Doublet Group distance statistics: 53797

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 3, 9, 6, 6, 6, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.001, 0.017, 0.033, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.017 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.001, 0.019, 0.036, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.019 std_dev=0.018
N4	A	0, 0.011, 0.037, 0.062, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.037 std_dev=0.025
O2	A	0, 0.005, 0.043, 0.081, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.043 std_dev=0.038
O4'	A	0, 0.039, 0.198, 0.357, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.198 std_dev=0.159
N3	B	0, 0.366, 0.538, 0.711, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.538 std_dev=0.172
C2'	A	0, 0.038, 0.213, 0.388, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.213 std_dev=0.175
C4	B	0, 0.301, 0.488, 0.674, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.488 std_dev=0.187
O2'	A	0, 0.101, 0.293, 0.486, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.293 std_dev=0.193
C2	B	0, 0.381, 0.575, 0.769, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.575 std_dev=0.194
C5	B	0, 0.314, 0.523, 0.732, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.523 std_dev=0.209
N1	B	0, 0.380, 0.594, 0.807, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.594 std_dev=0.213
C1'	B	0, 0.268, 0.481, 0.695, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.481 std_dev=0.214
N2	B	0, 0.432, 0.648, 0.863, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.648 std_dev=0.215
N9	B	0, 0.237, 0.453, 0.668, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.453 std_dev=0.215
O4'	B	0, 0.214, 0.432, 0.651, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.432 std_dev=0.219
C4'	A	0, 0.124, 0.343, 0.561, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.343 std_dev=0.219
C6	B	0, 0.366, 0.591, 0.816, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.591 std_dev=0.225
C3'	A	0, 0.114, 0.364, 0.614, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.364 std_dev=0.250
C8	B	0, 0.227, 0.481, 0.735, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.481 std_dev=0.254
N7	B	0, 0.265, 0.528, 0.790, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.528 std_dev=0.263
O6	B	0, 0.387, 0.669, 0.951, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.669 std_dev=0.282
C2'	B	0, 0.368, 0.659, 0.951, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.659 std_dev=0.292
C4'	B	0, 0.284, 0.588, 0.893, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.588 std_dev=0.305
C3'	B	0, 0.434, 0.767, 1.099, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.767 std_dev=0.332
C5'	B	0, 0.290, 0.623, 0.957, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.623 std_dev=0.334
O3'	A	0, 0.169, 0.504, 0.838, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.504 std_dev=0.334
O5'	A	0, 0.209, 0.574, 0.938, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.574 std_dev=0.365
O2'	B	0, 0.367, 0.741, 1.116, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.741 std_dev=0.375
P	B	0, 0.204, 0.597, 0.989, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.597 std_dev=0.392
O3'	B	0, 0.631, 1.034, 1.437, 1.889 max_d=1.889 avg_d=1.034 std_dev=0.403
O5'	B	0, 0.290, 0.709, 1.129, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.709 std_dev=0.420
OP2	B	0, 0.258, 0.701, 1.145, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.701 std_dev=0.444
P	A	0, 0.280, 0.725, 1.170, 1.788 max_d=1.788 avg_d=0.725 std_dev=0.445
C5'	A	0, 0.187, 0.654, 1.120, 1.771 max_d=1.771 avg_d=0.654 std_dev=0.466
OP1	B	0, 0.236, 0.707, 1.177, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.707 std_dev=0.470
OP1	A	0, 0.382, 0.935, 1.487, 2.184 max_d=2.184 avg_d=0.935 std_dev=0.553
OP2	A	0, 0.568, 1.160, 1.752, 2.914 max_d=2.914 avg_d=1.160 std_dev=0.592

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.07	0.02	0.01	0.03	0.03	0.07	0.02	0.02	0.01	0.14	0.26	0.33	0.12
C2	0.03	0.00	0.08	0.12	0.02	0.08	0.02	0.21	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.13	0.03	0.25	0.34	0.40	0.18
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.05	0.02	0.08	0.04	0.09	0.02	0.06	0.06	0.16	0.01	0.03	0.01	0.21	0.22	0.22	0.13
C3'	0.02	0.12	0.01	0.00	0.10	0.01	0.14	0.04	0.15	0.06	0.11	0.10	0.20	0.03	0.01	0.02	0.31	0.27	0.16	0.20
C4	0.03	0.02	0.05	0.10	0.00	0.11	0.00	0.30	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.08	0.11	0.04	0.34	0.44	0.47	0.27
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.11	0.00	0.13	0.01	0.13	0.07	0.09	0.12	0.11	0.07	0.03	0.00	0.02	0.12	0.29	0.05
C5	0.02	0.02	0.08	0.14	0.00	0.13	0.00	0.31	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.17	0.05	0.36	0.46	0.45	0.27
C5'	0.07	0.21	0.04	0.04	0.30	0.01	0.31	0.00	0.27	0.19	0.26	0.32	0.19	0.07	0.08	0.02	0.01	0.18	0.35	0.03
C6	0.02	0.02	0.09	0.15	0.01	0.13	0.01	0.27	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.17	0.04	0.32	0.40	0.39	0.21
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.07	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.07	0.02	0.24	0.33	0.37	0.16
N3	0.03	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.12	0.03	0.30	0.39	0.44	0.23
N4	0.03	0.02	0.06	0.10	0.01	0.12	0.01	0.32	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.09	0.13	0.04	0.37	0.47	0.50	0.30
O2	0.07	0.01	0.16	0.20	0.02	0.11	0.03	0.19	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.14	0.22	0.07	0.22	0.30	0.38	0.17
O2'	0.02	0.09	0.01	0.03	0.08	0.07	0.06	0.07	0.06	0.04	0.10	0.09	0.14	0.00	0.04	0.06	0.09	0.18	0.23	0.08
O3'	0.02	0.13	0.03	0.01	0.11	0.03	0.17	0.08	0.17	0.07	0.12	0.13	0.22	0.04	0.00	0.03	0.30	0.35	0.17	0.24
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.07	0.06	0.03	0.00	0.18	0.27	0.38	0.18
O5'	0.14	0.25	0.21	0.31	0.34	0.02	0.36	0.01	0.32	0.24	0.30	0.37	0.22	0.09	0.30	0.18	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.26	0.34	0.22	0.27	0.44	0.12	0.46	0.18	0.40	0.33	0.39	0.47	0.30	0.18	0.35	0.27	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	0.40	0.22	0.16	0.47	0.29	0.45	0.35	0.39	0.37	0.44	0.50	0.38	0.23	0.17	0.38	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.18	0.13	0.20	0.27	0.05	0.27	0.03	0.21	0.16	0.23	0.30	0.17	0.08	0.24	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.22	0.16	0.16	0.19	0.18	0.25	0.23	0.27	0.24	0.25	0.23	0.19	0.29	0.18	0.23	0.17	0.17	0.34	0.31	0.11	0.12	0.09
C2	0.18	0.21	0.18	0.17	0.17	0.19	0.22	0.23	0.25	0.21	0.23	0.23	0.19	0.25	0.15	0.25	0.18	0.18	0.34	0.28	0.15	0.20	0.15
C2'	0.17	0.22	0.14	0.17	0.21	0.16	0.25	0.27	0.26	0.27	0.24	0.22	0.21	0.29	0.21	0.20	0.17	0.16	0.40	0.29	0.20	0.10	0.18
C3'	0.25	0.23	0.21	0.19	0.24	0.23	0.26	0.21	0.26	0.27	0.25	0.23	0.23	0.29	0.24	0.27	0.20	0.26	0.11	0.29	0.03	0.11	0.02
C4	0.19	0.22	0.18	0.18	0.14	0.21	0.18	0.26	0.24	0.18	0.24	0.25	0.18	0.21	0.15	0.22	0.18	0.21	0.36	0.28	0.20	0.25	0.21
C4'	0.23	0.26	0.20	0.19	0.27	0.21	0.32	0.23	0.33	0.33	0.30	0.26	0.24	0.37	0.26	0.24	0.20	0.22	0.08	0.38	0.17	0.35	0.16
C5	0.19	0.21	0.17	0.18	0.14	0.22	0.20	0.28	0.26	0.21	0.25	0.24	0.17	0.25	0.16	0.21	0.18	0.22	0.39	0.32	0.22	0.26	0.24
C5'	0.40	0.46	0.41	0.41	0.47	0.40	0.53	0.42	0.54	0.52	0.50	0.45	0.44	0.57	0.45	0.40	0.42	0.37	0.24	0.58	0.36	0.60	0.35
C6	0.19	0.21	0.17	0.18	0.16	0.21	0.22	0.27	0.27	0.23	0.25	0.23	0.18	0.28	0.16	0.21	0.18	0.21	0.39	0.33	0.19	0.22	0.22
N1	0.17	0.21	0.16	0.15	0.17	0.19	0.23	0.23	0.27	0.22	0.24	0.23	0.18	0.27	0.15	0.22	0.16	0.18	0.35	0.31	0.13	0.16	0.14
N3	0.19	0.21	0.20	0.19	0.15	0.21	0.20	0.24	0.23	0.18	0.23	0.24	0.19	0.22	0.15	0.24	0.19	0.20	0.34	0.26	0.17	0.23	0.18
N4	0.20	0.24	0.20	0.20	0.15	0.21	0.16	0.27	0.20	0.19	0.23	0.28	0.21	0.20	0.17	0.23	0.20	0.22	0.36	0.25	0.23	0.28	0.23
O2	0.19	0.21	0.21	0.20	0.19	0.22	0.23	0.27	0.24	0.23	0.23	0.23	0.19	0.26	0.18	0.28	0.20	0.19	0.33	0.27	0.19	0.23	0.18
O2'	0.26	0.27	0.27	0.31	0.27	0.31	0.28	0.44	0.28	0.30	0.27	0.28	0.27	0.30	0.27	0.29	0.32	0.27	0.48	0.30	0.29	0.13	0.24
O3'	0.24	0.21	0.22	0.22	0.21	0.26	0.23	0.23	0.24	0.24	0.22	0.21	0.21	0.26	0.22	0.29	0.24	0.27	0.02	0.27	0.02	0.02	0.01
O4'	0.17	0.22	0.14	0.12	0.20	0.15	0.27	0.20	0.30	0.27	0.26	0.23	0.19	0.32	0.19	0.21	0.13	0.16	0.18	0.35	0.10	0.28	0.07
O5'	0.31	0.38	0.30	0.28	0.35	0.27	0.37	0.29	0.40	0.33	0.40	0.39	0.36	0.37	0.33	0.30	0.26	0.30	0.35	0.43	0.19	0.31	0.24
OP1	0.30	0.44	0.27	0.24	0.38	0.26	0.42	0.32	0.47	0.33	0.47	0.45	0.40	0.39	0.34	0.27	0.25	0.29	0.27	0.52	0.39	0.42	0.32
OP2	0.41	0.47	0.38	0.36	0.44	0.41	0.45	0.45	0.48	0.41	0.49	0.49	0.45	0.43	0.41	0.40	0.36	0.41	0.24	0.52	0.28	0.35	0.23
P	0.26	0.33	0.23	0.21	0.29	0.25	0.32	0.30	0.36	0.28	0.36	0.34	0.30	0.32	0.27	0.25	0.21	0.27	0.23	0.41	0.21	0.32	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.05	0.03	0.02	0.05	0.07	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.20	0.04	0.16	0.20	0.13
C2	0.05	0.00	0.11	0.12	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.14	0.06	0.28	0.02	0.25	0.31	0.23
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.03	0.05	0.08	0.09	0.15	0.11	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.19	0.06	0.21	0.18	0.13
C3'	0.02	0.12	0.01	0.00	0.08	0.01	0.09	0.03	0.10	0.12	0.11	0.15	0.11	0.12	0.06	0.01	0.01	0.02	0.21	0.12	0.27	0.16	0.15
C4	0.03	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.17	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.28	0.03	0.24	0.29	0.23
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.12	0.07	0.08	0.06	0.12	0.06	0.07	0.02	0.01	0.02	0.12	0.12	0.18	0.06
C5	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.09	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.03	0.31	0.03	0.28	0.33	0.27
C5'	0.05	0.16	0.03	0.03	0.17	0.01	0.24	0.00	0.25	0.24	0.21	0.15	0.14	0.27	0.15	0.06	0.06	0.01	0.01	0.28	0.21	0.25	0.02
C6	0.03	0.01	0.05	0.10	0.02	0.09	0.01	0.25	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.08	0.12	0.04	0.32	0.01	0.30	0.35	0.29
C8	0.02	0.02	0.08	0.12	0.01	0.12	0.01	0.24	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.15	0.04	0.32	0.05	0.27	0.29	0.25
N1	0.05	0.01	0.09	0.11	0.02	0.07	0.01	0.21	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.12	0.13	0.05	0.30	0.01	0.28	0.34	0.26
N2	0.07	0.01	0.15	0.15	0.02	0.08	0.02	0.15	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.19	0.19	0.07	0.27	0.03	0.24	0.30	0.22
N3	0.05	0.01	0.11	0.11	0.01	0.06	0.01	0.14	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.13	0.06	0.27	0.02	0.23	0.28	0.21
N7	0.01	0.02	0.06	0.12	0.01	0.12	0.01	0.27	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.15	0.04	0.33	0.05	0.30	0.34	0.29
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.15	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.28	0.04	0.23	0.26	0.21
O2'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.07	0.07	0.05	0.06	0.08	0.06	0.12	0.19	0.14	0.05	0.02	0.00	0.04	0.04	0.09	0.08	0.14	0.15	0.07
O3'	0.02	0.14	0.03	0.01	0.08	0.02	0.11	0.06	0.12	0.15	0.13	0.19	0.13	0.15	0.07	0.04	0.00	0.02	0.19	0.14	0.27	0.19	0.15
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.05	0.07	0.06	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.18	0.05	0.13	0.21	0.12
O5'	0.20	0.28	0.19	0.21	0.28	0.02	0.31	0.01	0.32	0.32	0.30	0.27	0.27	0.33	0.28	0.09	0.19	0.18	0.00	0.33	0.02	0.02	0.01
O6	0.04	0.02	0.06	0.12	0.03	0.12	0.03	0.28	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.04	0.08	0.14	0.05	0.33	0.00	0.33	0.38	0.32
OP1	0.16	0.25	0.21	0.27	0.24	0.12	0.28	0.21	0.30	0.27	0.28	0.24	0.23	0.30	0.23	0.14	0.27	0.13	0.02	0.33	0.00	0.02	0.01
OP2	0.20	0.31	0.18	0.16	0.29	0.18	0.33	0.25	0.35	0.29	0.34	0.30	0.28	0.34	0.26	0.15	0.19	0.21	0.02	0.38	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.23	0.13	0.15	0.23	0.06	0.27	0.02	0.29	0.25	0.26	0.22	0.21	0.29	0.21	0.07	0.15	0.12	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00