Doublet Group distance statistics: 53808

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.005, 0.009, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.009 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.006, 0.011, 0.015, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.007, 0.013, 0.020, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.013 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N4	A	0, 0.012, 0.027, 0.041, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.027 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.012, 0.028, 0.044, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.028 std_dev=0.016
C2'	A	0, 0.023, 0.187, 0.352, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.187 std_dev=0.165
O4'	A	0, 0.008, 0.181, 0.355, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.181 std_dev=0.173
O2'	A	0, 0.092, 0.266, 0.441, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.266 std_dev=0.174
P	B	0, 0.167, 0.392, 0.617, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.392 std_dev=0.225
C4'	A	0, 0.059, 0.307, 0.556, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.307 std_dev=0.249
C3'	A	0, 0.058, 0.318, 0.578, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.318 std_dev=0.260
OP2	B	0, 0.263, 0.534, 0.804, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.534 std_dev=0.270
N1	B	0, 0.277, 0.551, 0.825, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.551 std_dev=0.274
C4'	B	0, 0.262, 0.546, 0.830, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.546 std_dev=0.284
C6	B	0, 0.261, 0.551, 0.841, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.551 std_dev=0.290
C5	B	0, 0.243, 0.535, 0.827, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.535 std_dev=0.292
OP1	B	0, 0.173, 0.470, 0.768, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.470 std_dev=0.298
C4	B	0, 0.253, 0.557, 0.861, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.557 std_dev=0.304
C2	B	0, 0.250, 0.563, 0.876, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.563 std_dev=0.313
N3	B	0, 0.249, 0.587, 0.925, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.587 std_dev=0.338
N9	B	0, 0.297, 0.646, 0.995, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.646 std_dev=0.349
N7	B	0, 0.242, 0.606, 0.970, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.606 std_dev=0.364
O6	B	0, 0.300, 0.665, 1.030, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.665 std_dev=0.365
C8	B	0, 0.289, 0.659, 1.030, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.659 std_dev=0.370
O3'	A	0, 0.141, 0.524, 0.907, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.524 std_dev=0.383
C5'	A	0, 0.082, 0.502, 0.921, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.502 std_dev=0.420
O5'	B	0, 0.268, 0.696, 1.124, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.696 std_dev=0.428
C1'	B	0, 0.324, 0.753, 1.183, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.753 std_dev=0.430
O4'	B	0, 0.303, 0.739, 1.176, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.739 std_dev=0.436
N2	B	0, 0.212, 0.652, 1.091, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.652 std_dev=0.440
C3'	B	0, 0.255, 0.713, 1.172, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.713 std_dev=0.459
C5'	B	0, 0.260, 0.812, 1.363, 1.697 max_d=1.697 avg_d=0.812 std_dev=0.552
O5'	A	0, 0.159, 0.718, 1.277, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.718 std_dev=0.559
C2'	B	0, 0.246, 0.821, 1.395, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.821 std_dev=0.574
O3'	B	0, 0.430, 1.073, 1.717, 1.706 max_d=1.706 avg_d=1.073 std_dev=0.643
O2'	B	0, 0.359, 1.050, 1.740, 1.962 max_d=1.962 avg_d=1.050 std_dev=0.690
OP2	A	0, 0.399, 1.106, 1.812, 2.002 max_d=2.002 avg_d=1.106 std_dev=0.706
P	A	0, 0.237, 1.007, 1.778, 1.972 max_d=1.972 avg_d=1.007 std_dev=0.770
OP1	A	0, 0.246, 1.154, 2.063, 2.345 max_d=2.345 avg_d=1.154 std_dev=0.909

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.00	0.08	0.12	0.11	0.08
C2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.09	0.04	0.15	0.18	0.18	0.17
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.06	0.00	0.05	0.02	0.12	0.00	0.04	0.01	0.08	0.13	0.12	0.09
C3'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.09	0.00	0.13	0.02	0.13	0.04	0.06	0.10	0.10	0.02	0.01	0.01	0.08	0.14	0.08	0.08
C4	0.01	0.00	0.02	0.09	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.10	0.04	0.26	0.29	0.28	0.28
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.12	0.05	0.05	0.10	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.12	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.05	0.13	0.00	0.13	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.15	0.04	0.31	0.33	0.29	0.32
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.18	0.01	0.22	0.00	0.20	0.10	0.12	0.20	0.04	0.05	0.01	0.01	0.00	0.12	0.01	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.12	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.14	0.03	0.27	0.29	0.21	0.25
N1	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.16	0.20	0.17	0.16
N3	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.09	0.04	0.19	0.23	0.23	0.22
N4	0.02	0.01	0.02	0.10	0.00	0.10	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.12	0.05	0.28	0.33	0.32	0.33
O2	0.03	0.00	0.12	0.10	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.16	0.16	0.05	0.11	0.14	0.16	0.13
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.03	0.05	0.04	0.05	0.05	0.02	0.08	0.03	0.16	0.00	0.09	0.05	0.04	0.13	0.06	0.03
O3'	0.03	0.09	0.04	0.01	0.10	0.02	0.15	0.01	0.14	0.04	0.09	0.12	0.16	0.09	0.00	0.02	0.09	0.18	0.10	0.11
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.05	0.05	0.02	0.00	0.05	0.10	0.10	0.06
O5'	0.08	0.15	0.08	0.08	0.26	0.02	0.31	0.00	0.27	0.16	0.19	0.28	0.11	0.04	0.09	0.05	0.00	0.04	0.02	0.00
OP1	0.12	0.18	0.13	0.14	0.29	0.12	0.33	0.12	0.29	0.20	0.23	0.33	0.14	0.13	0.18	0.10	0.04	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.18	0.12	0.08	0.28	0.03	0.29	0.01	0.21	0.17	0.23	0.32	0.16	0.06	0.10	0.10	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.17	0.09	0.08	0.28	0.02	0.32	0.02	0.25	0.16	0.22	0.33	0.13	0.03	0.11	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.14	0.24	0.25	0.14	0.25	0.26	0.37	0.33	0.17	0.24	0.13	0.14	0.32	0.14	0.38	0.25	0.27	0.39	0.43	0.07	0.07	0.11
C2	0.31	0.13	0.30	0.27	0.16	0.26	0.13	0.29	0.20	0.16	0.17	0.13	0.17	0.12	0.23	0.41	0.26	0.31	0.34	0.27	0.06	0.20	0.12
C2'	0.34	0.15	0.29	0.28	0.15	0.27	0.30	0.37	0.34	0.28	0.22	0.18	0.19	0.43	0.17	0.45	0.29	0.33	0.45	0.46	0.14	0.17	0.20
C3'	0.48	0.12	0.43	0.40	0.14	0.40	0.22	0.29	0.31	0.14	0.19	0.16	0.21	0.33	0.24	0.56	0.44	0.56	0.12	0.47	0.05	0.07	0.01
C4	0.36	0.10	0.33	0.31	0.21	0.29	0.16	0.24	0.13	0.35	0.16	0.13	0.14	0.26	0.32	0.41	0.32	0.39	0.25	0.21	0.14	0.23	0.15
C4'	0.42	0.12	0.38	0.36	0.13	0.36	0.22	0.31	0.32	0.14	0.22	0.13	0.18	0.29	0.21	0.52	0.40	0.46	0.10	0.48	0.22	0.28	0.14
C5	0.37	0.12	0.33	0.32	0.16	0.30	0.10	0.26	0.22	0.31	0.22	0.14	0.12	0.17	0.30	0.41	0.34	0.42	0.26	0.36	0.16	0.21	0.18
C5'	0.46	0.12	0.42	0.43	0.12	0.44	0.22	0.34	0.37	0.13	0.28	0.11	0.14	0.25	0.24	0.55	0.48	0.55	0.14	0.56	0.40	0.50	0.30
C6	0.35	0.12	0.30	0.30	0.12	0.28	0.13	0.29	0.28	0.18	0.24	0.12	0.11	0.10	0.23	0.40	0.32	0.39	0.29	0.42	0.12	0.14	0.15
N1	0.31	0.12	0.28	0.27	0.11	0.26	0.17	0.32	0.28	0.11	0.22	0.12	0.13	0.17	0.19	0.40	0.28	0.33	0.34	0.39	0.06	0.13	0.12
N3	0.33	0.11	0.32	0.29	0.21	0.26	0.14	0.25	0.11	0.27	0.14	0.11	0.17	0.18	0.29	0.41	0.28	0.33	0.28	0.16	0.09	0.23	0.13
N4	0.36	0.10	0.34	0.32	0.26	0.29	0.27	0.21	0.14	0.43	0.13	0.15	0.15	0.40	0.36	0.41	0.33	0.39	0.23	0.14	0.17	0.27	0.18
O2	0.30	0.17	0.31	0.27	0.20	0.26	0.19	0.33	0.20	0.19	0.16	0.19	0.22	0.21	0.23	0.43	0.24	0.29	0.40	0.23	0.10	0.23	0.16
O2'	0.26	0.23	0.21	0.19	0.25	0.20	0.38	0.45	0.38	0.44	0.27	0.26	0.24	0.52	0.26	0.40	0.19	0.21	0.60	0.47	0.24	0.20	0.27
O3'	0.53	0.16	0.49	0.45	0.16	0.48	0.21	0.34	0.28	0.17	0.15	0.23	0.26	0.35	0.24	0.64	0.51	0.63	0.02	0.45	0.02	0.01	0.01
O4'	0.33	0.12	0.30	0.30	0.12	0.29	0.21	0.32	0.30	0.13	0.22	0.12	0.14	0.24	0.18	0.43	0.32	0.35	0.22	0.43	0.14	0.21	0.06
O5'	0.44	0.19	0.40	0.45	0.11	0.44	0.24	0.32	0.43	0.18	0.36	0.18	0.11	0.23	0.24	0.50	0.50	0.57	0.21	0.63	0.40	0.52	0.31
OP1	0.44	0.24	0.43	0.51	0.15	0.47	0.29	0.40	0.49	0.20	0.42	0.23	0.13	0.27	0.24	0.51	0.61	0.59	0.35	0.70	0.53	0.59	0.38
OP2	0.42	0.29	0.37	0.43	0.13	0.41	0.25	0.28	0.49	0.25	0.47	0.31	0.13	0.18	0.25	0.44	0.49	0.58	0.28	0.71	0.39	0.46	0.29
P	0.43	0.24	0.40	0.46	0.12	0.45	0.26	0.34	0.48	0.21	0.43	0.24	0.11	0.22	0.24	0.49	0.53	0.58	0.28	0.69	0.47	0.55	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.08	0.01	0.04	0.05	0.13	0.08	0.03	0.01	0.03	0.04	0.00	0.10	0.02	0.11	0.06	0.12
C2	0.08	0.00	0.18	0.13	0.02	0.07	0.01	0.23	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.26	0.19	0.09	0.32	0.00	0.26	0.49	0.27
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.07	0.04	0.03	0.03	0.06	0.09	0.13	0.23	0.17	0.06	0.02	0.00	0.05	0.01	0.13	0.04	0.17	0.16	0.12
C3'	0.02	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.09	0.20	0.09	0.18	0.12	0.18	0.08	0.02	0.01	0.03	0.27	0.11	0.29	0.24	0.24
C4	0.02	0.02	0.07	0.06	0.00	0.07	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.13	0.07	0.04	0.34	0.01	0.29	0.43	0.27
C4'	0.02	0.07	0.04	0.01	0.07	0.00	0.15	0.00	0.14	0.23	0.07	0.12	0.07	0.23	0.10	0.12	0.03	0.00	0.02	0.18	0.12	0.05	0.12
C5	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.15	0.00	0.42	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.09	0.04	0.47	0.02	0.49	0.63	0.47
C5'	0.08	0.23	0.03	0.01	0.29	0.00	0.42	0.00	0.43	0.47	0.33	0.18	0.19	0.52	0.29	0.11	0.12	0.01	0.01	0.49	0.12	0.18	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.14	0.01	0.43	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.13	0.09	0.04	0.49	0.00	0.55	0.72	0.53
C8	0.04	0.02	0.09	0.20	0.01	0.23	0.00	0.47	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.00	0.06	0.21	0.07	0.48	0.04	0.46	0.47	0.41
N1	0.05	0.00	0.13	0.09	0.01	0.07	0.01	0.33	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.21	0.13	0.06	0.41	0.01	0.42	0.63	0.42
N2	0.13	0.01	0.23	0.18	0.03	0.12	0.01	0.18	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.02	0.06	0.34	0.27	0.14	0.27	0.01	0.19	0.45	0.21
N3	0.08	0.01	0.17	0.12	0.01	0.07	0.00	0.19	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.24	0.18	0.09	0.26	0.01	0.17	0.37	0.18
N7	0.03	0.01	0.06	0.18	0.01	0.23	0.00	0.52	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.20	0.07	0.55	0.04	0.62	0.71	0.59
N9	0.01	0.03	0.02	0.08	0.01	0.10	0.01	0.29	0.01	0.00	0.02	0.06	0.03	0.01	0.00	0.05	0.07	0.02	0.30	0.03	0.22	0.29	0.18
O2'	0.03	0.26	0.00	0.02	0.13	0.12	0.09	0.11	0.13	0.06	0.21	0.34	0.24	0.04	0.05	0.00	0.14	0.04	0.11	0.11	0.21	0.08	0.20
O3'	0.04	0.19	0.05	0.01	0.07	0.03	0.09	0.12	0.09	0.21	0.13	0.27	0.18	0.20	0.07	0.14	0.00	0.05	0.36	0.11	0.42	0.34	0.35
O4'	0.00	0.09	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.06	0.14	0.09	0.07	0.02	0.04	0.05	0.00	0.16	0.06	0.25	0.25	0.30
O5'	0.10	0.32	0.13	0.27	0.34	0.02	0.47	0.01	0.49	0.48	0.41	0.27	0.26	0.55	0.30	0.11	0.36	0.16	0.00	0.55	0.01	0.04	0.00
O6	0.02	0.00	0.04	0.11	0.01	0.18	0.02	0.49	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.11	0.11	0.06	0.55	0.00	0.67	0.84	0.65
OP1	0.11	0.26	0.17	0.29	0.29	0.12	0.49	0.12	0.55	0.46	0.42	0.19	0.17	0.62	0.22	0.21	0.42	0.25	0.01	0.67	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.49	0.16	0.24	0.43	0.05	0.63	0.18	0.72	0.47	0.63	0.45	0.37	0.71	0.29	0.08	0.34	0.25	0.04	0.84	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.27	0.12	0.24	0.27	0.12	0.47	0.02	0.53	0.41	0.42	0.21	0.18	0.59	0.18	0.20	0.35	0.30	0.00	0.65	0.00	0.00	0.00