Doublet Group distance statistics: 53798

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 1, 3, 7, 4, 8, 3, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.011, 0.016, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.009, 0.015, 0.022, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.012, 0.019, 0.025, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.019 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.014, 0.026, 0.037, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.011, 0.022, 0.034, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.021 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.021, 0.052, 0.083, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.052 std_dev=0.031
N4	A	0, 0.023, 0.060, 0.098, 0.155 max_d=0.155 avg_d=0.060 std_dev=0.038
O4'	A	0, 0.035, 0.149, 0.262, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.149 std_dev=0.114
C2'	A	0, 0.084, 0.199, 0.314, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.199 std_dev=0.115
O2'	A	0, 0.135, 0.286, 0.438, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.286 std_dev=0.151
C4'	A	0, 0.126, 0.287, 0.448, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.287 std_dev=0.161
C3'	A	0, 0.111, 0.288, 0.464, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.288 std_dev=0.176
C6	B	0, 0.299, 0.482, 0.665, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.482 std_dev=0.183
N3	B	0, 0.428, 0.640, 0.852, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.640 std_dev=0.212
N1	B	0, 0.347, 0.560, 0.773, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.560 std_dev=0.213
C5	B	0, 0.282, 0.501, 0.721, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.501 std_dev=0.219
C2	B	0, 0.421, 0.647, 0.873, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.647 std_dev=0.226
C4	B	0, 0.326, 0.558, 0.791, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.558 std_dev=0.232
O3'	A	0, 0.183, 0.431, 0.679, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.431 std_dev=0.248
O6	B	0, 0.282, 0.531, 0.780, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.531 std_dev=0.249
C5'	A	0, 0.237, 0.510, 0.782, 1.579 max_d=1.579 avg_d=0.510 std_dev=0.273
N2	B	0, 0.592, 0.870, 1.147, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.870 std_dev=0.278
O5'	A	0, 0.268, 0.563, 0.859, 1.650 max_d=1.650 avg_d=0.563 std_dev=0.296
P	B	0, 0.246, 0.580, 0.915, 1.751 max_d=1.751 avg_d=0.580 std_dev=0.335
C5'	B	0, 0.327, 0.671, 1.014, 1.720 max_d=1.720 avg_d=0.671 std_dev=0.344
N9	B	0, 0.309, 0.664, 1.018, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.664 std_dev=0.354
N7	B	0, 0.265, 0.622, 0.978, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.622 std_dev=0.357
C4'	B	0, 0.309, 0.666, 1.023, 1.845 max_d=1.845 avg_d=0.666 std_dev=0.357
OP2	B	0, 0.273, 0.631, 0.989, 1.883 max_d=1.883 avg_d=0.631 std_dev=0.358
O5'	B	0, 0.365, 0.724, 1.083, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.724 std_dev=0.359
P	A	0, 0.460, 0.844, 1.228, 1.961 max_d=1.961 avg_d=0.844 std_dev=0.384
OP1	B	0, 0.303, 0.693, 1.082, 1.949 max_d=1.949 avg_d=0.693 std_dev=0.390
C1'	B	0, 0.427, 0.840, 1.254, 1.838 max_d=1.838 avg_d=0.840 std_dev=0.414
C3'	B	0, 0.545, 0.964, 1.384, 2.215 max_d=2.215 avg_d=0.964 std_dev=0.420
C8	B	0, 0.277, 0.707, 1.136, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.707 std_dev=0.429
O4'	B	0, 0.120, 0.563, 1.005, 2.052 max_d=2.052 avg_d=0.563 std_dev=0.443
O3'	B	0, 0.582, 1.160, 1.739, 2.592 max_d=2.592 avg_d=1.160 std_dev=0.579
C2'	B	0, 0.605, 1.194, 1.784, 2.703 max_d=2.703 avg_d=1.194 std_dev=0.589
OP2	A	0, 0.671, 1.447, 2.223, 2.357 max_d=2.357 avg_d=1.447 std_dev=0.776
O2'	B	0, 0.812, 1.761, 2.711, 4.049 max_d=4.049 avg_d=1.761 std_dev=0.949
OP1	A	0, 1.079, 2.442, 3.804, 4.127 max_d=4.127 avg_d=2.442 std_dev=1.363

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.35	0.23	0.08
C2	0.01	0.00	0.07	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.06	0.04	0.09	0.57	0.58	0.12
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.08	0.03	0.06	0.05	0.12	0.00	0.01	0.01	0.03	0.15	0.11	0.04
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.11	0.04	0.05	0.08	0.09	0.01	0.01	0.01	0.03	0.24	0.14	0.03
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.14	0.74	0.86	0.18
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.04	0.07	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.10	0.22	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.03	0.16	0.72	0.86	0.18
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.11	0.00	0.12	0.00	0.10	0.06	0.08	0.12	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.10	0.39	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.11	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.04	0.13	0.60	0.66	0.15
N1	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.09	0.51	0.50	0.11
N3	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.04	0.12	0.68	0.74	0.15
N4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.04	0.16	0.81	0.96	0.20
O2	0.01	0.00	0.12	0.09	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.11	0.06	0.07	0.51	0.47	0.10
O2'	0.02	0.08	0.00	0.01	0.04	0.04	0.05	0.04	0.05	0.02	0.07	0.05	0.13	0.00	0.03	0.04	0.02	0.14	0.12	0.03
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.08	0.02	0.13	0.03	0.12	0.04	0.06	0.09	0.11	0.03	0.00	0.01	0.06	0.49	0.38	0.06
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.04	0.06	0.04	0.01	0.00	0.05	0.39	0.13	0.09
O5'	0.04	0.09	0.03	0.03	0.14	0.01	0.16	0.01	0.13	0.09	0.12	0.16	0.07	0.02	0.06	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.35	0.57	0.15	0.24	0.74	0.10	0.72	0.10	0.60	0.51	0.68	0.81	0.51	0.14	0.49	0.39	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.58	0.11	0.14	0.86	0.22	0.86	0.39	0.66	0.50	0.74	0.96	0.47	0.12	0.38	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.12	0.04	0.03	0.18	0.03	0.18	0.02	0.15	0.11	0.15	0.20	0.10	0.03	0.06	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.28	0.09	0.14	0.11	0.12	0.17	0.16	0.21	0.29	0.25	0.37	0.22	0.29	0.14	0.27	0.13	0.16	0.19	0.25	0.03	0.05	0.04
C2	0.26	0.26	0.21	0.18	0.14	0.13	0.22	0.17	0.19	0.36	0.22	0.39	0.18	0.35	0.24	0.38	0.27	0.13	0.19	0.24	0.07	0.12	0.08
C2'	0.13	0.30	0.11	0.10	0.14	0.11	0.18	0.15	0.21	0.29	0.25	0.38	0.26	0.29	0.10	0.20	0.10	0.14	0.20	0.23	0.07	0.05	0.08
C3'	0.17	0.34	0.32	0.08	0.23	0.14	0.21	0.10	0.25	0.17	0.30	0.40	0.33	0.23	0.14	0.18	0.11	0.21	0.10	0.27	0.03	0.04	0.01
C4	0.26	0.25	0.25	0.30	0.15	0.16	0.20	0.14	0.12	0.32	0.18	0.39	0.18	0.33	0.24	0.28	0.22	0.16	0.24	0.20	0.11	0.12	0.12
C4'	0.14	0.33	0.28	0.07	0.20	0.12	0.20	0.12	0.26	0.15	0.30	0.39	0.30	0.22	0.11	0.13	0.10	0.18	0.07	0.28	0.12	0.11	0.06
C5	0.27	0.28	0.22	0.36	0.15	0.21	0.15	0.17	0.11	0.32	0.25	0.38	0.22	0.31	0.23	0.24	0.20	0.23	0.30	0.17	0.15	0.15	0.17
C5'	0.21	0.36	0.40	0.12	0.27	0.16	0.26	0.13	0.31	0.16	0.35	0.41	0.34	0.22	0.19	0.30	0.16	0.23	0.08	0.33	0.22	0.19	0.12
C6	0.25	0.29	0.17	0.32	0.12	0.20	0.12	0.17	0.17	0.30	0.26	0.38	0.22	0.29	0.19	0.21	0.18	0.24	0.30	0.22	0.13	0.13	0.16
N1	0.23	0.28	0.13	0.21	0.09	0.13	0.16	0.14	0.18	0.32	0.24	0.38	0.20	0.32	0.18	0.26	0.15	0.16	0.22	0.23	0.06	0.07	0.07
N3	0.26	0.23	0.26	0.22	0.15	0.13	0.23	0.15	0.18	0.34	0.18	0.39	0.16	0.35	0.25	0.36	0.30	0.13	0.20	0.24	0.08	0.13	0.09
N4	0.27	0.24	0.30	0.33	0.20	0.18	0.24	0.15	0.17	0.32	0.15	0.38	0.21	0.33	0.26	0.30	0.27	0.17	0.25	0.24	0.13	0.15	0.13
O2	0.30	0.27	0.27	0.18	0.21	0.20	0.26	0.25	0.23	0.39	0.23	0.38	0.21	0.37	0.29	0.53	0.40	0.21	0.21	0.26	0.11	0.18	0.13
O2'	0.18	0.28	0.13	0.13	0.14	0.16	0.18	0.21	0.20	0.32	0.23	0.37	0.24	0.30	0.16	0.39	0.18	0.17	0.20	0.22	0.12	0.05	0.09
O3'	0.22	0.34	0.43	0.10	0.26	0.16	0.23	0.12	0.26	0.18	0.29	0.39	0.34	0.24	0.19	0.24	0.16	0.22	0.01	0.27	0.02	0.03	0.01
O4'	0.15	0.30	0.14	0.10	0.14	0.11	0.17	0.13	0.23	0.19	0.28	0.38	0.25	0.23	0.08	0.15	0.10	0.16	0.12	0.27	0.08	0.10	0.03
O5'	0.27	0.41	0.44	0.18	0.32	0.19	0.31	0.14	0.36	0.20	0.39	0.44	0.38	0.24	0.26	0.44	0.22	0.28	0.13	0.38	0.22	0.20	0.14
OP1	0.52	0.35	0.89	0.53	0.41	0.54	0.41	0.62	0.41	0.54	0.39	0.35	0.37	0.48	0.49	0.94	0.50	0.48	0.62	0.47	1.07	0.87	0.81
OP2	0.65	1.23	0.77	0.22	1.01	0.26	1.09	0.17	1.28	0.72	1.32	1.28	1.08	0.91	0.79	0.93	0.20	0.48	0.23	1.37	0.45	0.27	0.33
P	0.33	0.45	0.52	0.20	0.38	0.22	0.38	0.15	0.43	0.29	0.46	0.47	0.42	0.32	0.33	0.60	0.24	0.32	0.14	0.46	0.27	0.22	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01	0.04	0.06	0.04	0.01	0.00	0.02	0.29	0.01	0.21	0.02	0.19	0.45	0.27
C2	0.04	0.00	0.24	0.14	0.01	0.14	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.21	0.33	0.24	0.21	0.01	0.28	0.47	0.33
C2'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.11	0.01	0.05	0.24	0.08	0.18	0.17	0.30	0.24	0.13	0.03	0.00	0.02	0.01	0.51	0.06	0.52	0.73	0.57
C3'	0.02	0.14	0.00	0.00	0.21	0.00	0.31	0.01	0.30	0.37	0.22	0.11	0.11	0.39	0.22	0.02	0.01	0.02	0.07	0.35	0.12	0.10	0.07
C4	0.02	0.01	0.11	0.21	0.00	0.04	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.16	0.19	0.13	0.20	0.01	0.25	0.46	0.29
C4'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.07	0.24	0.08	0.21	0.14	0.21	0.08	0.32	0.03	0.01	0.02	0.10	0.09	0.12	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.31	0.01	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.31	0.17	0.05	0.23	0.01	0.27	0.42	0.28
C5'	0.09	0.23	0.24	0.01	0.16	0.01	0.17	0.00	0.17	0.23	0.19	0.28	0.22	0.24	0.12	0.08	0.23	0.01	0.01	0.19	0.12	0.04	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.30	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.18	0.09	0.24	0.00	0.29	0.41	0.29
C8	0.01	0.01	0.18	0.37	0.01	0.24	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.45	0.25	0.15	0.25	0.01	0.25	0.41	0.25
N1	0.04	0.00	0.17	0.22	0.01	0.08	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.23	0.18	0.21	0.01	0.28	0.44	0.30
N2	0.06	0.01	0.30	0.11	0.02	0.21	0.01	0.28	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.32	0.44	0.30	0.22	0.01	0.30	0.48	0.35
N3	0.04	0.01	0.24	0.11	0.01	0.14	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.35	0.25	0.21	0.01	0.27	0.48	0.33
N7	0.01	0.01	0.13	0.39	0.01	0.21	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.47	0.27	0.10	0.30	0.01	0.29	0.40	0.28
N9	0.00	0.02	0.03	0.22	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.22	0.12	0.01	0.18	0.01	0.22	0.45	0.26
O2'	0.02	0.21	0.00	0.02	0.16	0.32	0.31	0.08	0.28	0.45	0.18	0.32	0.21	0.47	0.22	0.00	0.06	0.24	0.40	0.36	0.42	0.80	0.48
O3'	0.29	0.33	0.02	0.01	0.19	0.03	0.17	0.23	0.18	0.25	0.23	0.44	0.35	0.27	0.12	0.06	0.00	0.21	0.21	0.21	0.45	0.25	0.27
O4'	0.01	0.24	0.01	0.02	0.13	0.01	0.05	0.01	0.09	0.15	0.18	0.30	0.25	0.10	0.01	0.24	0.21	0.00	0.08	0.06	0.10	0.29	0.17
O5'	0.21	0.21	0.51	0.07	0.20	0.02	0.23	0.01	0.24	0.25	0.21	0.22	0.21	0.30	0.18	0.40	0.21	0.08	0.00	0.27	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.35	0.01	0.10	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.36	0.21	0.06	0.27	0.00	0.31	0.39	0.30
OP1	0.19	0.28	0.52	0.12	0.25	0.09	0.27	0.12	0.29	0.25	0.28	0.30	0.27	0.29	0.22	0.42	0.45	0.10	0.01	0.31	0.00	0.01	0.01
OP2	0.45	0.47	0.73	0.10	0.46	0.12	0.42	0.04	0.41	0.41	0.44	0.48	0.48	0.40	0.45	0.80	0.25	0.29	0.02	0.39	0.01	0.00	0.01
P	0.27	0.33	0.57	0.07	0.29	0.06	0.28	0.02	0.29	0.25	0.30	0.35	0.33	0.28	0.26	0.48	0.27	0.17	0.00	0.30	0.01	0.01	0.00