Doublet Group distance statistics: 53795

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 7, 10, 6, 4, 4, 12, 4, 7, 6, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.007, 0.013, 0.018, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.010, 0.021, 0.031, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.019, 0.033, 0.046, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.033 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.021, 0.035, 0.048, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.035 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.023, 0.036, 0.050, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.036 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.021, 0.035, 0.049, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.035 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.067, 0.101, 0.134, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.101 std_dev=0.034
N4	A	0, 0.067, 0.113, 0.159, 0.228 max_d=0.228 avg_d=0.113 std_dev=0.046
O4'	A	0, 0.054, 0.144, 0.234, 0.371 max_d=0.371 avg_d=0.144 std_dev=0.090
C2'	A	0, 0.077, 0.171, 0.266, 0.446 max_d=0.446 avg_d=0.171 std_dev=0.094
O2'	A	0, 0.120, 0.248, 0.375, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.248 std_dev=0.127
C4'	A	0, 0.097, 0.238, 0.379, 0.611 max_d=0.611 avg_d=0.238 std_dev=0.141
C3'	A	0, 0.121, 0.269, 0.418, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.269 std_dev=0.149
C8	B	0, 0.185, 0.396, 0.607, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.396 std_dev=0.211
N9	B	0, 0.217, 0.437, 0.656, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.437 std_dev=0.220
O3'	A	0, 0.179, 0.410, 0.641, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.410 std_dev=0.231
N7	B	0, 0.186, 0.427, 0.668, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.427 std_dev=0.241
C5	B	0, 0.208, 0.452, 0.696, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.452 std_dev=0.244
C4	B	0, 0.221, 0.479, 0.736, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.479 std_dev=0.257
C5'	A	0, 0.168, 0.434, 0.700, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.434 std_dev=0.266
C1'	B	0, 0.303, 0.580, 0.856, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.580 std_dev=0.277
O4'	B	0, 0.303, 0.582, 0.860, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.582 std_dev=0.279
O5'	B	0, 0.301, 0.600, 0.898, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.600 std_dev=0.298
C6	B	0, 0.290, 0.590, 0.889, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.590 std_dev=0.299
C5'	B	0, 0.354, 0.674, 0.994, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.674 std_dev=0.320
P	B	0, 0.246, 0.573, 0.900, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.573 std_dev=0.327
C4'	B	0, 0.337, 0.673, 1.009, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.673 std_dev=0.336
C2'	B	0, 0.356, 0.692, 1.028, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.692 std_dev=0.336
N3	B	0, 0.310, 0.651, 0.992, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.651 std_dev=0.341
O6	B	0, 0.350, 0.692, 1.033, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.692 std_dev=0.342
C3'	B	0, 0.373, 0.726, 1.080, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.726 std_dev=0.353
N1	B	0, 0.355, 0.709, 1.062, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.709 std_dev=0.354
OP2	B	0, 0.281, 0.647, 1.013, 1.572 max_d=1.572 avg_d=0.647 std_dev=0.366
C2	B	0, 0.372, 0.750, 1.127, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.750 std_dev=0.378
O2'	B	0, 0.390, 0.828, 1.267, 1.751 max_d=1.751 avg_d=0.828 std_dev=0.438
OP1	B	0, 0.332, 0.792, 1.252, 1.985 max_d=1.985 avg_d=0.792 std_dev=0.460
N2	B	0, 0.498, 0.973, 1.448, 2.042 max_d=2.042 avg_d=0.973 std_dev=0.475
O3'	B	0, 0.442, 0.923, 1.405, 1.963 max_d=1.963 avg_d=0.923 std_dev=0.481
O5'	A	0, 0.072, 0.647, 1.222, 2.763 max_d=2.763 avg_d=0.647 std_dev=0.575
P	A	0, 0.185, 0.924, 1.662, 3.449 max_d=3.449 avg_d=0.924 std_dev=0.739
OP2	A	0, 0.188, 0.964, 1.740, 3.631 max_d=3.631 avg_d=0.964 std_dev=0.776
OP1	A	0, 0.258, 1.143, 2.027, 4.005 max_d=4.005 avg_d=1.143 std_dev=0.884

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.17	0.18	0.17	0.16
C2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.08	0.03	0.35	0.35	0.38	0.35
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.07	0.03	0.06	0.07	0.11	0.00	0.03	0.01	0.19	0.22	0.14	0.16
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.11	0.00	0.13	0.03	0.12	0.06	0.09	0.12	0.11	0.01	0.01	0.01	0.24	0.29	0.12	0.20
C4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.13	0.03	0.51	0.54	0.60	0.55
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.06	0.09	0.05	0.05	0.02	0.01	0.02	0.11	0.19	0.03
C5	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.10	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.16	0.04	0.54	0.57	0.59	0.57
C5'	0.03	0.11	0.02	0.03	0.19	0.01	0.20	0.00	0.17	0.11	0.15	0.21	0.07	0.05	0.05	0.02	0.01	0.17	0.29	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.09	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.14	0.04	0.47	0.46	0.43	0.46
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02	0.35	0.33	0.32	0.33
N3	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.10	0.03	0.44	0.45	0.50	0.46
N4	0.02	0.01	0.07	0.12	0.00	0.09	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.15	0.03	0.55	0.61	0.67	0.61
O2	0.04	0.01	0.11	0.11	0.02	0.05	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.14	0.14	0.05	0.27	0.26	0.31	0.27
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.08	0.05	0.06	0.05	0.05	0.04	0.10	0.09	0.14	0.00	0.06	0.04	0.06	0.13	0.12	0.06
O3'	0.02	0.08	0.03	0.01	0.13	0.02	0.16	0.05	0.14	0.05	0.10	0.15	0.14	0.06	0.00	0.02	0.18	0.30	0.17	0.19
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.02	0.00	0.11	0.15	0.19	0.13
O5'	0.17	0.35	0.19	0.24	0.51	0.02	0.54	0.01	0.47	0.35	0.44	0.55	0.27	0.06	0.18	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.18	0.35	0.22	0.29	0.54	0.11	0.57	0.17	0.46	0.33	0.45	0.61	0.26	0.13	0.30	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.17	0.38	0.14	0.12	0.60	0.19	0.59	0.29	0.43	0.32	0.50	0.67	0.31	0.12	0.17	0.19	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.16	0.35	0.16	0.20	0.55	0.03	0.57	0.02	0.46	0.33	0.46	0.61	0.27	0.06	0.19	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.27	0.16	0.15	0.22	0.16	0.24	0.21	0.26	0.24	0.27	0.29	0.24	0.26	0.20	0.19	0.15	0.16	0.21	0.28	0.08	0.10	0.06
C2	0.23	0.30	0.22	0.18	0.22	0.22	0.21	0.23	0.23	0.21	0.27	0.34	0.29	0.23	0.19	0.28	0.20	0.22	0.21	0.24	0.11	0.19	0.09
C2'	0.18	0.23	0.15	0.15	0.21	0.15	0.24	0.21	0.25	0.25	0.24	0.23	0.21	0.27	0.20	0.16	0.16	0.16	0.25	0.27	0.13	0.10	0.12
C3'	0.18	0.21	0.14	0.14	0.19	0.14	0.20	0.16	0.22	0.19	0.22	0.22	0.20	0.21	0.18	0.16	0.16	0.18	0.09	0.24	0.02	0.07	0.01
C4	0.22	0.37	0.21	0.18	0.22	0.20	0.17	0.20	0.21	0.21	0.31	0.44	0.34	0.24	0.18	0.27	0.18	0.21	0.20	0.23	0.17	0.32	0.18
C4'	0.17	0.25	0.13	0.14	0.21	0.12	0.23	0.16	0.26	0.21	0.27	0.27	0.23	0.23	0.19	0.15	0.15	0.16	0.07	0.28	0.09	0.18	0.08
C5	0.19	0.36	0.17	0.18	0.23	0.17	0.21	0.20	0.27	0.22	0.34	0.42	0.31	0.25	0.18	0.21	0.18	0.18	0.23	0.28	0.22	0.36	0.23
C5'	0.25	0.33	0.22	0.23	0.29	0.19	0.31	0.19	0.34	0.29	0.34	0.34	0.30	0.31	0.27	0.22	0.24	0.22	0.13	0.36	0.22	0.32	0.19
C6	0.17	0.32	0.15	0.16	0.22	0.15	0.23	0.19	0.28	0.22	0.32	0.37	0.28	0.25	0.17	0.18	0.16	0.15	0.21	0.30	0.18	0.30	0.19
N1	0.18	0.30	0.16	0.14	0.22	0.16	0.23	0.19	0.26	0.23	0.29	0.33	0.27	0.25	0.18	0.20	0.14	0.17	0.19	0.27	0.07	0.19	0.08
N3	0.24	0.33	0.24	0.19	0.21	0.23	0.16	0.22	0.20	0.18	0.27	0.39	0.32	0.21	0.17	0.31	0.21	0.24	0.20	0.23	0.12	0.25	0.12
N4	0.25	0.42	0.24	0.22	0.24	0.22	0.17	0.21	0.19	0.23	0.32	0.51	0.37	0.26	0.21	0.30	0.22	0.24	0.23	0.24	0.21	0.37	0.22
O2	0.28	0.29	0.29	0.27	0.24	0.31	0.23	0.30	0.24	0.23	0.26	0.32	0.29	0.24	0.23	0.35	0.31	0.28	0.28	0.25	0.22	0.18	0.17
O2'	0.26	0.27	0.25	0.26	0.27	0.26	0.28	0.30	0.28	0.30	0.27	0.27	0.26	0.29	0.27	0.26	0.28	0.26	0.34	0.29	0.23	0.13	0.19
O3'	0.18	0.18	0.15	0.17	0.17	0.16	0.18	0.18	0.19	0.17	0.18	0.18	0.18	0.18	0.17	0.17	0.20	0.19	0.02	0.21	0.02	0.02	0.01
O4'	0.17	0.29	0.13	0.12	0.22	0.13	0.25	0.17	0.29	0.21	0.30	0.32	0.25	0.25	0.18	0.16	0.13	0.15	0.14	0.31	0.05	0.14	0.03
O5'	0.42	0.61	0.43	0.43	0.57	0.33	0.61	0.32	0.65	0.53	0.64	0.61	0.57	0.60	0.51	0.38	0.42	0.35	0.34	0.67	0.25	0.46	0.30
OP1	0.48	0.68	0.52	0.53	0.63	0.41	0.69	0.40	0.74	0.59	0.73	0.68	0.63	0.67	0.57	0.47	0.55	0.40	0.45	0.78	0.46	0.64	0.45
OP2	0.49	0.74	0.53	0.51	0.66	0.38	0.71	0.32	0.78	0.57	0.78	0.75	0.68	0.66	0.57	0.48	0.53	0.39	0.35	0.82	0.35	0.47	0.32
P	0.43	0.67	0.46	0.46	0.60	0.34	0.66	0.32	0.72	0.54	0.71	0.67	0.61	0.63	0.53	0.41	0.47	0.35	0.35	0.75	0.33	0.52	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.20	0.10
C2	0.04	0.00	0.13	0.16	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.20	0.05	0.13	0.01	0.13	0.27	0.15
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.08	0.07	0.11	0.16	0.13	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.10	0.07	0.13	0.14	0.08
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.10	0.01	0.10	0.02	0.12	0.11	0.14	0.18	0.14	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.15	0.13	0.17	0.13	0.11
C4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.12	0.03	0.13	0.02	0.12	0.27	0.15
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.05	0.07	0.06	0.06	0.03	0.05	0.03	0.00	0.02	0.07	0.10	0.13	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.03	0.15	0.02	0.16	0.29	0.17
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.09	0.09	0.08	0.08	0.07	0.10	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.11	0.10	0.13	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.17	0.04	0.16	0.01	0.18	0.29	0.18
C8	0.02	0.02	0.07	0.11	0.01	0.06	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.13	0.04	0.16	0.04	0.15	0.27	0.16
N1	0.03	0.00	0.11	0.14	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.19	0.05	0.15	0.01	0.16	0.29	0.17
N2	0.05	0.01	0.16	0.18	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.16	0.24	0.07	0.13	0.02	0.12	0.27	0.14
N3	0.04	0.01	0.13	0.14	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.17	0.05	0.12	0.01	0.11	0.26	0.14
N7	0.01	0.02	0.06	0.11	0.00	0.06	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.04	0.17	0.04	0.18	0.29	0.18
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.12	0.03	0.11	0.25	0.13
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.06	0.05	0.10	0.16	0.11	0.04	0.02	0.00	0.06	0.03	0.06	0.06	0.12	0.14	0.06
O3'	0.02	0.20	0.02	0.01	0.12	0.03	0.14	0.04	0.17	0.13	0.19	0.24	0.17	0.14	0.06	0.06	0.00	0.02	0.18	0.18	0.24	0.19	0.17
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.07	0.05	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.10	0.05	0.10	0.21	0.11
O5'	0.09	0.13	0.10	0.15	0.13	0.02	0.15	0.01	0.16	0.16	0.15	0.13	0.12	0.17	0.12	0.06	0.18	0.10	0.00	0.17	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.02	0.07	0.02	0.11	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.06	0.18	0.05	0.17	0.00	0.21	0.30	0.20
OP1	0.09	0.13	0.13	0.17	0.12	0.10	0.16	0.10	0.18	0.15	0.16	0.12	0.11	0.18	0.11	0.12	0.24	0.10	0.02	0.21	0.00	0.02	0.01
OP2	0.20	0.27	0.14	0.13	0.27	0.13	0.29	0.13	0.29	0.27	0.29	0.27	0.26	0.29	0.25	0.14	0.19	0.21	0.02	0.30	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.15	0.08	0.11	0.15	0.03	0.17	0.02	0.18	0.16	0.17	0.14	0.14	0.18	0.13	0.06	0.17	0.11	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00