	0.16	0.39	0.36	0.16	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.32	0.29	0.60	0.10	0.25	0.05	0.28	0.03	0.32	0.31	0.27	0.29	0.64	0.28	0.23	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.18	0.50	0.09	0.15	0.02	0.17	0.01	0.20	0.20	0.16	0.19	0.41	0.27	0.14	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00