Doublet Group distance statistics: 53785

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.003, 0.005, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.006 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.001, 0.010, 0.018, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.001, 0.013, 0.024, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.013 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.001, 0.013, 0.026, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.013 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.010, 0.037, 0.065, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.037 std_dev=0.027
N4	A	0, 0.009, 0.043, 0.077, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.043 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.023, 0.063, 0.104, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.063 std_dev=0.040
C2'	A	0, -0.002, 0.114, 0.230, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.114 std_dev=0.116
C4'	A	0, 0.007, 0.128, 0.250, 0.385 max_d=0.385 avg_d=0.128 std_dev=0.122
C5'	A	0, 0.066, 0.239, 0.411, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.239 std_dev=0.173
N1	B	0, 0.137, 0.328, 0.519, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.328 std_dev=0.191
C1'	B	0, 0.167, 0.362, 0.557, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.362 std_dev=0.195
C2	B	0, 0.109, 0.330, 0.551, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.330 std_dev=0.221
O2'	A	0, -0.037, 0.187, 0.411, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.187 std_dev=0.224
N3	B	0, 0.105, 0.339, 0.574, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.339 std_dev=0.234
C3'	A	0, -0.043, 0.192, 0.428, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.192 std_dev=0.236
O4'	B	0, 0.113, 0.357, 0.602, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.357 std_dev=0.245
C6	B	0, 0.105, 0.351, 0.597, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.351 std_dev=0.246
O2'	B	0, 0.250, 0.505, 0.761, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.505 std_dev=0.256
C2'	B	0, 0.163, 0.432, 0.702, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.432 std_dev=0.270
O2	B	0, 0.114, 0.385, 0.655, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.385 std_dev=0.270
C4	B	0, 0.061, 0.341, 0.621, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.341 std_dev=0.280
C5	B	0, 0.051, 0.358, 0.664, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.358 std_dev=0.307
N4	B	0, 0.024, 0.376, 0.729, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.376 std_dev=0.353
O5'	A	0, 0.035, 0.403, 0.771, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.403 std_dev=0.368
C4'	B	0, 0.021, 0.416, 0.811, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.416 std_dev=0.395
O3'	A	0, -0.105, 0.318, 0.741, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.318 std_dev=0.423
C3'	B	0, 0.016, 0.448, 0.879, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.448 std_dev=0.432
C5'	B	0, -0.042, 0.434, 0.910, 1.551 max_d=1.551 avg_d=0.434 std_dev=0.476
O5'	B	0, -0.073, 0.413, 0.899, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.413 std_dev=0.486
O3'	B	0, -0.006, 0.552, 1.110, 1.766 max_d=1.766 avg_d=0.552 std_dev=0.558
P	B	0, -0.171, 0.409, 0.988, 1.788 max_d=1.788 avg_d=0.409 std_dev=0.580
OP2	B	0, -0.123, 0.487, 1.097, 1.934 max_d=1.934 avg_d=0.487 std_dev=0.610
P	A	0, 0.023, 0.692, 1.362, 1.781 max_d=1.781 avg_d=0.692 std_dev=0.670
OP1	B	0, -0.113, 0.589, 1.292, 2.246 max_d=2.246 avg_d=0.589 std_dev=0.703
OP1	A	0, 0.018, 0.746, 1.475, 2.058 max_d=2.058 avg_d=0.746 std_dev=0.728
OP2	A	0, 0.028, 0.947, 1.866, 2.354 max_d=2.354 avg_d=0.947 std_dev=0.919

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.06	0.06	0.03
C2	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.08	0.02	0.13	0.13	0.14	0.13
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.03	0.07	0.03	0.04	0.07	0.05	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.10	0.08
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.16	0.00	0.19	0.03	0.17	0.10	0.12	0.18	0.05	0.01	0.00	0.01	0.09	0.17	0.14	0.11
C4	0.01	0.00	0.06	0.16	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.19	0.02	0.21	0.24	0.25	0.23
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.05	0.05	0.09	0.02	0.07	0.02	0.00	0.01	0.08	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.07	0.19	0.00	0.10	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.22	0.02	0.23	0.26	0.28	0.24
C5'	0.03	0.08	0.03	0.03	0.14	0.01	0.16	0.00	0.14	0.09	0.11	0.15	0.05	0.07	0.03	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.17	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.18	0.02	0.19	0.20	0.19	0.18
N1	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.12	0.12	0.12	0.11
N3	0.01	0.00	0.04	0.12	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.13	0.02	0.17	0.18	0.19	0.18
N4	0.01	0.00	0.07	0.18	0.00	0.09	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.22	0.02	0.22	0.28	0.30	0.26
O2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.06	0.03	0.10	0.11	0.11	0.10
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.03	0.07	0.03	0.07	0.04	0.02	0.06	0.04	0.12	0.00	0.03	0.07	0.07	0.13	0.09	0.07
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.19	0.02	0.22	0.03	0.18	0.09	0.13	0.22	0.06	0.03	0.00	0.01	0.10	0.23	0.22	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.01	0.00	0.03	0.03	0.13	0.08
O5'	0.05	0.13	0.08	0.09	0.21	0.01	0.23	0.00	0.19	0.12	0.17	0.22	0.10	0.07	0.10	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.13	0.14	0.17	0.24	0.08	0.26	0.06	0.20	0.12	0.18	0.28	0.11	0.13	0.23	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.14	0.10	0.14	0.25	0.03	0.28	0.01	0.19	0.12	0.19	0.30	0.11	0.09	0.22	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.13	0.08	0.11	0.23	0.01	0.24	0.01	0.18	0.11	0.18	0.26	0.10	0.07	0.16	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.17	0.13	0.11	0.12	0.11	0.12	0.11	0.15	0.14	0.17	0.11	0.21	0.15	0.11	0.13	0.10	0.03	0.07	0.03
C2	0.12	0.20	0.13	0.13	0.07	0.11	0.16	0.12	0.17	0.12	0.17	0.05	0.27	0.12	0.13	0.12	0.14	0.11	0.24	0.13
C2'	0.13	0.16	0.11	0.09	0.15	0.09	0.16	0.11	0.17	0.14	0.16	0.15	0.17	0.12	0.09	0.11	0.10	0.05	0.05	0.03
C3'	0.08	0.11	0.06	0.05	0.12	0.06	0.14	0.07	0.13	0.10	0.12	0.13	0.12	0.06	0.07	0.07	0.07	0.02	0.04	0.01
C4	0.12	0.17	0.14	0.19	0.13	0.14	0.27	0.17	0.23	0.13	0.16	0.13	0.26	0.12	0.19	0.12	0.24	0.29	0.43	0.30
C4'	0.11	0.13	0.08	0.05	0.12	0.08	0.11	0.08	0.12	0.10	0.14	0.13	0.16	0.12	0.07	0.11	0.06	0.03	0.06	0.02
C5	0.11	0.17	0.14	0.19	0.09	0.16	0.22	0.20	0.21	0.12	0.17	0.07	0.24	0.12	0.20	0.13	0.26	0.32	0.43	0.32
C5'	0.07	0.14	0.06	0.08	0.14	0.06	0.10	0.07	0.08	0.08	0.17	0.17	0.16	0.06	0.10	0.07	0.08	0.09	0.14	0.07
C6	0.11	0.17	0.12	0.16	0.09	0.14	0.15	0.18	0.17	0.11	0.18	0.09	0.24	0.12	0.17	0.12	0.21	0.25	0.33	0.25
N1	0.12	0.18	0.12	0.13	0.09	0.12	0.13	0.13	0.16	0.12	0.18	0.08	0.24	0.12	0.13	0.12	0.15	0.13	0.22	0.15
N3	0.12	0.19	0.14	0.16	0.12	0.12	0.25	0.14	0.21	0.13	0.16	0.12	0.28	0.12	0.15	0.12	0.18	0.20	0.35	0.22
N4	0.12	0.16	0.15	0.21	0.19	0.15	0.32	0.19	0.25	0.14	0.15	0.22	0.24	0.12	0.22	0.13	0.27	0.35	0.50	0.35
O2	0.15	0.21	0.15	0.14	0.06	0.14	0.10	0.15	0.11	0.14	0.16	0.05	0.29	0.14	0.14	0.14	0.13	0.08	0.14	0.06
O2'	0.26	0.25	0.24	0.20	0.21	0.20	0.21	0.15	0.24	0.25	0.23	0.19	0.27	0.24	0.18	0.24	0.15	0.11	0.07	0.08
O3'	0.11	0.13	0.07	0.05	0.16	0.07	0.19	0.06	0.17	0.13	0.14	0.17	0.12	0.09	0.06	0.11	0.01	0.02	0.02	0.00
O4'	0.13	0.17	0.11	0.08	0.13	0.10	0.10	0.10	0.12	0.12	0.18	0.14	0.21	0.14	0.09	0.12	0.08	0.02	0.05	0.01
O5'	0.13	0.21	0.18	0.21	0.23	0.15	0.18	0.16	0.14	0.16	0.24	0.25	0.23	0.12	0.24	0.11	0.19	0.17	0.24	0.17
OP1	0.23	0.28	0.31	0.35	0.31	0.27	0.29	0.29	0.26	0.26	0.31	0.33	0.28	0.25	0.39	0.21	0.32	0.35	0.42	0.33
OP2	0.28	0.34	0.40	0.46	0.39	0.33	0.38	0.34	0.33	0.31	0.37	0.42	0.33	0.33	0.51	0.24	0.40	0.37	0.48	0.37
P	0.17	0.26	0.26	0.31	0.31	0.21	0.27	0.22	0.22	0.22	0.30	0.34	0.26	0.19	0.34	0.15	0.28	0.27	0.37	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.04	0.14	0.08
C2	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.10	0.04	0.10	0.13	0.25	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.05	0.06	0.12	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.07	0.04
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.10	0.10	0.11	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.04	0.04
C4	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.10	0.02	0.13	0.22	0.32	0.22
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.01	0.06	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.10	0.04	0.13	0.22	0.31	0.23
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.07	0.04	0.06	0.09	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.07	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.08	0.05	0.11	0.16	0.25	0.18
N1	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.09	0.11	0.21	0.14
N3	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.11	0.03	0.12	0.18	0.30	0.19
N4	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.13	0.02	0.14	0.26	0.35	0.24
O2	0.01	0.00	0.12	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.13	0.06	0.08	0.10	0.22	0.13
O2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.05	0.07	0.05	0.06	0.02	0.03	0.06	0.06	0.00	0.02	0.05	0.03	0.06	0.06	0.03
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.10	0.02	0.10	0.02	0.08	0.04	0.11	0.13	0.13	0.02	0.00	0.01	0.05	0.11	0.10	0.08
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.06	0.05	0.01	0.00	0.03	0.05	0.10	0.06
O5'	0.05	0.10	0.04	0.03	0.13	0.01	0.13	0.01	0.11	0.09	0.12	0.14	0.08	0.03	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.13	0.03	0.05	0.22	0.06	0.22	0.07	0.16	0.11	0.18	0.26	0.10	0.06	0.11	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.25	0.07	0.04	0.32	0.02	0.31	0.01	0.25	0.21	0.30	0.35	0.22	0.06	0.10	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.15	0.04	0.04	0.22	0.01	0.23	0.01	0.18	0.14	0.19	0.24	0.13	0.03	0.08	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00