Doublet Group distance statistics: 53794

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 5, 13, 6, 18, 14, 11, 5, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.017, 0.023, 0.030, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.023 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.032, 0.040, 0.048, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.040 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.026, 0.034, 0.043, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.034 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.013, 0.021, 0.029, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.025, 0.034, 0.042, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.034 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.018, 0.027, 0.035, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.027 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.016, 0.025, 0.034, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.029, 0.051, 0.074, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.051 std_dev=0.023
N4	A	0, 0.016, 0.048, 0.080, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.048 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.050, 0.148, 0.246, 0.462 max_d=0.462 avg_d=0.148 std_dev=0.098
C2'	A	0, 0.068, 0.167, 0.267, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.167 std_dev=0.100
O2'	A	0, 0.102, 0.236, 0.370, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.236 std_dev=0.134
C4'	A	0, 0.093, 0.227, 0.360, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.227 std_dev=0.134
C3'	A	0, 0.138, 0.276, 0.415, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.276 std_dev=0.139
C5	B	0, 0.336, 0.514, 0.692, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.514 std_dev=0.178
O3'	A	0, 0.216, 0.411, 0.605, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.411 std_dev=0.195
C4	B	0, 0.341, 0.538, 0.736, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.538 std_dev=0.198
C8	B	0, 0.386, 0.589, 0.792, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.589 std_dev=0.203
C6	B	0, 0.380, 0.586, 0.793, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.586 std_dev=0.207
N7	B	0, 0.368, 0.578, 0.788, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.578 std_dev=0.210
N9	B	0, 0.387, 0.612, 0.837, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.612 std_dev=0.225
N1	B	0, 0.341, 0.575, 0.808, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.575 std_dev=0.233
N3	B	0, 0.400, 0.636, 0.873, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.636 std_dev=0.236
C2	B	0, 0.374, 0.615, 0.856, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.615 std_dev=0.241
C5'	A	0, 0.128, 0.380, 0.632, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.380 std_dev=0.252
O6	B	0, 0.489, 0.762, 1.035, 1.590 max_d=1.590 avg_d=0.762 std_dev=0.273
O5'	B	0, 0.489, 0.780, 1.072, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.780 std_dev=0.291
P	B	0, 0.386, 0.682, 0.979, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.682 std_dev=0.297
N2	B	0, 0.452, 0.757, 1.062, 1.652 max_d=1.652 avg_d=0.757 std_dev=0.305
C1'	B	0, 0.498, 0.805, 1.111, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.805 std_dev=0.306
O4'	B	0, 0.442, 0.763, 1.083, 1.586 max_d=1.586 avg_d=0.763 std_dev=0.320
C5'	B	0, 0.463, 0.810, 1.157, 1.740 max_d=1.740 avg_d=0.810 std_dev=0.347
OP2	B	0, 0.457, 0.814, 1.170, 1.905 max_d=1.905 avg_d=0.814 std_dev=0.357
C4'	B	0, 0.494, 0.860, 1.225, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.860 std_dev=0.365
O5'	A	0, 0.206, 0.576, 0.946, 1.812 max_d=1.812 avg_d=0.576 std_dev=0.370
C3'	B	0, 0.575, 0.983, 1.391, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.983 std_dev=0.408
OP1	B	0, 0.500, 0.936, 1.373, 2.206 max_d=2.206 avg_d=0.936 std_dev=0.436
C2'	B	0, 0.572, 1.012, 1.452, 1.778 max_d=1.778 avg_d=1.012 std_dev=0.440
O3'	B	0, 0.613, 1.116, 1.619, 2.389 max_d=2.389 avg_d=1.116 std_dev=0.503
O2'	B	0, 0.682, 1.211, 1.740, 2.239 max_d=2.239 avg_d=1.211 std_dev=0.529
P	A	0, 0.094, 0.626, 1.159, 2.348 max_d=2.348 avg_d=0.626 std_dev=0.533
OP2	A	0, 0.236, 1.108, 1.979, 2.874 max_d=2.874 avg_d=1.108 std_dev=0.872
OP1	A	0, 0.239, 1.147, 2.054, 3.375 max_d=3.375 avg_d=1.147 std_dev=0.907

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.09	0.42	0.19	0.13
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.21	0.60	0.48	0.24
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.05	0.05	0.12	0.00	0.02	0.01	0.14	0.21	0.16	0.14
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.02	0.11	0.04	0.07	0.08	0.11	0.02	0.01	0.01	0.20	0.23	0.13	0.17
C4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.09	0.02	0.30	0.74	0.74	0.34
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.03	0.06	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.09	0.17	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.13	0.03	0.32	0.75	0.74	0.35
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.11	0.07	0.09	0.12	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.12	0.32	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.04	0.27	0.67	0.55	0.29
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.20	0.57	0.41	0.22
N3	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.03	0.26	0.68	0.63	0.29
N4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.10	0.03	0.32	0.77	0.84	0.38
O2	0.03	0.01	0.12	0.11	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.12	0.14	0.05	0.17	0.54	0.40	0.20
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.04	0.05	0.05	0.05	0.02	0.06	0.05	0.12	0.00	0.04	0.04	0.06	0.14	0.08	0.06
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.09	0.02	0.13	0.04	0.12	0.05	0.08	0.10	0.14	0.04	0.00	0.02	0.18	0.41	0.17	0.19
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.02	0.00	0.07	0.43	0.14	0.13
O5'	0.09	0.21	0.14	0.20	0.30	0.02	0.32	0.01	0.27	0.20	0.26	0.32	0.17	0.06	0.18	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.42	0.60	0.21	0.23	0.74	0.09	0.75	0.12	0.67	0.57	0.68	0.77	0.54	0.14	0.41	0.43	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.48	0.16	0.13	0.74	0.17	0.74	0.32	0.55	0.41	0.63	0.84	0.40	0.08	0.17	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.24	0.14	0.17	0.34	0.04	0.35	0.01	0.29	0.22	0.29	0.38	0.20	0.06	0.19	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.23	0.18	0.17	0.17	0.19	0.18	0.25	0.20	0.25	0.20	0.29	0.23	0.26	0.18	0.27	0.18	0.22	0.17	0.24	0.07	0.10	0.05
C2	0.26	0.27	0.24	0.21	0.18	0.23	0.19	0.30	0.21	0.27	0.23	0.34	0.26	0.27	0.20	0.33	0.21	0.24	0.22	0.25	0.14	0.17	0.13
C2'	0.23	0.21	0.17	0.16	0.18	0.17	0.18	0.25	0.18	0.25	0.18	0.24	0.21	0.24	0.19	0.23	0.18	0.22	0.18	0.20	0.11	0.08	0.09
C3'	0.19	0.16	0.10	0.08	0.15	0.10	0.17	0.13	0.18	0.22	0.16	0.19	0.17	0.24	0.16	0.14	0.11	0.22	0.08	0.22	0.02	0.07	0.02
C4	0.22	0.30	0.21	0.20	0.16	0.21	0.15	0.27	0.20	0.21	0.25	0.36	0.27	0.22	0.17	0.27	0.19	0.21	0.22	0.26	0.15	0.24	0.16
C4'	0.19	0.19	0.11	0.09	0.16	0.11	0.20	0.14	0.21	0.24	0.19	0.22	0.19	0.27	0.17	0.16	0.12	0.21	0.07	0.27	0.06	0.15	0.05
C5	0.21	0.26	0.18	0.20	0.16	0.20	0.14	0.26	0.19	0.21	0.23	0.31	0.24	0.22	0.17	0.22	0.19	0.21	0.24	0.25	0.18	0.26	0.19
C5'	0.19	0.23	0.14	0.13	0.21	0.11	0.26	0.12	0.28	0.26	0.25	0.24	0.21	0.31	0.20	0.14	0.15	0.21	0.10	0.34	0.15	0.23	0.12
C6	0.21	0.24	0.17	0.19	0.16	0.20	0.15	0.27	0.19	0.22	0.21	0.29	0.23	0.24	0.17	0.22	0.19	0.21	0.23	0.25	0.16	0.22	0.17
N1	0.22	0.25	0.18	0.17	0.16	0.19	0.17	0.26	0.20	0.25	0.22	0.31	0.24	0.26	0.17	0.26	0.16	0.20	0.19	0.25	0.09	0.15	0.09
N3	0.26	0.30	0.26	0.23	0.18	0.24	0.18	0.30	0.21	0.25	0.25	0.38	0.28	0.25	0.20	0.34	0.22	0.25	0.23	0.25	0.15	0.21	0.14
N4	0.23	0.33	0.23	0.22	0.18	0.22	0.15	0.27	0.21	0.20	0.28	0.41	0.29	0.20	0.18	0.28	0.21	0.22	0.23	0.27	0.17	0.26	0.18
O2	0.30	0.28	0.30	0.27	0.20	0.29	0.21	0.34	0.22	0.30	0.24	0.35	0.27	0.28	0.24	0.40	0.28	0.28	0.26	0.25	0.20	0.18	0.17
O2'	0.28	0.23	0.25	0.24	0.21	0.26	0.19	0.30	0.18	0.26	0.20	0.28	0.25	0.24	0.23	0.32	0.27	0.28	0.22	0.20	0.16	0.08	0.12
O3'	0.18	0.14	0.11	0.09	0.14	0.11	0.17	0.09	0.18	0.19	0.14	0.15	0.14	0.22	0.15	0.12	0.13	0.24	0.02	0.22	0.02	0.02	0.01
O4'	0.20	0.23	0.13	0.12	0.17	0.14	0.20	0.20	0.22	0.24	0.22	0.28	0.22	0.27	0.17	0.21	0.13	0.20	0.11	0.28	0.03	0.13	0.03
O5'	0.38	0.47	0.36	0.33	0.43	0.29	0.45	0.26	0.47	0.40	0.47	0.48	0.45	0.44	0.40	0.35	0.32	0.36	0.31	0.49	0.26	0.38	0.28
OP1	0.50	0.70	0.51	0.52	0.61	0.42	0.63	0.47	0.70	0.52	0.72	0.73	0.64	0.58	0.54	0.50	0.57	0.44	0.54	0.72	0.72	0.75	0.62
OP2	0.55	0.88	0.59	0.51	0.76	0.39	0.83	0.30	0.93	0.61	0.93	0.90	0.80	0.75	0.64	0.56	0.51	0.44	0.33	0.99	0.33	0.35	0.26
P	0.40	0.53	0.41	0.38	0.48	0.32	0.51	0.29	0.55	0.44	0.55	0.54	0.50	0.50	0.44	0.39	0.39	0.36	0.33	0.58	0.32	0.41	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.07	0.02	0.07	0.16	0.09
C2	0.03	0.00	0.15	0.16	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.15	0.19	0.07	0.15	0.01	0.14	0.23	0.14
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.08	0.01	0.07	0.04	0.09	0.09	0.12	0.18	0.14	0.08	0.03	0.00	0.02	0.01	0.06	0.09	0.13	0.22	0.11
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.12	0.00	0.15	0.02	0.16	0.15	0.16	0.17	0.14	0.16	0.09	0.02	0.01	0.01	0.10	0.18	0.16	0.18	0.13
C4	0.01	0.01	0.08	0.12	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.04	0.16	0.01	0.14	0.21	0.14
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.05	0.05	0.04	0.10	0.05	0.08	0.03	0.00	0.01	0.08	0.08	0.10	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.15	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.17	0.02	0.21	0.01	0.20	0.26	0.20
C5'	0.03	0.09	0.04	0.02	0.10	0.01	0.14	0.00	0.15	0.16	0.12	0.08	0.07	0.18	0.09	0.05	0.05	0.01	0.01	0.17	0.12	0.09	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.16	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.20	0.04	0.22	0.01	0.23	0.29	0.22
C8	0.01	0.02	0.09	0.15	0.01	0.10	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.17	0.05	0.21	0.02	0.19	0.23	0.18
N1	0.02	0.00	0.12	0.16	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.20	0.05	0.19	0.01	0.19	0.27	0.18
N2	0.04	0.00	0.18	0.17	0.02	0.05	0.02	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.20	0.22	0.08	0.14	0.01	0.13	0.22	0.13
N3	0.03	0.01	0.14	0.14	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.16	0.06	0.13	0.01	0.12	0.20	0.12
N7	0.01	0.02	0.08	0.16	0.01	0.10	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.20	0.03	0.24	0.02	0.24	0.28	0.23
N9	0.00	0.02	0.03	0.09	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.14	0.02	0.12	0.19	0.12
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.08	0.08	0.07	0.05	0.09	0.08	0.12	0.20	0.15	0.08	0.03	0.00	0.06	0.06	0.05	0.09	0.13	0.20	0.09
O3'	0.03	0.19	0.02	0.01	0.12	0.03	0.17	0.05	0.20	0.17	0.20	0.22	0.16	0.20	0.08	0.06	0.00	0.03	0.15	0.23	0.26	0.25	0.20
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.05	0.05	0.08	0.06	0.03	0.01	0.06	0.03	0.00	0.12	0.04	0.14	0.16	0.15
O5'	0.07	0.15	0.06	0.10	0.16	0.01	0.21	0.01	0.22	0.21	0.19	0.14	0.13	0.24	0.14	0.05	0.15	0.12	0.00	0.24	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.09	0.18	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.23	0.04	0.24	0.00	0.27	0.33	0.25
OP1	0.07	0.14	0.13	0.16	0.14	0.08	0.20	0.12	0.23	0.19	0.19	0.13	0.12	0.24	0.12	0.13	0.26	0.14	0.02	0.27	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	0.23	0.22	0.18	0.21	0.10	0.26	0.09	0.29	0.23	0.27	0.22	0.20	0.28	0.19	0.20	0.25	0.16	0.02	0.33	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.14	0.11	0.13	0.14	0.03	0.20	0.01	0.22	0.18	0.18	0.13	0.12	0.23	0.12	0.09	0.20	0.15	0.00	0.25	0.01	0.01	0.00