Doublet Group distance statistics: 53793

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 14, 17, 20, 12, 10, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.013 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N4	A	0, 0.014, 0.039, 0.064, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.039 std_dev=0.025
O2	A	0, 0.010, 0.041, 0.071, 0.190 max_d=0.190 avg_d=0.041 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.040, 0.144, 0.248, 0.510 max_d=0.510 avg_d=0.144 std_dev=0.104
C2'	A	0, 0.056, 0.164, 0.273, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.164 std_dev=0.108
C4	B	0, 0.276, 0.402, 0.529, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.402 std_dev=0.127
O2'	A	0, 0.111, 0.244, 0.377, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.244 std_dev=0.133
C4'	A	0, 0.095, 0.239, 0.382, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.239 std_dev=0.144
N9	B	0, 0.255, 0.409, 0.563, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.409 std_dev=0.154
C5	B	0, 0.194, 0.350, 0.507, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.350 std_dev=0.157
C3'	A	0, 0.117, 0.274, 0.431, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.274 std_dev=0.157
N3	B	0, 0.368, 0.554, 0.741, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.554 std_dev=0.187
N7	B	0, 0.202, 0.393, 0.585, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.393 std_dev=0.191
C8	B	0, 0.204, 0.400, 0.597, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.400 std_dev=0.197
C6	B	0, 0.245, 0.444, 0.643, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.444 std_dev=0.199
C1'	B	0, 0.355, 0.566, 0.777, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.566 std_dev=0.211
O3'	A	0, 0.185, 0.410, 0.634, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.410 std_dev=0.224
O4'	B	0, 0.355, 0.580, 0.804, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.580 std_dev=0.225
N1	B	0, 0.308, 0.547, 0.785, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.547 std_dev=0.238
C2	B	0, 0.364, 0.603, 0.843, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.603 std_dev=0.239
O6	B	0, 0.292, 0.537, 0.782, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.537 std_dev=0.245
C5'	A	0, 0.163, 0.431, 0.699, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.431 std_dev=0.268
P	B	0, 0.266, 0.565, 0.864, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.565 std_dev=0.299
C2'	B	0, 0.416, 0.736, 1.057, 1.757 max_d=1.757 avg_d=0.736 std_dev=0.320
C5'	B	0, 0.393, 0.723, 1.052, 2.013 max_d=2.013 avg_d=0.723 std_dev=0.329
C4'	B	0, 0.388, 0.722, 1.057, 2.121 max_d=2.121 avg_d=0.722 std_dev=0.334
N2	B	0, 0.433, 0.779, 1.125, 2.031 max_d=2.031 avg_d=0.779 std_dev=0.346
O5'	B	0, 0.321, 0.674, 1.027, 1.850 max_d=1.850 avg_d=0.674 std_dev=0.353
OP2	B	0, 0.329, 0.705, 1.082, 2.152 max_d=2.152 avg_d=0.705 std_dev=0.377
C3'	B	0, 0.428, 0.814, 1.199, 2.386 max_d=2.386 avg_d=0.814 std_dev=0.385
OP1	B	0, 0.347, 0.755, 1.162, 2.305 max_d=2.305 avg_d=0.755 std_dev=0.408
O2'	B	0, 0.483, 0.936, 1.389, 2.069 max_d=2.069 avg_d=0.936 std_dev=0.453
O3'	B	0, 0.558, 1.132, 1.706, 3.364 max_d=3.364 avg_d=1.132 std_dev=0.574
O5'	A	0, 0.022, 0.725, 1.428, 3.027 max_d=3.027 avg_d=0.725 std_dev=0.703
OP2	A	0, 1.262, 2.006, 2.750, 4.561 max_d=4.561 avg_d=2.006 std_dev=0.744
P	A	0, 0.165, 0.953, 1.740, 3.593 max_d=3.593 avg_d=0.953 std_dev=0.787
OP1	A	0, 1.993, 2.962, 3.931, 4.434 max_d=4.434 avg_d=2.962 std_dev=0.969

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.15	0.37	0.24	0.17
C2	0.03	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.08	0.03	0.34	0.60	0.51	0.37
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.05	0.05	0.13	0.00	0.02	0.01	0.23	0.27	0.22	0.19
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.09	0.01	0.13	0.02	0.13	0.05	0.07	0.10	0.12	0.02	0.01	0.02	0.31	0.31	0.20	0.24
C4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.03	0.51	0.81	0.78	0.59
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.09	0.04	0.05	0.08	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.13	0.22	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.16	0.04	0.54	0.83	0.79	0.62
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.16	0.01	0.18	0.00	0.16	0.09	0.12	0.18	0.07	0.05	0.05	0.01	0.01	0.16	0.35	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01	0.09	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.14	0.04	0.47	0.70	0.59	0.49
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.33	0.56	0.44	0.35
N3	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.03	0.42	0.71	0.66	0.48
N4	0.02	0.02	0.05	0.10	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.12	0.03	0.54	0.88	0.89	0.65
O2	0.05	0.01	0.13	0.12	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.15	0.15	0.06	0.25	0.51	0.41	0.28
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.05	0.03	0.08	0.06	0.15	0.00	0.04	0.05	0.08	0.18	0.14	0.07
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.11	0.02	0.16	0.05	0.14	0.05	0.08	0.12	0.15	0.04	0.00	0.02	0.25	0.42	0.20	0.23
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.06	0.05	0.02	0.00	0.10	0.35	0.25	0.14
O5'	0.15	0.34	0.23	0.31	0.51	0.02	0.54	0.01	0.47	0.33	0.42	0.54	0.25	0.08	0.25	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.37	0.60	0.27	0.31	0.81	0.13	0.83	0.16	0.70	0.56	0.71	0.88	0.51	0.18	0.42	0.35	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.51	0.22	0.20	0.78	0.22	0.79	0.35	0.59	0.44	0.66	0.89	0.41	0.14	0.20	0.25	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.37	0.19	0.24	0.59	0.04	0.62	0.02	0.49	0.35	0.48	0.65	0.28	0.07	0.23	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.37	0.20	0.18	0.22	0.21	0.22	0.28	0.31	0.20	0.37	0.42	0.31	0.19	0.17	0.28	0.19	0.22	0.22	0.33	0.07	0.14	0.07
C2	0.28	0.42	0.28	0.23	0.23	0.25	0.19	0.27	0.27	0.27	0.38	0.50	0.36	0.23	0.20	0.35	0.24	0.25	0.25	0.27	0.13	0.23	0.12
C2'	0.19	0.29	0.16	0.18	0.20	0.19	0.21	0.29	0.27	0.19	0.30	0.33	0.25	0.20	0.16	0.22	0.19	0.19	0.26	0.28	0.13	0.17	0.13
C3'	0.19	0.30	0.16	0.17	0.24	0.15	0.25	0.22	0.30	0.19	0.31	0.32	0.27	0.22	0.19	0.18	0.18	0.20	0.09	0.32	0.02	0.09	0.02
C4	0.26	0.48	0.26	0.22	0.21	0.21	0.13	0.22	0.26	0.30	0.44	0.57	0.38	0.27	0.21	0.31	0.22	0.23	0.26	0.26	0.17	0.32	0.18
C4'	0.19	0.36	0.15	0.16	0.26	0.15	0.29	0.23	0.36	0.21	0.39	0.40	0.30	0.26	0.20	0.19	0.17	0.18	0.06	0.40	0.10	0.22	0.09
C5	0.23	0.46	0.20	0.20	0.22	0.20	0.16	0.23	0.32	0.27	0.46	0.53	0.35	0.21	0.18	0.25	0.20	0.21	0.27	0.33	0.22	0.35	0.23
C5'	0.25	0.43	0.23	0.24	0.34	0.18	0.38	0.22	0.45	0.30	0.46	0.45	0.37	0.36	0.28	0.22	0.24	0.23	0.14	0.49	0.22	0.38	0.20
C6	0.22	0.43	0.19	0.18	0.23	0.20	0.20	0.24	0.34	0.23	0.43	0.49	0.34	0.16	0.17	0.24	0.18	0.21	0.25	0.35	0.19	0.30	0.20
N1	0.24	0.41	0.21	0.18	0.23	0.20	0.21	0.24	0.31	0.23	0.40	0.47	0.34	0.19	0.17	0.28	0.18	0.22	0.22	0.32	0.09	0.21	0.11
N3	0.29	0.45	0.30	0.25	0.21	0.25	0.15	0.24	0.25	0.29	0.39	0.55	0.38	0.25	0.22	0.37	0.26	0.25	0.25	0.25	0.14	0.27	0.13
N4	0.27	0.49	0.28	0.25	0.20	0.22	0.13	0.22	0.20	0.31	0.43	0.62	0.37	0.31	0.22	0.33	0.26	0.23	0.27	0.24	0.20	0.35	0.20
O2	0.31	0.39	0.33	0.29	0.23	0.32	0.21	0.35	0.26	0.28	0.35	0.47	0.34	0.24	0.23	0.41	0.32	0.31	0.30	0.26	0.22	0.23	0.17
O2'	0.24	0.28	0.24	0.26	0.21	0.28	0.21	0.38	0.25	0.21	0.28	0.32	0.25	0.20	0.19	0.30	0.29	0.24	0.36	0.27	0.19	0.18	0.18
O3'	0.20	0.24	0.18	0.22	0.21	0.18	0.23	0.24	0.26	0.19	0.26	0.25	0.23	0.22	0.19	0.18	0.23	0.22	0.02	0.28	0.02	0.02	0.01
O4'	0.20	0.40	0.16	0.14	0.25	0.16	0.28	0.24	0.37	0.20	0.42	0.45	0.33	0.23	0.18	0.23	0.15	0.19	0.13	0.41	0.06	0.17	0.05
O5'	0.54	0.76	0.53	0.50	0.70	0.41	0.75	0.38	0.82	0.65	0.81	0.77	0.70	0.73	0.62	0.50	0.47	0.47	0.44	0.86	0.30	0.57	0.38
OP1	0.58	0.92	0.57	0.56	0.79	0.44	0.87	0.44	0.98	0.69	0.99	0.95	0.82	0.81	0.68	0.53	0.57	0.48	0.51	1.05	0.62	0.73	0.56
OP2	0.66	1.06	0.67	0.59	0.92	0.45	1.01	0.35	1.14	0.78	1.14	1.08	0.95	0.93	0.78	0.63	0.57	0.52	0.43	1.23	0.38	0.54	0.36
P	0.56	0.86	0.56	0.51	0.76	0.40	0.83	0.35	0.93	0.67	0.92	0.87	0.77	0.79	0.66	0.52	0.49	0.46	0.41	1.00	0.34	0.57	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.11	0.02	0.10	0.33	0.12
C2	0.05	0.00	0.23	0.26	0.01	0.10	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.21	0.33	0.08	0.21	0.02	0.13	0.31	0.15
C2'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.12	0.01	0.07	0.02	0.11	0.10	0.18	0.27	0.22	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.18	0.10	0.19	0.27	0.11
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.15	0.01	0.13	0.02	0.17	0.14	0.23	0.31	0.24	0.12	0.07	0.02	0.01	0.01	0.24	0.16	0.25	0.25	0.16
C4	0.02	0.01	0.12	0.15	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.17	0.04	0.22	0.01	0.14	0.30	0.15
C4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.09	0.10	0.10	0.12	0.09	0.10	0.05	0.04	0.03	0.00	0.02	0.10	0.11	0.29	0.06
C5	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.16	0.04	0.30	0.01	0.19	0.30	0.20
C5'	0.03	0.16	0.02	0.02	0.14	0.01	0.18	0.00	0.19	0.17	0.18	0.16	0.13	0.20	0.11	0.05	0.05	0.02	0.01	0.22	0.13	0.27	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.17	0.01	0.09	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.22	0.05	0.30	0.01	0.21	0.30	0.21
C8	0.02	0.02	0.10	0.14	0.01	0.10	0.01	0.17	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.15	0.05	0.31	0.02	0.19	0.29	0.18
N1	0.04	0.01	0.18	0.23	0.02	0.10	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.17	0.29	0.06	0.26	0.01	0.18	0.30	0.18
N2	0.06	0.00	0.27	0.31	0.02	0.12	0.02	0.16	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.26	0.40	0.09	0.19	0.02	0.12	0.31	0.14
N3	0.05	0.01	0.22	0.24	0.01	0.09	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.19	0.29	0.07	0.18	0.01	0.11	0.31	0.13
N7	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.15	0.04	0.35	0.02	0.23	0.29	0.23
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.02	0.21	0.02	0.13	0.31	0.13
O2'	0.02	0.21	0.01	0.02	0.10	0.04	0.07	0.05	0.11	0.07	0.17	0.26	0.19	0.05	0.02	0.00	0.06	0.05	0.07	0.09	0.14	0.28	0.08
O3'	0.02	0.33	0.02	0.01	0.17	0.03	0.16	0.05	0.22	0.15	0.29	0.40	0.29	0.15	0.07	0.06	0.00	0.03	0.22	0.21	0.32	0.26	0.19
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.05	0.05	0.06	0.09	0.07	0.04	0.02	0.05	0.03	0.00	0.11	0.05	0.11	0.38	0.17
O5'	0.11	0.21	0.18	0.24	0.22	0.02	0.30	0.01	0.30	0.31	0.26	0.19	0.18	0.35	0.21	0.07	0.22	0.11	0.00	0.34	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.10	0.16	0.01	0.10	0.01	0.22	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.21	0.05	0.34	0.00	0.26	0.32	0.26
OP1	0.10	0.13	0.19	0.25	0.14	0.11	0.19	0.13	0.21	0.19	0.18	0.12	0.11	0.23	0.13	0.14	0.32	0.11	0.02	0.26	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	0.31	0.27	0.25	0.30	0.29	0.30	0.27	0.30	0.29	0.30	0.31	0.31	0.29	0.31	0.28	0.26	0.38	0.02	0.32	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.15	0.11	0.16	0.15	0.06	0.20	0.02	0.21	0.18	0.18	0.14	0.13	0.23	0.13	0.08	0.19	0.17	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00