Doublet Group distance statistics: 53802

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 4, 1, 5, 3, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.010, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.010, 0.017, 0.024, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.019, 0.029, 0.038, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.029 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.013, 0.023, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.023 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.010, 0.024, 0.037, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.024 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.020, 0.046, 0.071, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.046 std_dev=0.025
N4	A	0, 0.012, 0.050, 0.088, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.050 std_dev=0.038
O4'	A	0, 0.101, 0.248, 0.394, 0.441 max_d=0.441 avg_d=0.248 std_dev=0.147
C4'	A	0, 0.329, 0.490, 0.651, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.490 std_dev=0.161
C2'	A	0, 0.150, 0.324, 0.498, 0.557 max_d=0.557 avg_d=0.324 std_dev=0.174
C2	B	0, 0.324, 0.500, 0.675, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.500 std_dev=0.175
N3	B	0, 0.234, 0.425, 0.615, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.425 std_dev=0.191
C4	B	0, 0.363, 0.559, 0.756, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.559 std_dev=0.196
C3'	A	0, 0.421, 0.653, 0.885, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.653 std_dev=0.232
O2'	A	0, 0.389, 0.625, 0.860, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.625 std_dev=0.236
N1	B	0, 0.404, 0.658, 0.912, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.658 std_dev=0.254
C5	B	0, 0.463, 0.717, 0.972, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.717 std_dev=0.254
N9	B	0, 0.487, 0.771, 1.054, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.771 std_dev=0.283
C6	B	0, 0.479, 0.776, 1.074, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.776 std_dev=0.298
C5'	A	0, 0.578, 0.878, 1.177, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.878 std_dev=0.300
N2	B	0, 0.373, 0.696, 1.019, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.696 std_dev=0.323
C1'	B	0, 0.528, 0.886, 1.244, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.886 std_dev=0.358
N7	B	0, 0.599, 0.974, 1.350, 1.588 max_d=1.588 avg_d=0.974 std_dev=0.376
C8	B	0, 0.604, 0.988, 1.373, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.988 std_dev=0.385
P	A	0, 0.577, 0.975, 1.372, 1.929 max_d=1.929 avg_d=0.975 std_dev=0.398
O3'	A	0, 0.619, 1.028, 1.438, 1.509 max_d=1.509 avg_d=1.028 std_dev=0.409
C2'	B	0, 0.566, 0.988, 1.410, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.988 std_dev=0.422
O5'	A	0, 0.863, 1.290, 1.718, 1.827 max_d=1.827 avg_d=1.290 std_dev=0.428
O6	B	0, 0.583, 1.014, 1.445, 1.944 max_d=1.944 avg_d=1.014 std_dev=0.431
O2'	B	0, 0.578, 1.030, 1.482, 1.695 max_d=1.695 avg_d=1.030 std_dev=0.452
O4'	B	0, 0.552, 1.032, 1.513, 1.814 max_d=1.814 avg_d=1.032 std_dev=0.481
O5'	B	0, 0.752, 1.323, 1.894, 2.001 max_d=2.001 avg_d=1.323 std_dev=0.571
OP2	A	0, 0.651, 1.238, 1.824, 2.477 max_d=2.477 avg_d=1.238 std_dev=0.587
P	B	0, 0.848, 1.458, 2.069, 2.160 max_d=2.160 avg_d=1.458 std_dev=0.610
OP1	A	0, 0.320, 0.935, 1.550, 2.842 max_d=2.842 avg_d=0.935 std_dev=0.615
C3'	B	0, 0.668, 1.288, 1.908, 2.302 max_d=2.302 avg_d=1.288 std_dev=0.620
C4'	B	0, 0.625, 1.265, 1.906, 2.579 max_d=2.579 avg_d=1.265 std_dev=0.641
OP2	B	0, 0.969, 1.620, 2.272, 2.399 max_d=2.399 avg_d=1.620 std_dev=0.652
C5'	B	0, 0.675, 1.438, 2.201, 3.367 max_d=3.367 avg_d=1.438 std_dev=0.763
O3'	B	0, 0.745, 1.513, 2.281, 2.947 max_d=2.947 avg_d=1.513 std_dev=0.768
OP1	B	0, 1.082, 1.877, 2.672, 2.921 max_d=2.921 avg_d=1.877 std_dev=0.795

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.11	0.15	0.23	0.11
C2	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.03	0.22	0.36	0.40	0.21
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.06	0.02	0.08	0.03	0.08	0.03	0.06	0.07	0.14	0.00	0.04	0.01	0.13	0.17	0.14	0.10
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.10	0.01	0.12	0.04	0.12	0.05	0.10	0.11	0.17	0.02	0.01	0.01	0.17	0.21	0.12	0.12
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.12	0.03	0.27	0.53	0.53	0.27
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.07	0.07	0.08	0.06	0.03	0.00	0.03	0.14	0.19	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.12	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.15	0.03	0.27	0.53	0.51	0.25
C5'	0.03	0.11	0.03	0.04	0.14	0.01	0.14	0.00	0.12	0.09	0.13	0.15	0.12	0.06	0.06	0.02	0.01	0.20	0.25	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.12	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.13	0.03	0.24	0.40	0.40	0.21
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02	0.20	0.30	0.34	0.17
N3	0.02	0.00	0.06	0.10	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.03	0.25	0.46	0.49	0.25
N4	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.14	0.03	0.28	0.60	0.59	0.29
O2	0.03	0.01	0.14	0.17	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.20	0.03	0.21	0.31	0.37	0.20
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.05	0.04	0.07	0.07	0.11	0.00	0.09	0.04	0.07	0.13	0.14	0.05
O3'	0.03	0.11	0.04	0.01	0.12	0.03	0.15	0.06	0.13	0.05	0.12	0.14	0.20	0.09	0.00	0.03	0.19	0.29	0.25	0.17
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.00	0.11	0.09	0.24	0.13
O5'	0.11	0.22	0.13	0.17	0.27	0.03	0.27	0.01	0.24	0.20	0.25	0.28	0.21	0.07	0.19	0.11	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.15	0.36	0.17	0.21	0.53	0.14	0.53	0.20	0.40	0.30	0.46	0.60	0.31	0.13	0.29	0.09	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.40	0.14	0.12	0.53	0.19	0.51	0.25	0.40	0.34	0.49	0.59	0.37	0.14	0.25	0.24	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.21	0.10	0.12	0.27	0.03	0.25	0.02	0.21	0.17	0.25	0.29	0.20	0.05	0.17	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.20	0.13	0.14	0.16	0.14	0.24	0.21	0.30	0.18	0.27	0.20	0.15	0.25	0.13	0.19	0.14	0.14	0.21	0.36	0.07	0.09	0.05
C2	0.20	0.22	0.20	0.16	0.18	0.16	0.19	0.17	0.23	0.16	0.24	0.23	0.20	0.17	0.17	0.23	0.16	0.17	0.17	0.25	0.09	0.15	0.08
C2'	0.14	0.18	0.12	0.16	0.18	0.14	0.27	0.23	0.31	0.24	0.26	0.17	0.14	0.31	0.15	0.16	0.16	0.15	0.24	0.37	0.12	0.08	0.10
C3'	0.20	0.24	0.17	0.16	0.23	0.16	0.31	0.16	0.36	0.25	0.31	0.22	0.20	0.35	0.20	0.18	0.17	0.23	0.09	0.44	0.03	0.09	0.02
C4	0.17	0.30	0.18	0.17	0.15	0.11	0.12	0.12	0.22	0.18	0.30	0.35	0.23	0.16	0.15	0.21	0.16	0.13	0.19	0.23	0.15	0.24	0.16
C4'	0.19	0.26	0.16	0.16	0.23	0.14	0.33	0.17	0.40	0.26	0.34	0.24	0.21	0.35	0.20	0.18	0.17	0.20	0.07	0.48	0.11	0.19	0.09
C5	0.16	0.30	0.15	0.18	0.15	0.14	0.16	0.17	0.30	0.18	0.35	0.35	0.21	0.15	0.14	0.18	0.18	0.15	0.25	0.35	0.21	0.28	0.21
C5'	0.28	0.37	0.27	0.24	0.34	0.22	0.43	0.19	0.50	0.35	0.45	0.36	0.32	0.44	0.31	0.25	0.24	0.29	0.15	0.59	0.24	0.33	0.20
C6	0.16	0.27	0.14	0.17	0.15	0.14	0.21	0.16	0.32	0.14	0.33	0.29	0.19	0.16	0.13	0.18	0.16	0.16	0.25	0.39	0.17	0.24	0.18
N1	0.16	0.23	0.15	0.13	0.16	0.11	0.22	0.14	0.29	0.14	0.28	0.24	0.18	0.20	0.13	0.19	0.11	0.14	0.19	0.34	0.07	0.14	0.07
N3	0.20	0.25	0.21	0.17	0.18	0.14	0.14	0.12	0.19	0.15	0.24	0.28	0.23	0.14	0.17	0.24	0.17	0.15	0.16	0.20	0.10	0.18	0.10
N4	0.18	0.34	0.21	0.21	0.16	0.14	0.12	0.16	0.14	0.22	0.30	0.42	0.26	0.23	0.17	0.23	0.22	0.13	0.20	0.16	0.19	0.28	0.20
O2	0.26	0.20	0.26	0.25	0.20	0.28	0.20	0.30	0.21	0.21	0.21	0.21	0.21	0.21	0.22	0.28	0.26	0.26	0.24	0.23	0.19	0.19	0.17
O2'	0.19	0.20	0.20	0.26	0.21	0.25	0.28	0.37	0.31	0.29	0.26	0.19	0.18	0.33	0.21	0.22	0.26	0.20	0.29	0.36	0.20	0.11	0.16
O3'	0.20	0.23	0.18	0.19	0.23	0.17	0.31	0.19	0.35	0.27	0.30	0.21	0.20	0.35	0.21	0.17	0.20	0.24	0.02	0.42	0.02	0.03	0.01
O4'	0.16	0.24	0.13	0.14	0.19	0.13	0.28	0.18	0.36	0.20	0.32	0.24	0.18	0.29	0.15	0.18	0.14	0.16	0.13	0.44	0.06	0.16	0.04
O5'	0.28	0.40	0.26	0.20	0.34	0.22	0.42	0.21	0.52	0.30	0.49	0.40	0.33	0.39	0.28	0.26	0.20	0.30	0.25	0.61	0.26	0.30	0.24
OP1	0.42	0.64	0.41	0.33	0.55	0.30	0.64	0.27	0.75	0.49	0.73	0.64	0.56	0.61	0.47	0.37	0.29	0.38	0.29	0.86	0.41	0.36	0.32
OP2	0.43	0.75	0.40	0.31	0.61	0.29	0.70	0.28	0.85	0.49	0.84	0.77	0.64	0.62	0.49	0.39	0.29	0.38	0.26	0.96	0.39	0.36	0.30
P	0.30	0.49	0.29	0.22	0.40	0.22	0.49	0.20	0.60	0.34	0.58	0.50	0.41	0.45	0.33	0.27	0.20	0.30	0.22	0.71	0.27	0.29	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.07	0.02	0.08	0.18	0.11
C2	0.04	0.00	0.14	0.17	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.20	0.06	0.18	0.01	0.20	0.34	0.23
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.02	0.07	0.02	0.09	0.05	0.12	0.16	0.13	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.11	0.08	0.11	0.18	0.11
C3'	0.02	0.17	0.00	0.00	0.15	0.00	0.18	0.02	0.19	0.17	0.18	0.17	0.15	0.19	0.12	0.03	0.02	0.02	0.16	0.20	0.17	0.16	0.15
C4	0.02	0.01	0.08	0.15	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.16	0.04	0.19	0.01	0.20	0.31	0.23
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.11	0.14	0.08	0.07	0.05	0.15	0.07	0.07	0.02	0.00	0.02	0.13	0.10	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.18	0.00	0.11	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.21	0.04	0.25	0.01	0.29	0.40	0.31
C5'	0.02	0.12	0.02	0.02	0.13	0.01	0.20	0.00	0.21	0.22	0.17	0.10	0.10	0.24	0.12	0.07	0.05	0.02	0.01	0.24	0.07	0.11	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.19	0.01	0.11	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.23	0.05	0.27	0.00	0.33	0.45	0.35
C8	0.02	0.01	0.05	0.17	0.01	0.14	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.19	0.05	0.25	0.02	0.25	0.31	0.27
N1	0.03	0.00	0.12	0.18	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.22	0.06	0.23	0.01	0.27	0.41	0.30
N2	0.05	0.00	0.16	0.17	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.22	0.08	0.16	0.01	0.17	0.33	0.21
N3	0.04	0.01	0.13	0.15	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.17	0.06	0.15	0.01	0.16	0.29	0.19
N7	0.01	0.01	0.05	0.19	0.01	0.15	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.23	0.05	0.29	0.02	0.34	0.42	0.35
N9	0.01	0.02	0.03	0.12	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.02	0.16	0.01	0.16	0.26	0.18
O2'	0.02	0.16	0.01	0.03	0.09	0.07	0.07	0.07	0.10	0.03	0.14	0.20	0.15	0.03	0.04	0.00	0.09	0.06	0.04	0.09	0.14	0.10	0.04
O3'	0.03	0.20	0.03	0.02	0.16	0.02	0.21	0.05	0.23	0.19	0.22	0.22	0.17	0.23	0.11	0.09	0.00	0.02	0.19	0.25	0.26	0.21	0.19
O4'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.02	0.05	0.05	0.06	0.08	0.06	0.05	0.02	0.06	0.02	0.00	0.11	0.06	0.12	0.19	0.15
O5'	0.07	0.18	0.11	0.16	0.19	0.02	0.25	0.01	0.27	0.25	0.23	0.16	0.15	0.29	0.16	0.04	0.19	0.11	0.00	0.31	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.20	0.01	0.13	0.01	0.24	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.25	0.06	0.31	0.00	0.39	0.50	0.41
OP1	0.08	0.20	0.11	0.17	0.20	0.10	0.29	0.07	0.33	0.25	0.27	0.17	0.16	0.34	0.16	0.14	0.26	0.12	0.02	0.39	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.34	0.18	0.16	0.31	0.06	0.40	0.11	0.45	0.31	0.41	0.33	0.29	0.42	0.26	0.10	0.21	0.19	0.02	0.50	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.23	0.11	0.15	0.23	0.03	0.31	0.02	0.35	0.27	0.30	0.21	0.19	0.35	0.18	0.04	0.19	0.15	0.01	0.41	0.01	0.01	0.00