Doublet Group distance statistics: 53804

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.006 std_dev=0.003
C4	A	0, 0.005, 0.010, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.009, 0.025, 0.040, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.025 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.012, 0.028, 0.044, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.016
C4	B	0, 0.268, 0.460, 0.652, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.460 std_dev=0.192
C5	B	0, 0.159, 0.361, 0.562, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.361 std_dev=0.202
N9	B	0, 0.237, 0.439, 0.641, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.439 std_dev=0.202
C2'	B	0, 0.268, 0.486, 0.705, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.486 std_dev=0.218
N7	B	0, 0.282, 0.529, 0.776, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.529 std_dev=0.247
C8	B	0, 0.312, 0.579, 0.846, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.579 std_dev=0.267
C6	B	0, 0.198, 0.485, 0.772, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.485 std_dev=0.287
C1'	B	0, 0.329, 0.618, 0.907, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.618 std_dev=0.289
O4'	A	0, 0.099, 0.395, 0.690, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.395 std_dev=0.295
O6	B	0, 0.207, 0.521, 0.836, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.521 std_dev=0.314
C2'	A	0, 0.085, 0.404, 0.723, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.404 std_dev=0.319
O2'	A	0, 0.046, 0.426, 0.806, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.426 std_dev=0.380
C4'	A	0, 0.159, 0.588, 1.017, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.588 std_dev=0.429
O4'	B	0, 0.434, 0.911, 1.388, 1.638 max_d=1.638 avg_d=0.911 std_dev=0.477
C3'	A	0, 0.158, 0.644, 1.130, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.644 std_dev=0.486
N3	B	0, 0.202, 0.691, 1.180, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.691 std_dev=0.489
N1	B	0, 0.159, 0.704, 1.249, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.704 std_dev=0.545
C2	B	0, 0.146, 0.810, 1.473, 1.923 max_d=1.923 avg_d=0.810 std_dev=0.664
O3'	A	0, 0.254, 0.924, 1.594, 1.909 max_d=1.909 avg_d=0.924 std_dev=0.670
O5'	A	0, 0.192, 0.885, 1.578, 2.619 max_d=2.619 avg_d=0.885 std_dev=0.693
O5'	B	0, 0.454, 1.186, 1.919, 2.233 max_d=2.233 avg_d=1.186 std_dev=0.733
C4'	B	0, 0.462, 1.213, 1.963, 2.307 max_d=2.307 avg_d=1.213 std_dev=0.751
O2'	B	0, 0.257, 1.040, 1.823, 2.831 max_d=2.831 avg_d=1.040 std_dev=0.783
C5'	A	0, 0.213, 1.010, 1.808, 2.117 max_d=2.117 avg_d=1.010 std_dev=0.798
P	B	0, 0.355, 1.161, 1.968, 2.354 max_d=2.354 avg_d=1.161 std_dev=0.806
C5'	B	0, 0.453, 1.263, 2.072, 2.445 max_d=2.445 avg_d=1.263 std_dev=0.810
C3'	B	0, 0.434, 1.275, 2.115, 2.512 max_d=2.512 avg_d=1.275 std_dev=0.840
OP2	B	0, 0.239, 1.101, 1.963, 2.377 max_d=2.377 avg_d=1.101 std_dev=0.862
OP1	B	0, 0.513, 1.484, 2.454, 2.910 max_d=2.910 avg_d=1.484 std_dev=0.970
N2	B	0, 0.077, 1.087, 2.098, 2.854 max_d=2.854 avg_d=1.087 std_dev=1.010
P	A	0, 0.165, 1.176, 2.188, 3.892 max_d=3.892 avg_d=1.176 std_dev=1.011
OP2	A	0, 0.133, 1.186, 2.238, 3.945 max_d=3.945 avg_d=1.186 std_dev=1.052
OP1	A	0, 0.207, 1.467, 2.726, 4.795 max_d=4.795 avg_d=1.467 std_dev=1.260
O3'	B	0, 0.976, 2.309, 3.642, 4.132 max_d=4.132 avg_d=2.309 std_dev=1.333

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.19	0.46	0.20
C2	0.01	0.00	0.07	0.11	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.11	0.02	0.29	0.38	0.60	0.37
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.10	0.02	0.11	0.03	0.04	0.04	0.16	0.00	0.01	0.00	0.22	0.26	0.36	0.22
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.04	0.00	0.14	0.02	0.16	0.03	0.08	0.05	0.22	0.01	0.00	0.01	0.33	0.31	0.25	0.26
C4	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.44	0.53	0.67	0.52
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.06	0.04	0.10	0.02	0.02	0.00	0.01	0.09	0.30	0.06
C5	0.01	0.00	0.10	0.14	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01	0.46	0.52	0.63	0.52
C5'	0.01	0.11	0.02	0.02	0.08	0.00	0.09	0.00	0.10	0.05	0.11	0.09	0.14	0.02	0.03	0.01	0.01	0.09	0.30	0.00
C6	0.00	0.01	0.11	0.16	0.01	0.08	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.17	0.01	0.39	0.42	0.56	0.42
N1	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.27	0.34	0.55	0.33
N3	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.37	0.47	0.66	0.45
N4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.47	0.59	0.70	0.57
O2	0.02	0.00	0.16	0.22	0.01	0.10	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.24	0.03	0.21	0.32	0.58	0.31
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.06	0.03	0.04	0.04	0.08	0.00	0.03	0.02	0.09	0.16	0.32	0.10
O3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.06	0.02	0.16	0.03	0.17	0.03	0.08	0.07	0.24	0.03	0.00	0.02	0.31	0.34	0.17	0.27
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.15	0.16	0.47	0.21
O5'	0.11	0.29	0.22	0.33	0.44	0.01	0.46	0.01	0.39	0.27	0.37	0.47	0.21	0.09	0.31	0.15	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.19	0.38	0.26	0.31	0.53	0.09	0.52	0.09	0.42	0.34	0.47	0.59	0.32	0.16	0.34	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.46	0.60	0.36	0.25	0.67	0.30	0.63	0.30	0.56	0.55	0.66	0.70	0.58	0.32	0.17	0.47	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.37	0.22	0.26	0.52	0.06	0.52	0.00	0.42	0.33	0.45	0.57	0.31	0.10	0.27	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.40	0.14	0.17	0.14	0.11	0.05	0.16	0.18	0.39	0.34	0.51	0.32	0.30	0.17	0.28	0.17	0.17	0.21	0.15	0.03	0.07	0.03
C2	0.18	0.50	0.17	0.11	0.15	0.23	0.09	0.25	0.15	0.45	0.38	0.65	0.42	0.42	0.15	0.29	0.33	0.19	0.18	0.15	0.07	0.12	0.06
C2'	0.29	0.25	0.16	0.18	0.15	0.12	0.15	0.15	0.09	0.48	0.18	0.35	0.23	0.38	0.26	0.34	0.15	0.23	0.23	0.11	0.06	0.08	0.08
C3'	0.26	0.33	0.34	0.09	0.24	0.17	0.15	0.12	0.16	0.18	0.26	0.39	0.33	0.14	0.20	0.24	0.09	0.28	0.11	0.11	0.03	0.06	0.01
C4	0.14	0.60	0.15	0.17	0.20	0.17	0.19	0.19	0.25	0.41	0.51	0.77	0.46	0.48	0.15	0.18	0.36	0.20	0.29	0.27	0.12	0.20	0.14
C4'	0.26	0.45	0.37	0.09	0.32	0.15	0.27	0.10	0.32	0.16	0.42	0.51	0.41	0.15	0.24	0.27	0.09	0.25	0.08	0.28	0.14	0.17	0.09
C5	0.14	0.54	0.14	0.27	0.21	0.13	0.19	0.21	0.29	0.40	0.50	0.68	0.41	0.44	0.16	0.17	0.34	0.15	0.38	0.28	0.23	0.30	0.25
C5'	0.45	0.60	0.63	0.18	0.53	0.25	0.51	0.17	0.53	0.41	0.58	0.63	0.58	0.43	0.47	0.61	0.12	0.37	0.16	0.48	0.22	0.30	0.18
C6	0.16	0.49	0.12	0.27	0.19	0.12	0.14	0.21	0.26	0.40	0.45	0.61	0.38	0.40	0.15	0.15	0.30	0.12	0.37	0.23	0.21	0.27	0.24
N1	0.19	0.47	0.13	0.16	0.16	0.12	0.08	0.18	0.20	0.43	0.39	0.59	0.37	0.39	0.15	0.22	0.23	0.14	0.25	0.17	0.06	0.11	0.08
N3	0.14	0.58	0.16	0.11	0.16	0.24	0.16	0.24	0.18	0.43	0.43	0.76	0.47	0.47	0.14	0.24	0.39	0.23	0.20	0.21	0.04	0.13	0.05
N4	0.14	0.65	0.15	0.18	0.21	0.19	0.23	0.20	0.28	0.37	0.55	0.86	0.47	0.45	0.16	0.20	0.41	0.24	0.29	0.35	0.14	0.22	0.15
O2	0.22	0.45	0.22	0.20	0.14	0.34	0.09	0.35	0.11	0.43	0.32	0.60	0.39	0.38	0.17	0.42	0.44	0.22	0.18	0.12	0.20	0.22	0.19
O2'	0.46	0.21	0.30	0.29	0.22	0.25	0.21	0.18	0.12	0.54	0.15	0.29	0.21	0.41	0.38	0.63	0.24	0.41	0.23	0.12	0.08	0.05	0.07
O3'	0.27	0.23	0.36	0.10	0.20	0.17	0.15	0.09	0.15	0.20	0.18	0.27	0.25	0.18	0.21	0.22	0.13	0.29	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00
O4'	0.19	0.49	0.22	0.11	0.27	0.12	0.21	0.12	0.33	0.18	0.46	0.58	0.41	0.12	0.15	0.19	0.13	0.19	0.13	0.30	0.10	0.12	0.05
O5'	0.39	0.48	0.43	0.48	0.47	0.33	0.54	0.34	0.56	0.54	0.53	0.48	0.44	0.59	0.45	0.41	0.51	0.33	0.48	0.60	0.33	0.54	0.41
OP1	0.66	0.87	0.73	0.49	0.82	0.43	0.90	0.37	0.96	0.79	0.93	0.86	0.81	0.90	0.75	0.81	0.52	0.53	0.47	1.02	0.50	0.62	0.47
OP2	0.77	0.96	0.77	0.45	0.90	0.46	0.94	0.29	0.99	0.80	0.99	0.97	0.92	0.88	0.83	0.92	0.43	0.66	0.34	0.99	0.29	0.42	0.29
P	0.57	0.76	0.61	0.44	0.70	0.36	0.77	0.29	0.82	0.67	0.81	0.76	0.70	0.76	0.64	0.68	0.46	0.46	0.41	0.87	0.39	0.55	0.40

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.26	0.00	0.14	0.02	0.14	0.39	0.23
C2	0.04	0.00	0.37	0.36	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.47	0.22	0.19	0.02	0.15	0.26	0.16
C2'	0.00	0.37	0.00	0.01	0.19	0.03	0.08	0.18	0.15	0.20	0.28	0.44	0.36	0.11	0.02	0.01	0.11	0.01	0.39	0.11	0.40	0.57	0.43
C3'	0.02	0.36	0.01	0.00	0.31	0.00	0.36	0.02	0.41	0.28	0.40	0.36	0.31	0.34	0.22	0.03	0.01	0.01	0.06	0.43	0.16	0.10	0.07
C4	0.03	0.01	0.19	0.31	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.17	0.35	0.12	0.15	0.01	0.11	0.27	0.15
C4'	0.01	0.05	0.03	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.11	0.19	0.06	0.08	0.05	0.19	0.09	0.30	0.08	0.00	0.01	0.14	0.09	0.12	0.05
C5	0.02	0.01	0.08	0.36	0.01	0.12	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.29	0.37	0.06	0.24	0.01	0.17	0.26	0.17
C5'	0.05	0.07	0.18	0.02	0.08	0.00	0.15	0.00	0.15	0.18	0.10	0.08	0.07	0.21	0.08	0.12	0.14	0.01	0.01	0.20	0.10	0.03	0.01
C6	0.03	0.01	0.15	0.41	0.01	0.11	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.43	0.10	0.28	0.00	0.22	0.28	0.20
C8	0.01	0.01	0.20	0.28	0.01	0.19	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.38	0.26	0.13	0.17	0.02	0.13	0.35	0.15
N1	0.04	0.00	0.28	0.40	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.47	0.18	0.25	0.02	0.20	0.27	0.18
N2	0.05	0.00	0.44	0.36	0.01	0.08	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.51	0.27	0.17	0.02	0.16	0.26	0.16
N3	0.04	0.00	0.36	0.31	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.43	0.22	0.14	0.01	0.11	0.26	0.15
N7	0.01	0.01	0.11	0.34	0.01	0.19	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.40	0.33	0.06	0.25	0.02	0.18	0.28	0.17
N9	0.01	0.01	0.02	0.22	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.22	0.24	0.01	0.09	0.01	0.10	0.33	0.16
O2'	0.02	0.11	0.01	0.03	0.17	0.30	0.29	0.12	0.27	0.38	0.17	0.16	0.11	0.40	0.22	0.00	0.17	0.22	0.27	0.32	0.29	0.61	0.34
O3'	0.26	0.47	0.11	0.01	0.35	0.08	0.37	0.14	0.43	0.26	0.47	0.51	0.43	0.33	0.24	0.17	0.00	0.21	0.21	0.46	0.42	0.27	0.27
O4'	0.00	0.22	0.01	0.01	0.12	0.00	0.06	0.01	0.10	0.13	0.18	0.27	0.22	0.06	0.01	0.22	0.21	0.00	0.05	0.07	0.08	0.32	0.19
O5'	0.14	0.19	0.39	0.06	0.15	0.01	0.24	0.01	0.28	0.17	0.25	0.17	0.14	0.25	0.09	0.27	0.21	0.05	0.00	0.34	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.02	0.11	0.43	0.01	0.14	0.01	0.20	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.32	0.46	0.07	0.34	0.00	0.28	0.32	0.25
OP1	0.14	0.15	0.40	0.16	0.11	0.09	0.17	0.10	0.22	0.13	0.20	0.16	0.11	0.18	0.10	0.29	0.42	0.08	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00
OP2	0.39	0.26	0.57	0.10	0.27	0.12	0.26	0.03	0.28	0.35	0.27	0.26	0.26	0.28	0.33	0.61	0.27	0.32	0.01	0.32	0.01	0.00	0.00
P	0.23	0.16	0.43	0.07	0.15	0.05	0.17	0.01	0.20	0.15	0.18	0.16	0.15	0.17	0.16	0.34	0.27	0.19	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00