Doublet Group distance statistics: 53800

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 2, 2, 6, 5, 6, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N4	A	0, 0.013, 0.041, 0.069, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.041 std_dev=0.028
O2	A	0, 0.011, 0.043, 0.075, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.043 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.114, 0.196, 0.278, 0.336 max_d=0.336 avg_d=0.196 std_dev=0.082
O4'	A	0, 0.093, 0.181, 0.268, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.181 std_dev=0.087
O2'	A	0, 0.086, 0.217, 0.348, 0.518 max_d=0.518 avg_d=0.217 std_dev=0.131
C4'	A	0, 0.198, 0.335, 0.472, 0.568 max_d=0.568 avg_d=0.335 std_dev=0.137
C3'	A	0, 0.208, 0.350, 0.492, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.350 std_dev=0.142
C5	B	0, 0.254, 0.415, 0.575, 0.725 max_d=0.725 avg_d=0.415 std_dev=0.160
C4	B	0, 0.267, 0.442, 0.618, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.442 std_dev=0.175
C6	B	0, 0.262, 0.455, 0.647, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.455 std_dev=0.192
N9	B	0, 0.323, 0.532, 0.742, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.532 std_dev=0.210
N7	B	0, 0.286, 0.502, 0.718, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.502 std_dev=0.216
O3'	A	0, 0.288, 0.513, 0.738, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.513 std_dev=0.225
O6	B	0, 0.308, 0.533, 0.758, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.533 std_dev=0.225
N3	B	0, 0.282, 0.514, 0.746, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.514 std_dev=0.232
C5'	A	0, 0.336, 0.578, 0.820, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.578 std_dev=0.242
C8	B	0, 0.333, 0.579, 0.824, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.579 std_dev=0.245
O4'	B	0, 0.388, 0.652, 0.916, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.652 std_dev=0.264
N1	B	0, 0.268, 0.537, 0.806, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.537 std_dev=0.269
C1'	B	0, 0.386, 0.656, 0.926, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.656 std_dev=0.270
O5'	A	0, 0.352, 0.637, 0.921, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.637 std_dev=0.285
C4'	B	0, 0.400, 0.691, 0.982, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.691 std_dev=0.291
P	B	0, 0.359, 0.664, 0.969, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.664 std_dev=0.305
C2	B	0, 0.244, 0.555, 0.867, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.555 std_dev=0.312
O5'	B	0, 0.384, 0.704, 1.025, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.704 std_dev=0.321
C5'	B	0, 0.364, 0.687, 1.011, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.687 std_dev=0.323
OP2	B	0, 0.344, 0.702, 1.061, 1.699 max_d=1.699 avg_d=0.702 std_dev=0.358
C3'	B	0, 0.398, 0.761, 1.124, 1.618 max_d=1.618 avg_d=0.761 std_dev=0.363
C2'	B	0, 0.392, 0.761, 1.130, 1.633 max_d=1.633 avg_d=0.761 std_dev=0.369
P	A	0, 0.470, 0.872, 1.274, 1.601 max_d=1.601 avg_d=0.872 std_dev=0.402
OP1	B	0, 0.399, 0.808, 1.217, 2.049 max_d=2.049 avg_d=0.808 std_dev=0.409
O2'	B	0, 0.414, 0.829, 1.245, 1.728 max_d=1.728 avg_d=0.829 std_dev=0.415
OP2	A	0, 0.548, 0.997, 1.446, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.997 std_dev=0.449
N2	B	0, 0.261, 0.715, 1.169, 2.066 max_d=2.066 avg_d=0.715 std_dev=0.454
O3'	B	0, 0.389, 0.878, 1.367, 2.213 max_d=2.213 avg_d=0.878 std_dev=0.489
OP1	A	0, 0.582, 1.125, 1.667, 2.106 max_d=2.106 avg_d=1.125 std_dev=0.543

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.07	0.08	0.11	0.07
C2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.09	0.04	0.15	0.15	0.20	0.15
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.02	0.07	0.02	0.07	0.02	0.06	0.05	0.14	0.00	0.02	0.01	0.05	0.12	0.09	0.06
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.09	0.02	0.10	0.04	0.06	0.06	0.12	0.02	0.01	0.01	0.06	0.15	0.11	0.08
C4	0.03	0.01	0.05	0.06	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.04	0.18	0.20	0.26	0.20
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.04	0.06	0.05	0.06	0.02	0.00	0.01	0.10	0.05	0.02
C5	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.04	0.18	0.20	0.25	0.20
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.10	0.07	0.09	0.12	0.07	0.06	0.03	0.01	0.01	0.09	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.04	0.16	0.16	0.19	0.16
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.13	0.13	0.17	0.13
N3	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.04	0.17	0.18	0.24	0.18
N4	0.03	0.02	0.05	0.06	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.08	0.05	0.19	0.22	0.28	0.22
O2	0.04	0.01	0.14	0.12	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.14	0.16	0.06	0.14	0.14	0.18	0.14
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0.03	0.08	0.07	0.14	0.00	0.05	0.05	0.04	0.13	0.08	0.05
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.07	0.02	0.11	0.03	0.11	0.04	0.08	0.08	0.16	0.05	0.00	0.02	0.11	0.22	0.18	0.15
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.06	0.05	0.02	0.00	0.08	0.08	0.14	0.10
O5'	0.07	0.15	0.05	0.06	0.18	0.01	0.18	0.01	0.16	0.13	0.17	0.19	0.14	0.04	0.11	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.08	0.15	0.12	0.15	0.20	0.10	0.20	0.09	0.16	0.13	0.18	0.22	0.14	0.13	0.22	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.20	0.09	0.11	0.26	0.05	0.25	0.03	0.19	0.17	0.24	0.28	0.18	0.08	0.18	0.14	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.07	0.15	0.06	0.08	0.20	0.02	0.20	0.02	0.16	0.13	0.18	0.22	0.14	0.05	0.15	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.22	0.21	0.18	0.18	0.23	0.24	0.25	0.24	0.33	0.20	0.27	0.22	0.37	0.21	0.25	0.19	0.25	0.21	0.32	0.06	0.09	0.06
C2	0.22	0.25	0.21	0.16	0.17	0.19	0.22	0.20	0.24	0.33	0.23	0.31	0.23	0.36	0.19	0.26	0.17	0.21	0.24	0.31	0.12	0.20	0.13
C2'	0.21	0.18	0.19	0.19	0.19	0.22	0.26	0.26	0.25	0.35	0.20	0.20	0.19	0.37	0.22	0.20	0.21	0.23	0.23	0.32	0.11	0.10	0.10
C3'	0.16	0.17	0.16	0.20	0.19	0.17	0.28	0.21	0.30	0.31	0.23	0.15	0.15	0.37	0.19	0.14	0.22	0.19	0.09	0.38	0.03	0.06	0.01
C4	0.21	0.24	0.18	0.15	0.17	0.21	0.16	0.20	0.22	0.18	0.23	0.27	0.23	0.20	0.17	0.22	0.14	0.26	0.23	0.31	0.13	0.23	0.15
C4'	0.18	0.15	0.16	0.19	0.17	0.18	0.27	0.23	0.29	0.32	0.21	0.16	0.15	0.38	0.19	0.16	0.22	0.20	0.07	0.39	0.09	0.14	0.06
C5	0.25	0.20	0.22	0.20	0.18	0.25	0.17	0.24	0.21	0.21	0.20	0.22	0.21	0.22	0.20	0.24	0.18	0.31	0.25	0.31	0.17	0.24	0.18
C5'	0.18	0.18	0.19	0.23	0.21	0.18	0.32	0.20	0.36	0.33	0.27	0.16	0.16	0.41	0.21	0.16	0.26	0.20	0.06	0.47	0.18	0.24	0.13
C6	0.25	0.20	0.22	0.20	0.18	0.25	0.19	0.24	0.23	0.23	0.19	0.22	0.21	0.28	0.20	0.24	0.19	0.30	0.25	0.33	0.15	0.21	0.16
N1	0.22	0.22	0.19	0.15	0.17	0.21	0.22	0.21	0.24	0.30	0.20	0.26	0.22	0.35	0.19	0.24	0.15	0.25	0.22	0.33	0.08	0.15	0.09
N3	0.21	0.26	0.20	0.15	0.16	0.19	0.18	0.19	0.23	0.23	0.24	0.32	0.24	0.27	0.16	0.24	0.16	0.22	0.23	0.31	0.13	0.22	0.14
N4	0.22	0.26	0.19	0.17	0.20	0.21	0.18	0.20	0.23	0.18	0.25	0.28	0.24	0.17	0.19	0.22	0.16	0.26	0.24	0.30	0.16	0.25	0.16
O2	0.29	0.27	0.29	0.24	0.19	0.24	0.25	0.26	0.25	0.41	0.24	0.35	0.24	0.40	0.26	0.33	0.25	0.24	0.29	0.31	0.19	0.23	0.19
O2'	0.29	0.24	0.28	0.29	0.24	0.32	0.27	0.36	0.26	0.38	0.22	0.27	0.25	0.38	0.27	0.30	0.32	0.30	0.29	0.32	0.17	0.12	0.15
O3'	0.17	0.20	0.18	0.23	0.21	0.18	0.29	0.22	0.32	0.29	0.26	0.18	0.18	0.35	0.20	0.15	0.26	0.19	0.02	0.39	0.03	0.02	0.01
O4'	0.21	0.18	0.17	0.17	0.16	0.20	0.23	0.24	0.25	0.31	0.19	0.23	0.19	0.36	0.18	0.21	0.18	0.23	0.14	0.35	0.06	0.10	0.02
O5'	0.22	0.26	0.25	0.28	0.26	0.21	0.37	0.22	0.42	0.35	0.34	0.23	0.22	0.44	0.25	0.22	0.32	0.23	0.16	0.53	0.18	0.26	0.16
OP1	0.24	0.35	0.27	0.30	0.31	0.24	0.42	0.23	0.50	0.34	0.45	0.33	0.28	0.44	0.28	0.25	0.35	0.25	0.21	0.62	0.27	0.29	0.22
OP2	0.29	0.39	0.36	0.37	0.35	0.30	0.43	0.28	0.51	0.36	0.47	0.39	0.34	0.44	0.32	0.34	0.43	0.30	0.26	0.62	0.26	0.31	0.23
P	0.24	0.31	0.29	0.31	0.30	0.23	0.40	0.22	0.47	0.35	0.41	0.29	0.26	0.44	0.28	0.26	0.35	0.25	0.19	0.59	0.21	0.27	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.10	0.02	0.11	0.16	0.07
C2	0.03	0.00	0.20	0.29	0.01	0.11	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.37	0.06	0.27	0.02	0.30	0.39	0.27
C2'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.11	0.01	0.06	0.02	0.09	0.09	0.15	0.24	0.20	0.06	0.03	0.00	0.02	0.02	0.13	0.07	0.17	0.11	0.10
C3'	0.02	0.29	0.00	0.00	0.20	0.01	0.16	0.02	0.21	0.08	0.26	0.33	0.27	0.09	0.09	0.02	0.01	0.01	0.21	0.19	0.23	0.11	0.16
C4	0.01	0.01	0.11	0.20	0.00	0.09	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.22	0.03	0.26	0.01	0.26	0.32	0.24
C4'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.09	0.00	0.11	0.01	0.12	0.07	0.12	0.10	0.09	0.10	0.06	0.05	0.03	0.00	0.02	0.13	0.11	0.15	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.16	0.00	0.11	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.19	0.03	0.32	0.01	0.33	0.39	0.32
C5'	0.02	0.17	0.02	0.02	0.16	0.01	0.20	0.00	0.23	0.16	0.21	0.16	0.14	0.20	0.11	0.05	0.03	0.01	0.01	0.25	0.13	0.18	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.21	0.01	0.12	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.26	0.04	0.35	0.00	0.38	0.46	0.37
C8	0.01	0.01	0.09	0.08	0.01	0.07	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.10	0.06	0.27	0.02	0.23	0.25	0.23
N1	0.02	0.00	0.15	0.26	0.01	0.12	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.34	0.05	0.32	0.01	0.36	0.45	0.34
N2	0.03	0.00	0.24	0.33	0.01	0.10	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.43	0.08	0.26	0.02	0.30	0.39	0.26
N3	0.03	0.00	0.20	0.27	0.00	0.09	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.32	0.07	0.23	0.01	0.25	0.32	0.22
N7	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.05	0.33	0.02	0.32	0.36	0.33
N9	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.09	0.02	0.21	0.01	0.19	0.23	0.17
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.08	0.06	0.11	0.17	0.13	0.06	0.03	0.00	0.06	0.07	0.05	0.08	0.15	0.12	0.06
O3'	0.02	0.37	0.02	0.01	0.22	0.03	0.19	0.03	0.26	0.10	0.34	0.43	0.32	0.11	0.09	0.06	0.00	0.02	0.24	0.25	0.31	0.18	0.22
O4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.05	0.08	0.07	0.05	0.02	0.07	0.02	0.00	0.11	0.04	0.12	0.20	0.10
O5'	0.10	0.27	0.13	0.21	0.26	0.02	0.32	0.01	0.35	0.27	0.32	0.26	0.23	0.33	0.21	0.05	0.24	0.11	0.00	0.38	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.07	0.19	0.01	0.13	0.01	0.25	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.25	0.04	0.38	0.00	0.43	0.51	0.42
OP1	0.11	0.30	0.17	0.23	0.26	0.11	0.33	0.13	0.38	0.23	0.36	0.30	0.25	0.32	0.19	0.15	0.31	0.12	0.01	0.43	0.00	0.02	0.00
OP2	0.16	0.39	0.11	0.11	0.32	0.15	0.39	0.18	0.46	0.25	0.45	0.39	0.32	0.36	0.23	0.12	0.18	0.20	0.02	0.51	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.27	0.10	0.16	0.24	0.03	0.32	0.02	0.37	0.23	0.34	0.26	0.22	0.33	0.17	0.06	0.22	0.10	0.01	0.42	0.00	0.01	0.00