Doublet Group distance statistics: 53780

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 1, 10, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.006, 0.016, 0.025, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.009, 0.032, 0.056, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.032 std_dev=0.024
N4	A	0, 0.021, 0.049, 0.076, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.049 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.032, 0.117, 0.202, 0.298 max_d=0.298 avg_d=0.117 std_dev=0.085
C2'	A	0, 0.069, 0.175, 0.281, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.175 std_dev=0.106
C4'	A	0, 0.062, 0.196, 0.331, 0.435 max_d=0.435 avg_d=0.196 std_dev=0.134
N1	B	0, 0.197, 0.344, 0.491, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.344 std_dev=0.147
O2'	A	0, 0.135, 0.283, 0.432, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.283 std_dev=0.148
C2	B	0, 0.249, 0.401, 0.554, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.401 std_dev=0.152
C3'	A	0, 0.105, 0.259, 0.413, 0.531 max_d=0.531 avg_d=0.259 std_dev=0.154
C1'	B	0, 0.275, 0.440, 0.604, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.440 std_dev=0.164
O4'	B	0, 0.355, 0.522, 0.689, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.522 std_dev=0.167
C4'	B	0, 0.353, 0.530, 0.706, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.530 std_dev=0.177
C3'	B	0, 0.291, 0.478, 0.665, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.478 std_dev=0.187
N3	B	0, 0.385, 0.579, 0.774, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.579 std_dev=0.195
C4	B	0, 0.402, 0.611, 0.819, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.611 std_dev=0.208
C5	B	0, 0.413, 0.623, 0.833, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.623 std_dev=0.210
C6	B	0, 0.330, 0.541, 0.751, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.541 std_dev=0.211
C2'	B	0, 0.309, 0.529, 0.748, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.529 std_dev=0.219
O2	B	0, 0.289, 0.516, 0.743, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.516 std_dev=0.227
O5'	B	0, 0.201, 0.441, 0.680, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.441 std_dev=0.239
O3'	A	0, 0.181, 0.422, 0.663, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.422 std_dev=0.241
C5'	A	0, 0.108, 0.349, 0.590, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.349 std_dev=0.241
C5'	B	0, 0.282, 0.525, 0.768, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.525 std_dev=0.243
N4	B	0, 0.553, 0.825, 1.097, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.825 std_dev=0.272
O3'	B	0, 0.346, 0.618, 0.890, 1.408 max_d=1.408 avg_d=0.618 std_dev=0.272
P	B	0, 0.272, 0.565, 0.858, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.565 std_dev=0.293
O2'	B	0, 0.445, 0.748, 1.050, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.748 std_dev=0.302
OP2	B	0, 0.341, 0.664, 0.987, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.664 std_dev=0.323
OP1	B	0, 0.373, 0.773, 1.173, 1.586 max_d=1.586 avg_d=0.773 std_dev=0.400
O5'	A	0, -0.110, 0.501, 1.111, 2.819 max_d=2.819 avg_d=0.501 std_dev=0.610
OP1	A	0, -0.064, 0.760, 1.584, 3.837 max_d=3.837 avg_d=0.760 std_dev=0.824
P	A	0, -0.156, 0.684, 1.525, 3.923 max_d=3.923 avg_d=0.684 std_dev=0.840
OP2	A	0, -0.054, 0.899, 1.853, 4.518 max_d=4.518 avg_d=0.899 std_dev=0.954

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.21	0.19	0.14	0.13
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.06	0.02	0.39	0.40	0.42	0.37
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.03	0.09	0.00	0.02	0.01	0.13	0.18	0.08	0.08
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.02	0.08	0.04	0.05	0.06	0.08	0.01	0.01	0.01	0.12	0.22	0.07	0.10
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.06	0.03	0.58	0.65	0.72	0.65
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.03	0.04	0.07	0.05	0.03	0.02	0.00	0.02	0.10	0.21	0.07
C5	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.04	0.62	0.69	0.74	0.69
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.16	0.01	0.18	0.00	0.15	0.09	0.12	0.17	0.05	0.03	0.03	0.01	0.01	0.18	0.23	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.04	0.55	0.55	0.52	0.54
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.40	0.39	0.35	0.36
N3	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.05	0.03	0.48	0.53	0.58	0.52
N4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.06	0.03	0.62	0.74	0.84	0.73
O2	0.03	0.00	0.09	0.08	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.13	0.11	0.02	0.28	0.28	0.31	0.25
O2'	0.02	0.08	0.00	0.01	0.06	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.08	0.07	0.13	0.00	0.04	0.06	0.04	0.06	0.16	0.12
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.06	0.02	0.09	0.03	0.08	0.03	0.05	0.06	0.11	0.04	0.00	0.01	0.10	0.17	0.12	0.09
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.02	0.06	0.01	0.00	0.16	0.16	0.17	0.08
O5'	0.21	0.39	0.13	0.12	0.58	0.02	0.62	0.01	0.55	0.40	0.48	0.62	0.28	0.04	0.10	0.16	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.19	0.40	0.18	0.22	0.65	0.10	0.69	0.18	0.55	0.39	0.53	0.74	0.28	0.06	0.17	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.42	0.08	0.07	0.72	0.21	0.74	0.23	0.52	0.35	0.58	0.84	0.31	0.16	0.12	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.37	0.08	0.10	0.65	0.07	0.69	0.02	0.54	0.36	0.52	0.73	0.25	0.12	0.09	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.16	0.12	0.11	0.12	0.13	0.12	0.19	0.13	0.10	0.17	0.16	0.23	0.16	0.12	0.13	0.15	0.05	0.06	0.04
C2	0.20	0.18	0.20	0.18	0.13	0.21	0.15	0.23	0.19	0.14	0.19	0.17	0.26	0.23	0.20	0.20	0.19	0.10	0.12	0.09
C2'	0.14	0.16	0.10	0.10	0.12	0.11	0.11	0.19	0.10	0.10	0.15	0.14	0.21	0.15	0.12	0.13	0.17	0.08	0.05	0.08
C3'	0.16	0.18	0.10	0.05	0.19	0.07	0.18	0.06	0.14	0.15	0.19	0.22	0.20	0.15	0.05	0.16	0.05	0.01	0.05	0.01
C4	0.20	0.15	0.20	0.19	0.11	0.19	0.16	0.20	0.21	0.17	0.17	0.17	0.20	0.22	0.19	0.20	0.18	0.11	0.17	0.12
C4'	0.15	0.19	0.09	0.04	0.21	0.06	0.19	0.06	0.15	0.15	0.21	0.25	0.21	0.15	0.05	0.15	0.04	0.07	0.14	0.06
C5	0.16	0.13	0.15	0.15	0.09	0.15	0.15	0.18	0.18	0.13	0.14	0.15	0.17	0.17	0.15	0.16	0.17	0.12	0.18	0.13
C5'	0.17	0.24	0.12	0.10	0.30	0.09	0.26	0.05	0.19	0.19	0.29	0.35	0.25	0.16	0.09	0.16	0.08	0.14	0.22	0.12
C6	0.14	0.14	0.13	0.12	0.11	0.13	0.13	0.17	0.16	0.11	0.15	0.16	0.18	0.15	0.12	0.14	0.16	0.10	0.15	0.11
N1	0.15	0.16	0.14	0.13	0.12	0.15	0.14	0.20	0.16	0.11	0.17	0.16	0.22	0.17	0.14	0.15	0.17	0.07	0.10	0.07
N3	0.23	0.18	0.23	0.21	0.13	0.22	0.16	0.23	0.21	0.17	0.19	0.18	0.25	0.25	0.22	0.22	0.19	0.11	0.15	0.11
N4	0.22	0.16	0.23	0.21	0.13	0.20	0.18	0.20	0.21	0.19	0.16	0.18	0.20	0.25	0.22	0.21	0.18	0.13	0.20	0.13
O2	0.21	0.20	0.23	0.21	0.14	0.24	0.15	0.26	0.18	0.15	0.20	0.17	0.29	0.27	0.24	0.22	0.21	0.14	0.12	0.12
O2'	0.18	0.17	0.16	0.17	0.11	0.18	0.11	0.23	0.10	0.12	0.15	0.13	0.24	0.20	0.20	0.17	0.19	0.11	0.05	0.09
O3'	0.15	0.17	0.09	0.06	0.22	0.09	0.22	0.04	0.17	0.15	0.19	0.25	0.18	0.15	0.07	0.19	0.01	0.02	0.01	0.00
O4'	0.15	0.17	0.11	0.06	0.14	0.09	0.14	0.13	0.13	0.12	0.17	0.18	0.22	0.16	0.08	0.13	0.09	0.04	0.11	0.03
O5'	0.37	0.57	0.35	0.30	0.67	0.20	0.58	0.14	0.46	0.47	0.66	0.73	0.57	0.32	0.27	0.26	0.18	0.16	0.23	0.13
OP1	0.49	0.75	0.52	0.48	0.91	0.33	0.79	0.27	0.63	0.63	0.87	1.03	0.73	0.47	0.47	0.36	0.36	0.18	0.44	0.28
OP2	0.50	0.79	0.55	0.50	0.93	0.33	0.77	0.25	0.61	0.64	0.92	1.08	0.79	0.49	0.50	0.35	0.33	0.24	0.41	0.26
P	0.42	0.69	0.43	0.39	0.83	0.24	0.70	0.17	0.55	0.56	0.81	0.96	0.68	0.38	0.37	0.28	0.25	0.14	0.33	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.07	0.09	0.06
C2	0.02	0.00	0.08	0.11	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.13	0.04	0.14	0.16	0.23	0.16
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.07	0.04	0.12	0.00	0.02	0.01	0.08	0.14	0.14	0.09
C3'	0.02	0.11	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.03	0.09	0.07	0.12	0.11	0.13	0.02	0.01	0.01	0.08	0.17	0.13	0.11
C4	0.02	0.01	0.04	0.11	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.14	0.03	0.20	0.27	0.34	0.26
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.07	0.04	0.05	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.06	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.13	0.03	0.21	0.27	0.32	0.27
C5'	0.03	0.08	0.02	0.03	0.14	0.00	0.16	0.00	0.13	0.08	0.11	0.15	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.03	0.18	0.20	0.23	0.20
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.13	0.14	0.18	0.14
N3	0.02	0.00	0.07	0.12	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.15	0.04	0.17	0.22	0.30	0.22
N4	0.02	0.01	0.04	0.11	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.16	0.03	0.21	0.31	0.38	0.29
O2	0.02	0.01	0.12	0.13	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.16	0.06	0.11	0.13	0.20	0.13
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.03	0.07	0.05	0.12	0.00	0.05	0.06	0.06	0.10	0.10	0.06
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.14	0.02	0.13	0.03	0.11	0.07	0.15	0.16	0.16	0.05	0.00	0.02	0.09	0.22	0.17	0.14
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.06	0.02	0.00	0.05	0.07	0.07	0.09
O5'	0.06	0.14	0.08	0.08	0.20	0.01	0.21	0.01	0.18	0.13	0.17	0.21	0.11	0.06	0.09	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.07	0.16	0.14	0.17	0.27	0.06	0.27	0.04	0.20	0.14	0.22	0.31	0.13	0.10	0.22	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.23	0.14	0.13	0.34	0.02	0.32	0.01	0.23	0.18	0.30	0.38	0.20	0.10	0.17	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.16	0.09	0.11	0.26	0.01	0.27	0.01	0.20	0.14	0.22	0.29	0.13	0.06	0.14	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00