Doublet Group distance statistics: 53779

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 4, 8, 4, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.010, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.005, 0.009, 0.014, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.009, 0.018, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.019 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.030, 0.059, 0.089, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.059 std_dev=0.030
N4	A	0, 0.025, 0.062, 0.099, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.062 std_dev=0.037
C2'	A	0, 0.190, 0.327, 0.464, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.327 std_dev=0.137
O4'	A	0, 0.154, 0.293, 0.432, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.293 std_dev=0.139
O2'	A	0, 0.235, 0.380, 0.525, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.380 std_dev=0.145
N3	B	0, 0.375, 0.575, 0.775, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.575 std_dev=0.200
C4	B	0, 0.488, 0.701, 0.914, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.701 std_dev=0.213
C6	B	0, 0.419, 0.634, 0.848, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.634 std_dev=0.214
C4'	A	0, 0.228, 0.443, 0.657, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.443 std_dev=0.214
N1	B	0, 0.392, 0.612, 0.833, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.612 std_dev=0.221
C2	B	0, 0.333, 0.555, 0.777, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.555 std_dev=0.222
C3'	A	0, 0.282, 0.504, 0.727, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.504 std_dev=0.222
C5	B	0, 0.485, 0.716, 0.948, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.716 std_dev=0.232
C1'	B	0, 0.635, 0.871, 1.107, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.871 std_dev=0.236
O2	B	0, 0.423, 0.663, 0.902, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.663 std_dev=0.240
O4'	B	0, 0.601, 0.845, 1.089, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.845 std_dev=0.244
N4	B	0, 0.611, 0.900, 1.188, 1.533 max_d=1.533 avg_d=0.900 std_dev=0.289
O3'	A	0, 0.392, 0.694, 0.997, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.694 std_dev=0.303
O5'	B	0, 0.716, 1.032, 1.348, 1.444 max_d=1.444 avg_d=1.032 std_dev=0.316
C5'	B	0, 0.754, 1.101, 1.449, 1.683 max_d=1.683 avg_d=1.101 std_dev=0.348
C4'	B	0, 0.845, 1.194, 1.543, 1.670 max_d=1.670 avg_d=1.194 std_dev=0.349
C2'	B	0, 0.925, 1.277, 1.629, 1.669 max_d=1.669 avg_d=1.277 std_dev=0.352
P	B	0, 0.647, 1.002, 1.358, 1.627 max_d=1.627 avg_d=1.002 std_dev=0.356
O5'	A	0, 0.507, 0.867, 1.228, 1.708 max_d=1.708 avg_d=0.867 std_dev=0.360
C5'	A	0, 0.480, 0.848, 1.217, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.848 std_dev=0.368
OP2	B	0, 0.755, 1.132, 1.509, 1.721 max_d=1.721 avg_d=1.132 std_dev=0.377
C3'	B	0, 1.013, 1.416, 1.819, 1.876 max_d=1.876 avg_d=1.416 std_dev=0.403
O2'	B	0, 1.155, 1.610, 2.065, 2.043 max_d=2.043 avg_d=1.610 std_dev=0.455
P	A	0, 0.604, 1.071, 1.538, 2.354 max_d=2.354 avg_d=1.071 std_dev=0.467
OP1	B	0, 0.678, 1.175, 1.672, 2.213 max_d=2.213 avg_d=1.175 std_dev=0.497
OP2	A	0, 0.821, 1.390, 1.958, 2.091 max_d=2.091 avg_d=1.390 std_dev=0.569
O3'	B	0, 1.325, 1.902, 2.478, 2.647 max_d=2.647 avg_d=1.902 std_dev=0.577
OP1	A	0, 1.005, 2.266, 3.528, 3.974 max_d=3.974 avg_d=2.266 std_dev=1.261

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.30	0.32	0.18
C2	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.09	0.01	0.13	0.73	0.28	0.25
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.04	0.10	0.00	0.01	0.01	0.04	0.14	0.08	0.05
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.05	0.02	0.04	0.04	0.09	0.08	0.11	0.01	0.01	0.01	0.07	0.18	0.10	0.08
C4	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.01	0.17	1.08	0.43	0.31
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.04	0.03	0.05	0.06	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.17	0.34	0.05
C5	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.02	0.17	1.08	0.43	0.32
C5'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.09	0.00	0.10	0.00	0.08	0.05	0.08	0.10	0.05	0.04	0.03	0.01	0.00	0.36	0.38	0.01
C6	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.15	0.82	0.31	0.29
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.11	0.63	0.27	0.24
N3	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.10	0.01	0.15	0.93	0.35	0.28
N4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.10	0.02	0.18	1.20	0.52	0.32
O2	0.01	0.00	0.10	0.11	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.12	0.02	0.11	0.60	0.27	0.23
O2'	0.02	0.04	0.00	0.01	0.03	0.05	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.03	0.07	0.00	0.03	0.05	0.04	0.11	0.24	0.05
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.08	0.02	0.06	0.03	0.05	0.04	0.10	0.10	0.12	0.03	0.00	0.02	0.13	0.45	0.23	0.20
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.00	0.07	0.20	0.51	0.21
O5'	0.06	0.13	0.04	0.07	0.17	0.01	0.17	0.00	0.15	0.11	0.15	0.18	0.11	0.04	0.13	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.30	0.73	0.14	0.18	1.08	0.17	1.08	0.36	0.82	0.63	0.93	1.20	0.60	0.11	0.45	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.28	0.08	0.10	0.43	0.34	0.43	0.38	0.31	0.27	0.35	0.52	0.27	0.24	0.23	0.51	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.25	0.05	0.08	0.31	0.05	0.32	0.01	0.29	0.24	0.28	0.32	0.23	0.05	0.20	0.21	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.28	0.17	0.13	0.24	0.17	0.19	0.22	0.19	0.22	0.29	0.25	0.31	0.21	0.15	0.17	0.15	0.06	0.10	0.03
C2	0.16	0.28	0.16	0.17	0.26	0.25	0.18	0.31	0.15	0.17	0.31	0.28	0.32	0.23	0.20	0.20	0.20	0.15	0.13	0.10
C2'	0.25	0.32	0.20	0.16	0.29	0.16	0.27	0.21	0.27	0.28	0.32	0.28	0.33	0.23	0.15	0.22	0.17	0.10	0.08	0.07
C3'	0.21	0.28	0.14	0.08	0.27	0.10	0.25	0.12	0.23	0.24	0.29	0.27	0.28	0.18	0.08	0.18	0.08	0.02	0.08	0.01
C4	0.21	0.16	0.18	0.20	0.23	0.30	0.18	0.31	0.16	0.10	0.25	0.30	0.22	0.25	0.21	0.30	0.22	0.14	0.17	0.12
C4'	0.19	0.25	0.13	0.08	0.25	0.10	0.21	0.11	0.19	0.21	0.27	0.26	0.27	0.17	0.09	0.16	0.07	0.08	0.16	0.06
C5	0.19	0.15	0.15	0.17	0.18	0.25	0.16	0.27	0.15	0.11	0.21	0.25	0.20	0.21	0.17	0.26	0.20	0.10	0.17	0.10
C5'	0.21	0.28	0.17	0.14	0.31	0.14	0.27	0.13	0.23	0.24	0.31	0.33	0.28	0.19	0.14	0.18	0.13	0.15	0.23	0.12
C6	0.14	0.19	0.12	0.13	0.20	0.20	0.14	0.25	0.12	0.11	0.23	0.24	0.22	0.17	0.14	0.19	0.18	0.08	0.15	0.08
N1	0.16	0.25	0.13	0.13	0.24	0.20	0.17	0.26	0.15	0.17	0.28	0.26	0.28	0.19	0.15	0.17	0.18	0.08	0.12	0.06
N3	0.17	0.24	0.18	0.20	0.26	0.30	0.18	0.33	0.14	0.11	0.30	0.30	0.29	0.26	0.23	0.27	0.22	0.16	0.15	0.12
N4	0.27	0.13	0.23	0.23	0.24	0.33	0.21	0.32	0.20	0.17	0.22	0.33	0.19	0.31	0.24	0.34	0.23	0.16	0.19	0.14
O2	0.20	0.32	0.20	0.19	0.27	0.25	0.19	0.31	0.17	0.21	0.33	0.29	0.37	0.28	0.24	0.17	0.19	0.18	0.11	0.12
O2'	0.33	0.35	0.29	0.25	0.30	0.26	0.28	0.26	0.30	0.33	0.34	0.29	0.37	0.32	0.25	0.31	0.21	0.13	0.06	0.10
O3'	0.22	0.26	0.14	0.08	0.27	0.12	0.27	0.07	0.25	0.25	0.27	0.28	0.26	0.18	0.07	0.22	0.01	0.02	0.02	0.00
O4'	0.16	0.24	0.12	0.08	0.21	0.12	0.15	0.17	0.13	0.17	0.25	0.23	0.26	0.17	0.10	0.14	0.11	0.04	0.14	0.03
O5'	0.23	0.31	0.21	0.21	0.33	0.21	0.26	0.22	0.23	0.25	0.34	0.35	0.31	0.22	0.23	0.21	0.23	0.18	0.25	0.18
OP1	0.73	1.11	0.68	0.53	1.24	0.43	0.96	0.37	0.77	0.88	1.27	1.40	1.14	0.68	0.51	0.53	0.44	0.68	0.64	0.55
OP2	0.63	0.71	0.74	0.77	0.83	0.60	0.86	0.55	0.76	0.70	0.76	0.85	0.68	0.68	0.81	0.54	0.64	0.46	0.62	0.48
P	0.29	0.36	0.29	0.32	0.36	0.28	0.29	0.29	0.27	0.30	0.39	0.40	0.37	0.29	0.35	0.26	0.33	0.34	0.42	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.08	0.09	0.19	0.13
C2	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.07	0.02	0.14	0.18	0.30	0.22
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.05	0.07	0.00	0.02	0.01	0.06	0.10	0.12	0.08
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.06	0.04	0.08	0.10	0.08	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.07	0.06
C4	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.11	0.01	0.17	0.26	0.37	0.27
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.06	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.02	0.17	0.27	0.37	0.27
C5'	0.03	0.06	0.02	0.02	0.09	0.01	0.10	0.00	0.08	0.06	0.07	0.10	0.05	0.04	0.02	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.00	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.15	0.21	0.30	0.23
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.13	0.16	0.27	0.20
N3	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.01	0.16	0.22	0.35	0.25
N4	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.13	0.01	0.17	0.29	0.39	0.29
O2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.09	0.02	0.13	0.15	0.29	0.20
O2'	0.02	0.04	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.04	0.04	0.06	0.00	0.03	0.03	0.05	0.08	0.10	0.06
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.11	0.02	0.10	0.02	0.07	0.04	0.10	0.13	0.09	0.03	0.00	0.02	0.05	0.19	0.11	0.09
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.06	0.08	0.17	0.13
O5'	0.08	0.14	0.06	0.04	0.17	0.02	0.17	0.01	0.15	0.13	0.16	0.17	0.13	0.05	0.05	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.18	0.10	0.12	0.26	0.06	0.27	0.06	0.21	0.16	0.22	0.29	0.15	0.08	0.19	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.30	0.12	0.07	0.37	0.06	0.37	0.02	0.30	0.27	0.35	0.39	0.29	0.10	0.11	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.22	0.08	0.06	0.27	0.03	0.27	0.01	0.23	0.20	0.25	0.29	0.20	0.06	0.09	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00