Doublet Group distance statistics: 53806

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 2, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.010, 0.024, 0.038, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.008, 0.022, 0.036, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.007, 0.022, 0.038, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.022 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.013, 0.029, 0.045, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.029 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.015, 0.052, 0.090, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.052 std_dev=0.037
N4	A	0, 0.004, 0.054, 0.104, 0.182 max_d=0.182 avg_d=0.054 std_dev=0.050
O4'	A	0, 0.048, 0.148, 0.249, 0.302 max_d=0.302 avg_d=0.148 std_dev=0.100
C2'	A	0, 0.034, 0.163, 0.291, 0.390 max_d=0.390 avg_d=0.163 std_dev=0.129
C4'	A	0, 0.155, 0.302, 0.448, 0.476 max_d=0.476 avg_d=0.302 std_dev=0.146
O2'	A	0, 0.116, 0.317, 0.517, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.317 std_dev=0.201
C3'	A	0, 0.116, 0.333, 0.551, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.333 std_dev=0.217
C5'	A	0, 0.300, 0.556, 0.813, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.556 std_dev=0.257
N9	B	0, 0.270, 0.535, 0.799, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.535 std_dev=0.265
C4	B	0, 0.240, 0.514, 0.789, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.514 std_dev=0.275
C5	B	0, 0.185, 0.464, 0.743, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.464 std_dev=0.279
C8	B	0, 0.227, 0.519, 0.811, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.519 std_dev=0.292
C6	B	0, 0.282, 0.580, 0.878, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.580 std_dev=0.298
O6	B	0, 0.342, 0.651, 0.959, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.651 std_dev=0.309
O5'	A	0, 0.329, 0.641, 0.953, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.641 std_dev=0.312
N7	B	0, 0.145, 0.461, 0.777, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.461 std_dev=0.316
C1'	B	0, 0.385, 0.702, 1.018, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.702 std_dev=0.316
N3	B	0, 0.332, 0.658, 0.983, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.658 std_dev=0.326
C2'	B	0, 0.338, 0.689, 1.040, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.689 std_dev=0.351
O3'	A	0, 0.200, 0.561, 0.922, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.561 std_dev=0.361
N1	B	0, 0.318, 0.688, 1.058, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.688 std_dev=0.370
C2	B	0, 0.342, 0.725, 1.107, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.725 std_dev=0.382
O2'	B	0, 0.492, 0.895, 1.297, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.895 std_dev=0.403
C3'	B	0, 0.496, 0.902, 1.307, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.902 std_dev=0.405
P	B	0, 0.441, 0.896, 1.352, 1.594 max_d=1.594 avg_d=0.896 std_dev=0.455
O4'	B	0, 0.437, 0.901, 1.364, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.901 std_dev=0.464
O5'	B	0, 0.528, 1.006, 1.484, 1.720 max_d=1.720 avg_d=1.006 std_dev=0.478
O3'	B	0, 0.630, 1.111, 1.592, 1.603 max_d=1.603 avg_d=1.111 std_dev=0.481
N2	B	0, 0.398, 0.893, 1.389, 1.682 max_d=1.682 avg_d=0.893 std_dev=0.496
C4'	B	0, 0.553, 1.075, 1.596, 1.813 max_d=1.813 avg_d=1.075 std_dev=0.522
P	A	0, 0.605, 1.133, 1.660, 1.752 max_d=1.752 avg_d=1.133 std_dev=0.527
OP2	B	0, 0.828, 1.460, 2.092, 2.405 max_d=2.405 avg_d=1.460 std_dev=0.632
OP2	A	0, 0.669, 1.326, 1.982, 2.143 max_d=2.143 avg_d=1.326 std_dev=0.657
C5'	B	0, 0.666, 1.509, 2.353, 2.751 max_d=2.751 avg_d=1.509 std_dev=0.844
OP1	B	0, 0.766, 1.656, 2.546, 2.932 max_d=2.932 avg_d=1.656 std_dev=0.890
OP1	A	0, 0.666, 1.570, 2.473, 3.504 max_d=3.504 avg_d=1.570 std_dev=0.903

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.02	0.01	0.00	0.10	0.18	0.22	0.15
C2	0.03	0.00	0.03	0.05	0.01	0.02	0.02	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.03	0.21	0.57	0.27	0.30
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.05	0.03	0.07	0.02	0.07	0.02	0.04	0.06	0.08	0.00	0.01	0.01	0.11	0.19	0.10	0.11
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.10	0.01	0.13	0.01	0.14	0.05	0.07	0.11	0.07	0.02	0.01	0.02	0.15	0.20	0.17	0.14
C4	0.04	0.01	0.05	0.10	0.00	0.05	0.01	0.15	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.05	0.13	0.04	0.23	0.80	0.31	0.38
C4'	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.03	0.06	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.18	0.14	0.03
C5	0.03	0.02	0.07	0.13	0.01	0.07	0.00	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.17	0.04	0.21	0.70	0.32	0.35
C5'	0.04	0.10	0.02	0.01	0.15	0.00	0.16	0.00	0.14	0.10	0.13	0.17	0.08	0.05	0.05	0.01	0.01	0.29	0.18	0.03
C6	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.15	0.04	0.17	0.48	0.29	0.27
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.03	0.02	0.10	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.02	0.06	0.01	0.17	0.43	0.26	0.24
N3	0.03	0.01	0.04	0.07	0.01	0.03	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.03	0.23	0.74	0.29	0.36
N4	0.04	0.01	0.06	0.11	0.00	0.06	0.01	0.17	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.05	0.14	0.04	0.25	0.91	0.33	0.42
O2	0.04	0.01	0.08	0.07	0.02	0.04	0.02	0.08	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.09	0.09	0.04	0.19	0.51	0.25	0.28
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.02	0.05	0.05	0.09	0.00	0.05	0.03	0.07	0.15	0.10	0.06
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.13	0.02	0.17	0.05	0.15	0.06	0.08	0.14	0.09	0.05	0.00	0.01	0.20	0.36	0.30	0.24
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.14	0.17	0.25	0.18
O5'	0.10	0.21	0.11	0.15	0.23	0.02	0.21	0.01	0.17	0.17	0.23	0.25	0.19	0.07	0.20	0.14	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.18	0.57	0.19	0.20	0.80	0.18	0.70	0.29	0.48	0.43	0.74	0.91	0.51	0.15	0.36	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.27	0.10	0.17	0.31	0.14	0.32	0.18	0.29	0.26	0.29	0.33	0.25	0.10	0.30	0.25	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.30	0.11	0.14	0.38	0.03	0.35	0.03	0.27	0.24	0.36	0.42	0.28	0.06	0.24	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.17	0.23	0.07	0.13	0.11	0.10	0.35	0.15	0.08	0.15	0.21	0.19	0.11	0.14	0.44	0.07	0.15	0.27	0.21	0.04	0.13	0.08
C2	0.19	0.16	0.18	0.17	0.12	0.22	0.15	0.38	0.21	0.13	0.20	0.17	0.14	0.14	0.13	0.28	0.15	0.21	0.25	0.25	0.07	0.20	0.09
C2'	0.35	0.23	0.26	0.08	0.18	0.08	0.11	0.39	0.14	0.10	0.17	0.28	0.26	0.13	0.18	0.47	0.07	0.19	0.34	0.17	0.11	0.17	0.16
C3'	0.42	0.22	0.32	0.22	0.22	0.20	0.14	0.21	0.14	0.15	0.16	0.26	0.27	0.15	0.26	0.48	0.22	0.40	0.11	0.18	0.02	0.07	0.02
C4	0.22	0.16	0.21	0.20	0.17	0.19	0.18	0.24	0.23	0.22	0.21	0.16	0.16	0.20	0.20	0.24	0.20	0.19	0.21	0.29	0.16	0.26	0.15
C4'	0.39	0.18	0.29	0.20	0.17	0.19	0.13	0.21	0.17	0.13	0.14	0.21	0.22	0.16	0.21	0.49	0.20	0.35	0.08	0.24	0.14	0.28	0.12
C5	0.29	0.13	0.24	0.21	0.16	0.24	0.15	0.24	0.19	0.26	0.18	0.13	0.14	0.19	0.23	0.30	0.21	0.27	0.28	0.27	0.25	0.33	0.24
C5'	0.39	0.21	0.32	0.30	0.22	0.28	0.24	0.20	0.28	0.22	0.23	0.21	0.23	0.27	0.26	0.45	0.31	0.41	0.18	0.37	0.30	0.49	0.26
C6	0.32	0.11	0.24	0.16	0.14	0.21	0.12	0.20	0.17	0.21	0.15	0.11	0.13	0.13	0.22	0.36	0.16	0.28	0.24	0.25	0.22	0.32	0.23
N1	0.26	0.13	0.21	0.12	0.11	0.14	0.12	0.28	0.17	0.12	0.15	0.15	0.14	0.12	0.15	0.35	0.11	0.16	0.20	0.23	0.08	0.19	0.10
N3	0.19	0.17	0.19	0.19	0.16	0.21	0.19	0.31	0.25	0.15	0.22	0.16	0.16	0.16	0.17	0.23	0.17	0.20	0.18	0.29	0.07	0.22	0.07
N4	0.21	0.22	0.21	0.23	0.19	0.21	0.21	0.25	0.24	0.24	0.24	0.24	0.19	0.25	0.21	0.21	0.23	0.19	0.24	0.32	0.18	0.26	0.17
O2	0.19	0.21	0.19	0.25	0.13	0.37	0.18	0.56	0.22	0.19	0.23	0.24	0.16	0.19	0.15	0.29	0.21	0.37	0.40	0.25	0.17	0.24	0.19
O2'	0.35	0.28	0.32	0.15	0.20	0.20	0.14	0.55	0.16	0.16	0.21	0.34	0.30	0.17	0.18	0.57	0.16	0.19	0.50	0.17	0.18	0.16	0.21
O3'	0.52	0.30	0.42	0.32	0.29	0.36	0.18	0.24	0.15	0.20	0.21	0.35	0.35	0.15	0.33	0.58	0.30	0.55	0.02	0.14	0.02	0.02	0.01
O4'	0.32	0.14	0.23	0.10	0.13	0.08	0.12	0.25	0.17	0.09	0.14	0.18	0.17	0.13	0.16	0.44	0.10	0.22	0.14	0.25	0.09	0.23	0.07
O5'	0.35	0.31	0.34	0.37	0.31	0.26	0.37	0.22	0.41	0.33	0.37	0.30	0.30	0.40	0.31	0.37	0.39	0.36	0.25	0.49	0.26	0.36	0.22
OP1	0.71	0.97	0.78	0.70	0.90	0.54	1.03	0.42	1.12	0.86	1.07	0.96	0.88	1.03	0.81	0.74	0.69	0.62	0.50	1.23	0.64	0.63	0.48
OP2	0.40	0.29	0.35	0.39	0.27	0.44	0.31	0.44	0.37	0.34	0.35	0.29	0.26	0.32	0.32	0.41	0.42	0.50	0.55	0.47	0.61	0.68	0.53
P	0.43	0.47	0.45	0.45	0.45	0.36	0.52	0.29	0.59	0.45	0.54	0.46	0.43	0.54	0.43	0.45	0.48	0.44	0.39	0.68	0.44	0.53	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.06	0.08	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.03	0.23	0.26	0.22
C2	0.07	0.00	0.15	0.18	0.01	0.04	0.02	0.10	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.12	0.24	0.12	0.16	0.03	0.09	0.34	0.11
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.07	0.02	0.04	0.03	0.06	0.10	0.11	0.18	0.15	0.07	0.01	0.00	0.03	0.01	0.21	0.06	0.20	0.29	0.14
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.12	0.13	0.16	0.21	0.15	0.10	0.06	0.02	0.01	0.01	0.32	0.12	0.28	0.40	0.25
C4	0.03	0.01	0.07	0.10	0.00	0.03	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.12	0.05	0.16	0.02	0.09	0.33	0.11
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.07	0.11	0.04	0.06	0.03	0.11	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.09	0.19	0.23	0.12
C5	0.02	0.02	0.04	0.09	0.01	0.07	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.03	0.18	0.02	0.12	0.40	0.14
C5'	0.03	0.10	0.03	0.04	0.12	0.01	0.19	0.00	0.20	0.21	0.15	0.08	0.09	0.24	0.12	0.05	0.03	0.01	0.01	0.23	0.14	0.28	0.02
C6	0.04	0.02	0.06	0.12	0.01	0.07	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.09	0.15	0.04	0.18	0.01	0.14	0.42	0.16
C8	0.02	0.02	0.10	0.13	0.01	0.11	0.01	0.21	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.07	0.14	0.10	0.18	0.03	0.12	0.36	0.14
N1	0.06	0.01	0.11	0.16	0.01	0.04	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.11	0.21	0.08	0.17	0.02	0.09	0.39	0.12
N2	0.08	0.01	0.18	0.21	0.02	0.06	0.03	0.08	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.15	0.30	0.15	0.16	0.04	0.12	0.33	0.12
N3	0.07	0.01	0.15	0.15	0.01	0.03	0.01	0.09	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.11	0.20	0.12	0.16	0.02	0.12	0.31	0.12
N7	0.01	0.02	0.07	0.10	0.01	0.11	0.01	0.24	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.07	0.19	0.03	0.18	0.43	0.19
N9	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.12	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.16	0.03	0.11	0.30	0.12
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.06	0.06	0.07	0.05	0.09	0.07	0.11	0.15	0.11	0.07	0.02	0.00	0.05	0.04	0.12	0.09	0.27	0.19	0.18
O3'	0.02	0.24	0.03	0.01	0.12	0.02	0.11	0.03	0.15	0.14	0.21	0.30	0.20	0.12	0.05	0.05	0.00	0.02	0.36	0.14	0.39	0.50	0.33
O4'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.10	0.08	0.15	0.12	0.07	0.02	0.04	0.02	0.00	0.17	0.04	0.33	0.35	0.33
O5'	0.11	0.16	0.21	0.32	0.16	0.02	0.18	0.01	0.18	0.18	0.17	0.16	0.16	0.19	0.16	0.12	0.36	0.17	0.00	0.19	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.03	0.06	0.12	0.02	0.09	0.02	0.23	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.09	0.14	0.04	0.19	0.00	0.20	0.46	0.20
OP1	0.23	0.09	0.20	0.28	0.09	0.19	0.12	0.14	0.14	0.12	0.09	0.12	0.12	0.18	0.11	0.27	0.39	0.33	0.02	0.20	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.34	0.29	0.40	0.33	0.23	0.40	0.28	0.42	0.36	0.39	0.33	0.31	0.43	0.30	0.19	0.50	0.35	0.02	0.46	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.11	0.14	0.25	0.11	0.12	0.14	0.02	0.16	0.14	0.12	0.12	0.12	0.19	0.12	0.18	0.33	0.33	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00