Doublet Group distance statistics: 53801

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 6, 9, 2, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C5	A	0, -0.001, 0.011, 0.024, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.011 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.006, 0.019, 0.031, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.001, 0.015, 0.029, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.015 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.011, 0.044, 0.077, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.044 std_dev=0.033
N4	A	0, 0.003, 0.047, 0.091, 0.184 max_d=0.184 avg_d=0.047 std_dev=0.044
O4'	A	0, 0.052, 0.169, 0.285, 0.518 max_d=0.518 avg_d=0.169 std_dev=0.117
C2'	A	0, 0.072, 0.203, 0.334, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.203 std_dev=0.131
C4	B	0, 0.268, 0.432, 0.595, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.432 std_dev=0.163
N9	B	0, 0.291, 0.455, 0.619, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.455 std_dev=0.164
C4'	A	0, 0.181, 0.346, 0.512, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.346 std_dev=0.166
C5	B	0, 0.222, 0.388, 0.555, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.388 std_dev=0.167
C3'	A	0, 0.167, 0.352, 0.537, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.352 std_dev=0.185
O2'	A	0, 0.156, 0.342, 0.529, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.342 std_dev=0.186
C6	B	0, 0.248, 0.443, 0.638, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.443 std_dev=0.195
C1'	B	0, 0.371, 0.567, 0.764, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.567 std_dev=0.196
C8	B	0, 0.261, 0.461, 0.662, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.461 std_dev=0.201
N7	B	0, 0.232, 0.435, 0.638, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.435 std_dev=0.203
O6	B	0, 0.285, 0.518, 0.752, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.518 std_dev=0.234
O4'	B	0, 0.368, 0.608, 0.848, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.608 std_dev=0.240
N3	B	0, 0.295, 0.540, 0.784, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.540 std_dev=0.244
N1	B	0, 0.269, 0.520, 0.771, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.520 std_dev=0.251
C2'	B	0, 0.335, 0.602, 0.870, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.602 std_dev=0.268
C3'	B	0, 0.370, 0.645, 0.919, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.645 std_dev=0.275
O3'	A	0, 0.285, 0.562, 0.839, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.562 std_dev=0.277
O5'	B	0, 0.369, 0.647, 0.925, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.647 std_dev=0.278
C2	B	0, 0.299, 0.577, 0.855, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.577 std_dev=0.278
C4'	B	0, 0.400, 0.681, 0.962, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.681 std_dev=0.281
P	B	0, 0.395, 0.689, 0.983, 1.452 max_d=1.452 avg_d=0.689 std_dev=0.294
C5'	A	0, 0.340, 0.660, 0.980, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.660 std_dev=0.320
OP2	B	0, 0.401, 0.730, 1.058, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.730 std_dev=0.328
O2'	B	0, 0.451, 0.786, 1.120, 1.779 max_d=1.779 avg_d=0.786 std_dev=0.335
O3'	B	0, 0.445, 0.798, 1.151, 1.760 max_d=1.760 avg_d=0.798 std_dev=0.353
O5'	A	0, 0.416, 0.778, 1.140, 1.709 max_d=1.709 avg_d=0.778 std_dev=0.362
N2	B	0, 0.364, 0.743, 1.121, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.743 std_dev=0.379
OP1	B	0, 0.491, 0.903, 1.315, 1.921 max_d=1.921 avg_d=0.903 std_dev=0.412
C5'	B	0, 0.332, 0.760, 1.189, 1.860 max_d=1.860 avg_d=0.760 std_dev=0.428
P	A	0, 0.477, 1.109, 1.742, 2.880 max_d=2.880 avg_d=1.109 std_dev=0.632
OP1	A	0, 0.534, 1.293, 2.051, 3.217 max_d=3.217 avg_d=1.293 std_dev=0.759
OP2	A	0, 0.463, 1.357, 2.252, 4.301 max_d=4.301 avg_d=1.357 std_dev=0.895

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.18	0.21	0.14	0.16
C2	0.02	0.00	0.08	0.06	0.01	0.03	0.02	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.07	0.04	0.26	0.32	0.35	0.26
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.02	0.08	0.02	0.09	0.03	0.07	0.07	0.15	0.01	0.02	0.01	0.12	0.21	0.19	0.14
C3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.10	0.00	0.15	0.02	0.16	0.07	0.07	0.11	0.11	0.02	0.01	0.02	0.12	0.25	0.24	0.16
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.07	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.14	0.03	0.31	0.42	0.55	0.35
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.09	0.04	0.05	0.08	0.04	0.09	0.02	0.00	0.01	0.15	0.16	0.03
C5	0.02	0.02	0.08	0.15	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.20	0.05	0.31	0.42	0.56	0.36
C5'	0.04	0.11	0.02	0.02	0.19	0.00	0.21	0.00	0.18	0.12	0.15	0.21	0.08	0.09	0.06	0.01	0.01	0.19	0.23	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.16	0.01	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.19	0.06	0.29	0.33	0.41	0.30
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.02	0.25	0.28	0.30	0.24
N3	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.09	0.03	0.29	0.37	0.46	0.31
N4	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.08	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.16	0.03	0.32	0.47	0.63	0.38
O2	0.04	0.01	0.15	0.11	0.02	0.04	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.20	0.15	0.06	0.24	0.29	0.30	0.24
O2'	0.02	0.12	0.01	0.02	0.08	0.09	0.07	0.09	0.07	0.03	0.12	0.09	0.20	0.00	0.05	0.08	0.06	0.21	0.22	0.10
O3'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.14	0.02	0.20	0.06	0.19	0.06	0.09	0.16	0.15	0.05	0.00	0.02	0.16	0.37	0.41	0.26
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.03	0.03	0.06	0.08	0.02	0.00	0.17	0.22	0.13	0.18
O5'	0.18	0.26	0.12	0.12	0.31	0.01	0.31	0.01	0.29	0.25	0.29	0.32	0.24	0.06	0.16	0.17	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.21	0.32	0.21	0.25	0.42	0.15	0.42	0.19	0.33	0.28	0.37	0.47	0.29	0.21	0.37	0.22	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.35	0.19	0.24	0.55	0.16	0.56	0.23	0.41	0.30	0.46	0.63	0.30	0.22	0.41	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.26	0.14	0.16	0.35	0.03	0.36	0.01	0.30	0.24	0.31	0.38	0.24	0.10	0.26	0.18	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.22	0.26	0.22	0.18	0.27	0.16	0.25	0.21	0.15	0.21	0.25	0.23	0.18	0.20	0.34	0.23	0.32	0.24	0.28	0.06	0.12	0.08
C2	0.32	0.22	0.28	0.24	0.18	0.26	0.13	0.24	0.19	0.22	0.20	0.26	0.23	0.18	0.24	0.34	0.24	0.30	0.26	0.27	0.12	0.21	0.13
C2'	0.23	0.20	0.20	0.19	0.17	0.23	0.21	0.25	0.25	0.16	0.22	0.21	0.20	0.24	0.16	0.26	0.20	0.27	0.26	0.30	0.11	0.12	0.12
C3'	0.21	0.20	0.18	0.18	0.19	0.16	0.22	0.16	0.25	0.18	0.22	0.20	0.19	0.24	0.18	0.19	0.18	0.25	0.09	0.31	0.02	0.07	0.01
C4	0.32	0.23	0.28	0.27	0.23	0.28	0.19	0.29	0.18	0.31	0.21	0.26	0.24	0.27	0.29	0.30	0.27	0.31	0.29	0.25	0.24	0.36	0.25
C4'	0.22	0.19	0.17	0.17	0.17	0.18	0.19	0.20	0.24	0.16	0.21	0.21	0.19	0.22	0.17	0.22	0.18	0.25	0.09	0.30	0.10	0.16	0.06
C5	0.33	0.22	0.28	0.29	0.23	0.32	0.19	0.35	0.21	0.31	0.22	0.24	0.23	0.24	0.29	0.30	0.30	0.35	0.32	0.27	0.31	0.42	0.31
C5'	0.24	0.22	0.21	0.22	0.21	0.17	0.24	0.17	0.27	0.21	0.25	0.23	0.22	0.25	0.21	0.21	0.22	0.26	0.06	0.33	0.21	0.28	0.15
C6	0.34	0.21	0.29	0.28	0.21	0.33	0.17	0.34	0.21	0.27	0.21	0.23	0.23	0.19	0.28	0.32	0.29	0.37	0.31	0.28	0.26	0.36	0.28
N1	0.32	0.21	0.27	0.24	0.18	0.28	0.14	0.26	0.20	0.20	0.20	0.24	0.23	0.16	0.24	0.32	0.24	0.33	0.26	0.27	0.12	0.23	0.15
N3	0.32	0.22	0.29	0.25	0.21	0.26	0.16	0.25	0.18	0.28	0.19	0.26	0.24	0.23	0.27	0.33	0.25	0.30	0.27	0.27	0.17	0.28	0.18
N4	0.31	0.25	0.29	0.29	0.25	0.27	0.24	0.31	0.20	0.33	0.23	0.29	0.26	0.31	0.30	0.30	0.29	0.30	0.31	0.26	0.29	0.40	0.28
O2	0.32	0.24	0.31	0.26	0.17	0.29	0.14	0.28	0.21	0.20	0.22	0.29	0.25	0.19	0.22	0.37	0.27	0.31	0.28	0.28	0.18	0.17	0.15
O2'	0.25	0.26	0.25	0.26	0.23	0.29	0.26	0.35	0.29	0.24	0.27	0.27	0.25	0.29	0.21	0.31	0.28	0.27	0.34	0.32	0.20	0.13	0.17
O3'	0.22	0.22	0.21	0.24	0.22	0.18	0.25	0.21	0.28	0.23	0.25	0.22	0.22	0.28	0.21	0.19	0.24	0.25	0.02	0.33	0.02	0.02	0.01
O4'	0.27	0.20	0.21	0.18	0.16	0.23	0.17	0.22	0.22	0.15	0.21	0.23	0.21	0.20	0.18	0.29	0.18	0.29	0.16	0.30	0.05	0.13	0.03
O5'	0.30	0.41	0.29	0.28	0.37	0.22	0.43	0.19	0.49	0.36	0.46	0.40	0.36	0.44	0.33	0.27	0.29	0.30	0.17	0.56	0.27	0.32	0.23
OP1	0.42	0.47	0.47	0.50	0.44	0.41	0.48	0.41	0.53	0.44	0.51	0.47	0.44	0.48	0.43	0.43	0.55	0.42	0.46	0.59	0.59	0.61	0.51
OP2	0.50	0.59	0.60	0.61	0.54	0.49	0.58	0.47	0.65	0.51	0.64	0.60	0.54	0.56	0.51	0.56	0.66	0.47	0.50	0.73	0.58	0.60	0.51
P	0.37	0.43	0.42	0.42	0.40	0.33	0.45	0.30	0.50	0.40	0.48	0.43	0.40	0.44	0.38	0.38	0.45	0.35	0.33	0.57	0.41	0.48	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.04	0.06	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.11	0.02	0.12	0.15	0.10
C2	0.05	0.00	0.15	0.21	0.01	0.11	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.18	0.25	0.04	0.24	0.02	0.25	0.33	0.24
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.04	0.07	0.07	0.12	0.18	0.15	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.16	0.06	0.21	0.11	0.14
C3'	0.02	0.21	0.00	0.00	0.14	0.00	0.14	0.04	0.17	0.12	0.20	0.23	0.19	0.12	0.08	0.02	0.01	0.01	0.23	0.17	0.27	0.12	0.19
C4	0.03	0.01	0.08	0.14	0.00	0.09	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.15	0.03	0.24	0.01	0.24	0.30	0.23
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.13	0.14	0.12	0.12	0.10	0.15	0.08	0.06	0.03	0.00	0.02	0.15	0.11	0.18	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.14	0.00	0.13	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.16	0.04	0.31	0.01	0.32	0.38	0.31
C5'	0.05	0.22	0.04	0.04	0.21	0.01	0.29	0.00	0.31	0.27	0.27	0.20	0.18	0.32	0.18	0.06	0.05	0.02	0.01	0.35	0.14	0.28	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.17	0.01	0.13	0.01	0.31	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.10	0.20	0.04	0.33	0.01	0.36	0.43	0.34
C8	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.14	0.01	0.27	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.13	0.05	0.30	0.02	0.28	0.29	0.26
N1	0.04	0.01	0.12	0.20	0.01	0.12	0.01	0.27	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.15	0.24	0.04	0.29	0.01	0.32	0.40	0.30
N2	0.06	0.01	0.18	0.23	0.01	0.12	0.02	0.20	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.22	0.29	0.05	0.22	0.03	0.23	0.32	0.22
N3	0.06	0.00	0.15	0.19	0.00	0.10	0.01	0.18	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.16	0.22	0.05	0.21	0.02	0.21	0.28	0.20
N7	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.15	0.01	0.32	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.05	0.34	0.02	0.35	0.40	0.34
N9	0.01	0.02	0.02	0.08	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.08	0.02	0.21	0.02	0.20	0.24	0.18
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.09	0.06	0.07	0.06	0.10	0.05	0.15	0.22	0.16	0.05	0.03	0.00	0.05	0.07	0.08	0.09	0.16	0.12	0.08
O3'	0.02	0.25	0.03	0.01	0.15	0.03	0.16	0.05	0.20	0.13	0.24	0.29	0.22	0.14	0.08	0.05	0.00	0.02	0.22	0.20	0.33	0.20	0.22
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.05	0.02	0.07	0.02	0.00	0.08	0.05	0.09	0.19	0.11
O5'	0.11	0.24	0.16	0.23	0.24	0.02	0.31	0.01	0.33	0.30	0.29	0.22	0.21	0.34	0.21	0.08	0.22	0.08	0.00	0.36	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.17	0.01	0.15	0.01	0.35	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.09	0.20	0.05	0.36	0.00	0.42	0.49	0.39
OP1	0.12	0.25	0.21	0.27	0.24	0.11	0.32	0.14	0.36	0.28	0.32	0.23	0.21	0.35	0.20	0.16	0.33	0.09	0.01	0.42	0.00	0.02	0.00
OP2	0.15	0.33	0.11	0.12	0.30	0.18	0.38	0.28	0.43	0.29	0.40	0.32	0.28	0.40	0.24	0.12	0.20	0.19	0.02	0.49	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.24	0.14	0.19	0.23	0.02	0.31	0.02	0.34	0.26	0.30	0.22	0.20	0.34	0.18	0.08	0.22	0.11	0.01	0.39	0.00	0.01	0.00